沖 真弥

最終更新日時: 2020/07/29 11:31:30

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氏名(漢字/フリガナ/アルファベット表記)
沖 真弥/オキ シンヤ/Oki, Shinya
所属部署・職名(部局/所属/講座等/職名)
医学研究科/創薬医学講座(寄附)/特定准教授
取得学位
学位名(日本語) 学位名(英語) 大学(日本語) 大学(英語) 取得区分
修士(工学) MA in Engineering 大阪大学 Osaka university
博士(医学) Ph.D. of Medical Science 大阪大学 Osaka university
出身大学院・研究科等
大学名(日本語) 大学名(英語) 研究科名(日本語) 研究科名(英語) 専攻名(日本語) 専攻名(英語) 修了区分
大阪大学 Osaka university 大学院工学研究科修士課程応用生物工学専攻 Graduate School of Engineering 修了
大阪大学 Osaka university 大学院医学系研究科博士課程生体制御医学専攻 Graduate School of Medicine 修了
出身学校・専攻等
大学名(日本語) 大学名(英語) 学部名(日本語) 学部名(英語) 学科名(日本語) 学科名(英語) 卒業区分
大阪大学 Osaka university 工学部応用自然科学科 Department of Engineering 卒業
出身高等学校
高等学校名 ふりがな
広島城北高校
職歴
期間 組織名(日本語) 組織名(英語) 職名(日本語) 職名(英語)
2109/02/01〜2020/03/31 九州大学大学院医学研究院 Graduate School of Medical Science, Kyushu university 講師 Lecturer
2007/02/01〜2019/01/31 九州大学大学院医学研究院 Graduate School of Medical Science, Kyushu university 助教 Assistant Professor
プロフィール
(日本語)
世界中で行われたChIP-seq実験などのエピゲノミクスデータを統合したデータベース、ChIP-Atlas を開発している。その十数万件ものオミクス実験データを統合的に分析することにより、細胞分化制御や遺伝性疾患のしくみの解明、および創薬ターゲットの探索などをおこなっている。 また最近では、光学と化学を融合させた新規オミクス技術、photo-isolation chemistry (PIC) を開発している。これは、様々な細胞タイプが混在する組織において「関心領域」に特定波長の光を照射すると、そのエリアだけのオミクス情報を引き出せる技術である。局所的な細胞集団のプロファイリングが可能となるこの新技術と、上述のデータ解析手法を駆使した多元的アプローチにより、器官形成や先天異常の原理を解き明かしたい。
ORCID ID
https://orcid.org/0000-0002-4767-3259
researchmap URL
https://researchmap.jp/okishinya
研究テーマ
(日本語)
エピゲノミクスデータを統合したデータベースの開発 光学と化学を融合させた新規オミクス技術の開発
研究概要
(日本語)
世界中で行われたChIP-seq実験などのエピゲノミクスデータを統合したデータベース、ChIP-Atlas を開発している。その十数万件ものオミクス実験データを統合的に分析することにより、細胞分化制御や遺伝性疾患のしくみの解明、および創薬ターゲットの探索などをおこなっている。 また最近では、光学と化学を融合させた新規オミクス技術、photo-isolation chemistry (PIC) を開発している。これは、様々な細胞タイプが混在する組織において「関心領域」に特定波長の光を照射すると、そのエリアだけのオミクス情報を引き出せる技術である。局所的な細胞集団のプロファイリングが可能となるこの新技術と、上述のデータ解析手法を駆使した多元的アプローチにより、器官形成や先天異常の原理を解き明かしたい。
研究分野(キーワード)
キーワード(日本語) キーワード(英語)
Epigenetics Epigenetics
Database Database
Developmental Biology Developmental Biology
論文
著者 著者(日本語) 著者(英語) タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 書誌情報等 書誌情報等(日本語) 書誌情報等(英語) 出版年月 査読の有無 記述言語 掲載種別 公開
Eli Kaminuma, Yukino Baba, Masahiro Mochizuki, Hirotaka Matsumoto, Haruka Ozaki, Toshitsugu Okayama, Takuya Kato, Shinya Oki, Takatomo Fujisawa, Yasukazu Nakamura, Masanori Arita, Osamu Ogasawara, Hisashi Kashima, Toshihisa Takagi Eli Kaminuma, Yukino Baba, Masahiro Mochizuki, Hirotaka Matsumoto, Haruka Ozaki, Toshitsugu Okayama, Takuya Kato, Shinya Oki, Takatomo Fujisawa, Yasukazu Nakamura, Masanori Arita, Osamu Ogasawara, Hisashi Kashima, Toshihisa Takagi Eli Kaminuma, Yukino Baba, Masahiro Mochizuki, Hirotaka Matsumoto, Haruka Ozaki, Toshitsugu Okayama, Takuya Kato, Shinya Oki, Takatomo Fujisawa, Yasukazu Nakamura, Masanori Arita, Osamu Ogasawara, Hisashi Kashima, Toshihisa Takagi DDBJ Data Analysis Challenge: a machine learning competition to predict Arabidopsis chromatin feature annotations from DNA sequences. DDBJ Data Analysis Challenge: a machine learning competition to predict Arabidopsis chromatin feature annotations from DNA sequences. DDBJ Data Analysis Challenge: a machine learning competition to predict Arabidopsis chromatin feature annotations from DNA sequences. Genes & genetic systems, 95, 1, 43-50 Genes & genetic systems, 95, 1, 43-50 Genes & genetic systems, 95, 1, 43-50 2020/04/22 英語 公開
Mayumi Hirayama, Fan-Yan Wei, Takeshi Chujo, Shinya Oki, Maya Yakita, Daiki Kobayashi, Norie Araki, Nozomu Takahashi, Ryoji Yoshida, Hideki Nakayama, Kazuhito Tomizawa Mayumi Hirayama, Fan-Yan Wei, Takeshi Chujo, Shinya Oki, Maya Yakita, Daiki Kobayashi, Norie Araki, Nozomu Takahashi, Ryoji Yoshida, Hideki Nakayama, Kazuhito Tomizawa Mayumi Hirayama, Fan-Yan Wei, Takeshi Chujo, Shinya Oki, Maya Yakita, Daiki Kobayashi, Norie Araki, Nozomu Takahashi, Ryoji Yoshida, Hideki Nakayama, Kazuhito Tomizawa FTO Demethylates Cyclin D1 mRNA and Controls Cell-Cycle Progression FTO Demethylates Cyclin D1 mRNA and Controls Cell-Cycle Progression FTO Demethylates Cyclin D1 mRNA and Controls Cell-Cycle Progression Cell Reports, 31, 1, 107464-107464 Cell Reports, 31, 1, 107464-107464 Cell Reports, 31, 1, 107464-107464 2020/04 研究論文(学術雑誌) 公開
Honda Mizuki, Oki Shinya, Harada Akihito, Maehara Kazumitsu, Tanaka Kaori, Meno Chikara, Ohkawa Yasuyuki Honda Mizuki, Oki Shinya, Harada Akihito, Maehara Kazumitsu, Tanaka Kaori, Meno Chikara, Ohkawa Yasuyuki Honda Mizuki, Oki Shinya, Harada Akihito, Maehara Kazumitsu, Tanaka Kaori, Meno Chikara, Ohkawa Yasuyuki High resolution spatial transcriptome analysis by photo-isolation chemistry High resolution spatial transcriptome analysis by photo-isolation chemistry High resolution spatial transcriptome analysis by photo-isolation chemistry BioRxiv BioRxiv BioRxiv 2020/03 英語 公開
Zhaoming Wu, Yanxia Rao, Sushan Zhang, Eun-Jung Kim, Shinya Oki, Hidemitsu Harada, Martin Cheung, Han-Sung Jung Zhaoming Wu, Yanxia Rao, Sushan Zhang, Eun-Jung Kim, Shinya Oki, Hidemitsu Harada, Martin Cheung, Han-Sung Jung Zhaoming Wu, Yanxia Rao, Sushan Zhang, Eun-Jung Kim, Shinya Oki, Hidemitsu Harada, Martin Cheung, Han-Sung Jung Cis-control of Six1 expression in neural crest cells during craniofacial development. Cis-control of Six1 expression in neural crest cells during craniofacial development. Cis-control of Six1 expression in neural crest cells during craniofacial development. Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists, 248, 12, 1264-1272 Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists, 248, 12, 1264-1272 Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists, 248, 12, 1264-1272 2019/12 英語 公開
Marina Lizio, Imad Abugessaisa, Shuhei Noguchi, Atsushi Kondo, Akira Hasegawa, Chung Chau Hon, Michiel de Hoon, Jessica Severin, Shinya Oki, Yoshihide Hayashizaki, Piero Carninci, Takeya Kasukawa, Hideya Kawaji Marina Lizio, Imad Abugessaisa, Shuhei Noguchi, Atsushi Kondo, Akira Hasegawa, Chung Chau Hon, Michiel de Hoon, Jessica Severin, Shinya Oki, Yoshihide Hayashizaki, Piero Carninci, Takeya Kasukawa, Hideya Kawaji Marina Lizio, Imad Abugessaisa, Shuhei Noguchi, Atsushi Kondo, Akira Hasegawa, Chung Chau Hon, Michiel de Hoon, Jessica Severin, Shinya Oki, Yoshihide Hayashizaki, Piero Carninci, Takeya Kasukawa, Hideya Kawaji Update of the FANTOM web resource: expansion to provide additional transcriptome atlases. Update of the FANTOM web resource: expansion to provide additional transcriptome atlases. Update of the FANTOM web resource: expansion to provide additional transcriptome atlases. Nucleic acids research, 47, D1, D752-D758-D758 Nucleic acids research, 47, D1, D752-D758-D758 Nucleic acids research, 47, D1, D752-D758-D758 2019/01/08 英語 公開
Yoshizaki, K, Koike, T, Kimura, R, Kikkawa, T, Oki, S, Koike, K, Mochizuki, K, Inada, H, Kobayashi, H, Matsui, Y, Kono, T, Osumi, N Yoshizaki, K, Koike, T, Kimura, R, Kikkawa, T, Oki, S, Koike, K, Mochizuki, K, Inada, H, Kobayashi, H, Matsui, Y, Kono, T, Osumi, N Yoshizaki, K, Koike, T, Kimura, R, Kikkawa, T, Oki, S, Koike, K, Mochizuki, K, Inada, H, Kobayashi, H, Matsui, Y, Kono, T, Osumi, N Paternal age affects offspring's behavior possibly via an epigenetic mechanism recruiting a transcriptional repressor REST. Paternal age affects offspring's behavior possibly via an epigenetic mechanism recruiting a transcriptional repressor REST. Paternal age affects offspring's behavior possibly via an epigenetic mechanism recruiting a transcriptional repressor REST. bioRxiv bioRxiv bioRxiv 2019 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Oki, S, Ohta, T, Shioi, G, Hatanaka, H, Ogasawara, O, Okuda, Y, Kawaji, H, Nakaki, R, Sese, J, Meno, C Oki, S, Ohta, T, Shioi, G, Hatanaka, H, Ogasawara, O, Okuda, Y, Kawaji, H, Nakaki, R, Sese, J, Meno, C ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data. ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data. ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data. EMBO Reports, e46255 EMBO Reports, e46255 EMBO Reports, e46255 2018/11 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Mochizuki K, Hayashi Y, Sekinaka T, Otsuka K, Ito-Matsuoka Y, Kobayashi H, Oki S, Takehara A, Kono T, Osumi N, Matsui Y Mochizuki K, Hayashi Y, Sekinaka T, Otsuka K, Ito-Matsuoka Y, Kobayashi H, Oki S, Takehara A, Kono T, Osumi N, Matsui Y Mochizuki K, Hayashi Y, Sekinaka T, Otsuka K, Ito-Matsuoka Y, Kobayashi H, Oki S, Takehara A, Kono T, Osumi N, Matsui Y Repression of Somatic Genes by Selective Recruitment of HDAC3 by BLIMP1 Is Essential for Mouse Primordial Germ Cell Fate Determination Repression of Somatic Genes by Selective Recruitment of HDAC3 by BLIMP1 Is Essential for Mouse Primordial Germ Cell Fate Determination Repression of Somatic Genes by Selective Recruitment of HDAC3 by BLIMP1 Is Essential for Mouse Primordial Germ Cell Fate Determination Cell Reports, 24, 10, 2682-2693.e6 Cell Reports, 24, 10, 2682-2693.e6 Cell Reports, 24, 10, 2682-2693.e6 2018/09 公開
Anan K, Hino S, Shimizu N, Sakamoto A, Nagaoka K, Takase R, Kohrogi K, Araki H, Hino Y, Usuki S, Oki S, Tanaka H, Nakamura K, Endo F, Nakao M Anan K, Hino S, Shimizu N, Sakamoto A, Nagaoka K, Takase R, Kohrogi K, Araki H, Hino Y, Usuki S, Oki S, Tanaka H, Nakamura K, Endo F, Nakao M Anan K, Hino S, Shimizu N, Sakamoto A, Nagaoka K, Takase R, Kohrogi K, Araki H, Hino Y, Usuki S, Oki S, Tanaka H, Nakamura K, Endo F, Nakao M LSD1 mediates metabolic reprogramming by glucocorticoids during myogenic differentiation. LSD1 mediates metabolic reprogramming by glucocorticoids during myogenic differentiation. LSD1 mediates metabolic reprogramming by glucocorticoids during myogenic differentiation. Nucleic acids research, 46, 11, 5441-5454 Nucleic acids research, 46, 11, 5441-5454 Nucleic acids research, 46, 11, 5441-5454 2018/06 公開
Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Hideki Hatanaka, Osamu Ogasawara, Yoshihiro Okuda, Hideya Kawaji, Ryo Nakaki, Jun Sese, Chikara Meno Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Hideki Hatanaka, Osamu Ogasawara, Yoshihiro Okuda, Hideya Kawaji, Ryo Nakaki, Jun Sese, Chikara Meno Shinya Oki, Tazro Ohta, Go Shioi, Hideki Hatanaka, Osamu Ogasawara, Yoshihiro Okuda, Hideya Kawaji, Ryo Nakaki, Jun Sese, Chikara Meno Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions bioRxiv bioRxiv bioRxiv 2018/02 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Yuichiro Semba, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Shinya Oki, Chikara Meno, Jun Ueda, Kazuo Yamagata, Atsushi Suzuki, Mitsuho Onimaru, Jumpei Nogami, Seiji Okada, Koichi Akashi, Yasuyuki Ohkawa Yuichiro Semba, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Shinya Oki, Chikara Meno, Jun Ueda, Kazuo Yamagata, Atsushi Suzuki, Mitsuho Onimaru, Jumpei Nogami, Seiji Okada, Koichi Akashi, Yasuyuki Ohkawa Yuichiro Semba, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Shinya Oki, Chikara Meno, Jun Ueda, Kazuo Yamagata, Atsushi Suzuki, Mitsuho Onimaru, Jumpei Nogami, Seiji Okada, Koichi Akashi, Yasuyuki Ohkawa Chd2 regulates chromatin for proper gene expression toward differentiation in mouse embryonic stem cells Chd2 regulates chromatin for proper gene expression toward differentiation in mouse embryonic stem cells Chd2 regulates chromatin for proper gene expression toward differentiation in mouse embryonic stem cells NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 45, 15, 8758-8772 NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 45, 15, 8758-8772 NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 45, 15, 8758-8772 2017/09 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Kazunari Matsuda, Tomoyuki Mikami, Shinya Oki, Hideaki Iida, Munazah Andrabi, Jeremy M. Boss, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Hisato Kondoh Kazunari Matsuda, Tomoyuki Mikami, Shinya Oki, Hideaki Iida, Munazah Andrabi, Jeremy M. Boss, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Hisato Kondoh Kazunari Matsuda, Tomoyuki Mikami, Shinya Oki, Hideaki Iida, Munazah Andrabi, Jeremy M. Boss, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Hisato Kondoh ChIP-seq analysis of genomic binding regions of five major transcription factors highlights a central role for ZIC2 in the mouse epiblast stem cell gene regulatory network ChIP-seq analysis of genomic binding regions of five major transcription factors highlights a central role for ZIC2 in the mouse epiblast stem cell gene regulatory network ChIP-seq analysis of genomic binding regions of five major transcription factors highlights a central role for ZIC2 in the mouse epiblast stem cell gene regulatory network DEVELOPMENT, 144, 11, 1948-1958 DEVELOPMENT, 144, 11, 1948-1958 DEVELOPMENT, 144, 11, 1948-1958 2017/06 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Kenji Ohshima, Satoshi Nojima, Shinichiro Tahara, Masako Kurashige, Yumiko Hori, Kohei Hagiwara, Daisuke Okuzaki, Shinya Oki, Naoki Wada, Jun-ichiro Ikeda, Yoshikatsu Kanai, Eiichi Morii Kenji Ohshima, Satoshi Nojima, Shinichiro Tahara, Masako Kurashige, Yumiko Hori, Kohei Hagiwara, Daisuke Okuzaki, Shinya Oki, Naoki Wada, Jun-ichiro Ikeda, Yoshikatsu Kanai, Eiichi Morii Kenji Ohshima, Satoshi Nojima, Shinichiro Tahara, Masako Kurashige, Yumiko Hori, Kohei Hagiwara, Daisuke Okuzaki, Shinya Oki, Naoki Wada, Jun-ichiro Ikeda, Yoshikatsu Kanai, Eiichi Morii Argininosuccinate Synthase 1-Deficiency Enhances the Cell Sensitivity to Arginine through Decreased DEPTOR Expression in Endometrial Cancer Argininosuccinate Synthase 1-Deficiency Enhances the Cell Sensitivity to Arginine through Decreased DEPTOR Expression in Endometrial Cancer Argininosuccinate Synthase 1-Deficiency Enhances the Cell Sensitivity to Arginine through Decreased DEPTOR Expression in Endometrial Cancer SCIENTIFIC REPORTS, 7, 45504 SCIENTIFIC REPORTS, 7, 45504 SCIENTIFIC REPORTS, 7, 45504 2017/03 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Masayasu Hayashi, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yuichiro Semba, Kensuke Kudo, Hidehisa Takahashi, Shinya Oki, Chikara Meno, Kenji Ichiyanagi, Koichi Akashi, Yasuyuki Ohkawa Masayasu Hayashi, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yuichiro Semba, Kensuke Kudo, Hidehisa Takahashi, Shinya Oki, Chikara Meno, Kenji Ichiyanagi, Koichi Akashi, Yasuyuki Ohkawa Masayasu Hayashi, Kazumitsu Maehara, Akihito Harada, Yuichiro Semba, Kensuke Kudo, Hidehisa Takahashi, Shinya Oki, Chikara Meno, Kenji Ichiyanagi, Koichi Akashi, Yasuyuki Ohkawa Chd5 Regulates MuERV-L/MERVL Expression in Mouse Embryonic Stem Cells Via H3K27me3 Modification and Histone H3.1/H3.2 Chd5 Regulates MuERV-L/MERVL Expression in Mouse Embryonic Stem Cells Via H3K27me3 Modification and Histone H3.1/H3.2 Chd5 Regulates MuERV-L/MERVL Expression in Mouse Embryonic Stem Cells Via H3K27me3 Modification and Histone H3.1/H3.2 JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY, 117, 3, 780-792 JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY, 117, 3, 780-792 JOURNAL OF CELLULAR BIOCHEMISTRY, 117, 3, 780-792 2016/03 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Masahiro Hachisuga, Shinya Oki, Keiko Kitajima, Satomi Ikuta, Tomoyuki Sumi, Kiyoko Kato, Norio Wake, Chikara Meno Masahiro Hachisuga, Shinya Oki, Keiko Kitajima, Satomi Ikuta, Tomoyuki Sumi, Kiyoko Kato, Norio Wake, Chikara Meno Masahiro Hachisuga, Shinya Oki, Keiko Kitajima, Satomi Ikuta, Tomoyuki Sumi, Kiyoko Kato, Norio Wake, Chikara Meno Hyperglycemia impairs left-right axis formation and thereby disturbs heart morphogenesis in mouse embryos Hyperglycemia impairs left-right axis formation and thereby disturbs heart morphogenesis in mouse embryos Hyperglycemia impairs left-right axis formation and thereby disturbs heart morphogenesis in mouse embryos PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 112, 38, E5300-E5307 PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 112, 38, E5300-E5307 PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 112, 38, E5300-E5307 2015/09 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Shinya Oki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Chikara Meno Shinya Oki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Chikara Meno Shinya Oki, Kazumitsu Maehara, Yasuyuki Ohkawa, Chikara Meno SraTailor: Graphical user interface software for processing and visualizing ChIP-seq data SraTailor: Graphical user interface software for processing and visualizing ChIP-seq data SraTailor: Graphical user interface software for processing and visualizing ChIP-seq data GENES TO CELLS, 19, 12, 919-926 GENES TO CELLS, 19, 12, 919-926 GENES TO CELLS, 19, 12, 919-926 2014/12 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Hidetaka Shiratori, Kenta Yashiro, Naomi Iwai, Shinya Oki, Katsura Minegishi, Yayoi Ikawa, Kohei Kanata, Hiroshi Hamada Hidetaka Shiratori, Kenta Yashiro, Naomi Iwai, Shinya Oki, Katsura Minegishi, Yayoi Ikawa, Kohei Kanata, Hiroshi Hamada Hidetaka Shiratori, Kenta Yashiro, Naomi Iwai, Shinya Oki, Katsura Minegishi, Yayoi Ikawa, Kohei Kanata, Hiroshi Hamada Self-regulated left-right asymmetric expression of Pitx2c in the developing mouse limb Self-regulated left-right asymmetric expression of Pitx2c in the developing mouse limb Self-regulated left-right asymmetric expression of Pitx2c in the developing mouse limb DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 395, 2, 331-341 DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 395, 2, 331-341 DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 395, 2, 331-341 2014/11 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Keiko Kitajima, Shinya Oki, Yasuyuki Ohkawa, Tomoyuki Sumi, Chikara Meno Keiko Kitajima, Shinya Oki, Yasuyuki Ohkawa, Tomoyuki Sumi, Chikara Meno Keiko Kitajima, Shinya Oki, Yasuyuki Ohkawa, Tomoyuki Sumi, Chikara Meno Wnt signaling regulates left-right axis formation in the node of mouse embryos Wnt signaling regulates left-right axis formation in the node of mouse embryos Wnt signaling regulates left-right axis formation in the node of mouse embryos DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 380, 2, 222-232 DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 380, 2, 222-232 DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 380, 2, 222-232 2013/08 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Sumi T, Oki S, Kitajima K, Meno C Sumi T, Oki S, Kitajima K, Meno C Tomoyuki Sumi, Shinya Oki, Keiko Kitajima, Chikara Meno Epiblast ground state is controlled by canonical Wnt/β-catenin signaling in the postimplantation mouse embryo and epiblast stem cells. Epiblast ground state is controlled by canonical Wnt/β-catenin signaling in the postimplantation mouse embryo and epiblast stem cells. Epiblast Ground State Is Controlled by Canonical Wnt/beta-Catenin Signaling in the Postimplantation Mouse Embryo and Epiblast Stem Cells PloS one, 8, 5, e63378 PloS one, 8, 5, e63378 PLOS ONE, 8, 5, e63378 2013/05 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Teppei Noda, Shinya Oki, Keiko Kitajima, Tetsuro Harada, Shizuo Komune, Chikara Meno Teppei Noda, Shinya Oki, Keiko Kitajima, Tetsuro Harada, Shizuo Komune, Chikara Meno Teppei Noda, Shinya Oki, Keiko Kitajima, Tetsuro Harada, Shizuo Komune, Chikara Meno Restriction of Wnt signaling in the dorsal otocyst determines semicircular canal formation in the mouse embryo Restriction of Wnt signaling in the dorsal otocyst determines semicircular canal formation in the mouse embryo Restriction of Wnt signaling in the dorsal otocyst determines semicircular canal formation in the mouse embryo DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 362, 1, 83-93 DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 362, 1, 83-93 DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 362, 1, 83-93 2012/02 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Rika Miki, Tetsu Yoshida, Kazuya Murata, Shinya Oki, Kazuhiko Kume, Shoen Kume Rika Miki, Tetsu Yoshida, Kazuya Murata, Shinya Oki, Kazuhiko Kume, Shoen Kume Rika Miki, Tetsu Yoshida, Kazuya Murata, Shinya Oki, Kazuhiko Kume, Shoen Kume Fate maps of ventral and dorsal pancreatic progenitor cells in early somite stage mouse embryos Fate maps of ventral and dorsal pancreatic progenitor cells in early somite stage mouse embryos Fate maps of ventral and dorsal pancreatic progenitor cells in early somite stage mouse embryos MECHANISMS OF DEVELOPMENT, 128, 11-12, 597-609 MECHANISMS OF DEVELOPMENT, 128, 11-12, 597-609 MECHANISMS OF DEVELOPMENT, 128, 11-12, 597-609 2012/01 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Oki S, Men C Oki S, Men C Oki S, Men C [The role of sulfated glycosaminoglycans in early mouse development]. [The role of sulfated glycosaminoglycans in early mouse development]. [The role of sulfated glycosaminoglycans in early mouse development]. Fukuoka igaku zasshi = Hukuoka acta medica, 101, 8, 157-164 Fukuoka igaku zasshi = Hukuoka acta medica, 101, 8, 157-164 Fukuoka igaku zasshi = Hukuoka acta medica, 101, 8, 157-164 2010/08 公開
Shinya Oki, Keiko Kitajima, Chikara Meno Shinya Oki, Keiko Kitajima, Chikara Meno Shinya Oki, Keiko Kitajima, Chikara Meno Dissecting the Role of Fgf Signaling During Gastrulation and Left-Right Axis Formation in Mouse Embryos Using Chemical Inhibitors Dissecting the Role of Fgf Signaling During Gastrulation and Left-Right Axis Formation in Mouse Embryos Using Chemical Inhibitors Dissecting the Role of Fgf Signaling During Gastrulation and Left-Right Axis Formation in Mouse Embryos Using Chemical Inhibitors DEVELOPMENTAL DYNAMICS, 239, 6, 1768-1778 DEVELOPMENTAL DYNAMICS, 239, 6, 1768-1778 DEVELOPMENTAL DYNAMICS, 239, 6, 1768-1778 2010/06 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Shinya Oki, Keiko Kitajima, Sara Marques, Jose Antonio Belo, Takahiko Yokoyama, Hiroshi Hamada, Chikara Meno Shinya Oki, Keiko Kitajima, Sara Marques, Jose Antonio Belo, Takahiko Yokoyama, Hiroshi Hamada, Chikara Meno Shinya Oki, Keiko Kitajima, Sara Marques, Jose Antonio Belo, Takahiko Yokoyama, Hiroshi Hamada, Chikara Meno Reversal of left-right asymmetry induced by aberrant Nodal signaling in the node of mouse embryos Reversal of left-right asymmetry induced by aberrant Nodal signaling in the node of mouse embryos Reversal of left-right asymmetry induced by aberrant Nodal signaling in the node of mouse embryos DEVELOPMENT, 136, 23, 3917-3925 DEVELOPMENT, 136, 23, 3917-3925 DEVELOPMENT, 136, 23, 3917-3925 2009/12 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Shinya Oki, Ryuju Hashimoto, Yuko Okui, Michael M. Shen, Eisuke Mekada, Hiroki Otani, Yukio Saijoh, Hiroshi Hamada Shinya Oki, Ryuju Hashimoto, Yuko Okui, Michael M. Shen, Eisuke Mekada, Hiroki Otani, Yukio Saijoh, Hiroshi Hamada Shinya Oki, Ryuju Hashimoto, Yuko Okui, Michael M. Shen, Eisuke Mekada, Hiroki Otani, Yukio Saijoh, Hiroshi Hamada Sulfated glycosaminoglycans are necessary for Nodal signal transmission from the node to the left lateral plate in the mouse embryo Sulfated glycosaminoglycans are necessary for Nodal signal transmission from the node to the left lateral plate in the mouse embryo Sulfated glycosaminoglycans are necessary for Nodal signal transmission from the node to the left lateral plate in the mouse embryo DEVELOPMENT, 134, 21, 3893-3904 DEVELOPMENT, 134, 21, 3893-3904 DEVELOPMENT, 134, 21, 3893-3904 2007/11 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Y Saijoh, S Oki, C Tanaka, T Nakamura, H Adachi, YT Yan, MM Shen, H Hamada Y Saijoh, S Oki, C Tanaka, T Nakamura, H Adachi, YT Yan, MM Shen, H Hamada Y Saijoh, S Oki, C Tanaka, T Nakamura, H Adachi, YT Yan, MM Shen, H Hamada Two nodal-responsive enhancers control left-right asymmetric expression of Nodal Two nodal-responsive enhancers control left-right asymmetric expression of Nodal Two nodal-responsive enhancers control left-right asymmetric expression of Nodal DEVELOPMENTAL DYNAMICS, 232, 4, 1031-1036 DEVELOPMENTAL DYNAMICS, 232, 4, 1031-1036 DEVELOPMENTAL DYNAMICS, 232, 4, 1031-1036 2005/04 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Y Saijoh, S Oki, S Ohishi, H Hamada Y Saijoh, S Oki, S Ohishi, H Hamada Y Saijoh, S Oki, S Ohishi, H Hamada Left-right patterning of the mouse lateral plate requires Nodal produced in the node Left-right patterning of the mouse lateral plate requires Nodal produced in the node Left-right patterning of the mouse lateral plate requires Nodal produced in the node DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 256, 1, 160-172 DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 256, 1, 160-172 DEVELOPMENTAL BIOLOGY, 256, 1, 160-172 2003/04 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
M Todoriki, S Oki, S Matsuyama, EP Ko-Mitamura, Urabe, I, T Yomo M Todoriki, S Oki, S Matsuyama, EP Ko-Mitamura, Urabe, I, T Yomo M Todoriki, S Oki, S Matsuyama, EP Ko-Mitamura, Urabe, I, T Yomo An observation of the initial stage towards a symbiotic relationship An observation of the initial stage towards a symbiotic relationship An observation of the initial stage towards a symbiotic relationship BIOSYSTEMS, 65, 2-3, 105-112 BIOSYSTEMS, 65, 2-3, 105-112 BIOSYSTEMS, 65, 2-3, 105-112 2002/03 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
M Todoriki, S Oki, SI Matsuyama, Urabe, I, T Yomo M Todoriki, S Oki, SI Matsuyama, Urabe, I, T Yomo M Todoriki, S Oki, SI Matsuyama, Urabe, I, T Yomo Unique colony housing the coexisting Escherichia coli and Dictyostelium discoideum Unique colony housing the coexisting Escherichia coli and Dictyostelium discoideum Unique colony housing the coexisting Escherichia coli and Dictyostelium discoideum JOURNAL OF BIOLOGICAL PHYSICS, 28, 4, 793-797 JOURNAL OF BIOLOGICAL PHYSICS, 28, 4, 793-797 JOURNAL OF BIOLOGICAL PHYSICS, 28, 4, 793-797 2002 英語 研究論文(学術雑誌) 公開

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著者 著者(日本語) 著者(英語) タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 書誌情報等 書誌情報等(日本語) 書誌情報等(英語) 出版年月 査読の有無 記述言語 掲載種別 公開
沖 真弥, 大田達郎 沖 真弥, 大田達郎 ChIP-Atlas:公共 ChIP-seq データを統合的に活用するためのウェブサービス ChIP-Atlas:公共 ChIP-seq データを統合的に活用するためのウェブサービス THE LUNG perspectives, 27, 243-249 THE LUNG perspectives, 27, 243-249 , 27, 243-249 2019 日本語 記事・総説・解説・論説等(学術雑誌) 公開
沖真弥, 大田達郎 沖真弥, 大田達郎 ChIP-Atlas:既報のChIP-seqデータをフル活用するためのウェブサービス ChIP-Atlas:既報のChIP-seqデータをフル活用するためのウェブサービス 実験医学, 37, 2760-2763 実験医学, 37, 2760-2763 , 37, 2760-2763 2019 日本語 記事・総説・解説・論説等(学術雑誌) 公開
Kazunari Matsuda, Shinya Oki, Shoji Shigenobu, Hisato Kondoh Kazunari Matsuda, Shinya Oki, Shoji Shigenobu, Hisato Kondoh Kazunari Matsuda, Shinya Oki, Shoji Shigenobu, Hisato Kondoh Roles for ZIC2 in the regulation of epiblast stem cells and embryonic stem cells Roles for ZIC2 in the regulation of epiblast stem cells and embryonic stem cells Roles for ZIC2 in the regulation of epiblast stem cells and embryonic stem cells MECHANISMS OF DEVELOPMENT, 145, S165-S166 MECHANISMS OF DEVELOPMENT, 145, S165-S166 MECHANISMS OF DEVELOPMENT, 145, S165-S166 2017/07 英語 研究発表ペーパー要旨(国際会議) 公開
神沼英里, 馬場雪乃, 望月正弘, 松本拡高, 尾崎遼, 岡山利次, 加藤卓也, 沖真弥, 小笠原理, 鹿島久嗣, 高木利久 神沼英里, 馬場雪乃, 望月正弘, 松本拡高, 尾崎遼, 岡山利次, 加藤卓也, 沖真弥, 小笠原理, 鹿島久嗣, 高木利久 神沼英里, 馬場雪乃, 望月正弘, 松本拡高, 尾崎遼, 岡山利次, 加藤卓也, 沖真弥, 小笠原理, 鹿島久嗣, 高木利久 DDBJデータ解析チャレンジ報告:機械学習コンペティションのタスク設計とルール設定 DDBJデータ解析チャレンジ報告:機械学習コンペティションのタスク設計とルール設定 DDBJデータ解析チャレンジ報告:機械学習コンペティションのタスク設計とルール設定 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 39th, ROMBUNNO.2LBA‐015 (WEB ONLY) 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 39th, ROMBUNNO.2LBA‐015 (WEB ONLY) 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 39th, ROMBUNNO.2LBA‐015 (WEB ONLY) 2016 日本語 公開
沖真弥 沖真弥 SraTailor: 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール SraTailor: 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール 実験医学 実験医学 2014/11 日本語 速報、短報、研究ノート等(学術雑誌) 公開
沖 真弥, 目野主税 沖 真弥, 目野主税 マウス初期発生における硫酸化グリコサミノグリカンの役割 マウス初期発生における硫酸化グリコサミノグリカンの役割 福岡医学雑誌 福岡医学雑誌 2010/08 日本語 記事・総説・解説・論説等(学術雑誌) 公開
沖 真弥, 目野主税, 濱田博司沖真弥 沖 真弥, 目野主税, 濱田博司沖真弥 左右決定におけるNodalシグナル 左右決定におけるNodalシグナル 細胞工学 細胞工学 2008/06 日本語 記事・総説・解説・論説等(学術雑誌) 公開
沖 真弥, 等々力 政彦, 梶山 慎一郎, 福崎 英一郎, 小林 昭雄, 卜部 格, 四方 哲也 沖 真弥, 等々力 政彦, 梶山 慎一郎, 福崎 英一郎, 小林 昭雄, 卜部 格, 四方 哲也 Oki S, Todoriki M, Kajiyama S, Fukuzaki E, Kobayash A, Urabe I, Yomo T 1M1045 大腸菌と細胞性粘菌よりなる粘性コロニーの解析 1M1045 大腸菌と細胞性粘菌よりなる粘性コロニーの解析 The analysis of viscous colony where Escherichia coli and Dictyostelium discoidium are coexisting. 生物物理, 40, 0 生物物理, 40, 0 Seibutsu Butsuri, 40, 0 2000 日本語 公開
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講演・口頭発表等
タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 会議名 会議名(日本語) 会議名(英語) 主催者 主催者(日本語) 主催者(英語) 発表年月日 記述言語 会議種別 公開
遺伝子発現の時空間的な制御のしくみ[招待あり] 遺伝子発現の時空間的な制御のしくみ [招待あり] KBC第4回勉強会 KBC第4回勉強会 2020/02/19 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation[招待あり] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation [招待あり] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation [招待あり] WPI-IIIS Seminar WPI-IIIS Seminar WPI-IIIS Seminar 2020/01/20 口頭発表(招待・特別) 公開
Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation[招待あり] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation [招待あり] Data-driven and technical approaches to understand spatial gene regulation [招待あり] RIKEN BDR seminar in Kobe RIKEN BDR seminar in Kobe RIKEN BDR seminar in Kobe 2020/01/16 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明や創薬に挑む 公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明や創薬に挑む 次世代脳プロジェクト冬のシンポジウム2019 次世代脳プロジェクト冬のシンポジウム2019 2019/12/19 ポスター発表 公開
ChIP-Atlas: 公共 ChIP-seq データを利活用できる[招待あり] ChIP-Atlas: 公共 ChIP-seq データを利活用できる [招待あり] 第42回日本分子生物学会年会 第42回日本分子生物学会年会 2019/12/03 口頭発表(招待・特別) 公開
位置情報と遺伝子発現とその仕組み[招待あり] 位置情報と遺伝子発現とその仕組み [招待あり] 新学術領域「個性創発脳」若手の会・技術支援講習会 新学術領域「個性創発脳」若手の会・技術支援講習会 2019/11/14 口頭発表(招待・特別) 公開
ChIP-Altasにおけるサンプルメタデータのキュレーションと、その爆速化[招待あり] ChIP-Altasにおけるサンプルメタデータのキュレーションと、その爆速化 [招待あり] Annotathon 2019 Annotathon 2019 2019/11/12 口頭発表(招待・特別) 公開
ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data[招待あり] ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data [招待あり] ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data [招待あり] Lecture in College of Dentistry, Yonsei University Lecture in College of Dentistry, Yonsei University Lecture in College of Dentistry, Yonsei University 2019/10/24 口頭発表(招待・特別) 公開
特定領域の発現情報を光照射で取り出す技術[招待あり] 特定領域の発現情報を光照射で取り出す技術 [招待あり] 2019/10/17 口頭発表(招待・特別) 公開
ChIP-Atlasをつないで使う[招待あり] ChIP-Atlasをつないで使う [招待あり] ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data [招待あり] トーゴーの日シンポジウム2019 トーゴーの日シンポジウム2019 Lecture in College of Dentistry, Yonsei University 2019/10/05 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
High resolution spatial transcriptomics method by photo-isolation chemistry High resolution spatial transcriptomics method by photo-isolation chemistry High resolution spatial transcriptomics method by photo-isolation chemistry EMBO/EMBL Symposium: Multiomics to Mechanisms - Challenges in Data Integration EMBO/EMBL Symposium: Multiomics to Mechanisms - Challenges in Data Integration EMBO/EMBL Symposium: Multiomics to Mechanisms - Challenges in Data Integration 2019/09/11 英語 口頭発表(一般) 公開
ChIP-Atlas: 既報ChIP-seqデータの統合データベース[招待あり] ChIP-Atlas: 既報ChIP-seqデータの統合データベース [招待あり] 統合データベース講習会:AJACS番町3 統合データベース講習会:AJACS番町3 2019/08/07 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
ChIP-Atlas: 既報ChIP-seqデータの統合データベース[招待あり] ChIP-Atlas: 既報ChIP-seqデータの統合データベース [招待あり] 日本プロテオーム学会2019年大会 日本プロテオーム学会2019年大会 2019/07/26 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータの統合解析[招待あり] 公共ChIP-seqデータの統合解析 [招待あり] 京都大学 セミナー 京都大学 セミナー 2019/06/25 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータの利活用術[招待あり] 公共ChIP-seqデータの利活用術 [招待あり] 国立精神・神経医療研究センター セミナー 国立精神・神経医療研究センター セミナー 2019/06/25 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
ChIP-Atlas の使い方とその応用[招待あり] ChIP-Atlas の使い方とその応用 [招待あり] 資生堂 セミナー 資生堂 セミナー 2019/05/22 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
薬効の作用点となる転写因子の特定と創薬への応用[招待あり] 薬効の作用点となる転写因子の特定と創薬への応用 [招待あり] 日本たばこ医薬総合研究所 セミナー 日本たばこ医薬総合研究所 セミナー 2019/05/16 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
ChIP-Atlas の使い方とその応用 ChIP-Atlas の使い方とその応用 協和発酵キリン セミナー 協和発酵キリン セミナー 2019/03/26 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明や創薬に挑む[招待あり] 公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明や創薬に挑む [招待あり] 質量分析インフォマティクス研究会 質量分析インフォマティクス研究会 2019/03/19 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data[招待あり] ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data [招待あり] ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data [招待あり] Lecture in College of Dentistry, Yonsei University Lecture in College of Dentistry, Yonsei University Lecture in College of Dentistry, Yonsei University 2019/03/13 英語 公開講演、セミナー、チュートリアル、講習、講義 公開
公共ChIP-seqデータの利活用術[招待あり] 公共ChIP-seqデータの利活用術 [招待あり] 新潟大学 セミナー 新潟大学 セミナー 2019/03/04 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータの利活用術[招待あり] 公共ChIP-seqデータの利活用術 [招待あり] 産総研 セミナー 産総研 セミナー 2019/02/20 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータの利活用術[招待あり] 公共ChIP-seqデータの利活用術 [招待あり] 全薬工業 セミナー 全薬工業 セミナー 2019/01/23 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータの利活用術[招待あり] 公共ChIP-seqデータの利活用術 [招待あり] 創価大学 セミナー 創価大学 セミナー 2019/01/18 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータの利活用術[招待あり] 公共ChIP-seqデータの利活用術 [招待あり] 東京理科大学 セミナー 東京理科大学 セミナー 2019/01/17 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む[招待あり] 公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む [招待あり] 北里大学 セミナー 北里大学 セミナー 2019/01/11 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む[招待あり] 公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む [招待あり] JSBi 九州部会 JSBi 九州部会 2018/12/17 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
医工学研究ビッグデータのデーターベース構築と活用[招待あり] 医工学研究ビッグデータのデーターベース構築と活用 [招待あり] 東京大学 工学系研究科 医工学概論 東京大学 工学系研究科 医工学概論 2018/12/14 日本語 公開講演、セミナー、チュートリアル、講習、講義 公開
ChIP-Atlas: 既報のChIP-seqデータをフル活用できる[招待あり] ChIP-Atlas: 既報のChIP-seqデータをフル活用できる [招待あり] 統合データベース講習会:AJACS町田 統合データベース講習会:AJACS町田 2018/12/14 日本語 公開講演、セミナー、チュートリアル、講習、講義 公開
公共ChIP-seqデータと疾患関連SNPの統合解析[招待あり] 公共ChIP-seqデータと疾患関連SNPの統合解析 [招待あり] 第41回日本分子生物学会年会 第41回日本分子生物学会年会 2018/11/28 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む[招待あり] 公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む [招待あり] 第16回JCGGシンポジウム 第16回JCGGシンポジウム 2018/11/27 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data[招待あり] ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data [招待あり] ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data [招待あり] Research collaborating meeting on "Molecular mechanism of tooth development and regeneration" Research collaborating meeting on "Molecular mechanism of tooth development and regeneration" Research collaborating meeting on "Molecular mechanism of tooth development and regeneration" 2018/11/17 英語 口頭発表(招待・特別) 公開
ChIP-seqとプロテオーム:公共データをつないで使う[招待あり] ChIP-seqとプロテオーム:公共データをつないで使う [招待あり] トーゴーの日シンポジウム2018 トーゴーの日シンポジウム2018 2018/10/05 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共 ChIP-seq データをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む[招待あり] 公共 ChIP-seq データをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む [招待あり] 九州工業大学 セミナー 九州工業大学 セミナー 2018/09/07 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions Towards Understanding “INDIVIDUALITY” Towards Understanding “INDIVIDUALITY” Towards Understanding “INDIVIDUALITY” Towards Understanding “INDIVIDUALITY” 2018/07/24 英語 ポスター発表 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む[招待あり] 公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む [招待あり] 岩手医科大学 歯学研究科 基礎・臨床教育特論 共通セミナー 岩手医科大学 歯学研究科 基礎・臨床教育特論 共通セミナー 2018/07/20 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む[招待あり] 公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む [招待あり] 医薬基盤・健康・栄養研究所 セミナー 医薬基盤・健康・栄養研究所 セミナー 2018/04/17 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions Keystone Symposium; Gene Control in Development and Disease Keystone Symposium; Gene Control in Development and Disease 2018/03/24 ポスター発表 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む[招待あり] 公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む [招待あり] 第17回日本再生医療学会総会 第17回日本再生医療学会総会 2018/03/21 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む[招待あり] 公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む [招待あり] 旭川医科大学 セミナー 旭川医科大学 セミナー 2018/03/12 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む[招待あり] 公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む [招待あり] 慶應義塾大学 セミナー 慶應義塾大学 セミナー 2018/01/30 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータのフル活用術〜組織特異的エンハンサーと遺伝性疾患の解析〜[招待あり] 公共ChIP-seqデータのフル活用術〜組織特異的エンハンサーと遺伝性疾患の解析〜 [招待あり] 東京農業大学 セミナー 東京農業大学 セミナー 2018/01/23 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータのフル活用術〜組織特異的エンハンサーと遺伝性疾患の解析〜[招待あり] 公共ChIP-seqデータのフル活用術〜組織特異的エンハンサーと遺伝性疾患の解析〜 [招待あり] 岩手医科大学 セミナー 岩手医科大学 セミナー 2018/01/18 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む 公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む 第4回 包括的神経グリア研究会 第4回 包括的神経グリア研究会 2018/01/07 日本語 口頭発表(一般) 公開
ChIP-Atlas: Make full use of public ChIP-seq data. ChIP-Atlas: Make full use of public ChIP-seq data. CREST ミーティング「離散構造統計学の創出と癌科学への展開」 CREST ミーティング「離散構造統計学の創出と癌科学への展開」 2017/12/22 日本語 口頭発表(一般) 公開
生命科学のデータベース活用法フォーラム ChIP-Atlas 生命科学のデータベース活用法フォーラム ChIP-Atlas ConBio 2017 ConBio 2017 2017/12/09 日本語 口頭発表(一般) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む 公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む ConBio 2017 ConBio 2017 2017/12/07 日本語 口頭発表(一般) 公開
公共ChIP-seqデータのフル活用術[招待あり] 公共ChIP-seqデータのフル活用術 [招待あり] 新学術領域「個性創発脳」若手の会・技術支援講習会 新学術領域「個性創発脳」若手の会・技術支援講習会 2017/11/21 日本語 口頭発表(一般) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む 公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む 名古屋大学 医学系研究科 セミナー 名古屋大学 医学系研究科 セミナー 2017/11/13 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充 エピゲノミクス統合データベースの開発と機能拡充 トーゴーの日シンポジウム2017 トーゴーの日シンポジウム2017 2017/10/05 日本語 口頭発表(一般) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む[招待あり] 公共ChIP-seqデータをフル活用し遺伝性疾患の解明に挑む [招待あり] 大阪大学生命機能研究科 セミナー 大阪大学生命機能研究科 セミナー 2017/09/07 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータのフル活用術 (組織特異的エンハンサーと遺伝性疾患の解析)[招待あり] 公共ChIP-seqデータのフル活用術 (組織特異的エンハンサーと遺伝性疾患の解析) [招待あり] 徳島大学藤井節郎記念医科学センター セミナー 徳島大学藤井節郎記念医科学センター セミナー 2017/08/28 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共 ChIP-seq データのフル活用術 公共 ChIP-seq データのフル活用術 第2回次世代生命科学の研究会 第2回次世代生命科学の研究会 2017/07/14 日本語 口頭発表(一般) 公開
公共ChIP-seqデータのフル活用術 公共ChIP-seqデータのフル活用術 新学術領域「個性創発脳」第2回領域会議 新学術領域「個性創発脳」第2回領域会議 2017/07/07 日本語 ポスター発表 公開
公共 ChIP-seq データのフル活用術[招待あり] 公共 ChIP-seq データのフル活用術 [招待あり] 東京大学 医学系研究科 セミナー 東京大学 医学系研究科 セミナー 2017/07/06 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共 ChIP-seq データで遺伝性疾患の解明に挑む 公共 ChIP-seq データで遺伝性疾患の解明に挑む NGS現場の会第五回研究会 NGS現場の会第五回研究会 2017/05/22 日本語 口頭発表(一般) 公開
Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions Integrative analysis of transcription factor occupancy at enhancers and disease risk loci in noncoding genomic regions 50th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists 50th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists 2017/05/11 英語 口頭発表(一般) 公開
公共ChIP-seq データの網羅的かつ統合的な解析[招待あり] 公共ChIP-seq データの網羅的かつ統合的な解析 [招待あり] 東京医科歯科大学 セミナー 東京医科歯科大学 セミナー 2017/03/17 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む[招待あり] 公共ChIP-seqデータをフル活用し、遺伝性疾患の解明に挑む [招待あり] 先端医療センター研究所 セミナー 先端医療センター研究所 セミナー 2017/03/13 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
既報の ChIP-seq データの利活用術 既報の ChIP-seq データの利活用術 第4回 発生における代謝を考える会 第4回 発生における代謝を考える会 2017/02/21 日本語 口頭発表(一般) 公開
The transcription factor landscape decodes the enhancers and risk variants in non-coding regions The transcription factor landscape decodes the enhancers and risk variants in non-coding regions The transcription factor landscape decodes the enhancers and risk variants in non-coding regions Keystone Symposium; Epigenetics and Human Disease: Progress from Mechanisms to Therapeutics Keystone Symposium; Epigenetics and Human Disease: Progress from Mechanisms to Therapeutics Keystone Symposium; Epigenetics and Human Disease: Progress from Mechanisms to Therapeutics 2017/01/30 英語 口頭発表(一般) 公開
ChIP-seq 統合データベースの紹介と non-coding GWAS SNP の解析[招待あり] ChIP-seq 統合データベースの紹介と non-coding GWAS SNP の解析 [招待あり] 国立がんセンター セミナー 国立がんセンター セミナー 2017/01/25 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
既報のChIP-seqデータの活用術[招待あり] 既報のChIP-seqデータの活用術 [招待あり] 第1回 「個性」創発脳 領域会議 第1回 「個性」創発脳 領域会議 2016/12/17 日本語 公開講演、セミナー、チュートリアル、講習、講義 公開
網羅的かつ統合的な ChIP-seq データの解析 網羅的かつ統合的な ChIP-seq データの解析 第39回日本分子生物学会年会 第39回日本分子生物学会年会 2016/12/01 日本語 シンポジウム・ワークショップパネル(公募) 公開
DDBJデータ解析事例「ChIP-Atlasデータベース」の紹介[招待あり] DDBJデータ解析事例「ChIP-Atlasデータベース」の紹介 [招待あり] DDBJデータ解析チャレンジ キックオフ講習会 DDBJデータ解析チャレンジ キックオフ講習会 2016/07/06 日本語 公開講演、セミナー、チュートリアル、講習、講義 公開
既報のChIP-seqデータをフル活用する 網羅的かつ統合的なデータベースの作成とその解析例[招待あり] 既報のChIP-seqデータをフル活用する 網羅的かつ統合的なデータベースの作成とその解析例 [招待あり] CiRA セミナー CiRA セミナー 2016/04/20 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Comprehensive and integrative database and analysis of published ChIP-seq data[招待あり] Comprehensive and integrative database and analysis of published ChIP-seq data [招待あり] Comprehensive and integrative database and analysis of published ChIP-seq data [招待あり] 横浜理研セミナー 横浜理研セミナー 横浜理研セミナー 2016/04/11 英語 口頭発表(招待・特別) 公開
ChIP-Atlas: Comprehensive and integrative database for visualizing and mining all published ChIP-seq data. ChIP-Atlas: Comprehensive and integrative database for visualizing and mining all published ChIP-seq data. ChIP-Atlas: Comprehensive and integrative database for visualizing and mining all published ChIP-seq data. SYSTEMS BIOLOGY: GLOBAL REGULATION OF GENE EXPRESSION SYSTEMS BIOLOGY: GLOBAL REGULATION OF GENE EXPRESSION SYSTEMS BIOLOGY: GLOBAL REGULATION OF GENE EXPRESSION 2016/03/17 英語 ポスター発表 公開
既報の ChIP-seq データの統合解析 既報の ChIP-seq データの統合解析 個体パターニング研究会 個体パターニング研究会 2016/03/11 日本語 口頭発表(一般) 公開
ChIP−seq SRAの統合的可視化とバイオデータベースとの連携[招待あり] ChIP−seq SRAの統合的可視化とバイオデータベースとの連携 [招待あり] 統合化推進プログラム 統合データ解析トライアル 平成27年度研究成果報告会 統合化推進プログラム 統合データ解析トライアル 平成27年度研究成果報告会 2016/03/10 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
既報のChIP-seqデータをフル活用するための統合データベース 既報のChIP-seqデータをフル活用するための統合データベース 第38回日本分子生物学会年会 第38回日本分子生物学会年会 2015/12/01 日本語 口頭発表(一般) 公開
ChIP-seq データベースのためのメタ情報アノテーション[招待あり] ChIP-seq データベースのためのメタ情報アノテーション [招待あり] Annotathon 2015 Annotathon 2015 2015/11/12 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
既報のChIP-seqデータをフル活用するための統合データベース 既報のChIP-seqデータをフル活用するための統合データベース トーゴーの日シンポジウム2015 トーゴーの日シンポジウム2015 2015/10/05 日本語 ポスター発表 公開
既報のChIP-seqデータをフル活用するための統合データベース 既報のChIP-seqデータをフル活用するための統合データベース 生命情報科学若手の会 第7回研究会 生命情報科学若手の会 第7回研究会 2015/10/01 日本語 ポスター発表 公開
ChIP-seq SRA を利活用するための統合データベース ChIP-seq SRA を利活用するための統合データベース NGS現場の会第四回研究会 NGS現場の会第四回研究会 2015/07/01 日本語 ポスター発表 公開
Comprehensive database for visualizing all published ChIP-seq data Comprehensive database for visualizing all published ChIP-seq data Comprehensive database for visualizing all published ChIP-seq data 48th Annual Meeting of JSDB 48th Annual Meeting of JSDB 48th Annual Meeting of JSDB 2015/06/02 英語 口頭発表(一般) 公開
誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール 定量性物の会 第7回年会 定量性物の会 第7回年会 2015/01/11 日本語 ポスター発表 公開
既報のChIP-seq データを超簡単に可視化する方法[招待あり] 既報のChIP-seq データを超簡単に可視化する方法 [招待あり] 遺伝研セミナー 遺伝研セミナー 2014/12/22 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
SraTailor: 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール SraTailor: 誰でも使えるChIP-seqデータの可視化ツール 第37回日本分子生物学会年会 第37回日本分子生物学会年会 2014/11/25 日本語 ポスター発表 公開
How to visualize published ChIP-seq raw data.[招待あり] How to visualize published ChIP-seq raw data. [招待あり] How to visualize published ChIP-seq raw data. [招待あり] CDB seminar CDB seminar CDB seminar 2014/07/23 英語 口頭発表(招待・特別) 公開
SraTailor: GUI software for visualizing high-throughput sequence read archives SraTailor: GUI software for visualizing high-throughput sequence read archives SraTailor: GUI software for visualizing high-throughput sequence read archives 47th Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists 47th Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists 47th Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists 2014/05/27 英語 口頭発表(一般) 公開
Development of a GUI software to visualize high through-put sequence read archives Development of a GUI software to visualize high through-put sequence read archives 第36回日本分子生物学会年会 第36回日本分子生物学会年会 2013/12/03 日本語 ポスター発表 公開
既報の次世代シーケンサ解析データを可視化するための簡易ソフトウェア 既報の次世代シーケンサ解析データを可視化するための簡易ソフトウェア 定量生物学の会 第六回年会 定量生物学の会 第六回年会 2013/11/22 日本語 ポスター発表 公開
Development of a Mac GUI Application to Visualize Published Raw ChIP-seq data Development of a Mac GUI Application to Visualize Published Raw ChIP-seq data Development of a Mac GUI Application to Visualize Published Raw ChIP-seq data The 61st NIBB Conference Cellular Community in Mammalian Embryogenesis The 61st NIBB Conference Cellular Community in Mammalian Embryogenesis The 61st NIBB Conference Cellular Community in Mammalian Embryogenesis 2013/07/10 英語 ポスター発表 公開
マウス初期発生におけるFgfシグナルの役割 −化学的阻害剤を用いた高時間分解能解析− マウス初期発生におけるFgfシグナルの役割 −化学的阻害剤を用いた高時間分解能解析− 43rd Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists 43rd Annual Meeting for the Japanese Society of Developmental Biologists 2010/06/21 日本語 ポスター発表 公開
Sulfated glycosaminoglycans are required for gastrulation, cell fate decision, and left-right axis formation in mouse embryo Sulfated glycosaminoglycans are required for gastrulation, cell fate decision, and left-right axis formation in mouse embryo Sulfated glycosaminoglycans are required for gastrulation, cell fate decision, and left-right axis formation in mouse embryo 5th Global COE International Symposium 5th Global COE International Symposium 5th Global COE International Symposium 2010/02/24 英語 口頭発表(一般) 公開
inv変異マウス胚の左右軸逆転はノードのNodalシグナルの異常が原因である inv変異マウス胚の左右軸逆転はノードのNodalシグナルの異常が原因である 日本分子生物学会 日本分子生物学会 2009/12/01 日本語 ポスター発表 公開
マウス胚左右軸形成において,ノードから左側板中胚葉へのNodal シグナル伝達には硫酸化グリコサミノグリカンが必要である マウス胚左右軸形成において,ノードから左側板中胚葉へのNodal シグナル伝達には硫酸化グリコサミノグリカンが必要である 第40回発生生物学会 第40回発生生物学会 2007/05/01 日本語 ポスター発表 公開
ノードのNodalは側板中胚葉の左右軸決定に必要である ノードのNodalは側板中胚葉の左右軸決定に必要である 日本発生生物学会 日本発生生物学会 2003/06/01 日本語 公開

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タイトル言語:
産業財産権 (特許)
発明者 発明者(日本語) 発明者(英語) 発明の名称 発明の名称(日本語) 発明の名称(英語) 審査の段階 番号 年月 公開
沖真弥, 大川恭行 沖真弥, 大川恭行 オリゴヌクレオチド、オミクス解析方法及びオミクス解析用キット オリゴヌクレオチド、オミクス解析方法及びオミクス解析用キット 特許出願 特願2019-094216 2019/05/20 公開
タイトル言語:
学術賞等
賞の名称(日本語) 賞の名称(英語) 授与組織名(日本語) 授与組織名(英語) 年月
DBCLS Open Science Award DBCLS Open Science Award DBCLS DBCLS 2015/03/
担当科目
講義名(日本語) 講義名(英語) 開講期 学部/研究科 年度
ゲノムインフォマティクス Genome Informatics 後期 医学研究科 2020/04〜2021/03