古賀 章彦

Last Update: 2017/10/12 09:28:23

Print

Name(Kanji/Kana/Abecedarium Latinum)
古賀 章彦/コガ アキヒコ/Akihiko Koga
Primary department(Org1/Org2/Org3/Job title)
霊長類研究所/ゲノム細胞研究部門/教授
Affiliated programs (koza)
Org1 Org2 Org3 Job title
理学研究科 生物科学専攻 霊長類学講座 教授
Contact address
Type Address(Japanese) Address(English)
Office 〒484-8506 愛知県犬山市官林41−2 41-2 Kanrin, Inuyama City 484-8506, Japan
Phone
Type Number
Office 0568 63 0526
E-mail address
koga.akihiko.5n @ kyoto-u.ac.jp
Affiliated academic organization(s) (Japanese)
Organization name(Japanese) Organization name(English)
日本遺伝学会 Genetics Society of Japan
日本分子生物学会 Molecular Biology Society of Japan
日本進化学会 Society for Evolutionary Studies, Japan
日本霊長類学会 Primatology Society of Japan
Academic degree
Field(Japanese) Field(English) University(Japanese) University(English) Method
理学修士 九州大学
理学博士 九州大学
Graduate school
University(Japanese) University(English) Faculty(Japanese) Faculty(English) Major(Japanese) Major(English) Degree
九州大学 大学院理学研究科修士課程生物学専攻 修了
九州大学 大学院理学研究科博士後期課程生物学専攻 修了
University
University(Japanese) University(English) Faculty(Japanese) Faculty(English) Major(s)(Japanese) Major(s)(English) Degree
九州大学 理学部生物学科 卒業
Work Experience
Period Organization(Japanese) Organization(English) Job title(Japanese) Job title(English)
1987/04/-1989/03/ 日本学術振興会 特別研究員
1989/04/-1990/09/ ワシントン大学 医学部 博士研究員
1990/10/-1993/03/ 広島大学 総合科学部 助手
1993/04/-1996/03/ 名古屋大学 理学部 助手
1996/04/-2005/03/ 名古屋大学 理学部 助教授
2005/04/-2008/09/ 名古屋大学 大学院理学研究科 准教授
2008/10/- 京都大学 霊長類研究所 教授
Personal Profile
(Japanese)
霊長類研究所には大学院(京都大学・大学院理学研究科・生物科学専攻を構成)があります。修士(理学)、博士(理学)の学位取得が可能です。大学院入学または進学を検討中で、古賀の研究テーマ、あるいは類似の研究テーマに興味がある方は、古賀へメール等でご連絡ください。これまでに霊長類や哺乳類を扱った経験を問わず、歓迎します。
Research Topics
(Japanese)
ゲノムを構成するDNAのうち、反復配列に焦点を当てて、機能・進化・由来等を調べています。現在の具体的な研究テーマとしては、[1]夜行性哺乳類の夜間視力増強をもたらす反復DNA、[2]目の不合理な構造の謎を進化の観点から追求、[3]高い知能に関連する可能性のある反復DNA、[4]トランスポゾンが遺伝情報一般を水平に運ぶ可能性。
Overview of your research
(Japanese)
各項目の概要です。  [1]夜行性哺乳類の夜間視力増強をもたらす反復DNA:中南米の森に棲み、昼行性から夜行性に短期間に移行した、ヨザル(漢字では夜猿)。移行に伴い、光を効率よく集めて夜間視力を増強する仕組みが、不完全ではあるが視細胞に復活している。この復活はどのような過程で進むのか。他の霊長類(たとえばヒト)でも、環境が変われば同様のことが起こる可能性はあるか。  [2]目の不合理な構造の謎を進化の観点から追求:脊椎動物の目では、視細胞の最奥部で光を受容する。電気信号を脳に送る神経突起は前方にある。間には細胞核もある。光が散逸するので、これは不合理な構造といえる。発生での制約が原因であるとの説明が、なされてはいる。しかし、目を獲得した当時の脊椎動物の生息環境を考慮すると、じつはこちらの方が合理的であるという解釈が可能。この可能性はどのくらいか。  [3]高い知能に関連する可能性のある反復DNA:中南米原産のオマキザルは、介助犬ならぬ介助猿の役が期待されるほどに、知能が高い。このオマキザルには特有の反復DNAがあり、その形状は、類人猿がもつ反復DNAに類似している。この反復DNAが知能に関与している可能性はあるか。  [4]トランスポゾンが遺伝情報一般を水平に運ぶ可能性:トランスポゾン(転移性遺伝因子)の水平伝播(生殖を介さない移動)の証拠が増加している。これから、トランスポゾンが種々の遺伝情報を合わせて水平に運ぶのは、一般的な現象ではないかと、考えた。この可能性を追求する。
Fields of research (key words)
Key words(Japanese) Key words(English)
分子進化学 Molecular evolution
分子遺伝学 Molecular genetics
ゲノム構造 Genome structure
Published Papers > Published Papers
(文系研究者の一般的な論文集への寄稿や単行本の分担執筆などは「著書等」を参照してください)
Authors Title Bibliography Date Peer-Review Language
Inoue Y, Saga T, Aikawa T, Kumagai M, Shimada A, Kawaguchi K, Naruse K, Morishita S, Koga A, *Takeda H (2017) [doi: 10.1038/s41467-017-00527-2] Complete fusion of a transposon and herpesvirus created the Teratorn mobile element in medaka fish(トランスポゾンとヘルペスウイルスの融合でメダカの転移因子 Teratorn が形成された) Nature Communications,8,551 2017/09 Refereed English
Ishiyama S Yamazaki K, Kurihara F, Yamashita D, Sao K, Hattori A, *Koga A (2017) [doi: https://doi.org/10.1016/j.genrep.2017.08.004] DNA-based transposable elements with nucleotide sequence similar to Tol2 from medaka fish are prevalent in cyprinid fishes(メダカの Tol2 因子と類似の塩基配列をもつDNAトランスポゾンがコイ科に広く分布している) Gene Repors,9,37-45 2017/09 Refereed English
*Koga A, Tanabe H, Hirai Y, Imai H, Imamura M, Oishi T, Stanyon R, Hirai H (2017) [doi: 10.1093/gbe/evx142] Co-opted megasatellite DNA drives evolution of secondary night vision in Azara's owl monkey(夜猿は新しい大規模反復DNAを利用して夜間視力を二次的に獲得した) Genome Biology and Evolution,9,7,1963-1970 2017/07 Refereed English
*Hirai H, Hirai Y, Morimoto M, Kaneko A, Kamanaka Y, Koga A (2016) [doi: 10.1093/gbe/evx058] Night monkey hybrids exhibit de novo genomic and karyotypic alterations: the first such case in primates(夜猿の交雑個体に生じたゲノムおよび核型の新規変異:霊長類での初めての例) Genome Biology and Evolution,9,4,945-955 2017/04 Refereed English
Irie M, Koga A, *Kaneko-Ishino T, *Ishino F (2016) [doi: 10.3389/fchem.2016.00026] An LTR retrotransposon-derived gene displays lineage-specific structural and putative species-specific functional variations in eutherians(レトロトランスポゾン由来の遺伝子が真獣類で系統特異的な構造変異を示し種特異的な機能変異もあると推測される) Frontiers in Chemistry,4,26 2016/06 Refereed English
Kugou K, Hirai H, *Masumoto H, *Koga A (2016) [doi: 10.1038/srep27833] Formation of functional CENP-B boxes at diverse locations in repeat units of centromeric DNA in New World monkeys.(CENP-B box が新世界ザルではセントロメア反復配列の異なる多くの場所に生じている) Scientific Reports,13,6,27833 2016/03 Refereed English
Suntronpong A, Kugou K, Masumoto H, Srikulnath K, Ohshima K, Hirai H, *Koga A (2016) [doi: 10.1098/rsbl.2015.0817] CENP-B box, a nucleotide motif involved in centromere formation, occurs in a New World monkey(セントロメア形成に関与するシグナル CENP-B box が新世界ザルに存在する) Biology Letters,12,3,20150817 2015/08 Refereed English
Sujiwattanarat P, Thapana W, Srikulnath K, Hirai Y, Hirai H, *Koga A (2015) [doi: 10.1038/srep10315] Higher-order repeat structure in alpha satellite DNA occurs in New World monkeys and is not confined to hominoids(アルファサテライトDNAの高次構造は新世界ザルにもありヒト上科に限定されない) Scientific Reports,5,10315 2015/05 Refereed English
Takeuchi M, Matsuda K, Yamaguchi S, Asakawa K, Miyasaka N, Lal P, Yoshihara Y, Koga A, Kawakami K, Shimizu T, *Hibi M (2015) [doi.org/10.1016/j.ydbio.2014.09.030] Establishment of Gal4 transgenic zebrafish lines for analysis of development of cerebellar neural circuitry(小脳神経回路の発生の解析に有用な遺伝子導入ゼブラフィッシュ系統の確立) Developmental Biology,397,1,1-17 2015/01 Refereed English
Thapana W, Sujiwattanarat P, Srikulnath K, Hirai H, *Koga A (2014) [doi: org/10.1017/S0016672314000172] Reduction in the structural instability of cloned eukaryotic tandem-repeat DNA by low-temperature culturing of host bacteria(低温での培養は反復配列クローンの崩壊の軽減をもたらす) Genetics Research,96,e13 2014/10 Refereed English
Baicharoen S, Miyabe-Nishiwaki T, Arsaithamkul V, Hirai Y, Duangsa-ard K, Siriaroonrat B, Domae H, Srikulnath K, Koga A, *Hirai H (2014) [doi: 10.1371/journal.pone.0109151] Locational diversity of alpha satellite DNA and intergeneric hybridization aspects in the Nomascus and Hylobates genera of small apes(テナガザル科 Nomascus 属と Hylobates 属でのアルファサテライトDNAの所在の変化および属間雑種での様相) PLOS ONE,9,10,e109151 2014/09 Refereed English
*Koga A, Hirai Y, Terada S, Jahan I, Baicharoen S, Arsaithamkul V, Hirai H (2014) [doi: 10.1093/dnares/dsu005] Evolutionary origin of higher-order repeat structure in alpha-satellite DNA of primate centromeres(霊長類のセントロメア反復配列にみられる高次構造の進化的起源) DNA Research,21,4,407-415 2014/08 Refereed English
Choi Y, Jung YD, Ayarpadikannan S, Koga A, Imai H, Hirai H, Roos C,*Kim HS (2014) [doi: 10.1139/gen-2014-0065] Novel variable number of tandem repeats of gibbon MAOA gene and its evolutionary significance.(テナガザル MAOA 遺伝子にみられる新規反復配列とその進化的意義) Genome,57,8,427-432 2014/08 Refereed English
Watanabe K, Koga H, Nakamura K, Fujita A, Hattori A, Matsuda M, *Koga A (2014) [doi: 10.1139/gen-2014-0011] Spontaneous germline excision of Tol1, a DNA-based transposable element naturally occurring in the medaka fish genome.(メダカの内在性トランスポゾン Tol1 の生殖系列での切り出し) Genome,57,4,193-199 2014/04 Refereed English
Chaiprasertsri N, Uno Y, Peyachoknagul S, Prakhongcheep O, Baicharoen S, Charernsuk S, Nishida C, Matsuda Y, Koga A, *Srikulnath K (2013) [doi: 10.1093/jhered/est061] Highly species-specific centromeric repetitive DNA sequences in lizards: molecular cytogenetic characterization of a novel family of satellite DNA sequences isolated from the water monitor lizard (Varanus salvator macromaculatus, Platynota)(トカゲにみられる種特異的なセ Journal of Heredity,104,6,798-806 2013/11 Refereed English
Terada S, Hirai Y, Hirai H, *Koga A (2013) [doi: 10.1038/jhg.2013.87] Higher-order repeat structure in alpha satellite DNA is an attribute of hominoids rather than hominids(アルファサテライトDNAの高次構造はヒト科に限定されずヒト上科に広くみられる) Journal of Human Genetics,58,11,752-754 2013/11 Refereed English
Prakhongcheep O, Chaiprasertsri N, Terada S, Hirai Y, Srikulnath K, Hirai H, *Koga A (2013) [doi: 10.1093/dnares/dst023] Heterochromatin blocks constituting the entire short arms of acrocentric chromosomes of Azara's owl monkey: formation processes inferred from chromosomal locations(ヨザルのアクロセントリック染色体短腕を構成するヘテロクロマチン:染色体上の配置から推測される形成過程) DNA Research,20,5,461-470 2013/10 Refereed English
Prakhongcheep O, Hirai Y, Hara T, Srikulnath K, Hirai H, *Koga A (2013) [doi: 10.1093/dnares/dst004] Two types of alpha satellite DNA in distinct chromosomal locations in Azara's owl monkey(ヨザルの染色体上で異なる部位に存在する2種類のアルファサテライトDNA) DNA Research,20,3,235-240 2013/06 Refereed English
Hara T, Hirai Y, Jahan I, Hirai H, *Koga A (2012) [doi:10.1038/jhg.2012.107] Tandem repeat sequences evolutionarily related to SVA-type retrotransposons are expanded in the centromere region of the western hoolock gibbon, a small ape(類人猿のフーロックテナガサルのセントロメア近辺でSVAレトロトランスポゾンに関連した縦列反復配列が増幅している) Journal of Human Genetics,57,12,760-765 2012/12 Refereed English
Baicharoen S, Arsaithamkul V, Hirai Y, Hara T, Koga A, *Hirai H (2012) [doi: 10.1139/gen-2012-0123] In situ hybridization analysis of gibbon chromosomes suggests that amplification of alpha satellite DNA in the telomere region is confined to two of the four genera(テロメア領域でアルファサテライトDNAが増幅する現象はテナガザル科4属のうち2属のみで起こっていると推測される) Genome,55,11,809-812 2012/11 Refereed English
Koga A, Hirai Y, Hara T, *Hirai H (2012) [doi: 10.1038/hdy.2012.28] Repetitive sequences originating from the centromere constitute large-scale heterochromatin in the telomere region in the siamang, a small ape(類人猿フクロテナガザルで、セントロメアに由来する反復配列がテロメアで大規模ヘテロクロマチンを形成している) Heredity,109,3,180-187 2012/09 Refereed English
*Koga A (2012) [doi: 10.1139/G11-088] Under-representation of repetitive sequences in whole-genome shotgun sequence databases: an illustration using a recently acquired transposable element(反復配列はホールゲノムショットガン塩基配列データベースには過小に反映されている:ゲノムに最近侵入したトランスポゾンを用いての例証) Genome,55,2,172-175 2012/02 Refereed English
Hara T, Hirai Y, Baicharoen S, Hayakawa T, Hirai H, *Koga A (2012) [doi: org/10.1266/ggs.87.181] A novel composite retrotransposon derived from or generated independently of the SVA (SINE/VNTR/Alu) transposon has undergone proliferation in gibbon genomes(SVAトランスポゾンからの派生または類似の機構で別に生じたと考えられる新規のレトロトランスポゾンが、テナガザルのゲノムで増幅している) Genes & Genetic Systems,87,3,181-190 2012 Refereed English
*Koga A, Sasaki S, Naruse K, Shimada A, Sakaizumi M (2011) [doi: org/10.1017/S0016672310000479] Occurrence of a short variant of the Tol2 transposable element in natural populations of the medaka fish.(メダカの自然集団での短い Tol2 因子の生起) Genetics Research,93,1,13-21 2011/02 Refereed English
Koga A, Notohara M, *Hirai H (2011) [doi: 10.1007/s10709-010-9534-0] Evolution of subterminal satellite (StSat) repeats in hominids(ヒト科での染色体次端部反復配列の進化) Genetica,139,2,167-175 2011/02 Refereed English
*Koga A, Wakamatsu Y, Sakaizumi M, Hamaguchi S, Shimada A(2009) [doi: org/10.1266/ggs.84.345] Distribution of complete and defective copies of the Tol1 transposable element in natural populations of the medaka fish Oryzias latipes.(完全型および欠損型 Tol1 因子のメダカの自然集団での分布) Genes & Genetic Systems,84,5,345-352 2009/10 Refereed English
*Hashimoto H, Miyamoto R, Watanabe N, Shiba D, Ozato K, Inoue C, Kubo Y, Koga A, Jindo T, Narita T, Naruse K, Ohishi K, Nogata K, Shin-I T, Asakawa S, Shimizu N, Miyamoto T, Mochizuki T, Yokoyama T, Hori H, Takeda H, Kohara Y, Wakamatsu Y (2009) [doi: org/10.1371/journal.pone.0006299] Polycystic kidney disease in the medaka (Oryzias latipes) pc mutant caused by a mutation in the Gli-Similar3 (glis3) gene.Gli-Similar3.(遺伝子の変異が原因となっているメダカの多嚢胞性腎) PLOS ONE,4,7,e6299 2009/07 Refereed English
Koga A, Cheah FS, Hamaguchi S, Yeo GH, *Chong SS (2008) [doi: 10.1002/dvdy.21688] Germline transgenesis of zebrafish using the medaka Tol1 transposon system.(メダカの Tol1 因子を利用したゼブラフィッシュ生殖系列への遺伝子導入) Developmental Dynamics,237,9,2466-2474 2008/09 Refereed English
Kodama K, Takagi S, *Koga A (2008) [doi: 10.1038/hdy.2008.47] The Tol1 element of the medaka fish, a member of the hAT transposable element family, jumps in Caenorhabditis elegans.(hAT ファミリーの転移因子であるメダカの Tol1 因子は線虫で転移する) Heredity,101,3,222-227 2008/06 Refereed English
Hikosaka A, *Koga A (2007) [doi: org/10.1017/S0016672307008889] PCR detection of excision suggests mobility of the medaka fish Tol1 transposable element in the frog Xenopus laevis. (PCR を用いた切り出しの検出から、メダカの Tol1 因子がカエルで転移することが推察される) Genetical Research,89,4,201-206 2007/08 Refereed English
*Koga A, Higashide I, Hori H, Wakamatsu Y, Kyono-Hamaguchi Y, Hamaguchi S (2007) [doi: 10.1007/s10038-007-0213-7] The Tol1 element of medaka fish is transposed with only terminal regions and can deliver large DNA fragments into the chromosomes. (メダカの Tol1 因子は末端部のみで転移し、長いDNA断片を染色体に組み込むことができる) Journal of Human Genetics,52,12,1026-1030 2007/08 Refereed English
*Koga A, Shimada A, Kuroki T, Hori H, Kusumi J, Kyono-Hamaguchi Y, Hamaguchi S (2007) [doi:10.1007/s10038-007-0161-2] The Tol1 transposable element of the medaka fish moves in human and mouse cells.(メダカの Tol1 因子はヒトとマウスの細胞で転移する) Journal of Human Genetics,52,7,628-635 2007/06 Refereed English
*Koga A, Iida A, Hori H, Shimada A, Shima A (2006) [doi: 10.1093/molbev/msl003] Vertebrate DNA transposon as a natural mutator: the medaka fish Tol2 element contributes to genetic variation without recognizable traces.(脊椎動物での自然突然変異原としての転移因子:メダカの Tol2 因子は痕跡を残さずに遺伝的変異を供給する) Molecular Biology and Evolution,23,7,1414-1419 2006/07 Refereed
Iida A, Shimada A, Shima A, Takamatsu N, Hori H, Takeuchi K, *Koga A (2006) [doi: org/10.1017/S0016672306008184] Targeted reduction of the DNA methylation level with 5-azacytidine promotes excision of the medaka fish Tol2 transposable element.(人為的にメチル化を低下させるとメダカの Tol2 因子のエクシジョンが活発になる) Genetical Research,87,3,187-193 2006/06 Refereed
Tsutsumi M, Imai S, Kyono-Hamaguchi Y, Hamaguchi S, Koga A, *Hori H (2006) [doi: 10.1111/j.1600-0749.2006.00300.x] Color reversion of the albino medaka fish associated with spontaneous somatic excision of the Tol-1 transposable element from the tyrosinase gene.(転移因子 Tol1 の切り出しで生じるアルビノメダカの野生型体色への復帰) Pigment Cell Research,19,3,243-247 2006/06 Refereed
Iida A, Takamatsu N, Hori H, Wakamatsu Y, Shimada A, Shima A, *Koga A (2005) [doi: 10.1111/j.1600-0749.2005.00247.x] Reversion mutation of ib oculocutaneous albinism to wild-type pigmentation in medaka fish.(メダカのibアルビノ変異から野生型体色への復帰) Pigment Cell Research,18,5,382-384 2005/10 Refereed
Iida A, Tachibana A, Hamada S, Hori H, *Koga A (2004) [doi: org/10.1266/ggs.79.119] Low transposition frequency of the medaka fish Tol2 element may be due to extranuclear localization of its transposase.(メダカの Tol2 因子の低い転移頻度は核外移行シグナルが原因となっている可能性がある) Genes & Genetic Systems,79,2,119-124 2004/04 Refereed
Iida A, Inagaki H, Suzuki M, Wakamatsu Y, Hori H, *Koga A (2004) [doi: 10.1046/j.1600-0749.2003.00122.x] The tyrosinase gene of the i(b) albino mutant of the medaka fish carries a transposable element insertion in the promoter region.(メダカのi(b)アルビノ変異体のチロシナーゼ遺伝子にはプロモーター領域に転移因子の挿入がある) Pigment Cell Research,17,2,158-164 2004/04 Refereed
Tsutsumi M, Koga A, *Hori H (2003) [doi: 10.1017/S0016672303006335] Long and short mRNAs transcribed from the medaka fish transposon Tol2 respectively exert positive and negative effects on excision.(メダカの Tol2 因子からの長い mRNA は切り出しを促進し短い mRNA は抑制する) Genetical Research,82,1,33-40 2003/08 Refereed
*Koga A, Iida A, Kamiya M, Hayashi R, Hori H, Ishikawa Y, Tachibana A (2003) [doi: 10.1007/s10038-003-0016-4] The medaka fish Tol2 transposable element can undergo excision in human and mouse cells.(メダカの Tol2 因子の切り出し反応がヒトとマウスの細胞で進行する) Journal of Human Genetics,48,5,231-235 2003 Refereed
*Koga A, Hori H, Sakaizumi M (2002) [doi: 10.1007/s10126-001-0086-2] Gene transfer and cloning of flanking chromosomal regions using the medaka fish Tol2 transposable element.(メダカの Tol2 因子を用いた遺伝子導入および挿入点に隣接する領域のクローニング) Marine Biotechnology,4,1,6-11 2002/01 Refereed
*Koga A, Sakaizumi M, Hori H (2002) [doi: http://dx.doi.org/10.2108/zsj.19.1] Transposable elements in medaka fish. Zoological Science,19,1,1-6 2002/01 Refereed
*Koga A, Hori H (2001) [doi.org/10.1266/ggs.76.1] The Tol2 transposable element of the medaka fish: an active DNA-based element naturally occurring in a vertebrate genome. (メダカの Tol2 因子:脊椎動物のゲノムに存在する活性型 DNA トランスポゾン) Genes & Genetic Systems,76,1,1-8 2001/02 Refereed
*Koga A, Hori H (2000) Detection of de novo insertion of the medaka fish transposable element Tol2. Genetics,156,3,1243-1247 2000/11 Refereed
Koga A, Shimada A, Shima A, Sakaizumi M, Tachida H, *Hori H (2000) Evidence for recent invasion of the medaka fish genome by the Tol2 transposable element. Genetics,155,1,273-281 2000/05 Refereed
Koga A, Suzuki M, Maruyama Y, Tsutsumi M, *Hori H (1999) Amino acid sequence of a putative transposase protein of the medaka fish transposable element Tol2 deduced from mRNA nucleotide sequences. FEBS Letters,461,3,295-298 1999/11 Refereed
Koga A, Wakamatsu Y, Kurosawa J, Hori H (1999) Oculocutaneous albinism in the i6 mutant of the medaka fish is associated with a deletion in the tyrosinase gene. Pigment cell research / sponsored by the European Society for Pigment Cell Research and the International Pigment Cell Society,12,4,252-258 1999/08 Refereed
Koga A, Hori H (1999) Homogeneity in the structure of the medaka fish transposable element Tol2. Genetical research,73,1,7-14 1999/02 Refereed
Hori H, Suzuki M, Inagaki H, Oshima T, Koga A (1998) An active Ac-like transposable element in teleost fish. Journal of marine biotechnology,6,4,206-207 1998/12 Refereed
Kawakami K, Koga A, Hori H, Shima A (1998) Excision of the tol2 transposable element of the medaka fish, Oryzias latipes, in zebrafish, Danio rerio. Gene,225,1-2,17-22 1998/12 Refereed
Inagaki H, Koga A, Bessho Y, *Hori H (1998) [doi: 10.1111/j.1600-0749.1998.tb00737.x] The tyrosinase gene from medakafish: transgenic expression rescues albino mutation.(メダカのチロシナーゼ遺伝子:アルビノ変異体への遺伝子導入で発現がみられる) Pigment Cell Research,11,5,283-290 1998/10 Refereed
Koga A, *Hori H (1997) [doi: 10.1111/j.1600-0749.1997.tb00695.x] Albinism due to transposable element insertion in fish.(転移因子t@引き起こす魚類のアルビノ変異) Pigment Cell Research,10,6,377-381 1997/12 Refereed
Koga A, Suzuki M, Inagaki H, Bessho Y, Hori H (1996) [doi:10.1038/383030a0] Transposable element in fish.(魚類の転移因子) Nature,383,6595,30 1996/09 Refereed
Koga A, Inagaki H, Bessho Y, Hori H (1995) Insertion of a novel transposable element in the tyrosinase gene is responsible for an albino mutation in the medaka fish, Oryzias latipes.(チロシナーゼ遺伝子への転移因子の挿入がメダカのアルビノ変異の原因となっている) Molecular and General Genetics,249,4,400-405 1995/12 Refereed
Inagaki H, Bessho Y, Koga A, *Hori H (1994) Expression of the tyrosinase-encoding gene in a colorless melanophore mutant of the medaka fish, Oryzias latipes.(メダカの色素欠損変異体でのチロシナーゼ遺伝子の発現様式) Gene,150,2,319-324 1994/12 Refereed
*Koga A, Baba H, Kusakabe S, Hattori M, Mukai T (1993) Distribution of polymorphic gene duplication at the Gpdh locus in natural populations of Drosophila melanogaster. Journal of molecular evolution,36,6,532-535 1993/06 Refereed
Danilevskaya ON, Petrov DA, Pavlova MN, Koga A, Kurenova EV, Hartl DL (1992) A repetitive DNA element, associated with telomeric sequences in Drosophila melanogaster, contains open reading frames. Chromosoma,102,1,32-40 1992/12 Refereed
*Koga A, Harada K, Kusakabe S, Mukai T (1992) [doi: org/10.1266/jjg.67.125 Spontaneous mutations affecting glycerol-3-phosphate dehydrogenase enzyme activity in Drosophila melanogaster. Idengaku zasshi,67,2,125-132 1992/04 Refereed
*Capy P, Koga A, David JR, Hartl DL (1992) Sequence analysis of active mariner elements in natural populations of Drosophila simulans. Genetics,130,3,499-506 1992/03 Refereed
*Koga A, Kusakabe S, Tajima F, Takano T, Harada K, Mukai T (1991) A method for detecting effect of beneficial mutations in natural populations of Drosophila melanogaster. Genetical research,58,2,145-156 1991/10 Refereed
Garza D, Medhora M, Koga A, Hartl DL (1991) Introduction of the transposable element mariner into the germline of Drosophila melanogaster. Genetics,128,2,303-310 1991/06 Refereed
*Danilevskaya ON, Kurenova EV, Pavlova MN, Bebehov DV, Link AJ, Koga A, Vellek A, Hartl DL (1991) He-T family DNA sequences in the Y chromosome of Drosophila melanogaster share homology with the X-linked stellate genes. Chromosoma,100,2,118-124 1991/02 Refereed
*Kusakabe S, Baba H, Koga A, Bewley GC, Mukai T (1990) [doi: 10.1098/rspb.1990.0119] Gene duplication and concerted evolution of the GPDH locus in natural populations of Drosophila melanogaster. Proceedings. Biological sciences / The Royal Society,242,1305,157-162 1990/12 Refereed
*Takano T, Kusakabe S, Koga A, Mukai T (1989) Polymorphism for the number of tandemly multiplicated glycerol-3-phosphate dehydrogenase genes in Drosophila melanogaster. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,86,13,5000-5004 1989/07 Refereed

  • <<
  • >>
Conference Presentation > International Society
(文系研究者の一般的な学会報告の業績は「講演等」を参照してください)
Authors Title Bibliography Date Peer-Review Language
Koga A(ポスター発表) Rapid replacement of centromeres by a variant-type repetitive DNA in a primate taxon(変異型反復配列でのセントロメアの急速な置換) Society for Molecular Biology and Evolution 2016 Conference (Goldcoast, Australia) 2016/07 English
Koga A, Hirai Y, Sujiwattanarat P, Thapana W, Baicharoen S, Srikulnath K, Hirai H(招待講演) Higher-order repeat structure in centromere-region satellite DNA occurs in a wide range of primates(セントロメア反復配列の高次構造は霊長類で広くみられる) The 5th Asian Chromosome Colloquium (Bangkok, Thailand) 2015/04 English
Koga A(招待講演) DNA-based transposable elements as natural mutators in vertebrate genomes(脊椎動物で自然発生突然変異の原因となっているDNA型トランスポゾン) The 26th International Conference of the Korean Society for Molecular and Cellular Biology (Suoul, Korea) 2014/10 English
Koga A, HIirai Y, Jahan I, Bbicharoen S, ArsaIthamkul V,Hirai H(招待講演) Diversity in the organization of repetitive DNA among the four gibbon genera(反復配列の構成に関してテナガザル科4属の間にみられる変異) The 4th International Congress on Asian Primates (Bogor, Indonesia) 2014/08 English
Baicharoen S, Miyabe-Nishiwaki, Hirai Y, Duangsa-Ard K, Siriaroonrat B, Koga A, Hirai H(ポスター発表) Intergeneric hybrid offspring in gibbon between Hylobates and Nomascus(テナガザル科Hylobates属とNamascus属との間の属間雑種) The 4th International Congress on Asian Primates (Bogor, Indonesia) 2014/08 English
Conference Presentation > Domestic Society
(文系研究者の一般的な学会報告の業績は「講演等」を参照してください)
Authors Title Bibliography Date Peer-Review Language
石山涼太郎、山﨑健太朗、栗原史弥、山下大介、佐尾賢太郎、服部明正、古賀章彦(一般講演) Tol2トランスポゾンの分布と構造から推測されるホスト間の移動 日本遺伝学会第89回大会(岡山市) 2017/09 Japanese
古賀章彦(招待講演) 夜猿が昼行性から夜行性に戻ったことの分子レベルでの証拠 日本進化学会第19回大会(京都市) 2017/08 Japanese
Koga A, Tanabe H, Hirai H(招待講演) Amplification of tandem repeat DNA may be responsible for a rapid shift from diurnality to nocturnality in a primate taxon(縦列反復配列の急速な増幅が夜行性への変化に関与した可能性がある) 第39回日本分子生物学会年会(横浜市) 2016/12 English
古賀章彦、平井啓久(一般講演) セントロメア反復配列の急速な入れ替わり:テナガザルとヨザルの例 日本遺伝学会第88回大会(静岡県三島市) 2016/09 Japanese
Suntronpong A, 久郷和人、舛本寛、平井啓久、古賀章彦(招待講演) CENP-B box is likely to confer a selective advantage on its host organism(CENP-B box はホストの長期的な生存に有利に作用することが考えられる) 日本遺伝学会第87回大会(仙台市) 2015/09 English
古賀 章彦,平井 啓久(一般講演) 夜行性への移行に関与したと考えられるヨザルの大規模反復配列 第31回日本霊長類学会大会(大阪市) 2015/07 Japanese
Sujiwattanarat P,Thapana W,Srikulnath K,Hirai H ,Koga A(一般講演) Higher-order repeat structure in centromeric repetitive DNA is not confined to central regions(セントロメア反復配列の高次構造の所在は中心部に限定されない) 日本進化学会第16回大会(大阪府高槻市) 2014/08 English
平井啓久、平井百合子、古賀章彦(一般講演) ヨザルの種間雑種形成が原因と思われる染色体変異の分子細胞遺伝学的解析 第30回日本霊長類学会大会(大阪市) 2014/07 Japanese
古賀章彦、オーン プラコンチープ、ナンペ チャイブラセルチ、平井百合子、平井啓久(一般講演) ヨザルの染色体変異に関与したと考えられる大規模反復配列 第30回日本霊長類学会大会(大阪市) 2014/07 Japanese
古賀章彦、Prakhongcheep O、Srikulnath K、平井百合子、平井啓久(一般講演) ヨザルのセントロメアを構成する反復配列の急速な置換 第29回日本霊長類学会・日本哺乳類学会2013年度合同大会(岡山市) 2013/09 Japanese
平井啓久、Prakhongcheep O、Chaiprasertsri N、平井百合子、古賀章彦(一般講演) ヨザルのアクロセントリック染色体短腕にあるヘテロクロマチンの形成過程 第29回日本霊長類学会・日本哺乳類学会2013年度合同大会(岡山市) 2013/09 Japanese
寺田祥子, 平井百合子, 平井啓久, 古賀章彦 ヒト科とテナガザル科におけるセントロメア反復配列高次構造の起源 第29回日本霊長類学会・日本哺乳類学会2013年度合同大会 2013/09 Japanese
古賀章彦, 平井百合子, 寺田祥子, 平井啓久 セントロメアを構成する反復配列の高次構造はヒト科ではなくヒト上科の特性である 日本遺伝学会第85回大会,85th,123 2013/08 Japanese
古賀章彦, 平井百合子, ORNJIRA Prakhongcheep, 平井啓久 ヨザルのヘテロクロマチンを構成する切れやすそうな縦列反復配列:染色体構成の急速な変化への関与に関する仮説 日本遺伝学会第84回大会 2012/08 Japanese
原暢, 平井百合子, スダラット バイチャローン, 早川卓志, 平井啓久, 古賀章彦 小型類人猿における新規複合型レトロトランスポゾンの形成 日本遺伝学会第84回大会 2012/08 Japanese
古賀章彦 メダカにみられる対照的な2つの転移因子:侵入直後の元気な因子と崩壊の危機に立つ因子 日本遺伝学会第83回大会 2011/08 Japanese
原暢, 山本博章, 三浦郁夫, 古賀章彦 体色突然変異を指標とした活性型DNAトランスポゾンの探索 日本遺伝学会第83回大会 2011/08 Japanese
古賀章彦, 平井啓久 染色体次端部反復配列はアフリカ類人猿の共通祖先にあってヒトでは消滅したことの統計的検証 日本遺伝学会第82回大会,82nd,111 2010/09 Japanese
古賀章彦 hATファミリーのトランスポゾンであるメダカのTol1因子は旧口動物と新口動物の両方で転移する 日本遺伝学会第80回大会 2008/08 Japanese
古賀 章彦 トランスポゾンは原因として認識されることなく突然変異を誘発する (日本の遺伝学の潮流--日本遺伝学会第78回大会ハイライト) -- (ワークショップ 生命の多様性を生み出すゲノム変化--分子遺伝学から比較ゲノム学まで) 生物の科学「遺伝」 別冊,21,273-276,155 2007/03 Japanese

  • <<
  • >>
Patents
Right holders Title Stage Patent number Date
古賀 章彦, 濱口 哲 Tol1因子のトランスポザーゼ及びそれを用いたDNA導入システム 特許登録 特許第5320546号 2013/07/26
古賀 章彦, 濱口 哲 Tol1因子のトランスポザーゼ及びそれを用いたDNA導入システム 特許公開 WO2008-072540 2008/06/19
External funds, competitive funds and Grants-in-Aid for Scientific Research(kaken)
Type Position Title(Japanese) Title(English) Period
基盤研究(B) Representative ヒトと類人猿のゲノムの大きな違い:組換え頻度に関する仮説のゲノム編集を用いた検証 2015-2018
挑戦的萌芽研究 Representative 縦列反復配列の正確な塩基配列決定 2015-2016
挑戦的萌芽研究 Representative 染色体構成の急速な変化がみられる霊長類:反復配列の関与に関する仮説の検証 2013-2014
基盤研究(B) Representative ヒト上科で種特異的に生じている反復配列増減の比較ゲノム実験に基づく定量的な解析  2012-2014
挑戦的萌芽研究 Representative ヒトでの構成的ヘテロクロマチンの消失:機構解明へ向けた痕跡部分の構造解析 2011-2012
基盤研究(C) Representative メダカの転移因子の突発的転移頻度上昇の機構 2007-2008
基盤研究(C) Representative メダカの自然発生突然変異率への転移性遺伝因子の関与 2004-2005
基盤研究(C) Representative メダカのDNA型転移因子の転移機構 1997-1998
奨励研究(A) Representative トランスポゾンの転移に必要なホストの遺伝子の同定 1993-1994
Teaching subject(s)
Name(Japanese) Name(English) Term Department Period
霊長類学のすすめ Topics in Primatology 前期 全学共通科目 2011/04-2012/03
霊長類学の現在 Primatology Today 前期集中 全学共通科目 2012/04-2013/03
霊長類遺伝学基礎論 Fundamental Primate Genetics 前期 理学研究科 2014/04-2015/03
霊長類遺伝学特論 Advanced Primate Genetics 後期 理学研究科 2014/04-2015/03
遺伝学実習 Practice on Genetics 後期集中 理学研究科 2014/04-2015/03
霊長類遺伝学ゼミナールIA Seminar on Primate Genetics IA 前期 理学研究科 2014/04-2015/03
霊長類遺伝学ゼミナールIB Seminar on Primate Genetics IB 後期 理学研究科 2014/04-2015/03
霊長類遺伝学ゼミナールIIA Seminar on Primate Genetics IIA 前期 理学研究科 2014/04-2015/03
霊長類遺伝学ゼミナールIIB Seminar on Primate Genetics IIB 後期 理学研究科 2014/04-2015/03
遺伝学実習 Practical on Genetics 後期集中 理学研究科 2015/04-2016/03
霊長類遺伝学ゼミナールIA Seminar on Primate Genetics IA 前期 理学研究科 2015/04-2016/03
霊長類遺伝学ゼミナールIB Seminar on Primate Genetics IB 後期 理学研究科 2015/04-2016/03
霊長類遺伝学ゼミナールIIA Seminar on Primate Genetics IIA 前期 理学研究科 2015/04-2016/03
霊長類遺伝学ゼミナールIIB Seminar on Primate Genetics IIB 後期 理学研究科 2015/04-2016/03
霊長類遺伝学基礎論 Fundamental Primate Genetics 前期集中 理学研究科 2015/04-2016/03
霊長類遺伝学特論 Advanced Primate Genetics 後期 理学研究科 2015/04-2016/03
ゲノム細胞学実習 Practical on Cellular and Molecular Biology 後期集中 理学研究科 2016/04-2017/03
霊長類ゲノム細胞基礎論 Fundamental Primate Cellular and Molecular Biology 前期集中 理学研究科 2016/04-2017/03
霊長類ゲノム細胞学ゼミナールA Seminar on Primate Cellular and Molcular Biology A 前期 理学研究科 2016/04-2017/03
霊長類ゲノム細胞学ゼミナールB Seminar on Primate Cellular and Molcular Biology B 後期 理学研究科 2016/04-2017/03
霊長類ゲノム細胞学ゼミナールC Seminar on Primate Cellular and Molcular Biology C 前期 理学研究科 2016/04-2017/03
霊長類ゲノム細胞学ゼミナールD Seminar on Primate Cellular and Molcular Biology D 後期 理学研究科 2016/04-2017/03
霊長類細胞生理学特論 Advanced Primate Cellular Biology 後期 理学研究科 2016/04-2017/03
ゲノム細胞学実習 Practical on Cellular and Molecular Biology 後期集中 理学研究科 2017/04-2018/03
霊長類学入門II Introduction to Primatology II 後期 全学共通科目 2017/04-2018/03
霊長類ゲノム細胞基礎論 Fundamental Primate Cellular and Molecular Biology 前期集中 理学研究科 2017/04-2018/03
霊長類ゲノム細胞学ゼミナールA Seminar on Primate Cellular and Molcular Biology A 前期 理学研究科 2017/04-2018/03
霊長類ゲノム細胞学ゼミナールB Seminar on Primate Cellular and Molcular Biology B 後期 理学研究科 2017/04-2018/03
霊長類ゲノム細胞学ゼミナールC Seminar on Primate Cellular and Molcular Biology C 前期 理学研究科 2017/04-2018/03
霊長類ゲノム細胞学ゼミナールD Seminar on Primate Cellular and Molcular Biology D 後期 理学研究科 2017/04-2018/03
霊長類細胞生理学特論 Advanced Primate Cellular Biology 後期 理学研究科 2017/04-2018/03

  • <<
  • >>
School management (title, position)
Title Period
英文一覧等小委員会 委員 2009/07/01-2011/03/31
国際交流委員会 委員 2009/07/01-2011/03/31
学生部委員会 委員 2009/04/01-2010/03/31
大学評価委員会 点検・評価実行委員会 委員 2010/04/01-2011/03/31
教育制度委員会 委員 2010/04/01-2011/03/31
国際交流委員会 委員 2011/04/01-2013/03/31
広報委員会 委員 2013/04/01-2015/03/31
広報委員会 楽友編集専門部会 2013/04/01-2015/03/31
広報委員会 楽友編集専門部会 2013/04/01-2015/03/31
国際交流委員会 委員 2009/07/01-2011/06/30
広報委員会 楽友編集専門部会 2013/04/01-2015/03/31
図書館協議会 協議員 2017/04/01-2019/03/31

  • <<
  • >>
Academic organizations (editor, editing team)
Organization name(Japanese) Organization name(English) Journal name(Japanese) Journal name(English) Title Period
日本遺伝学会 Genetics Society of Japan Genes & Genetic Systems Genes & Genetic Systems Editorial Board member 2004/04/01-
韓国遺伝学会 Genetics Society of Korea Genes & Genomics Genes & Genomics Editorial Board member 2015/01/01-
シュプリンガー・ネイチャー Springer Nature Scientific Reports Scientific reports Editorial Board member 2016/08/01-
Other activities (awards)
Award name Organization name Date
科学研究費補助金 審査委員表彰 日本学術振興会 2012/04/01