荒木 通啓

最終更新日時: 2019/06/26 12:43:25

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氏名(漢字/フリガナ/アルファベット表記)
荒木 通啓/アラキ ミチヒロ/Araki, Michihiro
所属部署・職名(部局/所属/講座等/職名)
医学研究科/臨床システム腫瘍学講座(寄附)/特定教授
取得学位
学位名(日本語) 学位名(英語) 大学(日本語) 大学(英語) 取得区分
修士(薬学) 京都大学
博士(薬学) 京都大学
職歴
期間 組織名(日本語) 組織名(英語) 職名(日本語) 職名(英語)
researchmap URL
https://researchmap.jp/7000005691
論文
著者 著者(日本語) 著者(英語) タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 書誌情報等 書誌情報等(日本語) 書誌情報等(英語) 出版年月 査読の有無 記述言語 掲載種別 公開
Vavricka Christopher J., Yoshida Takanobu, Kuriya Yuki, Takahashi Shunsuke, Ogawa Teppei, Ono Fumie, Agari Kazuko, Kiyota Hiromasa, Li Jianyong, Ishii Jun, Tsuge Kenji, Minami Hiromichi, Araki Michihiro, Hasunuma Tomohisa, Kondo Akihiko Vavricka Christopher J., Yoshida Takanobu, Kuriya Yuki, Takahashi Shunsuke, Ogawa Teppei, Ono Fumie, Agari Kazuko, Kiyota Hiromasa, Li Jianyong, Ishii Jun, Tsuge Kenji, Minami Hiromichi, Araki Michihiro, Hasunuma Tomohisa, Kondo Akihiko Vavricka Christopher J., Yoshida Takanobu, Kuriya Yuki, Takahashi Shunsuke, Ogawa Teppei, Ono Fumie, Agari Kazuko, Kiyota Hiromasa, Li Jianyong, Ishii Jun, Tsuge Kenji, Minami Hiromichi, Araki Michihiro, Hasunuma Tomohisa, Kondo Akihiko Mechanism-based tuning of insect 3,4-dihydroxyphenylacetaldehyde synthase for synthetic bioproduction of benzylisoquinoline alkaloids (vol 10, 2015, 2019) Mechanism-based tuning of insect 3,4-dihydroxyphenylacetaldehyde synthase for synthetic bioproduction of benzylisoquinoline alkaloids (vol 10, 2015, 2019) Mechanism-based tuning of insect 3,4-dihydroxyphenylacetaldehyde synthase for synthetic bioproduction of benzylisoquinoline alkaloids (vol 10, 2015, 2019) NATURE COMMUNICATIONS, 10, 1, 2336 NATURE COMMUNICATIONS, 10, 1, 2336 NATURE COMMUNICATIONS, 10, 1, 2336 2019/05/22 公開
Vavricka CJ, Yoshida T, Kuriya Y, Takahashi S, Ogawa T, Ono F, Agari K, Kiyota H, Li J, Ishii J, Tsuge K, Minami H, Araki M, Hasunuma T, Kondo A Vavricka CJ, Yoshida T, Kuriya Y, Takahashi S, Ogawa T, Ono F, Agari K, Kiyota H, Li J, Ishii J, Tsuge K, Minami H, Araki M, Hasunuma T, Kondo A Vavricka CJ, Yoshida T, Kuriya Y, Takahashi S, Ogawa T, Ono F, Agari K, Kiyota H, Li J, Ishii J, Tsuge K, Minami H, Araki M, Hasunuma T, Kondo A Mechanism-based tuning of insect 3,4-dihydroxyphenylacetaldehyde synthase for synthetic bioproduction of benzylisoquinoline alkaloids. Mechanism-based tuning of insect 3,4-dihydroxyphenylacetaldehyde synthase for synthetic bioproduction of benzylisoquinoline alkaloids. Mechanism-based tuning of insect 3,4-dihydroxyphenylacetaldehyde synthase for synthetic bioproduction of benzylisoquinoline alkaloids. Nature communications, 10, 1, 2015 Nature communications, 10, 1, 2015 Nature communications, 10, 1, 2015 2019/05 公開
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ARAKI Michihiro, COX SIDNEY ROBERT, MAKIGUCHI H., OGAWA T., TANIGUCHI T., MIYAOKU K., NAKATSUI Masahiko, HARA Kiyotaka, KONDO Akihiko ARAKI Michihiro, COX SIDNEY ROBERT, MAKIGUCHI H., OGAWA T., TANIGUCHI T., MIYAOKU K., NAKATSUI Masahiko, HARA Kiyotaka, KONDO Akihiko ARAKI Michihiro, COX SIDNEY ROBERT, MAKIGUCHI H., OGAWA T., TANIGUCHI T., MIYAOKU K., NAKATSUI Masahiko, HARA Kiyotaka, KONDO Akihiko M-path: A compass for navigating potential metabolic pathways M-path: A compass for navigating potential metabolic pathways M-path: A compass for navigating potential metabolic pathways Bioinformatics, 31, 6, 905-911 Bioinformatics, 31, 6, 905-911 Bioinformatics, 31, 6, 905-911 2015/03/15 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
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HARA Kiyotaka, ARAKI Michihiro, OKAI Naoko, WAKAI Satoshi, HASUNUMA Tomohisa, KONDO Akihiko HARA Kiyotaka, ARAKI Michihiro, OKAI Naoko, WAKAI Satoshi, HASUNUMA Tomohisa, KONDO Akihiko HARA Kiyotaka, ARAKI Michihiro, OKAI Naoko, WAKAI Satoshi, HASUNUMA Tomohisa, KONDO Akihiko Development of bio-based fine chemical production through synthetic bioengineering Development of bio-based fine chemical production through synthetic bioengineering Development of bio-based fine chemical production through synthetic bioengineering Microbial Cell Factories, 13, 1, 173 Microbial Cell Factories, 13, 1, 173 Microbial Cell Factories, 13, 1, 173 2014/12/14 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
HARA Kiyotaka, MORITA T., MOCHIZUKI M., YAMAMOTO K., OGINO Chiaki, ARAKI Michihiro, KONDO Akihiko HARA Kiyotaka, MORITA T., MOCHIZUKI M., YAMAMOTO K., OGINO Chiaki, ARAKI Michihiro, KONDO Akihiko HARA Kiyotaka, MORITA T., MOCHIZUKI M., YAMAMOTO K., OGINO Chiaki, ARAKI Michihiro, KONDO Akihiko Development of a multi-gene expression system in Xanthophyllomyces dendrorhous Development of a multi-gene expression system in Xanthophyllomyces dendrorhous Development of a multi-gene expression system in Xanthophyllomyces dendrorhous Microbial Cell Factories, 13, 1, 175 Microbial Cell Factories, 13, 1, 175 Microbial Cell Factories, 13, 1, 175 2014/12/04 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
HARA Kiyotaka, MORITA T., ENDO Yusuke, MOCHIZUKI M., ARAKI Michihiro, KONDO Akihiko HARA Kiyotaka, MORITA T., ENDO Yusuke, MOCHIZUKI M., ARAKI Michihiro, KONDO Akihiko HARA Kiyotaka, MORITA T., ENDO Yusuke, MOCHIZUKI M., ARAKI Michihiro, KONDO Akihiko Evaluation and screening of efficient promoters to improve astaxanthin production in Xanthophyllomyces dendrorhous Evaluation and screening of efficient promoters to improve astaxanthin production in Xanthophyllomyces dendrorhous Evaluation and screening of efficient promoters to improve astaxanthin production in Xanthophyllomyces dendrorhous Applied Microbiology and Biotechnology, 98, 15, 6787-6793 Applied Microbiology and Biotechnology, 98, 15, 6787-6793 Applied Microbiology and Biotechnology, 98, 15, 6787-6793 2014/08 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
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荒木通啓, 荒木通啓 荒木通啓, 荒木通啓 荒木通啓, 荒木通啓 人工知能(AI)がもたらす創薬イノベーション 6.バイオメディカル・基礎から臨床への開発プロセス(2)2)バイオロジクス・製剤・ロボティクス~医薬品製造・バイオロジクス生産に向けたAI技術開発~ 人工知能(AI)がもたらす創薬イノベーション 6.バイオメディカル・基礎から臨床への開発プロセス(2)2)バイオロジクス・製剤・ロボティクス~医薬品製造・バイオロジクス生産に向けたAI技術開発~ 人工知能(AI)がもたらす創薬イノベーション 6.バイオメディカル・基礎から臨床への開発プロセス(2)2)バイオロジクス・製剤・ロボティクス~医薬品製造・バイオロジクス生産に向けたAI技術開発~ 医薬ジャーナル, 54, 9, 2055‐2058 医薬ジャーナル, 54, 9, 2055‐2058 医薬ジャーナル, 54, 9, 2055‐2058 2018/09/01 日本語 公開
荒木通啓, 荒木通啓 荒木通啓, 荒木通啓 荒木通啓, 荒木通啓 スマートセル開発に向けた情報解析技術 スマートセル開発に向けた情報解析技術 スマートセル開発に向けた情報解析技術 日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集, 36th, 57 日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集, 36th, 57 日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集, 36th, 57 2018/08/15 日本語 公開
厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 微生物による有用物質生産に資する代謝モデルの実験データを用いた妥当性検証と予測精度の改善 微生物による有用物質生産に資する代謝モデルの実験データを用いた妥当性検証と予測精度の改善 微生物による有用物質生産に資する代謝モデルの実験データを用いた妥当性検証と予測精度の改善 日本生物工学会大会講演要旨集, 70th, 190 日本生物工学会大会講演要旨集, 70th, 190 日本生物工学会大会講演要旨集, 70th, 190 2018/08/07 日本語 公開
武田志津, 伊藤潔人, 荒木通啓 武田志津, 伊藤潔人, 荒木通啓 武田志津, 伊藤潔人, 荒木通啓 スマートセル開発を加速するAIの開発に向けた取組み スマートセル開発を加速するAIの開発に向けた取組み スマートセル開発を加速するAIの開発に向けた取組み 日本生物工学会大会講演要旨集, 70th, 224 日本生物工学会大会講演要旨集, 70th, 224 日本生物工学会大会講演要旨集, 70th, 224 2018/08/07 日本語 公開
渡邉直暉, 村田昌浩, 荻野千秋, 近藤昭彦, 荒木通啓, 荒木通啓 渡邉直暉, 村田昌浩, 荻野千秋, 近藤昭彦, 荒木通啓, 荒木通啓 渡邉直暉, 村田昌浩, 荻野千秋, 近藤昭彦, 荒木通啓, 荒木通啓 機械学習を用いた酵素のEC number予測 機械学習を用いた酵素のEC number予測 機械学習を用いた酵素のEC number予測 日本生物工学会大会講演要旨集, 70th, 191 日本生物工学会大会講演要旨集, 70th, 191 日本生物工学会大会講演要旨集, 70th, 191 2018/08/07 日本語 公開
内野詠一郎, 荒木通啓, 奥野恭史 内野詠一郎, 荒木通啓, 奥野恭史 内野詠一郎, 荒木通啓, 奥野恭史 ビッグデータ時代の精神医学 ビッグデータ時代のゲノム創薬 ビッグデータ時代の精神医学 ビッグデータ時代のゲノム創薬 ビッグデータ時代の精神医学 ビッグデータ時代のゲノム創薬 分子精神医学, 18, 3, 143‐148 分子精神医学, 18, 3, 143‐148 分子精神医学, 18, 3, 143‐148 2018/07/10 日本語 公開
厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 微生物による有用物質生産の改善に資する代謝モデルの反応データベースおよび配列データからの自動構築 微生物による有用物質生産の改善に資する代謝モデルの反応データベースおよび配列データからの自動構築 微生物による有用物質生産の改善に資する代謝モデルの反応データベースおよび配列データからの自動構築 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2018, ROMBUNNO.3A06p03 (WEB ONLY) 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2018, ROMBUNNO.3A06p03 (WEB ONLY) 日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2018, ROMBUNNO.3A06p03 (WEB ONLY) 2018/03/05 日本語 公開
厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 ゲノム配列および反応データベースを用いた有用物質生産の主要バクテリア宿主の代謝モデル構築 ゲノム配列および反応データベースを用いた有用物質生産の主要バクテリア宿主の代謝モデル構築 ゲノム配列および反応データベースを用いた有用物質生産の主要バクテリア宿主の代謝モデル構築 日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 12th, 66 日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 12th, 66 日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 12th, 66 2018/03/05 日本語 公開
柘植謙爾, 石井純, 荒木通啓, 荒木通啓, 近藤昭彦, 近藤昭彦 柘植謙爾, 石井純, 荒木通啓, 荒木通啓, 近藤昭彦, 近藤昭彦 柘植謙爾, 石井純, 荒木通啓, 荒木通啓, 近藤昭彦, 近藤昭彦 生命をつくる:ゲノム構築の時代 ゲノム合成の潮流のインパクト 微生物による物質生産 生命をつくる:ゲノム構築の時代 ゲノム合成の潮流のインパクト 微生物による物質生産 生命をつくる:ゲノム構築の時代 ゲノム合成の潮流のインパクト 微生物による物質生産 現代化学, 562, 36‐41 現代化学, 562, 36‐41 現代化学, 562, 36‐41 2018/01/01 日本語 公開
厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 厨祐喜, 大山彰, 荒木通啓, 荒木通啓 大腸菌による有用物質生産の改善のためのコアモデルの構築 大腸菌による有用物質生産の改善のためのコアモデルの構築 大腸菌による有用物質生産の改善のためのコアモデルの構築 日本生物工学会大会講演要旨集, 69th, 253 日本生物工学会大会講演要旨集, 69th, 253 日本生物工学会大会講演要旨集, 69th, 253 2017/08/08 日本語 公開
タイトル言語:
講演・口頭発表等
タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 会議名 会議名(日本語) 会議名(英語) 主催者 主催者(日本語) 主催者(英語) 開催年月日 記述言語 会議種別 公開
大腸菌における1,4-ブタンジオール人工生合成経路構築 大腸菌における1,4-ブタンジオール人工生合成経路構築 大腸菌における1,4-ブタンジオール人工生合成経路構築 日本農芸化学会2016年度大会 日本農芸化学会2016年度大会 日本農芸化学会2016年度大会 2016/03 日本語 口頭発表(一般) 公開
代謝シミュレーション基盤を利用した網羅的メタボローム推定 代謝シミュレーション基盤を利用した網羅的メタボローム推定 代謝シミュレーション基盤を利用した網羅的メタボローム推定 日本薬学会第135年会 日本薬学会第135年会 日本薬学会第135年会 日本薬学会 日本薬学会 日本薬学会 2015/03 日本語 口頭発表(一般) 公開
M-path: 拡張代謝パスウェイデータベースの構築 M-path: 拡張代謝パスウェイデータベースの構築 M-path: 拡張代謝パスウェイデータベースの構築 第37回日本分子生物学会年会 第37回日本分子生物学会年会 第37回日本分子生物学会年会 日本分子生物学会 日本分子生物学会 日本分子生物学会 2014/11 日本語 ポスター発表 公開
バイオプロセス合成経路データベース"M-path"の構築 バイオプロセス合成経路データベース"M-path"の構築 バイオプロセス合成経路データベース"M-path"の構築 第3回生命医薬情報学連合大会 第3回生命医薬情報学連合大会 第3回生命医薬情報学連合大会 日本バイオインフォマティクス学会 (JSBi) 日本バイオインフォマティクス学会 (JSBi) 日本バイオインフォマティクス学会 (JSBi) 2014/10 日本語 ポスター発表 公開
時系列データを利用した遺伝子制御ネットワーク選択手法の開発 時系列データを利用した遺伝子制御ネットワーク選択手法の開発 時系列データを利用した遺伝子制御ネットワーク選択手法の開発 第3回生命医薬情報学連合大会 第3回生命医薬情報学連合大会 第3回生命医薬情報学連合大会 日本バイオインフォマティクス学会 (JSBi) 日本バイオインフォマティクス学会 (JSBi) 日本バイオインフォマティクス学会 (JSBi) 2014/10 日本語 ポスター発表 公開
Mpath: Computationally-aided design of synthetic metabolic pathways[招待あり] Mpath: Computationally-aided design of synthetic metabolic pathways [招待あり] Mpath: Computationally-aided design of synthetic metabolic pathways [招待あり] The 20th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming The 20th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming The 20th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming DNA Computing and Molecular Programming DNA Computing and Molecular Programming DNA Computing and Molecular Programming 2014/09 英語 ポスター発表 公開
Size Dependent Regulation of Apoptosis with a Series of Equilateral-Triangular Shaped RNA-protein Complexes[招待あり] Size Dependent Regulation of Apoptosis with a Series of Equilateral-Triangular Shaped RNA-protein Complexes [招待あり] Size Dependent Regulation of Apoptosis with a Series of Equilateral-Triangular Shaped RNA-protein Complexes [招待あり] The 20th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming The 20th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming The 20th International Conference on DNA Computing and Molecular Programming DNA Computing and Molecular Programming DNA Computing and Molecular Programming DNA Computing and Molecular Programming 2014/09 英語 ポスター発表 公開
バイオ医薬開発に有用なCHO 細胞の改良、培養状態解明につながるデータの構築 バイオ医薬開発に有用なCHO 細胞の改良、培養状態解明につながるデータの構築 バイオ医薬開発に有用なCHO 細胞の改良、培養状態解明につながるデータの構築 第66回日本生物工学会大会 第66回日本生物工学会大会 第66回日本生物工学会大会 日本生物工学会 日本生物工学会 日本生物工学会 2014/09 日本語 ポスター発表 公開
Mpath: Computationally-Aided Design of Synthetic Metabolic Pathways[招待あり] Mpath: Computationally-Aided Design of Synthetic Metabolic Pathways [招待あり] Mpath: Computationally-Aided Design of Synthetic Metabolic Pathways [招待あり] The Synthetic Biology: Engineering, Evolution & Design 2014 The Synthetic Biology: Engineering, Evolution & Design 2014 The Synthetic Biology: Engineering, Evolution & Design 2014 2014 American Institute of Chemical Engineers 2014 American Institute of Chemical Engineers 2014 American Institute of Chemical Engineers 2014/07 英語 ポスター発表 公開
遺伝子発現における時系列データ・制御様式の整合性評価 遺伝子発現における時系列データ・制御様式の整合性評価 遺伝子発現における時系列データ・制御様式の整合性評価 生物工学若手研究者の集い(若手会)夏のセミナー2014 生物工学若手研究者の集い(若手会)夏のセミナー2014 生物工学若手研究者の集い(若手会)夏のセミナー2014 2014/07 日本語 ポスター発表 公開
モデルベース機械学習による配合注射薬外観変化予測アルゴリズムの開発 モデルベース機械学習による配合注射薬外観変化予測アルゴリズムの開発 モデルベース機械学習による配合注射薬外観変化予測アルゴリズムの開発 日本薬学会第134年会 日本薬学会第134年会 日本薬学会第134年会 日本薬学会 日本薬学会 日本薬学会 2014/03 日本語 口頭発表(一般) 公開
An approach for dynamical network reconstruction of simple network motifs[招待あり] An approach for dynamical network reconstruction of simple network motifs [招待あり] An approach for dynamical network reconstruction of simple network motifs [招待あり] The 24th International Conference on Genome Informatics The 24th International Conference on Genome Informatics The 24th International Conference on Genome Informatics 2013/12 英語 口頭発表(一般) 公開
バイオプロセスデザインプラットフォームを用いたアミノ酸のバイオプロセスデータベースの開発 バイオプロセスデザインプラットフォームを用いたアミノ酸のバイオプロセスデータベースの開発 バイオプロセスデザインプラットフォームを用いたアミノ酸のバイオプロセスデータベースの開発 第36回日本分子生物学会年会 第36回日本分子生物学会年会 第36回日本分子生物学会年会 日本分子生物学会 日本分子生物学会 日本分子生物学会 2013/12 日本語 ポスター発表 公開
細胞内ダイナミクス解析ツールの設計・開発[招待あり] 細胞内ダイナミクス解析ツールの設計・開発 [招待あり] 細胞内ダイナミクス解析ツールの設計・開発 [招待あり] 「細胞を創る」研究会6.0 「細胞を創る」研究会6.0 「細胞を創る」研究会6.0 2013/11 日本語 ポスター発表 公開

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タイトル言語:
特許
発明者 発明者(日本語) 発明者(英語) 発明の名称 発明の名称(日本語) 発明の名称(英語) 審査の段階 番号 年月 公開
荒木 通啓, 宮奥 康平, 谷口 岳志 荒木 通啓, 宮奥 康平, 谷口 岳志 合成経路作成装置、合成経路作成方法及び合成経路作成プログラム 合成経路作成装置、合成経路作成方法及び合成経路作成プログラム 特許登録 特許第5907072号 2016/04/01 公開
荒木 通啓, 宮奥 康平, 谷口 岳志, 依田 尚文, 湯村 秀一 荒木 通啓, 宮奥 康平, 谷口 岳志, 依田 尚文, 湯村 秀一 テレフタル酸の製造方法 テレフタル酸の製造方法 特許公開 特開2013-128460 2013/07/04 公開
荒木 通啓, 宮奥 康平, 谷口 岳志 荒木 通啓, 宮奥 康平, 谷口 岳志 合成経路作成装置、合成経路作成方法及び合成経路作成プログラムならびに3−ヒドロキシプロピオン酸、クロトニルアルコールおよびブタジエンの製造方法 合成経路作成装置、合成経路作成方法及び合成経路作成プログラムならびに3−ヒドロキシプロピオン酸、クロトニルアルコールおよびブタジエンの製造方法 特許公開 WO2012-081723 2012/06/21 公開
タイトル言語:
外部資金:競争的資金・科学研究費補助金
種別 代表/分担 テーマ(日本語) テーマ(英語) 期間
若手研究(B) 代謝ネットワークの再構築による天然化合物の設計原理の抽出 2008〜2010
若手研究(B) 代謝ネットワークの再構築による天然化合物の設計原理の抽出 2008〜2010
新学術領域研究(研究領域提案型) 代表 人工代謝経路の設計基盤の構築 2012〜2013
学外非常勤講師
講義名(日本語) 講義名(英語) 開講期 学校名 学部/研究科名 期間
バイオサイエンスにおけるビッグデータ 国立大学法人奈良先端科学技術大学院大学 2019/06/01〜2019/10/31
植物等の生物を用いた高機能品生産技術の開発/高生産性微生物創製に資する情報解析システムの開発 国立大学法人神戸大学 2019/04/01〜2020/03/31