山本 拓也

最終更新日時: 2018/10/11 10:38:44

印刷する

氏名(漢字/フリガナ/アルファベット表記)
山本 拓也/ヤマモト タクヤ/Yamamoto, Takuya
所属部署・職名(部局/所属/講座等/職名)
iPS細胞研究所/未来生命科学開拓部門/准教授
学内兼務
部局 所属 講座等 職名
iPS細胞研究所 初期化機構研究部門 特定拠点助教
取得学位
学位名(日本語) 学位名(英語) 大学(日本語) 大学(英語) 取得区分
修士(生命科学) 京都大学
博士(生命科学) 京都大学
個人ホームページ
URL
http://www.cira.kyoto-u.ac.jp/yamamoto/
研究テーマ
(日本語)
体細胞初期化過程における分子メカニズムの解明
(英語)
Elucidation of molecular basis of somatic cell reprogramming process
研究概要
(日本語)
iPS細胞の誘導プロセスおよび分化プロセスにおける分子メカニズムを解明することは、iPS細胞を再生医療等の応用へ繋げていくための重要なステップの一つである。現在までの研究によって、転写制御やエピジェネティック制御等の核内で起こる現象が、そうしたプロセスで鍵を握ることが明らかになっている。また、近年、生命科学の分野においては、マイクロアレイや次世代型シーケンサーに代表される解析装置の目覚ましい進歩によって、膨大なデータ量を短時間で入手することが可能になった。そのような大量データから生物学的に意味のあるデータを抽出するには、コンピューターサイエンスを利用したバイオインフォマティクス等の知識や解析技術(dry)とともに、分子生物学的および細胞生物学的な知識や実験技術(wet)が必要不可欠である。当研究では、全ゲノムにわたる網羅的解析を多角的なアプローチによって行い、dryとwetをそれぞれフィードバックさせながら融合させ、統合的にiPS細胞の誘導プロセスおよびiPS細胞の分化プロセスの解明を目指すことを第一義的な目標とする。本研究によって得られた知見は、安全かつ効率的なiPS細胞の作製技術に直結するだけでなく、再生医療等の応用面においても新しい可能性を提示できるものと考えている。
(英語)
Elucidation of the molecular mechanisms of iPS cell induction processes is an important step toward applications of iPS cells for regenerative medicine. Analytical techniques (dry), such as bioinformatics, as well as molecular- and cell-biological experimental techniques (wet) are essential to extract biologically meaningful information from the enormous amounts of data acquired by such analytical devices as microarrays and the next-generation sequencers.
研究分野(キーワード)
キーワード(日本語) キーワード(英語)
体細胞初期化 Somatic cell reprogramming
バイオインフォマティクス Bioinformatics
分子生物学 Molecular Biology
論文
著者 著者(日本語) 著者(英語) タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 書誌情報等 書誌情報等(日本語) 書誌情報等(英語) 出版年月 査読の有無 記述言語 掲載種別 公開
太田翔、山本拓也 太田翔、山本拓也 体細胞初期化過程における選択的スプライシングの変化とその分子機構 体細胞初期化過程における選択的スプライシングの変化とその分子機構 生化学, 86, 6, 807-811 生化学, 86, 6, 807-811 , 86, 6, 807-811 2014/12 日本語 公開
Yamashiro C, Sasaki K, Yabuta Y, Kojima Y, Nakamura T, Okamoto I, Yokobayashi S, Murase Y, Ishikura Y, Shirane K, Sasaki H, Yamamoto T, Saitou M Yamashiro C, Sasaki K, Yabuta Y, Kojima Y, Nakamura T, Okamoto I, Yokobayashi S, Murase Y, Ishikura Y, Shirane K, Sasaki H, Yamamoto T, Saitou M Generation of human oogonia from induced pluripotent stem cells in vitro. Generation of human oogonia from induced pluripotent stem cells in vitro. Science (New York, N.Y.) Science (New York, N.Y.) 2018/09 公開
Seo H, Chen SJ, Hashimoto K, Endo H, Nishi Y, Ohta A, Yamamoto T, Hotta A, Sawaguchi A, Hayashi H, Koseki N, Murphy GJ, Fukuda K, Sugimoto N, Eto K Seo H, Chen SJ, Hashimoto K, Endo H, Nishi Y, Ohta A, Yamamoto T, Hotta A, Sawaguchi A, Hayashi H, Koseki N, Murphy GJ, Fukuda K, Sugimoto N, Eto K A β1-tubulin-based megakaryocyte maturation reporter system identifies novel drugs that promote platelet production. A β1-tubulin-based megakaryocyte maturation reporter system identifies novel drugs that promote platelet production. Blood advances, 2, 17, 2262-2272 , 2, 17, 2262-2272 Blood advances, 2, 17, 2262-2272 2018/09 公開
Sogabe Y, Seno H, Yamamoto T, Yamada Y Sogabe Y, Seno H, Yamamoto T, Yamada Y Unveiling epigenetic regulation in cancer, aging, and rejuvenation with in vivo reprogramming technology. Unveiling epigenetic regulation in cancer, aging, and rejuvenation with in vivo reprogramming technology. Cancer science, 109, 9, 2641-2650 , 109, 9, 2641-2650 Cancer science, 109, 9, 2641-2650 2018/09 公開
Ito Y, Nakamura S, Sugimoto N, Shigemori T, Kato Y, Ohno M, Sakuma S, Ito K, Kumon H, Hirose H, Okamoto H, Nogawa M, Iwasaki M, Kihara S, Fujio K, Matsumoto T, Higashi N, Hashimoto K, Sawaguchi A, Harimoto KI, Nakagawa M, Yamamoto T, Handa M, Watanabe N, Nishi E, Arai F, Nishimura S, Eto K Ito Y, Nakamura S, Sugimoto N, Shigemori T, Kato Y, Ohno M, Sakuma S, Ito K, Kumon H, Hirose H, Okamoto H, Nogawa M, Iwasaki M, Kihara S, Fujio K, Matsumoto T, Higashi N, Hashimoto K, Sawaguchi A, Harimoto KI, Nakagawa M, Yamamoto T, Handa M, Watanabe N, Nishi E, Arai F, Nishimura S, Eto K Turbulence Activates Platelet Biogenesis to Enable Clinical Scale Ex Vivo Production. Turbulence Activates Platelet Biogenesis to Enable Clinical Scale Ex Vivo Production. Cell, 174, 3, 636-648.e18 , 174, 3, 636-648.e18 Cell, 174, 3, 636-648.e18 2018/07 公開
Shibata H, Komura S, Yamada Y, Sankoda N, Tanaka A, Ukai T, Kabata M, Sakurai S, Kuze B, Woltjen K, Haga H, Ito Y, Kawaguchi Y, Yamamoto T, Yamada Y Shibata H, Komura S, Yamada Y, Sankoda N, Tanaka A, Ukai T, Kabata M, Sakurai S, Kuze B, Woltjen K, Haga H, Ito Y, Kawaguchi Y, Yamamoto T, Yamada Y In vivo reprogramming drives Kras-induced cancer development. In vivo reprogramming drives Kras-induced cancer development. Nature communications, 9, 1, 2081 , 9, 1, 2081 Nature communications, 9, 1, 2081 2018/05 公開
Ikeda T, Hikichi T, Miura H, Shibata H, Mitsunaga K, Yamada Y, Woltjen K, Miyamoto K, Hiratani I, Yamada Y, Hotta A, Yamamoto T, Okita K, Masui S Ikeda T, Hikichi T, Miura H, Shibata H, Mitsunaga K, Yamada Y, Woltjen K, Miyamoto K, Hiratani I, Yamada Y, Hotta A, Yamamoto T, Okita K, Masui S Srf destabilizes cellular identity by suppressing cell-type-specific gene expression programs. Srf destabilizes cellular identity by suppressing cell-type-specific gene expression programs. Nature communications, 9, 1, 1387 , 9, 1, 1387 Nature communications, 9, 1, 1387 2018/04 公開
Honjoh S, Ihara A, Kajiwara Y, Yamamoto T, Nishida E Honjoh S, Ihara A, Kajiwara Y, Yamamoto T, Nishida E The Sexual Dimorphism of Dietary Restriction Responsiveness in Caenorhabditis elegans. The Sexual Dimorphism of Dietary Restriction Responsiveness in Caenorhabditis elegans. Cell reports, 21, 13, 3646-3652 , 21, 13, 3646-3652 Cell reports, 21, 13, 3646-3652 2017/12 公開
Mitani T, Yabuta Y, Ohta H, Nakamura T, Yamashiro C, Yamamoto T, Saitou M, Kurimoto K Mitani T, Yabuta Y, Ohta H, Nakamura T, Yamashiro C, Yamamoto T, Saitou M, Kurimoto K Principles for the regulation of multiple developmental pathways by a versatile transcriptional factor, BLIMP1. Principles for the regulation of multiple developmental pathways by a versatile transcriptional factor, BLIMP1. Nucleic acids research, 45, 21, 12152-12169 , 45, 21, 12152-12169 Nucleic acids research, 45, 21, 12152-12169 2017/12 公開
Ikeda H, Sone M, Yamanaka S, Yamamoto T Ikeda H, Sone M, Yamanaka S, Yamamoto T Structural and spatial chromatin features at developmental gene loci in human pluripotent stem cells. Structural and spatial chromatin features at developmental gene loci in human pluripotent stem cells. Nature communications, 8, 1, 1616 , 8, 1, 1616 Nature communications, 8, 1, 1616 2017/11 公開
Miyauchi H, Ohta H, Nagaoka S, Nakaki F, Sasaki K, Hayashi K, Yabuta Y, Nakamura T, Yamamoto T, Saitou M Miyauchi H, Ohta H, Nagaoka S, Nakaki F, Sasaki K, Hayashi K, Yabuta Y, Nakamura T, Yamamoto T, Saitou M Bone morphogenetic protein and retinoic acid synergistically specify female germ-cell fate in mice. Bone morphogenetic protein and retinoic acid synergistically specify female germ-cell fate in mice. The EMBO journal, 36, 21, 3100-3119 , 36, 21, 3100-3119 The EMBO journal, 36, 21, 3100-3119 2017/11 公開
Kojima Y, Sasaki K, Yokobayashi S, Sakai Y, Nakamura T, Yabuta Y, Nakaki F, Nagaoka S, Woltjen K, Hotta A, Yamamoto T, Saitou M Kojima Y, Sasaki K, Yokobayashi S, Sakai Y, Nakamura T, Yabuta Y, Nakaki F, Nagaoka S, Woltjen K, Hotta A, Yamamoto T, Saitou M Evolutionarily Distinctive Transcriptional and Signaling Programs Drive Human Germ Cell Lineage Specification from Pluripotent Stem Cells. Evolutionarily Distinctive Transcriptional and Signaling Programs Drive Human Germ Cell Lineage Specification from Pluripotent Stem Cells. Cell stem cell, 21, 4, 517-532.e5 , 21, 4, 517-532.e5 Cell stem cell, 21, 4, 517-532.e5 2017/10 公開
Matsuzono K, Imamura K, Murakami N, Tsukita K, Yamamoto T, Izumi Y, Kaji R, Ohta Y, Yamashita T, Abe K, Inoue H Matsuzono K, Imamura K, Murakami N, Tsukita K, Yamamoto T, Izumi Y, Kaji R, Ohta Y, Yamashita T, Abe K, Inoue H Antisense Oligonucleotides Reduce RNA Foci in Spinocerebellar Ataxia 36 Patient iPSCs. Antisense Oligonucleotides Reduce RNA Foci in Spinocerebellar Ataxia 36 Patient iPSCs. Molecular therapy. Nucleic acids, 8, 211-219 , 8, 211-219 Molecular therapy. Nucleic acids, 8, 211-219 2017/09 公開
Kitani-Morii F, Imamura K, Kondo T, Ohara R, Enami T, Shibukawa R, Yamamoto T, Sekiguchi K, Toguchida J, Mizuno T, Nakagawa M, Inoue H Kitani-Morii F, Imamura K, Kondo T, Ohara R, Enami T, Shibukawa R, Yamamoto T, Sekiguchi K, Toguchida J, Mizuno T, Nakagawa M, Inoue H Analysis of neural crest cells from Charcot-Marie-Tooth disease patients demonstrates disease-relevant molecular signature. Analysis of neural crest cells from Charcot-Marie-Tooth disease patients demonstrates disease-relevant molecular signature. Neuroreport, 28, 13, 814-821 , 28, 13, 814-821 Neuroreport, 28, 13, 814-821 2017/09 公開
Yagi M, Kishigami S, Tanaka A, Semi K, Mizutani E, Wakayama S, Wakayama T, Yamamoto T, Yamada Y Yagi M, Kishigami S, Tanaka A, Semi K, Mizutani E, Wakayama S, Wakayama T, Yamamoto T, Yamada Y Derivation of ground-state female ES cells maintaining gamete-derived DNA methylation. Derivation of ground-state female ES cells maintaining gamete-derived DNA methylation. Nature, 548, 7666, 224-227 , 548, 7666, 224-227 Nature, 548, 7666, 224-227 2017/08 公開
Imajo M, Kondoh K, Yamamoto T, Nakayama K, Nakajima-Koyama M, Nishida E Imajo M, Kondoh K, Yamamoto T, Nakayama K, Nakajima-Koyama M, Nishida E Antagonistic Interactions between Extracellular Signal-Regulated Kinase Mitogen-Activated Protein Kinase and Retinoic Acid Receptor Signaling in Colorectal Cancer Cells. Antagonistic Interactions between Extracellular Signal-Regulated Kinase Mitogen-Activated Protein Kinase and Retinoic Acid Receptor Signaling in Colorectal Cancer Cells. Molecular and cellular biology, 37, 15 , 37, 15 Molecular and cellular biology, 37, 15 2017/08 公開
Ohta H, Kurimoto K, Okamoto I, Nakamura T, Yabuta Y, Miyauchi H, Yamamoto T, Okuno Y, Hagiwara M, Shirane K, Sasaki H, Saitou M Ohta H, Kurimoto K, Okamoto I, Nakamura T, Yabuta Y, Miyauchi H, Yamamoto T, Okuno Y, Hagiwara M, Shirane K, Sasaki H, Saitou M <i>In vitro</i> expansion of mouse primordial germ cell-like cells recapitulates an epigenetic blank slate. <i>In vitro</i> expansion of mouse primordial germ cell-like cells recapitulates an epigenetic blank slate. The EMBO journal, 36, 13, 1888-1907 , 36, 13, 1888-1907 The EMBO journal, 36, 13, 1888-1907 2017/07 公開
Yokobayashi S, Okita K, Nakagawa M, Nakamura T, Yabuta Y, Yamamoto T, Saitou M Yokobayashi S, Okita K, Nakagawa M, Nakamura T, Yabuta Y, Yamamoto T, Saitou M Clonal variation of human induced pluripotent stem cells for induction into the germ cell fate. Clonal variation of human induced pluripotent stem cells for induction into the germ cell fate. Biology of reproduction, 96, 6, 1154-1166 , 96, 6, 1154-1166 Biology of reproduction, 96, 6, 1154-1166 2017/06 公開
Imamura K, Izumi Y, Watanabe A, Tsukita K, Woltjen K, Yamamoto T, Hotta A, Kondo T, Kitaoka S, Ohta A, Tanaka A, Watanabe D, Morita M, Takuma H, Tamaoka A, Kunath T, Wray S, Furuya H, Era T, Makioka K, Okamoto K, Fujisawa T, Nishitoh H, Homma K, Ichijo H, Julien JP, Obata N, Hosokawa M, Akiyama H, Kaneko S, Ayaki T, Ito H, Kaji R, Takahashi R, Yamanaka S, Inoue H Imamura K, Izumi Y, Watanabe A, Tsukita K, Woltjen K, Yamamoto T, Hotta A, Kondo T, Kitaoka S, Ohta A, Tanaka A, Watanabe D, Morita M, Takuma H, Tamaoka A, Kunath T, Wray S, Furuya H, Era T, Makioka K, Okamoto K, Fujisawa T, Nishitoh H, Homma K, Ichijo H, Julien JP, Obata N, Hosokawa M, Akiyama H, Kaneko S, Ayaki T, Ito H, Kaji R, Takahashi R, Yamanaka S, Inoue H The Src/c-Abl pathway is a potential therapeutic target in amyotrophic lateral sclerosis. The Src/c-Abl pathway is a potential therapeutic target in amyotrophic lateral sclerosis. Science translational medicine, 9, 391 , 9, 391 Science translational medicine, 9, 391 2017/05 公開
Sone M, Morone N, Nakamura T, Tanaka A, Okita K, Woltjen K, Nakagawa M, Heuser JE, Yamada Y, Yamanaka S, Yamamoto T Sone M, Morone N, Nakamura T, Tanaka A, Okita K, Woltjen K, Nakagawa M, Heuser JE, Yamada Y, Yamanaka S, Yamamoto T Hybrid Cellular Metabolism Coordinated by Zic3 and Esrrb Synergistically Enhances Induction of Naive Pluripotency. Hybrid Cellular Metabolism Coordinated by Zic3 and Esrrb Synergistically Enhances Induction of Naive Pluripotency. Cell metabolism, 25, 5, 1103-1117.e6 , 25, 5, 1103-1117.e6 Cell metabolism, 25, 5, 1103-1117.e6 2017/05 公開
Honda A, Kawano Y, Izu H, Choijookhuu N, Honsho K, Nakamura T, Yabuta Y, Yamamoto T, Takashima Y, Hirose M, Sankai T, Hishikawa Y, Ogura A, Saitou M Honda A, Kawano Y, Izu H, Choijookhuu N, Honsho K, Nakamura T, Yabuta Y, Yamamoto T, Takashima Y, Hirose M, Sankai T, Hishikawa Y, Ogura A, Saitou M Discrimination of Stem Cell Status after Subjecting Cynomolgus Monkey Pluripotent Stem Cells to Naïve Conversion. Discrimination of Stem Cell Status after Subjecting Cynomolgus Monkey Pluripotent Stem Cells to Naïve Conversion. Scientific reports, 7, 45285 , 7, 45285 Scientific reports, 7, 45285 2017/03 公開
Murakami N, Imamura K, Izumi Y, Egawa N, Tsukita K, Enami T, Yamamoto T, Kawarai T, Kaji R, Inoue H Murakami N, Imamura K, Izumi Y, Egawa N, Tsukita K, Enami T, Yamamoto T, Kawarai T, Kaji R, Inoue H Proteasome impairment in neural cells derived from HMSN-P patient iPSCs. Proteasome impairment in neural cells derived from HMSN-P patient iPSCs. Molecular brain, 10, 1, 7 , 10, 1, 7 Molecular brain, 10, 1, 7 2017/02 公開
Ashida Y, Nakajima-Koyama M, Hirota A, Yamamoto T, Nishida E Ashida Y, Nakajima-Koyama M, Hirota A, Yamamoto T, Nishida E Activin A in combination with ERK1/2 MAPK pathway inhibition sustains propagation of mouse embryonic stem cells. Activin A in combination with ERK1/2 MAPK pathway inhibition sustains propagation of mouse embryonic stem cells. Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms, 22, 2, 189-202 , 22, 2, 189-202 Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms, 22, 2, 189-202 2017/02 公開
Hashimoto K, Yamada Y, Semi K, Yagi M, Tanaka A, Itakura F, Aoki H, Kunisada T, Woltjen K, Haga H, Sakai Y, Yamamoto T, Yamada Y Hashimoto K, Yamada Y, Semi K, Yagi M, Tanaka A, Itakura F, Aoki H, Kunisada T, Woltjen K, Haga H, Sakai Y, Yamamoto T, Yamada Y Cellular context-dependent consequences of Apc mutations on gene regulation and cellular behavior. Cellular context-dependent consequences of Apc mutations on gene regulation and cellular behavior. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 114, 4, 758-763 , 114, 4, 758-763 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 114, 4, 758-763 2017/01 公開
Sugiyama H, Takahashi K, Yamamoto T, Iwasaki M, Narita M, Nakamura M, Rand TA, Nakagawa M, Watanabe A, Yamanaka S Sugiyama H, Takahashi K, Yamamoto T, Iwasaki M, Narita M, Nakamura M, Rand TA, Nakagawa M, Watanabe A, Yamanaka S Nat1 promotes translation of specific proteins that induce differentiation of mouse embryonic stem cells. Nat1 promotes translation of specific proteins that induce differentiation of mouse embryonic stem cells. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 114, 2, 340-345 , 114, 2, 340-345 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 114, 2, 340-345 2017/01 公開
Ishikura Y, Yabuta Y, Ohta H, Hayashi K, Nakamura T, Okamoto I, Yamamoto T, Kurimoto K, Shirane K, Sasaki H, Saitou M Ishikura Y, Yabuta Y, Ohta H, Hayashi K, Nakamura T, Okamoto I, Yamamoto T, Kurimoto K, Shirane K, Sasaki H, Saitou M In Vitro Derivation and Propagation of Spermatogonial Stem Cell Activity from Mouse Pluripotent Stem Cells. In Vitro Derivation and Propagation of Spermatogonial Stem Cell Activity from Mouse Pluripotent Stem Cells. Cell reports, 17, 10, 2789-2804 , 17, 10, 2789-2804 Cell reports, 17, 10, 2789-2804 2016/12 公開
Hirano Y, Ihara K, Masuda T, Yamamoto T, Iwata I, Takahashi A, Awata H, Nakamura N, Takakura M, Suzuki Y, Horiuchi J, Okuno H, Saitoe M Hirano Y, Ihara K, Masuda T, Yamamoto T, Iwata I, Takahashi A, Awata H, Nakamura N, Takakura M, Suzuki Y, Horiuchi J, Okuno H, Saitoe M Shifting transcriptional machinery is required for long-term memory maintenance and modification in Drosophila mushroom bodies. Shifting transcriptional machinery is required for long-term memory maintenance and modification in Drosophila mushroom bodies. Nature communications, 7, 13471 , 7, 13471 Nature communications, 7, 13471 2016/11 公開
Sasaki K, Nakamura T, Okamoto I, Yabuta Y, Iwatani C, Tsuchiya H, Seita Y, Nakamura S, Shiraki N, Takakuwa T, Yamamoto T, Saitou M Sasaki K, Nakamura T, Okamoto I, Yabuta Y, Iwatani C, Tsuchiya H, Seita Y, Nakamura S, Shiraki N, Takakuwa T, Yamamoto T, Saitou M The Germ Cell Fate of Cynomolgus Monkeys Is Specified in the Nascent Amnion. The Germ Cell Fate of Cynomolgus Monkeys Is Specified in the Nascent Amnion. Developmental cell, 39, 2, 169-185 , 39, 2, 169-185 Developmental cell, 39, 2, 169-185 2016/10 公開
Nakamura T, Okamoto I, Sasaki K, Yabuta Y, Iwatani C, Tsuchiya H, Seita Y, Nakamura S, Yamamoto T, Saitou M Nakamura T, Okamoto I, Sasaki K, Yabuta Y, Iwatani C, Tsuchiya H, Seita Y, Nakamura S, Yamamoto T, Saitou M A developmental coordinate of pluripotency among mice, monkeys and humans. A developmental coordinate of pluripotency among mice, monkeys and humans. Nature, 537, 7618, 57-62 , 537, 7618, 57-62 Nature, 537, 7618, 57-62 2016/09 公開
Ameku T, Taura D, Sone M, Numata T, Nakamura M, Shiota F, Toyoda T, Matsui S, Araoka T, Yasuno T, Mae S, Kobayashi H, Kondo N, Kitaoka F, Amano N, Arai S, Ichisaka T, Matsuura N, Inoue S, Yamamoto T, Takahashi K, Asaka I, Yamada Y, Ubara Y, Muso E, Fukatsu A, Watanabe A, Sato Y, Nakahata T, Mori Y, Koizumi A, Nakao K, Yamanaka S, Osafune K Ameku T, Taura D, Sone M, Numata T, Nakamura M, Shiota F, Toyoda T, Matsui S, Araoka T, Yasuno T, Mae S, Kobayashi H, Kondo N, Kitaoka F, Amano N, Arai S, Ichisaka T, Matsuura N, Inoue S, Yamamoto T, Takahashi K, Asaka I, Yamada Y, Ubara Y, Muso E, Fukatsu A, Watanabe A, Sato Y, Nakahata T, Mori Y, Koizumi A, Nakao K, Yamanaka S, Osafune K Identification of MMP1 as a novel risk factor for intracranial aneurysms in ADPKD using iPSC models. Identification of MMP1 as a novel risk factor for intracranial aneurysms in ADPKD using iPSC models. Scientific reports, 6, 30013 , 6, 30013 Scientific reports, 6, 30013 2016/07 公開
Komura S, Semi K, Itakura F, Shibata H, Ohno T, Hotta A, Woltjen K, Yamamoto T, Akiyama H, Yamada Y Komura S, Semi K, Itakura F, Shibata H, Ohno T, Hotta A, Woltjen K, Yamamoto T, Akiyama H, Yamada Y An EWS-FLI1-Induced Osteosarcoma Model Unveiled a Crucial Role of Impaired Osteogenic Differentiation on Osteosarcoma Development. An EWS-FLI1-Induced Osteosarcoma Model Unveiled a Crucial Role of Impaired Osteogenic Differentiation on Osteosarcoma Development. Stem cell reports, 6, 4, 592-606 , 6, 4, 592-606 Stem cell reports, 6, 4, 592-606 2016/04 公開
Yamashiro C, Hirota T, Kurimoto K, Nakamura T, Yabuta Y, Nagaoka SI, Ohta H, Yamamoto T, Saitou M Yamashiro C, Hirota T, Kurimoto K, Nakamura T, Yabuta Y, Nagaoka SI, Ohta H, Yamamoto T, Saitou M Persistent Requirement and Alteration of the Key Targets of PRDM1 During Primordial Germ Cell Development in Mice. Persistent Requirement and Alteration of the Key Targets of PRDM1 During Primordial Germ Cell Development in Mice. Biology of reproduction, 94, 1, 7 , 94, 1, 7 Biology of reproduction, 94, 1, 7 2016/01 公開
Nakajima-Koyama M, Lee J, Ohta S, Yamamoto T, Nishida E Nakajima-Koyama M, Lee J, Ohta S, Yamamoto T, Nishida E Induction of Pluripotency in Astrocytes through a Neural Stem Cell-like State. Induction of Pluripotency in Astrocytes through a Neural Stem Cell-like State. The Journal of biological chemistry, 290, 52, 31173-31188 , 290, 52, 31173-31188 The Journal of biological chemistry, 290, 52, 31173-31188 2015/12 公開
Lee J, Nakajima-Koyama M, Sone M, Koga M, Ebisuya M, Yamamoto T, Nishida E Lee J, Nakajima-Koyama M, Sone M, Koga M, Ebisuya M, Yamamoto T, Nishida E Secreted Ephrin Receptor A7 Promotes Somatic Cell Reprogramming by Inducing ERK Activity Reduction. Secreted Ephrin Receptor A7 Promotes Somatic Cell Reprogramming by Inducing ERK Activity Reduction. Stem cell reports, 5, 4, 480-489 , 5, 4, 480-489 Stem cell reports, 5, 4, 480-489 2015/10 公開
Sasaki K, Yokobayashi S, Nakamura T, Okamoto I, Yabuta Y, Kurimoto K, Ohta H, Moritoki Y, Iwatani C, Tsuchiya H, Nakamura S, Sekiguchi K, Sakuma T, Yamamoto T, Mori T, Woltjen K, Nakagawa M, Yamamoto T, Takahashi K, Yamanaka S, Saitou M Sasaki K, Yokobayashi S, Nakamura T, Okamoto I, Yabuta Y, Kurimoto K, Ohta H, Moritoki Y, Iwatani C, Tsuchiya H, Nakamura S, Sekiguchi K, Sakuma T, Yamamoto T, Mori T, Woltjen K, Nakagawa M, Yamamoto T, Takahashi K, Yamanaka S, Saitou M Robust In Vitro Induction of Human Germ Cell Fate from Pluripotent Stem Cells. Robust In Vitro Induction of Human Germ Cell Fate from Pluripotent Stem Cells. Cell stem cell, 17, 2, 178-194 , 17, 2, 178-194 Cell stem cell, 17, 2, 178-194 2015/08 英語 公開
Matsumoto Y, Ikeya M, Hino K, Horigome K, Fukuta M, Watanabe M, Nagata S, Yamamoto T, Otsuka T, Toguchida J Matsumoto Y, Ikeya M, Hino K, Horigome K, Fukuta M, Watanabe M, Nagata S, Yamamoto T, Otsuka T, Toguchida J New Protocol to Optimize iPS Cells for Genome Analysis of Fibrodysplasia Ossificans Progressiva. New Protocol to Optimize iPS Cells for Genome Analysis of Fibrodysplasia Ossificans Progressiva. Stem cells, 33, 6, 1730-1742 , 33, 6, 1730-1742 Stem cells, 33, 6, 1730-1742 2015/06 英語 公開
Kurimoto K, Yabuta Y, Hayashi K, Ohta H, Kiyonari H, Mitani T, Moritoki Y, Kohri K, Kimura H, Yamamoto T, Katou Y, Shirahige K, Saitou M Kurimoto K, Yabuta Y, Hayashi K, Ohta H, Kiyonari H, Mitani T, Moritoki Y, Kohri K, Kimura H, Yamamoto T, Katou Y, Shirahige K, Saitou M Quantitative Dynamics of Chromatin Remodeling during Germ Cell Specification from Mouse Embryonic Stem Cells. Quantitative Dynamics of Chromatin Remodeling during Germ Cell Specification from Mouse Embryonic Stem Cells. Cell stem cell, 16, 5, 517-532 , 16, 5, 517-532 Cell stem cell, 16, 5, 517-532 2015/05 英語 公開
Nakamura T, Yabuta Y, Okamoto I, Aramaki S, Yokobayashi S, Kurimoto K, Sekiguchi K, Nakagawa M, Yamamoto T, Saitou M Nakamura T, Yabuta Y, Okamoto I, Aramaki S, Yokobayashi S, Kurimoto K, Sekiguchi K, Nakagawa M, Yamamoto T, Saitou M SC3-seq: a method for highly parallel and quantitative measurement of single-cell gene expression. SC3-seq: a method for highly parallel and quantitative measurement of single-cell gene expression. Nucleic acids research, 43, 9 , 43, 9 Nucleic acids research, 43, 9 2015/05 英語 公開
Kim SI, Oceguera-Yanez F, Hirohata R, Linker S, Okita K, Yamada Y, Yamamoto T, Yamanaka S, Woltjen K Kim SI, Oceguera-Yanez F, Hirohata R, Linker S, Okita K, Yamada Y, Yamamoto T, Yamanaka S, Woltjen K KLF4 N-terminal variance modulates induced reprogramming to pluripotency. KLF4 N-terminal variance modulates induced reprogramming to pluripotency. Stem cell reports, 4, 4, 727-743 , 4, 4, 727-743 Stem cell reports, 4, 4, 727-743 2015/04 英語 公開
Sato T, Yamamoto T, Sehara-Fujisawa A Sato T, Yamamoto T, Sehara-Fujisawa A miR-195/497 induce postnatal quiescence of skeletal muscle stem cells. miR-195/497 induce postnatal quiescence of skeletal muscle stem cells. Nature communications, 5 , 5 Nature communications, 5 2014/08 英語 公開
K. Ohnishi; K. Semi; T. Yamamoto; M. Shimizu; A. Tanaka; K. Mitsunaga; K. Okita; K. Osafune; Y. Arioka; T. Maeda; H. Soejima; H. Moriwaki; S. Yamanaka; K. Woltjen; Y. Yamada K. Ohnishi; K. Semi; T. Yamamoto; M. Shimizu; A. Tanaka; K. Mitsunaga; K. Okita; K. Osafune; Y. Arioka; T. Maeda; H. Soejima; H. Moriwaki; S. Yamanaka; K. Woltjen; Y. Yamada Premature termination of reprogramming in vivo leads to cancer development through altered epigenetic regulation Premature termination of reprogramming in vivo leads to cancer development through altered epigenetic regulation Cell, 156, 4, 663-677 , 156, 4, 663-677 Cell, 156, 4, 663-677 2014/01 英語 公開
Fukuta M, Nakai Y, Kirino K, Nakagawa M, Sekiguchi K, Nagata S, Matsumoto Y, Yamamoto T, Umeda K, Heike T, Okumura N, Koizumi N, Sato T, Nakahata T, Saito M, Otsuka T, Kinoshita S, Ueno M, Ikeya M, Toguchida J Fukuta M, Nakai Y, Kirino K, Nakagawa M, Sekiguchi K, Nagata S, Matsumoto Y, Yamamoto T, Umeda K, Heike T, Okumura N, Koizumi N, Sato T, Nakahata T, Saito M, Otsuka T, Kinoshita S, Ueno M, Ikeya M, Toguchida J Derivation of mesenchymal stromal cells from pluripotent stem cells through a neural crest lineage using small molecule compounds with defined media. Derivation of mesenchymal stromal cells from pluripotent stem cells through a neural crest lineage using small molecule compounds with defined media. PLoS ONE, 9, 12 , 9, 12 PLoS ONE, 9, 12 2014 英語 公開
T. Hikichi; R. Matoba; T. Ikeda; A. Watanabe; T. Yamamoto; S. Yoshitake; M. Tamura-Nakano; T. Kimura; M. Kamon; M. Shimura; K. Kawakami; A. Okuda; H. Okochi; T. Inoue; A. Suzuki; S. Masui T. Hikichi; R. Matoba; T. Ikeda; A. Watanabe; T. Yamamoto; S. Yoshitake; M. Tamura-Nakano; T. Kimura; M. Kamon; M. Shimura; K. Kawakami; A. Okuda; H. Okochi; T. Inoue; A. Suzuki; S. Masui Transcription factors interfering with dedifferentiation induce cell type-specific transcriptional profiles Transcription factors interfering with dedifferentiation induce cell type-specific transcriptional profiles Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 110, 16, 6412-6417 , 110, 16, 6412-6417 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 110, 16, 6412-6417 2013/04/16 英語 公開
A. Nasu; M. Ikeya; T. Yamamoto; A. Watanabe; Y. Jin; Y. Matsumoto; K. Hayakawa; N. Amano; S. Sato; K. Osafune; T. Aoyama; T. Nakamura; T. Kato; J. Toguchida A. Nasu; M. Ikeya; T. Yamamoto; A. Watanabe; Y. Jin; Y. Matsumoto; K. Hayakawa; N. Amano; S. Sato; K. Osafune; T. Aoyama; T. Nakamura; T. Kato; J. Toguchida Genetically Matched Human iPS Cells Reveal that Propensity for Cartilage and Bone Differentiation Differs with Clones, not Cell Type of Origin Genetically Matched Human iPS Cells Reveal that Propensity for Cartilage and Bone Differentiation Differs with Clones, not Cell Type of Origin PLoS ONE, 8, 1 , 8, 1 PLoS ONE, 8, 1 2013/01 英語 公開
A. Hirata; J. Utikal; S. Yamashita; H. Aoki; A. Watanabe; T. Yamamoto; H. Okano; N. Bardeesy; T. Kunisada; T. Ushijima; A. Hara; R. Jaenisch; K. Hochedlinger; Y. Yamada A. Hirata; J. Utikal; S. Yamashita; H. Aoki; A. Watanabe; T. Yamamoto; H. Okano; N. Bardeesy; T. Kunisada; T. Ushijima; A. Hara; R. Jaenisch; K. Hochedlinger; Y. Yamada Dose-dependent roles for canonical Wnt signalling in de novo crypt formation and cell cycle properties of the colonic epithelium Dose-dependent roles for canonical Wnt signalling in de novo crypt formation and cell cycle properties of the colonic epithelium Development (Cambridge), 140, 1, 66-75 , 140, 1, 66-75 Development (Cambridge), 140, 1, 66-75 2013 英語 公開
M. Uno; S. Honjoh; M. Matsuda; H. Hoshikawa; S. Kishimoto; T. Yamamoto; M. Ebisuya; T. Yamamoto; K. Matsumoto; E. Nishida M. Uno; S. Honjoh; M. Matsuda; H. Hoshikawa; S. Kishimoto; T. Yamamoto; M. Ebisuya; T. Yamamoto; K. Matsumoto; E. Nishida A Fasting-Responsive Signaling Pathway that Extends Life Span in C. elegans A Fasting-Responsive Signaling Pathway that Extends Life Span in C. elegans Cell Reports, 3, 1, 79-91 , 3, 1, 79-91 Cell Reports, 3, 1, 79-91 2013 英語 公開
A. Tanaka; K. Woltjen; K. Miyake; A. Hotta; M. Ikeya; T. Yamamoto; T. Nishino; E. Shoji; A. Sehara-Fujisawa; Y. Manabe; N. Fujii; K. Hanaoka; T. Era; S. Yamashita; K.-I. Isobe; E. Kimura; H. Sakurai A. Tanaka; K. Woltjen; K. Miyake; A. Hotta; M. Ikeya; T. Yamamoto; T. Nishino; E. Shoji; A. Sehara-Fujisawa; Y. Manabe; N. Fujii; K. Hanaoka; T. Era; S. Yamashita; K.-I. Isobe; E. Kimura; H. Sakurai Efficient and Reproducible Myogenic Differentiation from Human iPS Cells: Prospects for Modeling Miyoshi Myopathy In Vitro Efficient and Reproducible Myogenic Differentiation from Human iPS Cells: Prospects for Modeling Miyoshi Myopathy In Vitro PLoS ONE, 8, 4 , 8, 4 PLoS ONE, 8, 4 2013 英語 公開
H. Sakai; T. Sato; H. Sakurai; T. Yamamoto; K. Hanaoka; D. Montarras; A. Sehara-Fujisawa H. Sakai; T. Sato; H. Sakurai; T. Yamamoto; K. Hanaoka; D. Montarras; A. Sehara-Fujisawa Fetal Skeletal Muscle Progenitors Have Regenerative Capacity after Intramuscular Engraftment in Dystrophin Deficient Mice Fetal Skeletal Muscle Progenitors Have Regenerative Capacity after Intramuscular Engraftment in Dystrophin Deficient Mice PLoS ONE, 8, 5 , 8, 5 PLoS ONE, 8, 5 2013 英語 公開
S. Ohta; E. Nishida; S. Yamanaka; T. Yamamoto S. Ohta; E. Nishida; S. Yamanaka; T. Yamamoto Global Splicing Pattern Reversion during Somatic Cell Reprogramming Global Splicing Pattern Reversion during Somatic Cell Reprogramming Cell Reports, 5, 2, 357-366 , 5, 2, 357-366 Cell Reports, 5, 2, 357-366 2013 英語 公開
T. Tanaka; K. Takahashi; M. Yamane; S. Tomida; S. Nakamura; K. Oshima; A. Niwa; R. Nishikomori; N. Kambe; H. Hara; M. Mitsuyama; N. Morone; J.E. Heuser; T. Yamamoto; A. Watanabe; A. Sato-Otsubo; S. Ogawa; I. Asaka; T. Heike; S. Yamanaka; T. Nakahata; M.K. Saito T. Tanaka; K. Takahashi; M. Yamane; S. Tomida; S. Nakamura; K. Oshima; A. Niwa; R. Nishikomori; N. Kambe; H. Hara; M. Mitsuyama; N. Morone; J.E. Heuser; T. Yamamoto; A. Watanabe; A. Sato-Otsubo; S. Ogawa; I. Asaka; T. Heike; S. Yamanaka; T. Nakahata; M.K. Saito Induced pluripotent stem cells from CINCA syndrome patients as a model for dissecting somatic mosaicism and drug discovery Induced pluripotent stem cells from CINCA syndrome patients as a model for dissecting somatic mosaicism and drug discovery Blood, 120, 6, 1299-1308 , 120, 6, 1299-1308 Blood, 120, 6, 1299-1308 2012/08/09 英語 公開
I. Minami; K. Yamada; T.G. Otsuji; T. Yamamoto; Y. Shen; S. Otsuka; S. Kadota; N. Morone; M. Barve; Y. Asai; T. Tenkova-Heuser; J.E. Heuser; M. Uesugi; K. Aiba; N. Nakatsuji I. Minami; K. Yamada; T.G. Otsuji; T. Yamamoto; Y. Shen; S. Otsuka; S. Kadota; N. Morone; M. Barve; Y. Asai; T. Tenkova-Heuser; J.E. Heuser; M. Uesugi; K. Aiba; N. Nakatsuji A Small Molecule that Promotes Cardiac Differentiation of Human Pluripotent Stem Cells under Defined, Cytokine- and Xeno-free Conditions A Small Molecule that Promotes Cardiac Differentiation of Human Pluripotent Stem Cells under Defined, Cytokine- and Xeno-free Conditions Cell Reports, 2, 5, 1448-1460 , 2, 5, 1448-1460 Cell Reports, 2, 5, 1448-1460 2012 英語 公開
S. Matsumura; M. Hamasaki; T. Yamamoto; M. Ebisuya; M. Sato; E. Nishida; F. Toyoshima S. Matsumura; M. Hamasaki; T. Yamamoto; M. Ebisuya; M. Sato; E. Nishida; F. Toyoshima ABL1 regulates spindle orientation in adherent cells and mammalian skin ABL1 regulates spindle orientation in adherent cells and mammalian skin Nature Communications, 3 , 3 Nature Communications, 3 2012 英語 公開
N. Egawa; S. Kitaoka; K. Tsukita; M. Naitoh; K. Takahashi; T. Yamamoto; F. Adachi; T. Kondo; K. Okita; I. Asaka; T. Aoi; A. Watanabe; Y. Yamada; A. Morizane; J. Takahashi; T. Ayaki; H. Ito; K. Yoshikawa; S. Yamawaki; S. Suzuki; D. Watanabe; H. Hioki; T. Kaneko; K. Makioka; K. Okamoto; H. Takuma; A. Tamaoka; K. Hasegawa; T. Nonaka; M. Hasegawa; A. Kawata; M. Yoshida; T. Nakahata; R. Takahashi; M.C.N. Marchetto; F.H. Gage; S. Yamanaka; H. Inoue N. Egawa; S. Kitaoka; K. Tsukita; M. Naitoh; K. Takahashi; T. Yamamoto; F. Adachi; T. Kondo; K. Okita; I. Asaka; T. Aoi; A. Watanabe; Y. Yamada; A. Morizane; J. Takahashi; T. Ayaki; H. Ito; K. Yoshikawa; S. Yamawaki; S. Suzuki; D. Watanabe; H. Hioki; T. Kaneko; K. Makioka; K. Okamoto; H. Takuma; A. Tamaoka; K. Hasegawa; T. Nonaka; M. Hasegawa; A. Kawata; M. Yoshida; T. Nakahata; R. Takahashi; M.C.N. Marchetto; F.H. Gage; S. Yamanaka; H. Inoue Drug screening for ALS using patient-specific induced pluripotent stem cells Drug screening for ALS using patient-specific induced pluripotent stem cells Science Translational Medicine, 4, 145 , 4, 145 Science Translational Medicine, 4, 145 2012 英語 公開
K. Sunadome; T. Yamamoto; M. Ebisuya; K. Kondoh; A. Sehara-Fujisawa; E. Nishida K. Sunadome; T. Yamamoto; M. Ebisuya; K. Kondoh; A. Sehara-Fujisawa; E. Nishida ERK5 Regulates Muscle Cell Fusion through Klf Transcription Factors ERK5 Regulates Muscle Cell Fusion through Klf Transcription Factors Developmental Cell, 20, 2, 192-205 , 20, 2, 192-205 Developmental Cell, 20, 2, 192-205 2011/02/15 英語 公開
T. Endo; M. Kusakabe; K. Sunadome; T. Yamamoto; E. Nishida T. Endo; M. Kusakabe; K. Sunadome; T. Yamamoto; E. Nishida The kinase SGK1 in the endoderm and mesoderm promotes ectodermal survival by down-regulating components of the death-inducing signaling complex The kinase SGK1 in the endoderm and mesoderm promotes ectodermal survival by down-regulating components of the death-inducing signaling complex Science Signaling, 4, 156 , 4, 156 Science Signaling, 4, 156 2011/01/18 英語 公開
M. Mitsushima; K. Aoki; M. Ebisuya; S. Matsumura; T. Yamamoto; M. Matsuda; F. Toyoshima; E. Nishida M. Mitsushima; K. Aoki; M. Ebisuya; S. Matsumura; T. Yamamoto; M. Matsuda; F. Toyoshima; E. Nishida Revolving movement of a dynamic cluster of actin filaments during mitosis Revolving movement of a dynamic cluster of actin filaments during mitosis Journal of Cell Biology, 191, 3, 453-462 , 191, 3, 453-462 Journal of Cell Biology, 191, 3, 453-462 2010 英語 公開
M. Akashi; H. Soma; T. Yamamoto; A. Tsugitomi; S. Yamashita; T. Yamamoto; E. Nishida; A. Yasuda; J.K. Liao; K. Node M. Akashi; H. Soma; T. Yamamoto; A. Tsugitomi; S. Yamashita; T. Yamamoto; E. Nishida; A. Yasuda; J.K. Liao; K. Node Noninvasive method for assessing the human circadian clock using hair follicle cells Noninvasive method for assessing the human circadian clock using hair follicle cells Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 107, 35, 15643-15648 , 107, 35, 15643-15648 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 107, 35, 15643-15648 2010 英語 公開
S. Honjoh; T. Yamamoto; M. Uno; E. Nishida S. Honjoh; T. Yamamoto; M. Uno; E. Nishida Signalling through RHEB-1 mediates intermittent fasting-induced longevity in C. elegans Signalling through RHEB-1 mediates intermittent fasting-induced longevity in C. elegans Nature, 457, 7230, 726-U6 , 457, 7230, 726-U6 Nature, 457, 7230, 726-U6 2009/02/05 英語 公開
M. Ebisuya; T. Yamamoto; M. Nakajima; E. Nishida M. Ebisuya; T. Yamamoto; M. Nakajima; E. Nishida Ripples from neighbouring transcription Ripples from neighbouring transcription Nature Cell Biology, 10, 9, 1106-1113 , 10, 9, 1106-1113 Nature Cell Biology, 10, 9, 1106-1113 2008 英語 公開
M. Maekawa; T. Yamamoto; M. Kohno; M. Takeichi; E. Nishida M. Maekawa; T. Yamamoto; M. Kohno; M. Takeichi; E. Nishida Requirement for ERK MAP kinase in mouse preimplantation development Requirement for ERK MAP kinase in mouse preimplantation development Development, 134, 15, 2751-2759 , 134, 15, 2751-2759 Development, 134, 15, 2751-2759 2007 英語 公開
T. Yamamoto; M. Ebisuya; F. Ashida; K. Okamoto; S. Yonehara; E. Nishida T. Yamamoto; M. Ebisuya; F. Ashida; K. Okamoto; S. Yonehara; E. Nishida Continuous ERK Activation Downregulates Antiproliferative Genes throughout G1 Phase to Allow Cell-Cycle Progression Continuous ERK Activation Downregulates Antiproliferative Genes throughout G1 Phase to Allow Cell-Cycle Progression Current Biology, 16, 12, 1171-1182 , 16, 12, 1171-1182 Current Biology, 16, 12, 1171-1182 2006 英語 公開
S. Torii; T. Yamamoto; Y. Tsuchiya; E. Nishida S. Torii; T. Yamamoto; Y. Tsuchiya; E. Nishida ERK MAP kinase in G<sub>1</sub> cell cycle progression and cancer ERK MAP kinase in G<sub>1</sub> cell cycle progression and cancer Cancer Science, 97, 8, 697-702 , 97, 8, 697-702 Cancer Science, 97, 8, 697-702 2006 英語 公開
M. Maekawa; T. Yamamoto; T. Tanoue; Y. Yuasa; O. Chisaka; E. Nishida M. Maekawa; T. Yamamoto; T. Tanoue; Y. Yuasa; O. Chisaka; E. Nishida Requirement of the MAP kinase signaling pathways for mouse preimplantation development Requirement of the MAP kinase signaling pathways for mouse preimplantation development Development, 132, 8, 1773-1783 , 132, 8, 1773-1783 Development, 132, 8, 1773-1783 2005/04 英語 公開
S. Torii; K. Nakayama; T. Yamamoto; E. Nishida S. Torii; K. Nakayama; T. Yamamoto; E. Nishida Regulatory mechanisms and function of ERK MAP kinases Regulatory mechanisms and function of ERK MAP kinases Journal of Biochemistry, 136, 5, 557-561 , 136, 5, 557-561 Journal of Biochemistry, 136, 5, 557-561 2004 英語 公開
M. Maekawa; T. Yamamoto; E. Nishida M. Maekawa; T. Yamamoto; E. Nishida Regulation of subcellular localization of the antiproliferative protein Tob by its nuclear export signal and bipartite nuclear localization signal sequences Regulation of subcellular localization of the antiproliferative protein Tob by its nuclear export signal and bipartite nuclear localization signal sequences Experimental Cell Research, 295, 1, 59-65 , 295, 1, 59-65 Experimental Cell Research, 295, 1, 59-65 2004 英語 公開
s. Torii; M. Kusakabe; T. Yamamoto; M. Maekawa; E. Nishida s. Torii; M. Kusakabe; T. Yamamoto; M. Maekawa; E. Nishida Sef is a spatial regulator for Ras/MAP kinase signaling Sef is a spatial regulator for Ras/MAP kinase signaling Developmental Cell, 7, 1, 33-44 , 7, 1, 33-44 Developmental Cell, 7, 1, 33-44 2004 英語 公開
T. Tanoue; T. Yamamoto; E. Nishida T. Tanoue; T. Yamamoto; E. Nishida Modular structure of a docking surface on MAPK phosphatases Modular structure of a docking surface on MAPK phosphatases Journal of Biological Chemistry, 277, 25, 22942-22949 , 277, 25, 22942-22949 Journal of Biological Chemistry, 277, 25, 22942-22949 2002 英語 公開
T. Tanoue; T. Yamamoto; R. Maeda; E. Nishida T. Tanoue; T. Yamamoto; R. Maeda; E. Nishida A Novel MAPK Phosphatase MKP-7 Acts Preferentially on JNK/SAPK and p38α and β MAPKs A Novel MAPK Phosphatase MKP-7 Acts Preferentially on JNK/SAPK and p38α and β MAPKs Journal of Biological Chemistry, 276, 28, 26629-26639 , 276, 28, 26629-26639 Journal of Biological Chemistry, 276, 28, 26629-26639 2001 英語 公開

  • <<
  • >>
  • 表示
タイトル言語:
Misc
著者 著者(日本語) 著者(英語) タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 書誌情報等 書誌情報等(日本語) 書誌情報等(英語) 出版年月 査読の有無 記述言語 掲載種別 公開
那須輝,加藤友久,山本拓也,中村孝志,池谷真,戸口田淳也 那須輝,加藤友久,山本拓也,中村孝志,池谷真,戸口田淳也 同一ドナーの異なる組織より樹立したiPS 細胞の比較検討 同一ドナーの異なる組織より樹立したiPS 細胞の比較検討 第11 回日本再生医療学会(2012.6.13.横浜) 第11 回日本再生医療学会(2012.6.13.横浜) 2012 日本語 公開
太田翔、西田栄介、山中伸弥、山本拓也 太田翔、西田栄介、山中伸弥、山本拓也 Ohta S, Nishida E, Yamanaka S, and Yamamoto T. 体細胞初期化過程における選択的スプライシング制御の変化 体細胞初期化過程における選択的スプライシング制御の変化 Global changes of splicing regulation in the reprogramming process 第34回日本分子生物学会年会、パシフィコ横浜、2011.12.13-16 第34回日本分子生物学会年会、パシフィコ横浜、2011.12.13-16 第34回日本分子生物学会年会、パシフィコ横浜、2011.12.13-16 2011/12 英語 公開
太田翔、西田栄介、山中伸弥、山本拓也 太田翔、西田栄介、山中伸弥、山本拓也 体細胞初期化過程における選択的スプライシング制御機構の解明 体細胞初期化過程における選択的スプライシング制御機構の解明 第84回日本生化学会大会、京都 2011.9.21-24. 第84回日本生化学会大会、京都 2011.9.21-24. 2011/09 日本語 公開
松村繁,濱崎真弓,山本拓也,戎家美紀,佐藤みずほ,西田栄介,豊島文子 松村繁,濱崎真弓,山本拓也,戎家美紀,佐藤みずほ,西田栄介,豊島文子 ABL1による 細胞分裂軸方向の制御機構 ABL1による 細胞分裂軸方向の制御機構 第63 回 日本細胞生物学会大会、札幌、2011 年6 月 27-29 日( ポスター) 第63 回 日本細胞生物学会大会、札幌、2011 年6 月 27-29 日( ポスター) 2011/06 日本語 公開
山本拓也;山中伸弥;山中伸弥 山本拓也;山中伸弥;山中伸弥 細胞核の初期化メカニズム  多能性・全能性獲得のナゾに迫る  05  iPS細胞の樹立からみた「遺伝子導入と核のリプログラミング」 細胞核の初期化メカニズム  多能性・全能性獲得のナゾに迫る  05  iPS細胞の樹立からみた「遺伝子導入と核のリプログラミング」 メディカルバイオ, 6, 5, 34-39 メディカルバイオ, 6, 5, 34-39 , 6, 5, 34-39 2009/09/01 日本語 公開
松村繁,濱畸眞弓,戎家美紀,山本拓也,西田栄介,豊島文子 松村繁,濱畸眞弓,戎家美紀,山本拓也,西田栄介,豊島文子 c-Abl チロシンキナーゼ によるマウス胎杼の皮膚基底層における細胞分裂軸の制御機構 c-Abl チロシンキナーゼ によるマウス胎杼の皮膚基底層における細胞分裂軸の制御機構 第82 回日本生化学会大会、神戸、2009 年10月21-24 日 第82 回日本生化学会大会、神戸、2009 年10月21-24 日 2009 日本語 公開
松村繁,濱畸眞弓,戎家美紀,山本拓也,西田栄介,豊島文子 松村繁,濱畸眞弓,戎家美紀,山本拓也,西田栄介,豊島文子 c-Abl チロシンキナーゼ による細胞分裂軸の制御機構 c-Abl チロシンキナーゼ による細胞分裂軸の制御機構 第32 回日本分子生物学会年会、横浜、2009年12月9-12 日 第32 回日本分子生物学会年会、横浜、2009年12月9-12 日 2009 日本語 公開
山本拓也、西田栄介 山本拓也、西田栄介 MAPキナーゼERKの時空間制御 MAPキナーゼERKの時空間制御 蛋白質 核酸 酵素, 6月, 747-752’ 蛋白質 核酸 酵素, 6月, 747-752’ , 6月, 747-752’ 2007/06 日本語 総説・解説(商業誌、新聞、ウェブメディア) 公開
山本拓也、西田栄介 山本拓也、西田栄介 MAPキナーゼカスケードの多様な役割 MAPキナーゼカスケードの多様な役割 実験医学増刊号, 6月, 31-38 実験医学増刊号, 6月, 31-38 , 6月, 31-38 2005/06 日本語 総説・解説(商業誌、新聞、ウェブメディア) 公開
山本拓也、西田栄介 山本拓也、西田栄介 増殖因子からがんへ 増殖因子からがんへ 最新医学, 9月, 2194-2202 最新医学, 9月, 2194-2202 , 9月, 2194-2202 2003/09 日本語 総説・解説(商業誌、新聞、ウェブメディア) 公開
Masamitsu Sone, Shinya Yamanaka, Takuya Yamamoto. Masamitsu Sone, Shinya Yamanaka, Takuya Yamamoto. Hybrid cellular metabolism coordinated by Zic3 and Esrrb synergistically enhances somatic cell reprogramming. Hybrid cellular metabolism coordinated by Zic3 and Esrrb synergistically enhances somatic cell reprogramming. ISSCR 2017, Boston, USA, June 14-17, 2017 ISSCR 2017, Boston, USA, June 14-17, 2017 2017/06 英語 公開
Hiroki Ikeda, Masamitsu Sone, Shinya Yamanaka, Takuya Yamamoto Hiroki Ikeda, Masamitsu Sone, Shinya Yamanaka, Takuya Yamamoto CHROMATIN INTERACTIONS AT DEVELOPMENTAL GENE LOCI ARE REESTABLISHED BY SOMATIC CELL REPROGRAMMING CHROMATIN INTERACTIONS AT DEVELOPMENTAL GENE LOCI ARE REESTABLISHED BY SOMATIC CELL REPROGRAMMING 第13 回ISSCR(2015.6.24-27 ストックホルム) 第13 回ISSCR(2015.6.24-27 ストックホルム) 2015/06 英語 公開
Sone M, Yamanaka S, and Yamamoto T. Sone M, Yamanaka S, and Yamamoto T. ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR AND ZIC FAMILY TRANSCRPTION FACTORS SYNERGISTICALLY ENHANCE SOMATIC CELL REPROGRAMMING ORPHAN NUCLEAR RECEPTOR AND ZIC FAMILY TRANSCRPTION FACTORS SYNERGISTICALLY ENHANCE SOMATIC CELL REPROGRAMMING 第13 回ISSCR(2015.6.24-27 ストックホルム) 第13 回ISSCR(2015.6.24-27 ストックホルム) 2015/06 英語 公開
Hiroki Ikeda, Masamitsu Sone, Shinya Yamanaka, Takuya Yamamoto Hiroki Ikeda, Masamitsu Sone, Shinya Yamanaka, Takuya Yamamoto ANALYSIS OF LONG-RANGE CHROMATIN INTERACTION NETWORKS IN PLURIPOTENT STEM CELLS ANALYSIS OF LONG-RANGE CHROMATIN INTERACTION NETWORKS IN PLURIPOTENT STEM CELLS 第12 回ISSCR(2014.6.18-21 バンクーバー) 第12 回ISSCR(2014.6.18-21 バンクーバー) 2014/06 英語 公開
Ohta S, Nishida E, Yamanaka S, and Yamamoto T. Ohta S, Nishida E, Yamanaka S, and Yamamoto T. RNA splicing regulation during somatic cell reprogramming RNA splicing regulation during somatic cell reprogramming 第11 回ISSCR(2013.6.12-15 ボストン) 第11 回ISSCR(2013.6.12-15 ボストン) 2013/07 英語 公開
Sone M, Yamanaka S, and Yamamoto T. Sone M, Yamanaka S, and Yamamoto T. Inferring the transcription networks required for induction of pluripotecy Inferring the transcription networks required for induction of pluripotecy 第10 回ISSCR(2012.6.13-16.横浜) 第10 回ISSCR(2012.6.13-16.横浜) 2013/06 英語 公開
Hiroki Ikeda, Masamitsu Sone, Shinya Yamanaka, Takuya Yamamoto Hiroki Ikeda, Masamitsu Sone, Shinya Yamanaka, Takuya Yamamoto Exploration of chromatin interactions in pluripotent stem cells Exploration of chromatin interactions in pluripotent stem cells 第11 回ISSCR(2013.6.12-15 ボストン) 第11 回ISSCR(2013.6.12-15 ボストン) 2013/06 英語 公開
Ikeda H, Sone M, Yamanaka S, and Yamamoto T. Ikeda H, Sone M, Yamanaka S, and Yamamoto T. Global analysis of higher-order chromatin structure in pluripotent stem cells Global analysis of higher-order chromatin structure in pluripotent stem cells 第10 回ISSCR(2012.6.13-16.横浜) 第10 回ISSCR(2012.6.13-16.横浜) 2012/06 英語 公開
Ohta S, Nishida E, Yamanaka S, and Yamamoto T. Ohta S, Nishida E, Yamanaka S, and Yamamoto T. Dynamic alteration in rna splicing during somatic cell reprogramming Dynamic alteration in rna splicing during somatic cell reprogramming 第10 回ISSCR(2012.6.13-16.横浜) 第10 回ISSCR(2012.6.13-16.横浜) 2012/06 英語 公開
Nasu A, Kato T, Yamamoto T, Ikeya M, Toguchida J. Nasu A, Kato T, Yamamoto T, Ikeya M, Toguchida J. Genetically matched human iPS cells revealed that the propensity for iPS cells to differentiate into cartilage lineage cells differs with clones, but not cell type of origin Genetically matched human iPS cells revealed that the propensity for iPS cells to differentiate into cartilage lineage cells differs with clones, but not cell type of origin 第10 回ISSCR(2012.6.15.横浜) 第10 回ISSCR(2012.6.15.横浜) 2012/06 英語 公開
S. Matsumura, M. Hamasaki, T. Yamamoto, M. Ebisuya, M. Sato, E. Nishida, F. Toyoshima S. Matsumura, M. Hamasaki, T. Yamamoto, M. Ebisuya, M. Sato, E. Nishida, F. Toyoshima Genome-wide survey of kinases identified ABL 1 as a novel regulator of spindle orientation \nin adherent cells and mammalian skin. Genome-wide survey of kinases identified ABL 1 as a novel regulator of spindle orientation \nin adherent cells and mammalian skin. EMBO Conference “Centrosomes and Spindle Pole Bodies", October 2-6, 2011, Barcelona, Spain (oral) EMBO Conference “Centrosomes and Spindle Pole Bodies", October 2-6, 2011, Barcelona, Spain (oral) 2011 英語 公開
Nasu A, Kato T, Yamamoto T, Nakamura T, Toguchida J. Nasu A, Kato T, Yamamoto T, Nakamura T, Toguchida J. Comaprison of human iPSCs generated from different \ntissues of identical donors. Comaprison of human iPSCs generated from different \ntissues of identical donors. 第33 回日本分子生物学会年会(2010.12.10 神戸) 第33 回日本分子生物学会年会(2010.12.10 神戸) 2010/12/10 英語 公開

  • <<
  • >>
  • 表示
タイトル言語:
講演・口頭発表等
タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 会議名 会議名(日本語) 会議名(英語) 主催者 主催者(日本語) 主催者(英語) 開催年月日 記述言語 会議種別 公開
次世代シークエンサーを用いたiPS細胞研究[招待あり] 次世代シークエンサーを用いたiPS細胞研究 [招待あり] 第35回近畿肉腫研究会 第35回近畿肉腫研究会 2010/12/18 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
次世代シーケンサーを用いたiPS細胞研究[招待あり] 次世代シーケンサーを用いたiPS細胞研究 [招待あり] Japan Sequencing Forum 2010 Japan Sequencing Forum 2010 2010/09/30 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
次世代シークエンサーSOLiDを用いたiPS細胞研究[招待あり] 次世代シークエンサーSOLiDを用いたiPS細胞研究 [招待あり] 第43回日本発生生物学会ランチョンセミナー 第43回日本発生生物学会ランチョンセミナー 2010/06/23 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
次世代シークエンサーを用いたiPS細胞研究[招待あり] 次世代シークエンサーを用いたiPS細胞研究 [招待あり] 第57回日本生化学会近畿支部例会 第57回日本生化学会近畿支部例会 2010/05/22 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Dynamic alteration in RNA splicing during somatic cell reprogramming[招待あり] Dynamic alteration in RNA splicing during somatic cell reprogramming [招待あり] Global COE Program “Education and Research Center for Stem Cell Medicine” Final Symposium, Global COE Program “Education and Research Center for Stem Cell Medicine” Final Symposium, 2012/12/04 英語 口頭発表(招待・特別) 公開
Reversion of somatic splicing during the reprogramming process[招待あり] Reversion of somatic splicing during the reprogramming process [招待あり] CLS-iCeMS Joint Symposium CLS-iCeMS Joint Symposium 2012/04/21 英語 口頭発表(招待・特別) 公開
タイトル言語:
外部資金:競争的資金・科学研究費補助金
種別 代表/分担 テーマ(日本語) テーマ(英語) 期間
若手研究(B) 代表 iPS細胞における個性の評価法の開発 2010/04/01〜2011/03/31
特別推進研究 分担 細胞核初期化の分子基盤 2011/04/01〜2012/03/31
挑戦的萌芽研究 代表 体細胞初期化過程における内在性レトロトランスポゾンの役割 (平成26年度分) 2014/04/01〜2016/03/31
新学術領域(領域提案型) 公募 代表 細胞分化可塑性を規定する染色体高次構造の解析 Analysis of higher-order chromatin structures that regulate cell differentiation plasticity 2015/04/01〜2017/03/31
新学術領域研究(研究領域提案型) 代表 細胞分化可塑性を規定する染色体高次構造の解析 (平成27年度分) 2015/04/01〜2016/03/31
挑戦的萌芽研究 代表 体細胞初期化過程における内在性レトロトランスポゾンの役割 (平成27年度分) 2015/04/01〜2016/03/31
新学術領域研究(研究領域提案型) 代表 細胞分化可塑性を規定する染色体高次構造の解析 (平成28年度分) 2016/04/01〜2017/03/31
担当科目
講義名(日本語) 講義名(英語) 開講期 学部/研究科 年度
細胞と物質をつなぐ科学 Integrated Cell-Material Sciences 後期 全学共通科目 2012/04〜2013/03
細胞と物質をつなぐ科学 Integrated Cell-Material Sciences 後期 全学共通科目 2013/04〜2014/03
細胞と物質をつなぐ科学 Integrated Cell-Material Sciences 後期 全学共通科目 2014/04〜2015/03
細胞と物質をつなぐ科学 Integrated Cell-Material Sciences 後期 全学共通科目 2015/04〜2016/03
ゲノム生命科学特論 Advanced course of genome life sciences 通年集中 生命科学研究科 2018/04〜2019/03
全学運営(役職等)
役職名 期間
部局運営(役職等)
役職名 期間
運営小委員会A(高速シークエンサー委員会) 2011/06/01〜
共通機器管理運営委員会1号委員
情報管理委員会7号委員 2014/04/01〜2020/03/31
その他活動:講演歴
会合名 講演タイトル 年月
京都大学iPS細胞研究所(CiRA=サイラ)主催 サイエンスカフェ 第2回CiRAカフェ・FIRST 「iPS細胞を解読せよ!  最先端の次世代シーケンサーを用いた謎解き」 2011/11/18
第13回 iCeMSカフェ 『iPS 細胞と「研究」とわたし』 2012/12/08
東海高等学校・中学校 サタデープログラム29th (土曜市民公開講座) iPSの誕生とその未来 2016/06/25
YCAMバイオ・リサーチ・オープンデイvol6 細胞と遺伝子 2017/02/11
川西市生涯学習短期大学レフネック オープン講座 よくわかるiPS細胞講座:iPS細胞が生まれた科学的背景と今後の生物学の発展について 2017/07/07
その他活動:初等・中等教育活動歴
活動名 活動内容 学校名 都道府県名 年月
「未来のサイエンティスト養成事業」、「科学の子育成事業」 出前授業 京都市教育委員会、大津市科学館、共催 京都府、滋賀県 2015/07/29
その他活動:新聞・雑誌等
タイトル 内容 メディア名 掲載欄 年月日
ニッポンのサイエンス iPS細胞研究最前線 日本経済新聞朝刊、日経産業新聞 広告欄 2014/07/28
iPS細胞作製に関与 2種類のたんぱく質 京大が発見 Cell Reports掲載の報道 日本経済新聞 科学欄 2013/10/18
DNAの”切り貼り”パターン iPS作製時に初期化 Cell Reports掲載報道 日刊工業新聞 科学欄 2013/10/18
その他活動:国・地方公共団体での活動
委員会名(日本語) 委員会名(英語) 役職名 公共団体の名称 期間
その他活動:民間企業・NPO等の兼業
相手先名 兼業の内容 期間