由里本 博也

最終更新日時: 2017/06/19 18:09:39

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氏名(漢字/フリガナ/アルファベット表記)
由里本 博也/ユリモト ヒロヤ/Hiroya Yurimoto
所属部署・職名(部局/所属/講座等/職名)
農学研究科/応用生命科学専攻応用微生物学講座/准教授
学部兼担
部局 所属 講座等 職名
農学部
連絡先住所
種別 住所(日本語) 住所(英語)
職場 〒606-8502 京都府京都市左京区北白川追分町 Kitashirakawa Oiwake, Sakyo-ku, Kyoto 606-8502, Japan
所属学会(国内)
学会名(日本語) 学会名(英語)
日本農芸化学会 Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
日本生物工学会 The Society for Biotechnology, Japan
日本分子生物学会 The Molecular Biology Society of Japan
取得学位
学位名(日本語) 学位名(英語) 大学(日本語) 大学(英語) 取得区分
修士(農学) 京都大学
博士(農学) 京都大学
出身大学院・研究科等
大学名(日本語) 大学名(英語) 研究科名(日本語) 研究科名(英語) 専攻名(日本語) 専攻名(英語) 修了区分
京都大学 大学院農学研究科修士課程農芸化学専攻 修了
出身学校・専攻等
大学名(日本語) 大学名(英語) 学部名(日本語) 学部名(英語) 学科名(日本語) 学科名(英語) 卒業区分
京都大学 農学部農芸化学科 卒業
職歴
期間 組織名(日本語) 組織名(英語) 職名(日本語) 職名(英語)
プロフィール
(日本語)
1994年京都大学農学部農芸化学科卒業、1996年京都大学大学院農学研究科農芸化学専攻修士課程修了。1996年より京都大学農学部助手、2006年より京都大学大学院農学研究科助教授、2007年より同准教授、現在に至る。2001年3月京都大学博士(農学)取得。2007年3月日本農芸化学会農芸化学奨励賞受賞。
個人ホームページ
URL
http://www.seigyo.kais.kyoto-u.ac.jp/
研究テーマ
(日本語)
微生物の代謝生理・遺伝子発現制御機構の解明と応用機能開発
(英語)
Physiology and metabolism of microorganisms, molecular mechanism of gene regulation and its application
研究概要
(日本語)
メタン、メタノール、ホルムアルデヒドなどのC1化合物を利用する微生物を対象に、代謝、細胞生理、遺伝子発現制御の分子基盤を解明し、自然界における生理・生態と炭素循環における役割を明らかにするとともに、C1微生物やその細胞機能を利用した有用物質・有用タンパク質生産技術の開発や環境浄化技術の開発などの応用機能開発研究を行っている。
研究分野(キーワード)
キーワード(日本語) キーワード(英語)
応用微生物学
微生物代謝
遺伝子発現
環境微生物
環境技術
研究分野(科研費分類コード)
科研費分類コード
応用微生物学
環境技術・環境材料
応用分子細胞生物学
論文
著者 著者(日本語) 著者(英語) タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 書誌情報等 出版年月 査読の有無 記述言語 掲載種別 公開
Ohsawa S, Yurimoto H, Sakai Y Ohsawa S, Yurimoto H, Sakai Y Ohsawa S, Yurimoto H, Sakai Y Novel function of Wsc proteins as a methanol-sensing machinery in the yeast Pichia pastoris. Novel function of Wsc proteins as a methanol-sensing machinery in the yeast Pichia pastoris. Novel function of Wsc proteins as a methanol-sensing machinery in the yeast Pichia pastoris. Molecular microbiology,104,2,349-363 2017/04 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Ikezoe T, Yang J, Nishioka C, Pan B, Xu K, Furihata M, Nakamura K, Yurimoto H, Sakai Y, Honda G, Yokoyama A Ikezoe T, Yang J, Nishioka C, Pan B, Xu K, Furihata M, Nakamura K, Yurimoto H, Sakai Y, Honda G, Yokoyama A Ikezoe T, Yang J, Nishioka C, Pan B, Xu K, Furihata M, Nakamura K, Yurimoto H, Sakai Y, Honda G, Yokoyama A The fifth epidermal growth factor-like region of thrombomodulin exerts cytoprotective function and prevents SOS in a murine model. The fifth epidermal growth factor-like region of thrombomodulin exerts cytoprotective function and prevents SOS in a murine model. The fifth epidermal growth factor-like region of thrombomodulin exerts cytoprotective function and prevents SOS in a murine model. Bone marrow transplantation,52,1,73-79 2017/01 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Oda S, Yurimoto H, Nitta N, Sakai Y Oda S, Yurimoto H, Nitta N, Sakai Y Oda S, Yurimoto H, Nitta N, Sakai Y Unique C-terminal region of Hap3 is required for methanol-regulated gene expression in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Unique C-terminal region of Hap3 is required for methanol-regulated gene expression in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Unique C-terminal region of Hap3 is required for methanol-regulated gene expression in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Microbiology (Reading, England),162,5,898-907 2016/05 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Damtab J, Nutaratat P, Boontham W, Srisuk N, Duangmal K, Yurimoto H, Sakai Y, Muramatsu Y, Nakagawa Y Damtab J, Nutaratat P, Boontham W, Srisuk N, Duangmal K, Yurimoto H, Sakai Y, Muramatsu Y, Nakagawa Y Damtab J, Nutaratat P, Boontham W, Srisuk N, Duangmal K, Yurimoto H, Sakai Y, Muramatsu Y, Nakagawa Y Roseomonas elaeocarpi sp. nov., isolated from olive (Elaeocarpus hygrophilus Kurz.) phyllosphere. Roseomonas elaeocarpi sp. nov., isolated from olive (Elaeocarpus hygrophilus Kurz.) phyllosphere. Roseomonas elaeocarpi sp. nov., isolated from olive (Elaeocarpus hygrophilus Kurz.) phyllosphere. International journal of systematic and evolutionary microbiology,66,1,474-480 2015/11 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Shiraishi K, Oku M, Uchida D, Yurimoto H, Sakai Y Shiraishi K, Oku M, Uchida D, Yurimoto H, Sakai Y Shiraishi K, Oku M, Uchida D, Yurimoto H, Sakai Y Regulation of nitrate and methylamine metabolism by multiple nitrogen sources in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Regulation of nitrate and methylamine metabolism by multiple nitrogen sources in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Regulation of nitrate and methylamine metabolism by multiple nitrogen sources in the methylotrophic yeast Candida boidinii. FEMS yeast research,15,7 2015/09 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
由里本 博也, 阪井 康能 由里本 博也, 阪井 康能 由里本 博也, 阪井 康能 C1微生物-植物共生系によるC1炭素固定と植物生長促進 C1微生物-植物共生系によるC1炭素固定と植物生長促進 C1-Carbon Fixation and Plant Growth Promotion Through Symbiotic Interactions between C1-Microorganisms and Plants 光合成研究 = News letter,25,2,92-99 2015/08 日本語 公開
Hamilton R, Kits KD, Ramonovskaya VA, Rozova ON, Yurimoto H, Iguchi H, Khmelenina VN, Sakai Y, Dunfield PF, Klotz MG, Knief C, Op den Camp HJ, Jetten MS, Bringel F, Vuilleumier S, Svenning MM, Shapiro N, Woyke T, Trotsenko YA, Stein LY, Kalyuzhnaya MG Hamilton R, Kits KD, Ramonovskaya VA, Rozova ON, Yurimoto H, Iguchi H, Khmelenina VN, Sakai Y, Dunfield PF, Klotz MG, Knief C, Op den Camp HJ, Jetten MS, Bringel F, Vuilleumier S, Svenning MM, Shapiro N, Woyke T, Trotsenko YA, Stein LY, Kalyuzhnaya MG Hamilton R, Kits KD, Ramonovskaya VA, Rozova ON, Yurimoto H, Iguchi H, Khmelenina VN, Sakai Y, Dunfield PF, Klotz MG, Knief C, Op den Camp HJ, Jetten MS, Bringel F, Vuilleumier S, Svenning MM, Shapiro N, Woyke T, Trotsenko YA, Stein LY, Kalyuzhnaya MG Draft genomes of gammaproteobacterial methanotrophs isolated from terrestrial ecosystems. Draft genomes of gammaproteobacterial methanotrophs isolated from terrestrial ecosystems. Draft genomes of gammaproteobacterial methanotrophs isolated from terrestrial ecosystems. Genome announcements,3,3 2015/06 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Shiraishi K, Oku M, Kawaguchi K, Uchida D, Yurimoto H, Sakai Y Shiraishi K, Oku M, Kawaguchi K, Uchida D, Yurimoto H, Sakai Y Shiraishi K, Oku M, Kawaguchi K, Uchida D, Yurimoto H, Sakai Y Yeast nitrogen utilization in the phyllosphere during plant lifespan under regulation of autophagy. Yeast nitrogen utilization in the phyllosphere during plant lifespan under regulation of autophagy. Yeast nitrogen utilization in the phyllosphere during plant lifespan under regulation of autophagy. Scientific reports,5,9719 2015/04 英語 公開
Oda S, Yurimoto H, Nitta N, Sasano Y, Sakai Y Oda S, Yurimoto H, Nitta N, Sasano Y, Sakai Y Oda S, Yurimoto H, Nitta N, Sasano Y, Sakai Y Molecular characterization of Hap complex components responsible for methanol-inducible gene expression in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Molecular characterization of Hap complex components responsible for methanol-inducible gene expression in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Molecular characterization of Hap complex components responsible for methanol-inducible gene expression in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Eukaryotic cell 2015/01 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Hoefman S, van der Ha D, Iguchi H, Yurimoto H, Sakai Y, Boon N, Vandamme P, Heylen K, De Vos P Hoefman S, van der Ha D, Iguchi H, Yurimoto H, Sakai Y, Boon N, Vandamme P, Heylen K, De Vos P Hoefman S, van der Ha D, Iguchi H, Yurimoto H, Sakai Y, Boon N, Vandamme P, Heylen K, De Vos P Methyloparacoccus murrellii gen. nov., sp. nov., a methanotroph isolated from pond water. Methyloparacoccus murrellii gen. nov., sp. nov., a methanotroph isolated from pond water. Methyloparacoccus murrellii gen. nov., sp. nov., a methanotroph isolated from pond water. International journal of systematic and evolutionary microbiology,64,2100-2107 2014/06 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
由里本 博也, 阪井 康能 由里本 博也, 阪井 康能 由里本 博也, 阪井 康能 植物から放出されるC1化合物と微生物-植物間相互作用による炭素循環 (小特集 グリーンケミカル・イノベーション(2)) 植物から放出されるC1化合物と微生物-植物間相互作用による炭素循環 (小特集 グリーンケミカル・イノベーション(2)) C1-compounds emitted from plants and the carbon cycle driven by microbe-plant interactions Aroma research = アロマリサーチ : journal of aroma science technology and safety,15,1,80-84 2014 日本語 公開
Kawaguchi K, Yurimoto H, Sakai Y Kawaguchi K, Yurimoto H, Sakai Y Kawaguchi K, Yurimoto H, Sakai Y Expression of a codon-optimized Aspergillus niger pectin methylesterase gene in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Expression of a codon-optimized Aspergillus niger pectin methylesterase gene in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Expression of a codon-optimized Aspergillus niger pectin methylesterase gene in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Bioscience, biotechnology, and biochemistry,78,718-721 2014 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Yoshida N, Iguchi H, Yurimoto H, Murakami A, Sakai Y Yoshida N, Iguchi H, Yurimoto H, Murakami A, Sakai Y Yoshida N, Iguchi H, Yurimoto H, Murakami A, Sakai Y Aquatic plant surface as a niche for methanotrophs. Aquatic plant surface as a niche for methanotrophs. Aquatic plant surface as a niche for methanotrophs. Frontiers in microbiology,5,30 2014 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
阪井 康能, 由里本 博也 阪井 康能, 由里本 博也 阪井 康能, 由里本 博也 葉面に棲息するC1微生物 : 共生系による炭素循環と環境バイオへの利用 (特集 微生物で植物と動物を操る環境バイオテクノロジー) 葉面に棲息するC1微生物 : 共生系による炭素循環と環境バイオへの利用 (特集 微生物で植物と動物を操る環境バイオテクノロジー) C1-Microorganisms in the Phyllosphere : Carbon Cycle by Symbiotic System and Its Application in Environmental Biotechnology Journal of environmental biotechnology,13,2,79-84 2013/12 日本語 公開
Iguchi H, Sato I, Yurimoto H, Sakai Y Iguchi H, Sato I, Yurimoto H, Sakai Y Iguchi H, Sato I, Yurimoto H, Sakai Y Stress resistance and C1 metabolism involved in plant colonization of a methanotroph Methylosinus sp. B4S. Stress resistance and C1 metabolism involved in plant colonization of a methanotroph Methylosinus sp. B4S. Stress resistance and C1 metabolism involved in plant colonization of a methanotroph Methylosinus sp. B4S. Archives of microbiology,195,717-726 2013/11 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
由里本 博也, 井口 博之, 阪井 康能 由里本 博也, 井口 博之, 阪井 康能 C1微生物複合生物系が駆動する炭素循環(メタンサイクル) (特集 地球温暖化と土壌微生物) -- (炭素代謝と温室効果ガスCH₄) C1微生物複合生物系が駆動する炭素循環(メタンサイクル) (特集 地球温暖化と土壌微生物) -- (炭素代謝と温室効果ガスCH₄) 遺伝 : 生物の科学,67,5,591-595 2013/09 日本語 公開
由里本 博也, 阪井 康能 由里本 博也, 阪井 康能 C1微生物代謝経路の省エネ型炭素固定系としての利用とその問題点(<特集>日本から発信するエネルギー革新省エネ型炭素固定とe-バイオの融合) C1微生物代謝経路の省エネ型炭素固定系としての利用とその問題点(<特集>日本から発信するエネルギー革新省エネ型炭素固定とe-バイオの融合) 生物工学会誌 : seibutsu-kogaku kaishi,91,7,384-387 2013/07/25 日本語 公開
Fujimura S, Yurimoto H, Kurimoto S, Matsufuji Y, Ito T, Hayakawa T, Tomizuka N, Sakai Y, Nakagawa T Fujimura S, Yurimoto H, Kurimoto S, Matsufuji Y, Ito T, Hayakawa T, Tomizuka N, Sakai Y, Nakagawa T Fujimura S, Yurimoto H, Kurimoto S, Matsufuji Y, Ito T, Hayakawa T, Tomizuka N, Sakai Y, Nakagawa T Expression level of methanol-inducible peroxisomal proteins and peroxisome morphology are affected by oxygen conditions and mitochondrial respiratory pathway function in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Expression level of methanol-inducible peroxisomal proteins and peroxisome morphology are affected by oxygen conditions and mitochondrial respiratory pathway function in the methylotrophic yeast Candida boidinii. Expression level of methanol-inducible peroxisomal proteins and peroxisome morphology are affected by oxygen conditions and mitochondrial respiratory pathway function in the methylotrophic yeast Candida boidinii. FEMS yeast research,13,359-366 2013/06 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Nutaratat P, Srisuk N, Duangmal K, Yurimoto H, Sakai Y, Muramatsu Y, Nakagawa Y Nutaratat P, Srisuk N, Duangmal K, Yurimoto H, Sakai Y, Muramatsu Y, Nakagawa Y Nutaratat P, Srisuk N, Duangmal K, Yurimoto H, Sakai Y, Muramatsu Y, Nakagawa Y Roseomonas musae sp. nov., a new bacterium isolated from a banana phyllosphere. Roseomonas musae sp. nov., a new bacterium isolated from a banana phyllosphere. Roseomonas musae sp. nov., a new bacterium isolated from a banana phyllosphere. Antonie van Leeuwenhoek,103,617-624 2013/03 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Mizuno M, Yurimoto H, Iguchi H, Tani A, Sakai Y Mizuno M, Yurimoto H, Iguchi H, Tani A, Sakai Y Mizuno M, Yurimoto H, Iguchi H, Tani A, Sakai Y Dominant colonization and inheritance of Methylobacterium sp. strain OR01 on perilla plants. Dominant colonization and inheritance of Methylobacterium sp. strain OR01 on perilla plants. Dominant colonization and inheritance of Methylobacterium sp. strain OR01 on perilla plants. Bioscience, biotechnology, and biochemistry,77,1533-1538 2013 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Zhai Z, Yurimoto H, Sakai Y Zhai Z, Yurimoto H, Sakai Y Zhai Z, Yurimoto H, Sakai Y Molecular characterization of Candida boidinii MIG1 and its role in the regulation of methanol-inducible gene expression. Molecular characterization of Candida boidinii MIG1 and its role in the regulation of methanol-inducible gene expression. Molecular characterization of Candida boidinii MIG1 and its role in the regulation of methanol-inducible gene expression. Yeast (Chichester, England),29,293-301 2012/07 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Iguchi H, Sato I, Sakakibara M, Yurimoto H, Sakai Y Iguchi H, Sato I, Sakakibara M, Yurimoto H, Sakai Y Iguchi H, Sato I, Sakakibara M, Yurimoto H, Sakai Y Distribution of methanotrophs in the phyllosphere. Distribution of methanotrophs in the phyllosphere. Distribution of methanotrophs in the phyllosphere. Bioscience, biotechnology, and biochemistry,76,1580-1583 2012 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
阪井康能;由里本博也 阪井康能;由里本博也 C1微生物複合生物系による省エネ型炭素固定技術 C1微生物複合生物系による省エネ型炭素固定技術 環境資源工学,58,2,59-63 2011/05/25 日本語 公開
由里本博也;阪井康能 由里本博也;阪井康能 光合成経路と相性のよいホルムアルデヒド固定反応 光合成経路と相性のよいホルムアルデヒド固定反応 バイオサイエンスとインダストリー,69,1,46-48 2011/01/01 日本語 公開
由里本博也, 阪井康能 由里本博也, 阪井康能 C_1微生物と植物の相互作用と炭素循環 : 代謝生化学・分子細胞生物学からの理解 C_1微生物と植物の相互作用と炭素循環 : 代謝生化学・分子細胞生物学からの理解 植物の生長調節,45,2,125-131 2010/12/20 日本語 公開
M. Mizuno; H. Yurimoto; N. Yoshida; H. Iguchi; Y. Sakai M. Mizuno; H. Yurimoto; N. Yoshida; H. Iguchi; Y. Sakai Distribution of pink-pigmented facultative methylotrophs on leaves of vegetables Distribution of pink-pigmented facultative methylotrophs on leaves of vegetables ,76,3,578-580 2012/03 英語 公開
Z. Zhai; H. Yurimoto; Y. Sakai Z. Zhai; H. Yurimoto; Y. Sakai Msn5p is involved in formaldehyde resistance but not in oxidative stress response in the methylotrophic yeast Candida boidinii Msn5p is involved in formaldehyde resistance but not in oxidative stress response in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,76,2,299-304 2012/02 英語 公開
H. Iguchi; H. Yurimoto; Y. Sakai H. Iguchi; H. Yurimoto; Y. Sakai Stimulation of methanotrophic growth in cocultures by cobalamin excreted by rhizobia Stimulation of methanotrophic growth in cocultures by cobalamin excreted by rhizobia ,77,24,8509-8515 2011/12 英語 公開
K. Kawaguchi; H. Yurimoto; M. Oku; Y. Sakai K. Kawaguchi; H. Yurimoto; M. Oku; Y. Sakai Yeast methylotrophy and autophagy in a methanol-oscillating environment on growing Arabidopsis thaliana leaves Yeast methylotrophy and autophagy in a methanol-oscillating environment on growing Arabidopsis thaliana leaves ,6,9 2011/09/26 英語 公開
C. Nishizaki; M. Nishikawa; T. Yata; T. Yamada; Y. Takahashi; M. Oku; H. Yurimoto; Y. Sakai; K. Nakanishi; Y. Takakura C. Nishizaki; M. Nishikawa; T. Yata; T. Yamada; Y. Takahashi; M. Oku; H. Yurimoto; Y. Sakai; K. Nakanishi; Y. Takakura Inhibition of surgical trauma-enhanced peritoneal dissemination of tumor cells by human catalase derivatives in mice Inhibition of surgical trauma-enhanced peritoneal dissemination of tumor cells by human catalase derivatives in mice ,51,3,773-779 2011/08/01 英語 公開
H. Iguchi; H. Yurimoto; Y. Sakai H. Iguchi; H. Yurimoto; Y. Sakai Methylovulum miyakonense gen. nov., sp. nov., a type i methanotroph isolated from forest soil Methylovulum miyakonense gen. nov., sp. nov., a type i methanotroph isolated from forest soil ,61,810-815 2011/04 英語 公開
Y. Fukuta; S. Nanda; Y. Kato; H. Yurimoto; Y. Sakai; H. Komeda; Y. Asano Y. Fukuta; S. Nanda; Y. Kato; H. Yurimoto; Y. Sakai; H. Komeda; Y. Asano Characterization of a new (R)-hydroxynitrile lyase from the japanese apricot Prunus mume and cDNA cloning and secretory expression of one of the isozymes in Pichia pastoris Characterization of a new (R)-hydroxynitrile lyase from the japanese apricot Prunus mume and cDNA cloning and secretory expression of one of the isozymes in Pichia pastoris ,75,2,214-220 2011/02 英語 公開
H. Yurimoto; M. Oku; Y. Sakai H. Yurimoto; M. Oku; Y. Sakai Yeast methylotrophy: Metabolism, gene regulation and peroxisome homeostasis Yeast methylotrophy: Metabolism, gene regulation and peroxisome homeostasis 2011 英語 公開
I. Orita; A. Kita; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; K. Miki I. Orita; A. Kita; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; K. Miki Crystal structure of 3-hexulose-6-phosphate synthase, a member of the orotidine 5\\'-monophosphate decarboxylase suprafamily Crystal structure of 3-hexulose-6-phosphate synthase, a member of the orotidine 5\\'-monophosphate decarboxylase suprafamily ,78,16,3488-3492 2010/12 英語 公開
H. Iguchi; H. Yurimoto; Y. Sakai H. Iguchi; H. Yurimoto; Y. Sakai Soluble and particulate methane monooxygenase gene clusters of the type I methanotroph Methylovulum miyakonense HT12 Soluble and particulate methane monooxygenase gene clusters of the type I methanotroph Methylovulum miyakonense HT12 ,312,1,71-76 2010/11 英語 公開
Z. Song; I. Orita; F. Yin; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; K. Izui; K. Li; L. Chen Z. Song; I. Orita; F. Yin; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; K. Izui; K. Li; L. Chen Overexpression of an HPS/PHI fusion enzyme from Mycobacterium gastri in chloroplasts of geranium enhances its ability to assimilate and phytoremediate formaldehyde Overexpression of an HPS/PHI fusion enzyme from Mycobacterium gastri in chloroplasts of geranium enhances its ability to assimilate and phytoremediate formaldehyde ,32,10,1541-1548 2010/10 英語 公開
T. Yano; M. Oku; N. Akeyama; A. Itoyama; H. Yurimoto; S. Kuge; Y. Fujiki; Y. Sakai T. Yano; M. Oku; N. Akeyama; A. Itoyama; H. Yurimoto; S. Kuge; Y. Fujiki; Y. Sakai A novel fluorescent sensor protein for visualization of redox states in the cytoplasm and in peroxisomes A novel fluorescent sensor protein for visualization of redox states in the cytoplasm and in peroxisomes ,30,15,3758-3766 2010/08 英語 公開
Y. Sasano; H. Yurimoto; M. Kuriyama; Y. Sakai Y. Sasano; H. Yurimoto; M. Kuriyama; Y. Sakai Trm2p-dependent derepression is essential for methanol-specific gene activation in the methylotrophic yeast Candida boidinii Trm2p-dependent derepression is essential for methanol-specific gene activation in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,10,5,535-544 2010/08 英語 公開
T. Nakagawa; K. Yoshida; A. Takeuchi; T. Ito; S. Fujimura; Y. Matsufuji; N. Tomizuka; H. Yurimoto; Y. Sakai; T. Hayakawa T. Nakagawa; K. Yoshida; A. Takeuchi; T. Ito; S. Fujimura; Y. Matsufuji; N. Tomizuka; H. Yurimoto; Y. Sakai; T. Hayakawa The peroxisomal catalase gene in the methylotrophic yeast Pichia methanolica The peroxisomal catalase gene in the methylotrophic yeast Pichia methanolica ,74,8,1733-1735 2010/08 英語 公開
T. Nakagawa; S. Fujimura; T. Ito; Y. Matsufuji; S. Ozawa; T. Miyaji; J. Nakagawa; N. Tomizuka; H. Yurimoto; Y. Sakai; T. Hayakawa T. Nakagawa; S. Fujimura; T. Ito; Y. Matsufuji; S. Ozawa; T. Miyaji; J. Nakagawa; N. Tomizuka; H. Yurimoto; Y. Sakai; T. Hayakawa Molecular characterization of two genes with high similarity to the dihydroxyacetone synthase gene in the methylotrophic yeast Pichia methanolica Molecular characterization of two genes with high similarity to the dihydroxyacetone synthase gene in the methylotrophic yeast Pichia methanolica ,74,7,1491-1493 2010/07 英語 公開
L.-M. Chen; H. Yurimoto; K.-Z. Li; I. Orita; M. Akita; N. Kato; Y. Sakai; K. Izui L.-M. Chen; H. Yurimoto; K.-Z. Li; I. Orita; M. Akita; N. Kato; Y. Sakai; K. Izui Assimilation of formaldehyde in transgenic plants due to the introduction of the bacterial ribulose monophosphate pathway genes Assimilation of formaldehyde in transgenic plants due to the introduction of the bacterial ribulose monophosphate pathway genes ,74,3,627-635 2010/03 英語 公開
T. Yata; M. Nishikawa; C. Nishizaki; M. Oku; H. Yurimoto; Y. Sakai; Y. Takakura T. Yata; M. Nishikawa; C. Nishizaki; M. Oku; H. Yurimoto; Y. Sakai; Y. Takakura Control of hypoxia-induced tumor cell adhesion by cytophilic human catalase Control of hypoxia-induced tumor cell adhesion by cytophilic human catalase ,47,12,1772-1778 2009/12/15 英語 公開
H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai Genomic organization and biochemistry of the ribulose monophosphate pathway and its application in biotechnology Genomic organization and biochemistry of the ribulose monophosphate pathway and its application in biotechnology ,84,3,407-416 2009/09 英語 公開
S.-I. Yamashita; H. Yurimoto; D. Murakami; M. Yoshikawa; M. Oku; Y. Sakai S.-I. Yamashita; H. Yurimoto; D. Murakami; M. Yoshikawa; M. Oku; Y. Sakai Lag-phase autophagy in the methylotrophic yeast Pichia pastoris Lag-phase autophagy in the methylotrophic yeast Pichia pastoris ,14,7,861-870 2009/07 英語 公開
H. Yurimoto; Y. Sakai H. Yurimoto; Y. Sakai Methanol-inducible gene expression and heterologous protein production in the methylotrophic yeast Candida boidinii Methanol-inducible gene expression and heterologous protein production in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,53,85-92 2009/06 英語 公開
T. Yano; H. Yurimoto; Y. Sakai T. Yano; H. Yurimoto; Y. Sakai Activation of the oxidative stress regulator PpYap1 through conserved cysteine residues during methanol metabolism in the yeast Pichia pastoris Activation of the oxidative stress regulator PpYap1 through conserved cysteine residues during methanol metabolism in the yeast Pichia pastoris ,73,6,1404-1411 2009/06 英語 公開
T. Yano; E. Takigami; H. Yurimoto; Y. Sakai T. Yano; E. Takigami; H. Yurimoto; Y. Sakai Yap1-regulated glutathione redox system curtails accumulation of formaldehyde and reactive oxygen species in methanol metabolism of Pichia pastoris Yap1-regulated glutathione redox system curtails accumulation of formaldehyde and reactive oxygen species in methanol metabolism of Pichia pastoris ,8,4,540-549 2009/04 英語 公開
H. Yurimoto H. Yurimoto Molecular basis of methanol-inducible gene expression and its application in the methylotrophic yeast Candida boidinii Molecular basis of methanol-inducible gene expression and its application in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,73,4,793-800 2009/04 英語 公開
K. Egawa; H. Shibata; S.-i. Yamashita; H. Yurimoto; Y. Sakai; H. Kato K. Egawa; H. Shibata; S.-i. Yamashita; H. Yurimoto; Y. Sakai; H. Kato Overexpression and purification of rat peroxisomal membrane protein 22, PMP22, in Pichia pastoris Overexpression and purification of rat peroxisomal membrane protein 22, PMP22, in Pichia pastoris ,64,1,47-54 2009/03 英語 公開
Y. Sasano; H. Yurimoto; M. Yanaka; Y. Sakai Y. Sasano; H. Yurimoto; M. Yanaka; Y. Sakai Trm1p, a Zn(II)<sub>2</sub>Cys<sub>6</sub>-type transcription factor, is a master regulator of methanol-specific gene activation in the methylotrophic yeast Candida boidinii Trm1p, a Zn(II)<sub>2</sub>Cys<sub>6</sub>-type transcription factor, is a master regulator of methanol-specific gene activation in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,7,3,527-536 2008/03 英語 公開
S. Limtong; N. Srisuk; W. Yongmanitchai; H. Yurimoto; T. Nakase S. Limtong; N. Srisuk; W. Yongmanitchai; H. Yurimoto; T. Nakase Ogataea chonburiensis sp. nov. and Ogataea nakhonphanomensis sp. nov., thermotolerant, methylotrophic yeast species isolated in Thailand, and transfer of Pichia siamensis and Pichia thermomethanolica to the genus Ogataea Ogataea chonburiensis sp. nov. and Ogataea nakhonphanomensis sp. nov., thermotolerant, methylotrophic yeast species isolated in Thailand, and transfer of Pichia siamensis and Pichia thermomethanolica to the genus Ogataea ,58,1,302-307 2008 英語 公開
A. Sawada; T. Oyabu; L.-M. Chen; K.-Z. Li; N. Hirai; H. Yurimoto; I. Orita; Y. Sakai; N. Kato; K. Izui A. Sawada; T. Oyabu; L.-M. Chen; K.-Z. Li; N. Hirai; H. Yurimoto; I. Orita; Y. Sakai; N. Kato; K. Izui Purification capability of tobacco transformed with enzymes from a methylotrophic bacterium for formaldehyde (International Journal of Phytoremediation (2007) 9, 6, (487-496)) Purification capability of tobacco transformed with enzymes from a methylotrophic bacterium for formaldehyde (International Journal of Phytoremediation (2007) 9, 6, (487-496)) ,10,6,598- 2008 英語 公開
T. Kotani; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai T. Kotani; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai Novel acetone metabolism in a propane-utilizing bacterium, Gordonia sp. strain TY-5 Novel acetone metabolism in a propane-utilizing bacterium, Gordonia sp. strain TY-5 ,189,3,886-893 2007 英語 公開
I. Orita; N. Sakamoto; N. Kato; H. Yurimoto; Y. Sakai I. Orita; N. Sakamoto; N. Kato; H. Yurimoto; Y. Sakai Bifunctional enzyme fusion of 3-hexulose-6-phosphate synthase and 6-phospho-3-hexuloisomerase Bifunctional enzyme fusion of 3-hexulose-6-phosphate synthase and 6-phospho-3-hexuloisomerase ,76,2,439-445 2007 英語 公開
Y. Sasano; H. Yurimoto; Y. Sakai Y. Sasano; H. Yurimoto; Y. Sakai Gene-tagging mutagenesis in the methylotrophic yeast Candida boidinii Gene-tagging mutagenesis in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,104,1,86-89 2007 英語 公開
I. Orita; T. Sato; H. Yurimoto; N. Kato; H. Atomi; T. Imanaka; Y. Sakai I. Orita; T. Sato; H. Yurimoto; N. Kato; H. Atomi; T. Imanaka; Y. Sakai The ribulose monophosphate pathway substitutes for the missing pentose phosphate pathway in the archaeon Thermococcus kodakaraensis The ribulose monophosphate pathway substitutes for the missing pentose phosphate pathway in the archaeon Thermococcus kodakaraensis ,188,13,4698-4704 2006/07 英語 公開
N. Kato; H. Yurimoto; R.K. Thauer N. Kato; H. Yurimoto; R.K. Thauer The physiological role of the ribulose monophosphate pathway in bacteria and archaea The physiological role of the ribulose monophosphate pathway in bacteria and archaea ,70,1,10-21 2006 英語 公開
T. Nakagawa; A. Inagaki; T. Ito; S. Fujimura; T. Miyaji; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; N. Tomizuka T. Nakagawa; A. Inagaki; T. Ito; S. Fujimura; T. Miyaji; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; N. Tomizuka Regulation of two distinct alcohol oxidase promoters in the methylotrophic yeast Pichia methanolica Regulation of two distinct alcohol oxidase promoters in the methylotrophic yeast Pichia methanolica ,23,1,15-22 2006 英語 公開
K. Kawaguchi; Y. Shinoda; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato K. Kawaguchi; Y. Shinoda; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato Purification and characterization of benzoate-CoA ligase from Magnetospirillum sp. strain TS-6 capable of aerobic and anaerobic degradation of aromatic compounds Purification and characterization of benzoate-CoA ligase from Magnetospirillum sp. strain TS-6 capable of aerobic and anaerobic degradation of aromatic compounds ,257,2,208-213 2006 英語 公開
T. Kotani; Y. Kawashima; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai T. Kotani; Y. Kawashima; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai Gene structure and regulation of alkane monooxygenases in propane-utilizing Mycobacterium sp. TY-6 and Pseudonocardia sp. TY-7 Gene structure and regulation of alkane monooxygenases in propane-utilizing Mycobacterium sp. TY-6 and Pseudonocardia sp. TY-7 ,102,3,184-192 2006 英語 公開
I.J. van der Klei; H. Yurimoto; Y. Sakai; M. Veenhuis I.J. van der Klei; H. Yurimoto; Y. Sakai; M. Veenhuis The significance of peroxisomes in methanol metabolism in methylotrophic yeast The significance of peroxisomes in methanol metabolism in methylotrophic yeast ,1763,12,1453-1462 2006 英語 公開
N. Srisuk; S. Limtong; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato N. Srisuk; S. Limtong; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato Physiological study and alcohol oxidase gene(s) of thermotolerant methylotrophic yeasts isolated in Thailand Physiological study and alcohol oxidase gene(s) of thermotolerant methylotrophic yeasts isolated in Thailand ,40,1,121-135 2006 英語 公開
I. Orita; H. Yurimoto; R. Hirai; Y. Kawarabayasi; Y. Sakai; N. Kato I. Orita; H. Yurimoto; R. Hirai; Y. Kawarabayasi; Y. Sakai; N. Kato The archaeon Pyrococcus horikoshii possesses a bifunctional enzyme for formaldehyde fixation via the ribulose monophosphate pathway The archaeon Pyrococcus horikoshii possesses a bifunctional enzyme for formaldehyde fixation via the ribulose monophosphate pathway ,187,11,3636-3642 2005 英語 公開
H. Yurimoto; R. Hirai; N. Matsuno; H. Yasueda; N. Kato; Y. Sakai H. Yurimoto; R. Hirai; N. Matsuno; H. Yasueda; N. Kato; Y. Sakai HxlR, a member of the DUF24 protein family, is a DNA-binding protein that acts as a positive regulator of the formaldehyde-inducible hxlAB operon in Bacillus subtilis HxlR, a member of the DUF24 protein family, is a DNA-binding protein that acts as a positive regulator of the formaldehyde-inducible hxlAB operon in Bacillus subtilis ,57,2,511-519 2005 英語 公開
Y. Shinoda; J. Akagi; Y. Uchihashi; A. Hiraishi; H. Yukawa; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato Y. Shinoda; J. Akagi; Y. Uchihashi; A. Hiraishi; H. Yukawa; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato Anaerobic degradation of aromatic compounds by Magnetospirillum strains: Isolation and degradation genes Anaerobic degradation of aromatic compounds by Magnetospirillum strains: Isolation and degradation genes ,69,8,1483-1491 2005 英語 公開
S. Limtong; N. Srisuk; W. Yongmanitchai; H. Yurimoto; T. Nakase; N. Kato S. Limtong; N. Srisuk; W. Yongmanitchai; H. Yurimoto; T. Nakase; N. Kato Pichia thermomethanolica sp. nov., a novel thermotolerant, methylotrophic yeast isolated in Thailand Pichia thermomethanolica sp. nov., a novel thermotolerant, methylotrophic yeast isolated in Thailand ,55,5,2225-2229 2005 英語 公開
M. Goenrich; R.K. Thauer; H. Yurimoto; N. Kato M. Goenrich; R.K. Thauer; H. Yurimoto; N. Kato Formaldehyde activating enzyme (Fae) and hexulose-6-phosphate synthase (Hps) in Methanosarcina barkeri: A possible function in ribose-5-phosphate biosynthesis Formaldehyde activating enzyme (Fae) and hexulose-6-phosphate synthase (Hps) in Methanosarcina barkeri: A possible function in ribose-5-phosphate biosynthesis ,184,1,41-48 2005 英語 公開
H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai Assimilation, dissimilation, and detoxification of formaldehyde, a central metabolic intermediate of methylotrophic metabolism Assimilation, dissimilation, and detoxification of formaldehyde, a central metabolic intermediate of methylotrophic metabolism ,5,6,367-375 2005 英語 公開
T. Nakagawa; T. Ito; S. Fujimura; M. Chikui; T. Mizumura; T. Miyaji; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; N. Tomizuka T. Nakagawa; T. Ito; S. Fujimura; M. Chikui; T. Mizumura; T. Miyaji; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; N. Tomizuka Molecular characterization of the glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase gene FLD1 from the methylotrophic yeast Pichia methanolica Molecular characterization of the glutathione-dependent formaldehyde dehydrogenase gene FLD1 from the methylotrophic yeast Pichia methanolica ,21,5,445-453 2004 英語 公開
Y. Shinoda; Y. Sakai; H. Uenishi; Y. Uchihashi; A. Hiraishi; H. Yukawa; H. Yurimoto; N. Kato Y. Shinoda; Y. Sakai; H. Uenishi; Y. Uchihashi; A. Hiraishi; H. Yukawa; H. Yurimoto; N. Kato Aerobic and Anaerobic Toluene Degradation by a Newly Isolated Denitrifying Bacterium, Thauera sp. Strain DNT-1 Aerobic and Anaerobic Toluene Degradation by a Newly Isolated Denitrifying Bacterium, Thauera sp. Strain DNT-1 ,70,3,1385-1392 2004 英語 公開
H. Yurimoto; B. Lee; F. Yasuda; Y. Sakai; N. Kato H. Yurimoto; B. Lee; F. Yasuda; Y. Sakai; N. Kato Alcohol dehydrogenases that catalyse methyl formate synthesis participate in formaldehyde detoxification in the methylotrophic yeast Candida boidinii Alcohol dehydrogenases that catalyse methyl formate synthesis participate in formaldehyde detoxification in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,21,4,341-350 2004 英語 公開
Y. Sakai; H. Takahashi; Y. Wakasa; T. Kotani; H. Yurimoto; N. Miyachi; P.P. Van Veldhoven; N. Kato Y. Sakai; H. Takahashi; Y. Wakasa; T. Kotani; H. Yurimoto; N. Miyachi; P.P. Van Veldhoven; N. Kato Role of α-methylacyl coenzyme A racemase in the degradation of methyl-branched alkanes by Mycobacterium sp. strain P101 Role of α-methylacyl coenzyme A racemase in the degradation of methyl-branched alkanes by Mycobacterium sp. strain P101 ,186,21,7214-7220 2004 英語 公開
S. Limtong; N. Srisuk; W. Yongmanitchai; H. Kawasaki; H. Yurimoto; T. Nakase; N. Kato S. Limtong; N. Srisuk; W. Yongmanitchai; H. Kawasaki; H. Yurimoto; T. Nakase; N. Kato Three new thermotolerant methylotrophic yeasts, Candida krabiensis sp. nov., Candida sithepensis sp. nov., and Pichia siamensis sp. nov., isolated in Thailand Three new thermotolerant methylotrophic yeasts, Candida krabiensis sp. nov., Candida sithepensis sp. nov., and Pichia siamensis sp. nov., isolated in Thailand ,50,3,119-127 2004 英語 公開
H. Yurimoto; M. Yamane; Y. Kikuchi; H. Matsui; N. Kato; Y. Sakai H. Yurimoto; M. Yamane; Y. Kikuchi; H. Matsui; N. Kato; Y. Sakai The pro-peptide of Streptomyces mobaraensis transglutaminase functions in cis and in trans to mediate efficient secretion of active enzyme from methylotrophic yeasts The pro-peptide of Streptomyces mobaraensis transglutaminase functions in cis and in trans to mediate efficient secretion of active enzyme from methylotrophic yeasts ,68,10,2058-2069 2004 英語 公開
H. Yurimoto; B. Lee; T. Yano; Y. Sakai; N. Kato H. Yurimoto; B. Lee; T. Yano; Y. Sakai; N. Kato Physiological role of S-formylglutathione hydrolase in C<sub>1</sub> metabolism of the methylotrophic yeast Candida boidinii Physiological role of S-formylglutathione hydrolase in C<sub>1</sub> metabolism of the methylotrophic yeast Candida boidinii ,149,8,1971-1979 2003 英語 公開
R. Mitsui; Y. Kusano; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato; M. Tanaka R. Mitsui; Y. Kusano; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato; M. Tanaka Formaldehyde Fixation Contributes to Detoxification for Growth of a Nonmethylotroph, Burkholderia cepacia TM1, on Vanillic Acid Formaldehyde Fixation Contributes to Detoxification for Growth of a Nonmethylotroph, Burkholderia cepacia TM1, on Vanillic Acid ,69,10,6128-6132 2003 英語 公開
T. Kotani; T. Yamamoto; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato T. Kotani; T. Yamamoto; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato Propane Monooxygenase and NAD<sup>+</sup>-Dependent Secondary Alcohol Dehydrogenase in Propane Metabolism by Gordonia sp. Strain TY-5 Propane Monooxygenase and NAD<sup>+</sup>-Dependent Secondary Alcohol Dehydrogenase in Propane Metabolism by Gordonia sp. Strain TY-5 ,185,24,7120-7128 2003 英語 公開
T. Komeda; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; K. Kondo T. Komeda; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; K. Kondo Cis-acting elements sufficient for induction of FDH1 expression by formate in the methylotrophic yeast Candida boidinii Cis-acting elements sufficient for induction of FDH1 expression by formate in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,270,3,273-280 2003 英語 公開
H. Yurimoto; R. Hirai; H. Yasueda; R. Mitsui; Y. Sakai; N. Kato H. Yurimoto; R. Hirai; H. Yasueda; R. Mitsui; Y. Sakai; N. Kato The ribulose monophosphate pathway operon encoding formaldehyde fixation in a thermotolerant methylotroph, Bacillus brevis S1 The ribulose monophosphate pathway operon encoding formaldehyde fixation in a thermotolerant methylotroph, Bacillus brevis S1 ,214,2,189-193 2002 英語 公開
T. Nakagawa; T. Mizumura; H. Mukaiyama; T. Miyaji; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; N. Tomizuka T. Nakagawa; T. Mizumura; H. Mukaiyama; T. Miyaji; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; N. Tomizuka Physiological role of the second alcohol oxidase gene MOD2 in the methylotrophic growth of Pichia methanolica Physiological role of the second alcohol oxidase gene MOD2 in the methylotrophic growth of Pichia methanolica ,19,12,1067-1073 2002 英語 公開
T. Nakagawa; Y. Sakai; H. Mukaiyama; T. Mizumura; T. Miyaji; H. Yurimoto; N. Kato; N. Tomizuka T. Nakagawa; Y. Sakai; H. Mukaiyama; T. Mizumura; T. Miyaji; H. Yurimoto; N. Kato; N. Tomizuka Analysis of alcohol oxidase isozymes in gene-disrupted strains of methylotrophic yeast Pichia methanolica Analysis of alcohol oxidase isozymes in gene-disrupted strains of methylotrophic yeast Pichia methanolica ,91,2,225-227 2001 英語 公開
H. Yurimoto; T. Hasegawa; Y. Sakai; N. Kato H. Yurimoto; T. Hasegawa; Y. Sakai; N. Kato Characterization and high-level production of D-amino acid oxidase in Candida boidinii Characterization and high-level production of D-amino acid oxidase in Candida boidinii ,65,3,627-633 2001 英語 公開
H. Horiguchi; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai H. Horiguchi; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai Antioxidant system within yeast peroxisome. Biochemical and physiological characterization of CbPmp20 in the methylotrophic yeast Candida boidinii Antioxidant system within yeast peroxisome. Biochemical and physiological characterization of CbPmp20 in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,276,17,14279-14288 2001 英語 公開
M. Nishikawa; T. Hagishita; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; T. Hatanaka M. Nishikawa; T. Hagishita; H. Yurimoto; N. Kato; Y. Sakai; T. Hatanaka Primary structure and expression of peroxisomal acetylspermidine oxidase in the methylotrophic yeast Candida boidinii Primary structure and expression of peroxisomal acetylspermidine oxidase in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,476,3,150-154 2000/07/07 英語 公開
D.-Y. Suh; J. Kagami; K. Fukuma; N. Iwanami; Y. Yamazaki; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato; M. Shibuya; Y. Ebizuka; U. Sankawa D.-Y. Suh; J. Kagami; K. Fukuma; N. Iwanami; Y. Yamazaki; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato; M. Shibuya; Y. Ebizuka; U. Sankawa Chalcone and stilbene synthases expressed in eucaryotes exhibit reduced cross-reactivity in vitro Chalcone and stilbene synthases expressed in eucaryotes exhibit reduced cross-reactivity in vitro ,48,7,1051-1054 2000/07 英語 公開
T. Nakagawa; T. Imanaka; M. Morita; K. Ishiguro; H. Yurimoto; A. Yamashita; N. Kato; Y. Sakai T. Nakagawa; T. Imanaka; M. Morita; K. Ishiguro; H. Yurimoto; A. Yamashita; N. Kato; Y. Sakai Peroxisomal membrane protein Pmp47 is essential in the metabolism of middle-chain fatty acid in yeast peroxisomes and is associated with peroxisome proliferation Peroxisomal membrane protein Pmp47 is essential in the metabolism of middle-chain fatty acid in yeast peroxisomes and is associated with peroxisome proliferation ,275,5,3455-3461 2000/02/04 英語 公開
T. Nakagawa; T. Miyaji; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato; N. Tomizuka T. Nakagawa; T. Miyaji; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato; N. Tomizuka A methylotrophic pathway participates in pectin utilization by Candida boidinii A methylotrophic pathway participates in pectin utilization by Candida boidinii ,66,10,4253-4257 2000 英語 公開
H. Yurimoto; T. Komeda; C.R. Lim; T. Nakagawa; K. Kondo; N. Kato; Y. Sakai H. Yurimoto; T. Komeda; C.R. Lim; T. Nakagawa; K. Kondo; N. Kato; Y. Sakai Regulation and evaluation of five methanol-inducible promoters in the methylotrophic yeast Candida boidinii Regulation and evaluation of five methanol-inducible promoters in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,1493,1-2,56-63 2000 英語 公開
H. Yurimoto; T. Hasegawa; Y. Sakai; N. Kato H. Yurimoto; T. Hasegawa; Y. Sakai; N. Kato Physiological role of the D-amino acid oxidase gene, DAOI, in carbon and nitrogen metabolism in the methylotrophic yeast Candida boidinii Physiological role of the D-amino acid oxidase gene, DAOI, in carbon and nitrogen metabolism in the methylotrophic yeast Candida boidinii ,16,13,1217-1227 2000 英語 公開
Y. Sakai; H. Yoshida; H. Yurimoto; N. Yoshida; H. Fukuya; K. Takabe; N. Kato Y. Sakai; H. Yoshida; H. Yurimoto; N. Yoshida; H. Fukuya; K. Takabe; N. Kato Production of fungal fructosyl amino acid oxidase useful for diabetic diagnosis in the peroxisome of Candida boidinii Production of fungal fructosyl amino acid oxidase useful for diabetic diagnosis in the peroxisome of Candida boidinii ,459,2,233-237 1999/10/08 英語 公開
T. Nakagawa; H. Mukaiyama; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato T. Nakagawa; H. Mukaiyama; H. Yurimoto; Y. Sakai; N. Kato Alcohol oxidase hybrid oligomers formed in vivo and in vitro Alcohol oxidase hybrid oligomers formed in vivo and in vitro ,15,12,1223-1230 1999/09/15 英語 公開
Y. Sakai; J. Ishikawa; S. Fukasaka; H. Yurimoto; R. Mitsui; H. Yanase; N. Kato Y. Sakai; J. Ishikawa; S. Fukasaka; H. Yurimoto; R. Mitsui; H. Yanase; N. Kato A new carboxylesterase from Brevibacterium linens IFO 12171 responsible for the conversion of 1,4-butanediol diacrylate to 4-hydroxybutyl acrylate: Purification, characterization, gene cloning, and gene expression in Escherichia coli A new carboxylesterase from Brevibacterium linens IFO 12171 responsible for the conversion of 1,4-butanediol diacrylate to 4-hydroxybutyl acrylate: Purification, characterization, gene cloning, and gene expression in Escherichia coli ,63,4,688-697 1999/04 英語 公開
Y. Sakai; H. Yoshida; H. Yurimoto; K. Takabe; N. Kato Y. Sakai; H. Yoshida; H. Yurimoto; K. Takabe; N. Kato Subcellular localization of fructosyl amino acid oxidases in peroxisomes of Aspergillus terreus and Penicillium janthinellum Subcellular localization of fructosyl amino acid oxidases in peroxisomes of Aspergillus terreus and Penicillium janthinellum ,87,1,108-111 1999 英語 公開
Y. Sakai; H. Yurimoto; H. Matsuo; N. Kato Y. Sakai; H. Yurimoto; H. Matsuo; N. Kato Regulation of peroxisomal proteins and organelle proliferation by multiple carbon sources in the methylotrophic yeast, Candida boidinii Regulation of peroxisomal proteins and organelle proliferation by multiple carbon sources in the methylotrophic yeast, Candida boidinii ,14,13,1175-1187 1998/09/30 英語 公開
Y. Sakai; K. Ayukawa; H. Yurimoto; K. Yamamoto; N. Kato Y. Sakai; K. Ayukawa; H. Yurimoto; K. Yamamoto; N. Kato A novel arylesterase active toward 7-aminocephalosporanic acid from Agrobacterium radiobacter IFO 12607: Purification and characterization A novel arylesterase active toward 7-aminocephalosporanic acid from Agrobacterium radiobacter IFO 12607: Purification and characterization ,85,1,58-62 1998 英語 公開
Y. Sakai; K. Ayukawa; R. Mitsui; H. Yurimoto; K. Yamamoto; N. Kato Y. Sakai; K. Ayukawa; R. Mitsui; H. Yurimoto; K. Yamamoto; N. Kato A novel arylesterase active toward 7-aminocephalosporanic acid from agrobacterium radiobacter IFO 12607: Nucleotide sequence, gene expression in escherichia coli, and site-directed mutagenesis A novel arylesterase active toward 7-aminocephalosporanic acid from agrobacterium radiobacter IFO 12607: Nucleotide sequence, gene expression in escherichia coli, and site-directed mutagenesis ,85,2,138-143 1998 英語 公開
Y. Sakai; A. Saiganji; H. Yurimoto; K. Takabe; H. Saiki; N. Kato Y. Sakai; A. Saiganji; H. Yurimoto; K. Takabe; H. Saiki; N. Kato The absence of Pmp47, a putative yeast peroxisomal transporter, causes a defect in transport and folding of a specific matrix enzyme The absence of Pmp47, a putative yeast peroxisomal transporter, causes a defect in transport and folding of a specific matrix enzyme ,134,1,37-51 1996/07 英語 公開

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著者 著者(日本語) 著者(英語) タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 書誌情報等 出版年月 査読の有無 記述言語 掲載種別 公開
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書籍等出版物
著者 著者(日本語) 著者(英語) タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 出版社 出版年月 記述言語 担当区分 公開
由里本博也、阪井康能 由里本博也、阪井康能 遺伝子組換えってどうやるの? 「ひらく、ひらく「バイオの世界」14歳からの生物工学入門 遺伝子組換えってどうやるの? 「ひらく、ひらく「バイオの世界」14歳からの生物工学入門 pp. 64-65, 日本生物工学会 編、化学同人(東京) 2012 日本語 公開
タイトル言語:
学術賞等
賞の名称(日本語) 賞の名称(英語) 授与組織名(日本語) 授与組織名(英語) 年月
農芸化学奨励賞(日本農芸化学会)Aword for Young Scientists 2007
天野エンザイム株式会社第9回酵素応用シンポジウム研究奨励賞受賞 2008
外部資金:競争的資金・科学研究費補助金
種別 代表/分担 テーマ(日本語) テーマ(英語) 期間
若手研究(B) 代表 微生物のC1化合物代謝の分子基盤と遺伝子発現制御機構の解明 
基盤研究(B) 代表 微生物におけるC1化合物代謝制御の分子基盤に立脚した環境技術開発 2010〜2012
基盤研究(B) 代表 メタノールエコノミーでの活用を目指すC1微生物代謝生理の分子基盤解明と新技術開発 2013〜2015
挑戦的萌芽研究 代表 C1化合物とその代謝制御システムを利用した新規代謝工学技術の開発 2013〜2014
基盤研究(B) 代表 C1微生物で拓くメタノールエコノミー:低炭素・循環型社会で活用する基盤技術開発 2016/04/01〜2019/03/01
挑戦的萌芽研究 代表 メタノール酵母の高レベル転写能を利用するメタノールからの機能性RNA生産 2016/04/01〜2018/03/31
基盤研究(B) 代表 メタノールエコノミーでの活用を目指すC1微生物代謝生理の分子基盤解明と新技術開発 (平成27年度分) 2015/04/01〜2016/03/31
挑戦的萌芽研究 代表 メタノール酵母の高レベル転写能を利用するメタノールからの機能性RNA生産 (平成28年度分) 2016/04/01〜2017/03/31
基盤研究(B) 代表 C1微生物で拓くメタノールエコノミー:低炭素・循環型社会で活用する基盤技術開発 (平成28年度分) 2016/04/01〜2017/03/31
外部資金:競争的資金・科学研究費補助金以外
制度名 代表者名 研究課題(日本語) 研究課題(英語) 期間
公益財団法人発酵研究所 平成24年度一般研究助成 由里本博也 微生物のホルムアルデヒド代謝生理機能を利用した環境技術開発 2012〜2013
担当科目
講義名(日本語) 講義名(英語) 開講期 学部/研究科 年度
生化学I Biochemistry I
応用微生物学実験 Laboratory Course in Applied Microbiology
生化学I 前期 農学部 2011/04〜2012/03
応用微生物学実験 後期 農学部 2011/04〜2012/03
応用微生物学III 後期 農学部 2011/04〜2012/03
応用微生物学II 前期 農学部 2011/04〜2012/03
制御発酵学専攻実験 農学研究科 2011/04〜2012/03
制御発酵学専攻演習 農学研究科 2011/04〜2012/03
制御発酵学研究論 農学研究科 2011/04〜2012/03
応用微生物学II Applied Microbiology II 前期 農学部 2012/04〜2013/03
応用微生物学III Applied Microbiology III 後期 農学部 2012/04〜2013/03
応用微生物学実験 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2012/04〜2013/03
生化学Ⅰ Biochemistry I 前期 農学部 2012/04〜2013/03
生化学Ⅰ Biochemistry I 前期 農学部 2013/04〜2014/03
応用微生物学II Applied Microbiology II 前期 農学部 2013/04〜2014/03
応用微生物学III Applied Microbiology III 後期 農学部 2013/04〜2014/03
応用微生物学実験 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2013/04〜2014/03
制御発酵学講義 Biotechnology of molecular and cellular regulation 後期集中 農学研究科 2013/04〜2014/03
制御発酵学専攻演習 Microbial Biotechnology Seminar 通年 農学研究科 2013/04〜2014/03
制御発酵学専攻実験 Experimental Course of Microbial Biotechnology 通年 農学研究科 2013/04〜2014/03
生化学Ⅰ Biochemistry I 前期 農学部 2014/04〜2015/03
応用微生物学II Applied Microbiology II 前期 農学部 2014/04〜2015/03
応用微生物学III Applied Microbiology III 後期 農学部 2014/04〜2015/03
応用微生物学実験 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2014/04〜2015/03
制御発酵学講義 Biotechnology of molecular and cellular regulation 前期集中 農学研究科 2014/04〜2015/03
制御発酵学専攻演習 Microbial Biotechnology Seminar 通年 農学研究科 2014/04〜2015/03
制御発酵学専攻実験 Experimental Course of Microbial Biotechnology 通年 農学研究科 2014/04〜2015/03
制御発酵学専攻実験1 Experimental Course of Microbial Biotechnology1 通年 農学研究科 2015/04〜2016/03
制御発酵学専攻実験 Experimental Course of Microbial Biotechnology 通年 農学研究科 2015/04〜2016/03
制御発酵学専攻演習1 Microbial Biotechnology Seminar1 通年 農学研究科 2015/04〜2016/03
制御発酵学専攻演習 Microbial Biotechnology Seminar 通年 農学研究科 2015/04〜2016/03
制御発酵学講義 Biotechnology of molecular and cellular regulation 前期集中 農学研究科 2015/04〜2016/03
応用微生物学II Applied Microbiology II 前期 農学部 2015/04〜2016/03
応用微生物学III Applied Microbiology III 後期 農学部 2015/04〜2016/03
応用微生物学実験 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2015/04〜2016/03
生化学Ⅰ Biochemistry I 前期 農学部 2015/04〜2016/03
ILASセミナー ILAS Seminar 前期 全学共通科目 2016/04〜2017/03
制御発酵学専攻実験1 Experimental Course of Microbial Biotechnology1 通年 農学研究科 2016/04〜2017/03
制御発酵学専攻実験2 Experimental Course of Microbial Biotechnology2 通年 農学研究科 2016/04〜2017/03
制御発酵学専攻実験 Experimental Course of Microbial Biotechnology 通年 農学研究科 2016/04〜2017/03
制御発酵学専攻演習1 Microbial Biotechnology Seminar1 通年 農学研究科 2016/04〜2017/03
制御発酵学専攻演習2 Microbial Biotechnology Seminar2 通年 農学研究科 2016/04〜2017/03
制御発酵学専攻演習 Microbial Biotechnology Seminar 通年 農学研究科 2016/04〜2017/03
制御発酵学講義 Biotechnology of molecular and cellular regulation 前期集中 農学研究科 2016/04〜2017/03
応用微生物学II Applied Microbiology II 前期 農学部 2016/04〜2017/03
応用微生物学III Applied Microbiology III 後期 農学部 2016/04〜2017/03
応用微生物学実験 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2016/04〜2017/03
生化学Ⅰ Biochemistry I 前期 農学部 2016/04〜2017/03
制御発酵学専攻実験1 Experimental Course of Microbial Biotechnology1 通年 農学研究科 2017/04〜2018/03
制御発酵学専攻実験2 Experimental Course of Microbial Biotechnology2 通年 農学研究科 2017/04〜2018/03
制御発酵学専攻実験 Experimental Course of Microbial Biotechnology 通年 農学研究科 2017/04〜2018/03
制御発酵学専攻演習1 Microbial Biotechnology Seminar1 通年 農学研究科 2017/04〜2018/03
制御発酵学専攻演習2 Microbial Biotechnology Seminar2 通年 農学研究科 2017/04〜2018/03
制御発酵学専攻演習 Microbial Biotechnology Seminar 通年 農学研究科 2017/04〜2018/03
制御発酵学講義 Biotechnology of molecular and cellular regulation 前期集中 農学研究科 2017/04〜2018/03
応用微生物学II Applied Microbiology II 前期 農学部 2017/04〜2018/03
応用微生物学III Applied Microbiology III 後期 農学部 2017/04〜2018/03
応用微生物学実験 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2017/04〜2018/03
生化学I Biochemistry I 前期 農学部 2017/04〜2018/03

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全学運営(役職等)
役職名 期間
京都大学組換えDNA実験安全委員会 委員 2011/04/01〜2013/03/31
京都大学組換えDNA実験安全委員会 委員 2013/04/01〜2015/03/31
京都大学組み換えDNA実験安全委員会 委員 2013/04/01〜2015/03/31
組換えDNA実験安全委員会 委員 2011/04/01〜2013/03/31
組換えDNA実験安全委員会 委員 2013/04/01〜2015/03/31
附属図書館選書小委員会 委員 2013/04/01〜2014/03/31
部局運営(役職等)
役職名 期間
図書委員会 委員 2013/04/01〜2015/03/31