緒方 博之

最終更新日時: 2019/10/21 14:17:41

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氏名(漢字/フリガナ/アルファベット表記)
緒方 博之/オガタ ヒロユキ/Ogata, Hiroyuki
所属部署・職名(部局/所属/講座等/職名)
化学研究所/化学研究所附属バイオインフォマティクスセンター/ /教授
協力講座
部局 所属 講座等 職名
薬学研究科 医薬創成情報科学専攻 医薬創成情報科学講座 教授
理学研究科 生物科学専攻 生体分子情報学講座 教授
取得学位
学位名(日本語) 学位名(英語) 大学(日本語) 大学(英語) 取得区分
修士(理学) Master of Science 京都大学 Kyoto University
博士(理学) Doctor of Science 京都大学 Kyoto University
プロフィール
(日本語)
微生物のゲノム・メタゲノム解析。ゲノム進化。微生物生態学。
(英語)
Microbial genomics, metagenomics, genome evolution and microbial ecology.
使用言語
言語名
英語
フランス語
個人ホームページ
URL
https://cls.kuicr.kyoto-u.ac.jp/
ORCID ID
https://orcid.org/0000-0001-6594-377X
researchmap URL
https://researchmap.jp/hiroyuki.ogata
研究テーマ
(日本語)
ウイルスゲノム、微生物ゲノム、ゲノム進化、メタゲノム、バイオインフォマティクス、微生物生態学
(英語)
Viral genomics, Microbial genomics, Genome evolution, Metagenomics, Bioinformatics, Microbial ecology
研究概要
(日本語)
微生物の多様性と時空間分布の意味を進化学と生態学の視点で理解することを目的としています。主に巨大ウイルスの進化、海洋微生物の機能と環境との相互作用を中心に研究をしています。
(英語)
My principal research interest is to understand the diversity and spatio-temporal distributions of viruses and microbes in the light of their evolution and ecology. I am currently focusing on the evolution and ecology of giant viruses and their hosts.
研究分野(キーワード)
キーワード(日本語) キーワード(英語)
ウイルス Virus
メタゲノム Metagenome
論文
著者 著者(日本語) 著者(英語) タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 書誌情報等 書誌情報等(日本語) 書誌情報等(英語) 出版年月 査読の有無 記述言語 掲載種別 公開
Okazaki Y., Nishimura Y., Yoshida T., Ogata H., Nakano S. Okazaki Y., Nishimura Y., Yoshida T., Ogata H., Nakano S. Okazaki Y., Nishimura Y., Yoshida T., Ogata H., Nakano S. Genome-resolved viral and cellular metagenomes revealed potential key virus-host interactions in a deep freshwater lake. Genome-resolved viral and cellular metagenomes revealed potential key virus-host interactions in a deep freshwater lake. Genome-resolved viral and cellular metagenomes revealed potential key virus-host interactions in a deep freshwater lake. Environ. Microbiol., doi: 10., 1111, 1462-2920.14816 Environ. Microbiol., doi: 10., 1111, 1462-2920.14816 Environ. Microbiol., doi: 10., 1111, 1462-2920.14816 2019/10 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Li Y., Endo H., Gotoh Y., Watai H., Ogawa N., Blanc-Mathieu R., Yoshida T., Ogata H. Li Y., Endo H., Gotoh Y., Watai H., Ogawa N., Blanc-Mathieu R., Yoshida T., Ogata H. Li Y., Endo H., Gotoh Y., Watai H., Ogawa N., Blanc-Mathieu R., Yoshida T., Ogata H. The earth is small for “leviathans”: long distance dispersal of giant viruses across aquatic environments. The earth is small for “leviathans”: long distance dispersal of giant viruses across aquatic environments. The earth is small for “leviathans”: long distance dispersal of giant viruses across aquatic environments. Microbes Environ., 34, 3, 334-339 Microbes Environ., 34, 3, 334-339 Microbes Environ., 34, 3, 334-339 2019/09 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Castillo Y.M., Mangot J.-F., Benites F., Logares R., Kuronishi M., Ogata H., Jaillon O., Massana R., Sebastián M., Vaqué D. Castillo Y.M., Mangot J.-F., Benites F., Logares R., Kuronishi M., Ogata H., Jaillon O., Massana R., Sebastián M., Vaqué D. Castillo Y.M., Mangot J.-F., Benites F., Logares R., Kuronishi M., Ogata H., Jaillon O., Massana R., Sebastián M., Vaqué D. Assessing the viral content of uncultured picoeukaryotes in the global-ocean by single cell genomics Assessing the viral content of uncultured picoeukaryotes in the global-ocean by single cell genomics Assessing the viral content of uncultured picoeukaryotes in the global-ocean by single cell genomics Cell., 177, 1109-1123 Cell., 177, 1109-1123 Cell., 177, 1109-1123 2019/05 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Aoki K., Hagiwara R., Akashi M., Murata K., Ogata H., Takemura M. Aoki K., Hagiwara R., Akashi M., Murata K., Ogata H., Takemura M. Aoki K., Hagiwara R., Akashi M., Murata K., Ogata H., Takemura M. Fifteen marseilleviruses newly isolated from three water samples in Japan reveal a local diversity of Marseilleviridae. Fifteen marseilleviruses newly isolated from three water samples in Japan reveal a local diversity of Marseilleviridae. Fifteen marseilleviruses newly isolated from three water samples in Japan reveal a local diversity of Marseilleviridae. Front. Microbiol., 24, 10, 1152 Front. Microbiol., 24, 10, 1152 Front. Microbiol., 24, 10, 1152 2019/05 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Gregory A.C., Zayed A.A., Conceicao-Neto N., Temperton B., Bolduc B., Alberti A., Ardyna M., Arkhipova K., Carmichael M., Cruaud C., Dimier C., Dominguez-Huerta G., Ferland J., Kandels S., Liu Y., Marec C., Pesant S., Picheral M., Pisarev S., Poulain J., Tremblay J.E., Vik D.; Tara Oceans Coordinators, Babin M., Bowler C., Culley A.I., de Vargas C., Dutilh B.E., Iudicone D., Karp-Boss L., Roux S., Sunagawa S., Wincker P., Sullivan M.B. Gregory A.C., Zayed A.A., Conceicao-Neto N., Temperton B., Bolduc B., Alberti A., Ardyna M., Arkhipova K., Carmichael M., Cruaud C., Dimier C., Dominguez-Huerta G., Ferland J., Kandels S., Liu Y., Marec C., Pesant S., Picheral M., Pisarev S., Poulain J., Tremblay J.E., Vik D.; Tara Oceans Coordinators, Babin M., Bowler C., Culley A.I., de Vargas C., Dutilh B.E., Iudicone D., Karp-Boss L., Roux S., Sunagawa S., Wincker P., Sullivan M.B. Gregory A.C., Zayed A.A., Conceicao-Neto N., Temperton B., Bolduc B., Alberti A., Ardyna M., Arkhipova K., Carmichael M., Cruaud C., Dimier C., Dominguez-Huerta G., Ferland J., Kandels S., Liu Y., Marec C., Pesant S., Picheral M., Pisarev S., Poulain J., Tremblay J.E., Vik D.; Tara Oceans Coordinators, Babin M., Bowler C., Culley A.I., de Vargas C., Dutilh B.E., Iudicone D., Karp-Boss L., Roux S., Sunagawa S., Wincker P., Sullivan M.B. Marine DNA Viral Macro- and Microdiversity from Pole to Pole. Marine DNA Viral Macro- and Microdiversity from Pole to Pole. Marine DNA Viral Macro- and Microdiversity from Pole to Pole. Cell., 16;177, 5, 1109-1123 Cell., 16;177, 5, 1109-1123 Cell., 16;177, 5, 1109-1123 2019/05 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Yoshikawa G., Blanc-Mathieu R., Song C., Kayama Y., Mochizuki T., Murata K., Ogata H., Takemura M. Yoshikawa G., Blanc-Mathieu R., Song C., Kayama Y., Mochizuki T., Murata K., Ogata H., Takemura M. Yoshikawa G., Blanc-Mathieu R., Song C., Kayama Y., Mochizuki T., Murata K., Ogata H., Takemura M. Medusavirus, a novel large DNA virus discovered from hot spring water. Medusavirus, a novel large DNA virus discovered from hot spring water. Medusavirus, a novel large DNA virus discovered from hot spring water. J. Virol., 93, e02130-18 J. Virol., 93, e02130-18 J. Virol., 93, e02130-18 2019/04 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Caputi L., Carradec Q., Eveillard D., Kirilovsky A., Pelletier, Pierella Karlusich J.J., Vieira F.R.J., Villar E., Chaffron S., Malviya S., Scalco E., Acinas S.G., Alberti A., Aury J.-M., Benoiston A.-S., Bertrand A., Biard T., Bittner L., Boccara M., Brum J.R., Brunet C., Busseni G., Carratala A., Claustre H., Coelho L.P., Colin S., D’Aniello S., Da Silva C., Del Core M., Dore H., Gasparini S., Kokoszka F., Jamet J.-L., Lejeusne C., Lepoivre C., Lescot M., Lima-Mendez G., Lombard F., Lukes J., Maillet N., Madoui M.-A., Martinez E., Mazzocchi M.G., Neou M.B., Paz-Yepes J., Poulain J., Ramondenc S., Romagnan J.-B., Roux S., Manta D.S., Sanges R., Speich S., Sprovieri M., Sunagawa S., Taillander V., Tanaka A., Tirichine L., Trottier C., Uitz J., Veluchamy A., Vesela J., Vincent F., Yau S., Kandels-Lewis S., Searson S., Dimier C., Picheral M., Tara Oceans Coordinators, Bork P., Boss E., de Vargas C., Follows M.J., Grimsley N., Guidi L., Hingamp P., Karsenti E., Sordino P., Stemmann L., Sullivan M.B., Tagliabue A., Zingone A., Garczarek L., d’Ortenzio F., Testor P., Not F., Ribera d’Alcala M., Wincker P., Bowler C., Iudicone D. Caputi L., Carradec Q., Eveillard D., Kirilovsky A., Pelletier, Pierella Karlusich J.J., Vieira F.R.J., Villar E., Chaffron S., Malviya S., Scalco E., Acinas S.G., Alberti A., Aury J.-M., Benoiston A.-S., Bertrand A., Biard T., Bittner L., Boccara M., Brum J.R., Brunet C., Busseni G., Carratala A., Claustre H., Coelho L.P., Colin S., D’Aniello S., Da Silva C., Del Core M., Dore H., Gasparini S., Kokoszka F., Jamet J.-L., Lejeusne C., Lepoivre C., Lescot M., Lima-Mendez G., Lombard F., Lukes J., Maillet N., Madoui M.-A., Martinez E., Mazzocchi M.G., Neou M.B., Paz-Yepes J., Poulain J., Ramondenc S., Romagnan J.-B., Roux S., Manta D.S., Sanges R., Speich S., Sprovieri M., Sunagawa S., Taillander V., Tanaka A., Tirichine L., Trottier C., Uitz J., Veluchamy A., Vesela J., Vincent F., Yau S., Kandels-Lewis S., Searson S., Dimier C., Picheral M., Tara Oceans Coordinators, Bork P., Boss E., de Vargas C., Follows M.J., Grimsley N., Guidi L., Hingamp P., Karsenti E., Sordino P., Stemmann L., Sullivan M.B., Tagliabue A., Zingone A., Garczarek L., d’Ortenzio F., Testor P., Not F., Ribera d’Alcala M., Wincker P., Bowler C., Iudicone D. Caputi L., Carradec Q., Eveillard D., Kirilovsky A., Pelletier, Pierella Karlusich J.J., Vieira F.R.J., Villar E., Chaffron S., Malviya S., Scalco E., Acinas S.G., Alberti A., Aury J.-M., Benoiston A.-S., Bertrand A., Biard T., Bittner L., Boccara M., Brum J.R., Brunet C., Busseni G., Carratala A., Claustre H., Coelho L.P., Colin S., D’Aniello S., Da Silva C., Del Core M., Dore H., Gasparini S., Kokoszka F., Jamet J.-L., Lejeusne C., Lepoivre C., Lescot M., Lima-Mendez G., Lombard F., Lukes J., Maillet N., Madoui M.-A., Martinez E., Mazzocchi M.G., Neou M.B., Paz-Yepes J., Poulain J., Ramondenc S., Romagnan J.-B., Roux S., Manta D.S., Sanges R., Speich S., Sprovieri M., Sunagawa S., Taillander V., Tanaka A., Tirichine L., Trottier C., Uitz J., Veluchamy A., Vesela J., Vincent F., Yau S., Kandels-Lewis S., Searson S., Dimier C., Picheral M., Tara Oceans Coordinators, Bork P., Boss E., de Vargas C., Follows M.J., Grimsley N., Guidi L., Hingamp P., Karsenti E., Sordino P., Stemmann L., Sullivan M.B., Tagliabue A., Zingone A., Garczarek L., d’Ortenzio F., Testor P., Not F., Ribera d’Alcala M., Wincker P., Bowler C., Iudicone D. Community-level responses to iron availability in open ocean planktonic ecosystems. Community-level responses to iron availability in open ocean planktonic ecosystems. Community-level responses to iron availability in open ocean planktonic ecosystems. Global Biogeochem. Cycles, 33, 391-419 Global Biogeochem. Cycles, 33, 391-419 Global Biogeochem. Cycles, 33, 391-419 2019/01 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Roux S., Adriaenssens E.M., Dutilh B.E., Koonin E.V., Kropinski A.M., Krupovic M., Kuhn J.H., Lavigne R., Brister J.R., Varsani A., Amid C., Aziz R.K., Bordenstein S.R., Bork P., Breitbart M., Cochrane G.R., Daly R.A., Desnues C., Duhaime M.B., Emerson J.B., Enault F., Fuhrman J.A., Hingamp P., Hugenholtz P., Hurwitz B.L., Ivanova N.N., Labonte J.M., Lee K.-B., Malmstrom R.R., Martinez-Garcia M., Mizrachi I., Ogata H., Paez-Espino D., Petit M.-A., Putonti C., Rattei T., Reyes A., Rodriguez-Valera F., Rosario K., Schriml L., Schulz F., Steward G.F., Sullivan M.B., Sunagawa S., Suttle C.A., Temperton B., Tringe S.G., Vega Thurber R., Webster N.S., Whiteson K.L., Wilhelm S.W., Wommack K.E., Woyke T., Wrighton K., Yilmaz P., Yoshida T., Young M.J., Yutin N., Allen L.Z., Kyrpides N.C., and Eloe-Fadrosh E.A. Roux S., Adriaenssens E.M., Dutilh B.E., Koonin E.V., Kropinski A.M., Krupovic M., Kuhn J.H., Lavigne R., Brister J.R., Varsani A., Amid C., Aziz R.K., Bordenstein S.R., Bork P., Breitbart M., Cochrane G.R., Daly R.A., Desnues C., Duhaime M.B., Emerson J.B., Enault F., Fuhrman J.A., Hingamp P., Hugenholtz P., Hurwitz B.L., Ivanova N.N., Labonte J.M., Lee K.-B., Malmstrom R.R., Martinez-Garcia M., Mizrachi I., Ogata H., Paez-Espino D., Petit M.-A., Putonti C., Rattei T., Reyes A., Rodriguez-Valera F., Rosario K., Schriml L., Schulz F., Steward G.F., Sullivan M.B., Sunagawa S., Suttle C.A., Temperton B., Tringe S.G., Vega Thurber R., Webster N.S., Whiteson K.L., Wilhelm S.W., Wommack K.E., Woyke T., Wrighton K., Yilmaz P., Yoshida T., Young M.J., Yutin N., Allen L.Z., Kyrpides N.C., and Eloe-Fadrosh E.A. Roux S., Adriaenssens E.M., Dutilh B.E., Koonin E.V., Kropinski A.M., Krupovic M., Kuhn J.H., Lavigne R., Brister J.R., Varsani A., Amid C., Aziz R.K., Bordenstein S.R., Bork P., Breitbart M., Cochrane G.R., Daly R.A., Desnues C., Duhaime M.B., Emerson J.B., Enault F., Fuhrman J.A., Hingamp P., Hugenholtz P., Hurwitz B.L., Ivanova N.N., Labonte J.M., Lee K.-B., Malmstrom R.R., Martinez-Garcia M., Mizrachi I., Ogata H., Paez-Espino D., Petit M.-A., Putonti C., Rattei T., Reyes A., Rodriguez-Valera F., Rosario K., Schriml L., Schulz F., Steward G.F., Sullivan M.B., Sunagawa S., Suttle C.A., Temperton B., Tringe S.G., Vega Thurber R., Webster N.S., Whiteson K.L., Wilhelm S.W., Wommack K.E., Woyke T., Wrighton K., Yilmaz P., Yoshida T., Young M.J., Yutin N., Allen L.Z., Kyrpides N.C., and Eloe-Fadrosh E.A. Minimum Information about Uncultivated Virus Genomes (MIUViG): a community consensus on standards and best practices for describing genome sequences from uncultivated viruses. Minimum Information about Uncultivated Virus Genomes (MIUViG): a community consensus on standards and best practices for describing genome sequences from uncultivated viruses. Minimum Information about Uncultivated Virus Genomes (MIUViG): a community consensus on standards and best practices for describing genome sequences from uncultivated viruses. Nat. Biotechnol., 37, 29-37 Nat. Biotechnol., 37, 29-37 Nat. Biotechnol., 37, 29-37 2019/01 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Caputi L., Carradec Q., Eveillard D., Kirilovsky A., Pelletier, Pierella Karlusich J.J., Vieira F.R.J., Villar E., Chaffron S., Malviya S., Scalco E., Acinas S.G., Alberti A., Aury J.-M., Benoiston A.-S., Bertrand A., Biard T., Bittner L., Boccara M., Brum J.R., Brunet C., Busseni G., Carratala A., Claustre H., Coelho L.P., Colin S., D’Aniello S., Da Silva C., Del Core M., Dore H., Gasparini S., Kokoszka F., Jamet J.-L., Lejeusne C., Lepoivre C., Lescot M., Lima-Mendez G., Lombard F., Lukes J., Maillet N., Madoui M.-A., Martinez E., Mazzocchi M.G., Neou M.B., Paz-Yepes J., Poulain J., Ramondenc S., Romagnan J.-B., Roux S., Manta D.S., Sanges R., Speich S., Sprovieri M., Sunagawa S., Taillander V., Tanaka A., Tirichine L., Trottier C., Uitz J., Veluchamy A., Vesela J., Vincent F., Yau S., Kandels-Lewis S., Searson S., Dimier C., Picheral M., Tara Oceans Coordinators, Bork P., Boss E., de Vargas C., Follows M.J., Grimsley N., Guidi L., Hingamp P., Karsenti E., Sordino P., Stemmann L., Sullivan M.B., Tagliabue A., Zingone A., Garczarek L., d’Ortenzio F., Testor P., Not F., Ribera d’Alcala M., Wincker P., Bowler C., Iudicone D. Caputi L., Carradec Q., Eveillard D., Kirilovsky A., Pelletier, Pierella Karlusich J.J., Vieira F.R.J., Villar E., Chaffron S., Malviya S., Scalco E., Acinas S.G., Alberti A., Aury J.-M., Benoiston A.-S., Bertrand A., Biard T., Bittner L., Boccara M., Brum J.R., Brunet C., Busseni G., Carratala A., Claustre H., Coelho L.P., Colin S., D’Aniello S., Da Silva C., Del Core M., Dore H., Gasparini S., Kokoszka F., Jamet J.-L., Lejeusne C., Lepoivre C., Lescot M., Lima-Mendez G., Lombard F., Lukes J., Maillet N., Madoui M.-A., Martinez E., Mazzocchi M.G., Neou M.B., Paz-Yepes J., Poulain J., Ramondenc S., Romagnan J.-B., Roux S., Manta D.S., Sanges R., Speich S., Sprovieri M., Sunagawa S., Taillander V., Tanaka A., Tirichine L., Trottier C., Uitz J., Veluchamy A., Vesela J., Vincent F., Yau S., Kandels-Lewis S., Searson S., Dimier C., Picheral M., Tara Oceans Coordinators, Bork P., Boss E., de Vargas C., Follows M.J., Grimsley N., Guidi L., Hingamp P., Karsenti E., Sordino P., Stemmann L., Sullivan M.B., Tagliabue A., Zingone A., Garczarek L., d’Ortenzio F., Testor P., Not F., Ribera d’Alcala M., Wincker P., Bowler C., Iudicone D. Caputi L., Carradec Q., Eveillard D., Kirilovsky A., Pelletier, Pierella Karlusich J.J., Vieira F.R.J., Villar E., Chaffron S., Malviya S., Scalco E., Acinas S.G., Alberti A., Aury J.-M., Benoiston A.-S., Bertrand A., Biard T., Bittner L., Boccara M., Brum J.R., Brunet C., Busseni G., Carratala A., Claustre H., Coelho L.P., Colin S., D’Aniello S., Da Silva C., Del Core M., Dore H., Gasparini S., Kokoszka F., Jamet J.-L., Lejeusne C., Lepoivre C., Lescot M., Lima-Mendez G., Lombard F., Lukes J., Maillet N., Madoui M.-A., Martinez E., Mazzocchi M.G., Neou M.B., Paz-Yepes J., Poulain J., Ramondenc S., Romagnan J.-B., Roux S., Manta D.S., Sanges R., Speich S., Sprovieri M., Sunagawa S., Taillander V., Tanaka A., Tirichine L., Trottier C., Uitz J., Veluchamy A., Vesela J., Vincent F., Yau S., Kandels-Lewis S., Searson S., Dimier C., Picheral M., Tara Oceans Coordinators, Bork P., Boss E., de Vargas C., Follows M.J., Grimsley N., Guidi L., Hingamp P., Karsenti E., Sordino P., Stemmann L., Sullivan M.B., Tagliabue A., Zingone A., Garczarek L., d’Ortenzio F., Testor P., Not F., Ribera d’Alcala M., Wincker P., Bowler C., Iudicone D. Community‐Level Responses to Iron Availability in Open Ocean Plankton Ecosystems Community‐Level Responses to Iron Availability in Open Ocean Plankton Ecosystems Community‐Level Responses to Iron Availability in Open Ocean Plankton Ecosystems Global Biogeochem. Cycles, 33, 33 Global Biogeochem. Cycles, 33, 33 Global Biogeochem. Cycles, 33, 33 2019/01 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Inoue M., Nakamoto I., Omae K., Oguro T., Ogata H., Yoshida T., Sako Y. Inoue M., Nakamoto I., Omae K., Oguro T., Ogata H., Yoshida T., Sako Y. Inoue M., Nakamoto I., Omae K., Oguro T., Ogata H., Yoshida T., Sako Y. Structural and phylogenetic diversity of anaerobic carbon-monoxide dehydrogenases. Structural and phylogenetic diversity of anaerobic carbon-monoxide dehydrogenases. Structural and phylogenetic diversity of anaerobic carbon-monoxide dehydrogenases. Front. Microbiol., 9, 3353 Front. Microbiol., 9, 3353 Front. Microbiol., 9, 3353 2019/01 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Salazar G., Paoli L., Alberti A., Huerta-Cepas J., Ruscheweyh H.-J., Cuenca M., Field C.M., Coelho L.P., Cruaud C., Engelen S., Gregory A.C., Labadie K., Marec C., Pelletier E., Royo-Llonch M., Roux S., Sánchez P., Uehara H., Zayed A.A., Zeller G., Carmichae M., Dimier C., Ferland J., Kandels S., Picheral M., Pisarev S., Poulain J., Tara Oceans Coordinators, Acinas S.G., Babin M., Bork P., Bowler C., de Vargas C., Guidi L., Hingamp P., Iudicone D., Karp-Boss L., Karsenti E., Ogata H., Pesant S., Speich S., Sullivan M.B., Wincker P., Sunagawa S. Salazar G., Paoli L., Alberti A., Huerta-Cepas J., Ruscheweyh H.-J., Cuenca M., Field C.M., Coelho L.P., Cruaud C., Engelen S., Gregory A.C., Labadie K., Marec C., Pelletier E., Royo-Llonch M., Roux S., Sánchez P., Uehara H., Zayed A.A., Zeller G., Carmichae M., Dimier C., Ferland J., Kandels S., Picheral M., Pisarev S., Poulain J., Tara Oceans Coordinators, Acinas S.G., Babin M., Bork P., Bowler C., de Vargas C., Guidi L., Hingamp P., Iudicone D., Karp-Boss L., Karsenti E., Ogata H., Pesant S., Speich S., Sullivan M.B., Wincker P., Sunagawa S. Salazar G., Paoli L., Alberti A., Huerta-Cepas J., Ruscheweyh H.-J., Cuenca M., Field C.M., Coelho L.P., Cruaud C., Engelen S., Gregory A.C., Labadie K., Marec C., Pelletier E., Royo-Llonch M., Roux S., Sánchez P., Uehara H., Zayed A.A., Zeller G., Carmichae M., Dimier C., Ferland J., Kandels S., Picheral M., Pisarev S., Poulain J., Tara Oceans Coordinators, Acinas S.G., Babin M., Bork P., Bowler C., de Vargas C., Guidi L., Hingamp P., Iudicone D., Karp-Boss L., Karsenti E., Ogata H., Pesant S., Speich S., Sullivan M.B., Wincker P., Sunagawa S. Gene expression changes and community turnover differentially shape the global ocean metatranscriptome. Gene expression changes and community turnover differentially shape the global ocean metatranscriptome. Gene expression changes and community turnover differentially shape the global ocean metatranscriptome. Cell. Cell. Cell. 2019 英語 公開
Ibarbalz F.M., Henry N., Brandão M.C., Martini S., Busseni G., Byrne H., Coelho L.P., Endo H., Gasol J.M., Gregory A.C, Mahé F., Rigonato J., Royo-Llonch M., Salazar G., Sanz-Sáez I, Scalco E., Soviadan D., Zayed A.A., Zingone A., Labadie K., Ferland J., Marec C., Kandels S., Picheral M., Dimier C., Poulain J., Pisarev S., Carmichael M., Pesant S., Tara Oceans Coordinators, Babin M., Boss E., Iudicone D., Jaillon O., Acinas S.G., Ogata H., Pelletier E., Stemmann L., Sullivan M.B., Sunagawa S., Bopp L., de Vargas C., Karp-Boss L., Wincker P., Lombard F., Bowler C., Zinger L. Ibarbalz F.M., Henry N., Brandão M.C., Martini S., Busseni G., Byrne H., Coelho L.P., Endo H., Gasol J.M., Gregory A.C, Mahé F., Rigonato J., Royo-Llonch M., Salazar G., Sanz-Sáez I, Scalco E., Soviadan D., Zayed A.A., Zingone A., Labadie K., Ferland J., Marec C., Kandels S., Picheral M., Dimier C., Poulain J., Pisarev S., Carmichael M., Pesant S., Tara Oceans Coordinators, Babin M., Boss E., Iudicone D., Jaillon O., Acinas S.G., Ogata H., Pelletier E., Stemmann L., Sullivan M.B., Sunagawa S., Bopp L., de Vargas C., Karp-Boss L., Wincker P., Lombard F., Bowler C., Zinger L. Ibarbalz F.M., Henry N., Brandão M.C., Martini S., Busseni G., Byrne H., Coelho L.P., Endo H., Gasol J.M., Gregory A.C, Mahé F., Rigonato J., Royo-Llonch M., Salazar G., Sanz-Sáez I, Scalco E., Soviadan D., Zayed A.A., Zingone A., Labadie K., Ferland J., Marec C., Kandels S., Picheral M., Dimier C., Poulain J., Pisarev S., Carmichael M., Pesant S., Tara Oceans Coordinators, Babin M., Boss E., Iudicone D., Jaillon O., Acinas S.G., Ogata H., Pelletier E., Stemmann L., Sullivan M.B., Sunagawa S., Bopp L., de Vargas C., Karp-Boss L., Wincker P., Lombard F., Bowler C., Zinger L. Global trends in marine plankton diversity across kingdoms of life. Global trends in marine plankton diversity across kingdoms of life. Global trends in marine plankton diversity across kingdoms of life. Cell. Cell. Cell. 2019 英語 公開
Piredda R., Claverie J.-M., Decelle J., de Vargas C., Dunthorn M., Edvardsen B., Eikrem W., Forster D., Kooistra W.H.C.F., Logares R., Massana R., Montresor M., Not F., Ogata H., Pawlowski J., Romac S., Sarno D., Stoeck T., Zingone A. Piredda R., Claverie J.-M., Decelle J., de Vargas C., Dunthorn M., Edvardsen B., Eikrem W., Forster D., Kooistra W.H.C.F., Logares R., Massana R., Montresor M., Not F., Ogata H., Pawlowski J., Romac S., Sarno D., Stoeck T., Zingone A. Piredda R., Claverie J.-M., Decelle J., de Vargas C., Dunthorn M., Edvardsen B., Eikrem W., Forster D., Kooistra W.H.C.F., Logares R., Massana R., Montresor M., Not F., Ogata H., Pawlowski J., Romac S., Sarno D., Stoeck T., Zingone A. Diatom diversity through HTS-metabarcoding in coastal European seas. Diatom diversity through HTS-metabarcoding in coastal European seas. Diatom diversity through HTS-metabarcoding in coastal European seas. Sci. Rep., 8, 18059 Sci. Rep., 8, 18059 Sci. Rep., 8, 18059 2018/12 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Li Y., Hingamp P., Watai H., Endo H., Yoshida T., Ogata H. Li Y., Hingamp P., Watai H., Endo H., Yoshida T., Ogata H. Li Y., Hingamp P., Watai H., Endo H., Yoshida T., Ogata H. Degenerate PCR primers to reveal the diversity of giant viruses in coastal waters. Degenerate PCR primers to reveal the diversity of giant viruses in coastal waters. Degenerate PCR primers to reveal the diversity of giant viruses in coastal waters. Viruses, 10, E496 Viruses, 10, E496 Viruses, 10, E496 2018/09 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Arai W., Taniguchi T., Goto S., Moriya Y., Uehara H., Takemoto K., Ogata H., Takami H. Arai W., Taniguchi T., Goto S., Moriya Y., Uehara H., Takemoto K., Ogata H., Takami H. Arai W., Taniguchi T., Goto S., Moriya Y., Uehara H., Takemoto K., Ogata H., Takami H. MAPLE 2.3.0: an improved system for evaluating the functionomes of genomes and metagenomes. MAPLE 2.3.0: an improved system for evaluating the functionomes of genomes and metagenomes. MAPLE 2.3.0: an improved system for evaluating the functionomes of genomes and metagenomes. Biosci. Biotechnol. Biochem., doi:10., 1080/09168451.2018.1476122 Biosci. Biotechnol. Biochem., doi:10., 1080/09168451.2018.1476122 Biosci. Biotechnol. Biochem., doi:10., 1080/09168451.2018.1476122 2018/05 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Yoshikawa G., Askora A., Blanc-Mathieu R., Kawasaki T., Li Y., Nakano M., Ogata H., Yamada T. Yoshikawa G., Askora A., Blanc-Mathieu R., Kawasaki T., Li Y., Nakano M., Ogata H., Yamada T. Yoshikawa G., Askora A., Blanc-Mathieu R., Kawasaki T., Li Y., Nakano M., Ogata H., Yamada T. Xanthomonas citri jumbo phage XacN1 exhibits a wide host range and high complement of tRNA genes. Xanthomonas citri jumbo phage XacN1 exhibits a wide host range and high complement of tRNA genes. Xanthomonas citri jumbo phage XacN1 exhibits a wide host range and high complement of tRNA genes. Sci. Rep., 8, 4486,, doi:10.1038/s41598-018-22239-3 Sci. Rep., 8, 4486,, doi:10.1038/s41598-018-22239-3 Sci. Rep., 8, 4486,, doi:10.1038/s41598-018-22239-3 2018 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Seeleuthner Y., Mondy S., Lombard V., Carradec Q., Pelletier E., Wessner M., Leconte J., Mangot J.F., Poulain J., Labadie K., Logares R., Sunagawa S., de Berardinis V., Salanoubat M., Dimier C., Kandels-Lewis S., Picheral M., Searson S., Tara Oceans Coordinators, Pesant S., Poulton N., Stepanauskas R., Bork P., Bowler C., Hingamp P., Sullivan M.B., Iudicone D., Massana R., Aury J.M., Henrissat B., Karsenti E., Jaillon O., Sieracki M., de Vargas C., Wincker P. Seeleuthner Y., Mondy S., Lombard V., Carradec Q., Pelletier E., Wessner M., Leconte J., Mangot J.F., Poulain J., Labadie K., Logares R., Sunagawa S., de Berardinis V., Salanoubat M., Dimier C., Kandels-Lewis S., Picheral M., Searson S., Tara Oceans Coordinators, Pesant S., Poulton N., Stepanauskas R., Bork P., Bowler C., Hingamp P., Sullivan M.B., Iudicone D., Massana R., Aury J.M., Henrissat B., Karsenti E., Jaillon O., Sieracki M., de Vargas C., Wincker P. Seeleuthner Y., Mondy S., Lombard V., Carradec Q., Pelletier E., Wessner M., Leconte J., Mangot J.F., Poulain J., Labadie K., Logares R., Sunagawa S., de Berardinis V., Salanoubat M., Dimier C., Kandels-Lewis S., Picheral M., Searson S., Tara Oceans Coordinators, Pesant S., Poulton N., Stepanauskas R., Bork P., Bowler C., Hingamp P., Sullivan M.B., Iudicone D., Massana R., Aury J.M., Henrissat B., Karsenti E., Jaillon O., Sieracki M., de Vargas C., Wincker P. Single-cell genomics of multiple uncultured stramenopiles reveals underestimated functional diversity across oceans. Single-cell genomics of multiple uncultured stramenopiles reveals underestimated functional diversity across oceans. Single-cell genomics of multiple uncultured stramenopiles reveals underestimated functional diversity across oceans. Nat.Commun., 9,310, doi:10., 1038/s41467-017-02235-3 Nat.Commun., 9,310, doi:10., 1038/s41467-017-02235-3 Nat.Commun., 9,310, doi:10., 1038/s41467-017-02235-3 2018 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Carradec Q., Pelletier E., Da Silva C., Alberti A., Seeleuthner Y., Blanc-Mathieu R., Lima-Mendez G., Rocha F., Tirichine L., Labadie K., Kirilovsky A., Bertrand A., Engelen S., Madoui M.-A., Meheust R., Poulain J., Romac S., Richter D., Yoshikawa G., Dimier C., Kandels-Lewis S., Picheral M., Searson S., Tara Oceans Coordinators, Jaillon O., Aury J.-M., Karsenti E., Sullivan M.B., Sunagawa S., Bork P., Not F., Hingamp P., Raes J., Guidi L., Ogata H., de Vargas C., Iudicone D., Bowler C., Wincker P. Carradec Q., Pelletier E., Da Silva C., Alberti A., Seeleuthner Y., Blanc-Mathieu R., Lima-Mendez G., Rocha F., Tirichine L., Labadie K., Kirilovsky A., Bertrand A., Engelen S., Madoui M.-A., Meheust R., Poulain J., Romac S., Richter D., Yoshikawa G., Dimier C., Kandels-Lewis S., Picheral M., Searson S., Tara Oceans Coordinators, Jaillon O., Aury J.-M., Karsenti E., Sullivan M.B., Sunagawa S., Bork P., Not F., Hingamp P., Raes J., Guidi L., Ogata H., de Vargas C., Iudicone D., Bowler C., Wincker P. Carradec Q., Pelletier E., Da Silva C., Alberti A., Seeleuthner Y., Blanc-Mathieu R., Lima-Mendez G., Rocha F., Tirichine L., Labadie K., Kirilovsky A., Bertrand A., Engelen S., Madoui M.-A., Meheust R., Poulain J., Romac S., Richter D., Yoshikawa G., Dimier C., Kandels-Lewis S., Picheral M., Searson S., Tara Oceans Coordinators, Jaillon O., Aury J.-M., Karsenti E., Sullivan M.B., Sunagawa S., Bork P., Not F., Hingamp P., Raes J., Guidi L., Ogata H., de Vargas C., Iudicone D., Bowler C., Wincker P. A global ocean atlas of eukaryotic genes. A global ocean atlas of eukaryotic genes. A global ocean atlas of eukaryotic genes. Nat. Commun., 9,373, doi:10., 1038/s41467-017-02342-1 Nat. Commun., 9,373, doi:10., 1038/s41467-017-02342-1 Nat. Commun., 9,373, doi:10., 1038/s41467-017-02342-1 2018 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Hiroyuki Ogata Hiroyuki Ogata Hiroyuki Ogata Habitat Alterations by Viruses: Strategies by Tupanviruses and Others. Habitat Alterations by Viruses: Strategies by Tupanviruses and Others. Habitat Alterations by Viruses: Strategies by Tupanviruses and Others. Microbes Environ, 33, 117-119 Microbes Environ, 33, 117-119 Microbes Environ, 33, 117-119 2018 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Roux S., Adriaenssens E.M., Dutilh B.E., Koonin E.V., Kropinski A.M., Krupovic M., Kuhn J.H., Lavigne R., Brister J.R., Varsani A., Amid C., Aziz R.K., Bordenstein S.R., Bork P., Breitbart M., Cochrane G.R., Daly R.A., Desnues C., Duhaime M.B., Emerson J.B., Enault F., Fuhrman J.A., Hingamp P., Hugenholtz P., Hurwitz B.L., Ivanova N.N., Labonte J.M., Lee K.-B., Malmstrom R.R., Martinez-Garcia M., Mizrachi I., Ogata H., Paez-Espino D., Petit M.-A., Putonti C., Rattei T., Reyes A., Rodriguez-Valera F., Rosario K., Schriml L., Schulz F., Steward G.F., Sullivan M.B., Sunagawa S., Suttle C.A., Temperton B., Tringe S.G., Vega Thurber R., Webster N.S., Whiteson K.L., Wilhelm S.W., Wommack K.E., Woyke T., Wrighton K., Yilmaz P., Yoshida T., Young M.J., Yutin N., Allen L.Z., Kyrpides N.C., Eloe-Fadrosh E.A. Roux S., Adriaenssens E.M., Dutilh B.E., Koonin E.V., Kropinski A.M., Krupovic M., Kuhn J.H., Lavigne R., Brister J.R., Varsani A., Amid C., Aziz R.K., Bordenstein S.R., Bork P., Breitbart M., Cochrane G.R., Daly R.A., Desnues C., Duhaime M.B., Emerson J.B., Enault F., Fuhrman J.A., Hingamp P., Hugenholtz P., Hurwitz B.L., Ivanova N.N., Labonte J.M., Lee K.-B., Malmstrom R.R., Martinez-Garcia M., Mizrachi I., Ogata H., Paez-Espino D., Petit M.-A., Putonti C., Rattei T., Reyes A., Rodriguez-Valera F., Rosario K., Schriml L., Schulz F., Steward G.F., Sullivan M.B., Sunagawa S., Suttle C.A., Temperton B., Tringe S.G., Vega Thurber R., Webster N.S., Whiteson K.L., Wilhelm S.W., Wommack K.E., Woyke T., Wrighton K., Yilmaz P., Yoshida T., Young M.J., Yutin N., Allen L.Z., Kyrpides N.C., Eloe-Fadrosh E.A. Roux S., Adriaenssens E.M., Dutilh B.E., Koonin E.V., Kropinski A.M., Krupovic M., Kuhn J.H., Lavigne R., Brister J.R., Varsani A., Amid C., Aziz R.K., Bordenstein S.R., Bork P., Breitbart M., Cochrane G.R., Daly R.A., Desnues C., Duhaime M.B., Emerson J.B., Enault F., Fuhrman J.A., Hingamp P., Hugenholtz P., Hurwitz B.L., Ivanova N.N., Labonte J.M., Lee K.-B., Malmstrom R.R., Martinez-Garcia M., Mizrachi I., Ogata H., Paez-Espino D., Petit M.-A., Putonti C., Rattei T., Reyes A., Rodriguez-Valera F., Rosario K., Schriml L., Schulz F., Steward G.F., Sullivan M.B., Sunagawa S., Suttle C.A., Temperton B., Tringe S.G., Vega Thurber R., Webster N.S., Whiteson K.L., Wilhelm S.W., Wommack K.E., Woyke T., Wrighton K., Yilmaz P., Yoshida T., Young M.J., Yutin N., Allen L.Z., Kyrpides N.C., Eloe-Fadrosh E.A. Minimum Information about Uncultivated Virus Genomes (MIUViG): a community consensus on standards and best practices for describing genome sequences from uncultivated viruses. Minimum Information about Uncultivated Virus Genomes (MIUViG): a community consensus on standards and best practices for describing genome sequences from uncultivated viruses. Minimum Information about Uncultivated Virus Genomes (MIUViG): a community consensus on standards and best practices for describing genome sequences from uncultivated viruses. Nat. Biotechnol. Nat. Biotechnol. 2018 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Endo H., Ogata H., Suzuki K. Endo H., Ogata H., Suzuki K. Endo H., Ogata H., Suzuki K. Contrasting biogeography and diversity patterns between diatoms and haptophytes in the central Pacific Ocean. Contrasting biogeography and diversity patterns between diatoms and haptophytes in the central Pacific Ocean. Contrasting biogeography and diversity patterns between diatoms and haptophytes in the central Pacific Ocean. Sci. Rep. Sci. Rep. Sci. Rep. 2018 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Nishiyama H., Nagai T., Kudo M., Okazaki Y., Azuma Y., Watanabe T., Susumu G., Ogata H., Sakurai T. Nishiyama H., Nagai T., Kudo M., Okazaki Y., Azuma Y., Watanabe T., Susumu G., Ogata H., Sakurai T. Nishiyama H., Nagai T., Kudo M., Okazaki Y., Azuma Y., Watanabe T., Susumu G., Ogata H., Sakurai T. Supplementation of pancreatic digestive enzymes alters the composition of intestinal microbiota in mice. Supplementation of pancreatic digestive enzymes alters the composition of intestinal microbiota in mice. Supplementation of pancreatic digestive enzymes alters the composition of intestinal microbiota in mice. Biochem.Biophys.Res.Commun., 495, 1, 273-279 Biochem.Biophys.Res.Commun., 495, 1, 273-279 Biochem.Biophys.Res.Commun., 495, 1, 273-279 2018 英語 公開
Yoshida T., Nishimura Y., Watai H., Haruki N., Morimoto D., Kaneko H., Honda T., Yamamoto K., Hingamp P., Sako Y., Goto S., Ogata H. Yoshida T., Nishimura Y., Watai H., Haruki N., Morimoto D., Kaneko H., Honda T., Yamamoto K., Hingamp P., Sako Y., Goto S., Ogata H. Yoshida T., Nishimura Y., Watai H., Haruki N., Morimoto D., Kaneko H., Honda T., Yamamoto K., Hingamp P., Sako Y., Goto S., Ogata H. Locality and diel cycling of viral production revealed by a 24 h time course cross-omics analysis in a coastal region of Japan. Locality and diel cycling of viral production revealed by a 24 h time course cross-omics analysis in a coastal region of Japan. Locality and diel cycling of viral production revealed by a 24 h time course cross-omics analysis in a coastal region of Japan. ISME J., doi:10., 1038/s41396-018-0052-x ISME J., doi:10., 1038/s41396-018-0052-x ISME J., doi:10., 1038/s41396-018-0052-x 2018 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Mihara T., Koyano H., Hingamp P., Grimsley N., Goto S., Ogata H. Mihara T., Koyano H., Hingamp P., Grimsley N., Goto S., Ogata H. Mihara T., Koyano H., Hingamp P., Grimsley N., Goto S., Ogata H. Taxon richness of "Megaviridae" exceeds those of Bacteria and Archaea in the ocean. Taxon richness of "Megaviridae" exceeds those of Bacteria and Archaea in the ocean. Taxon richness of "Megaviridae" exceeds those of Bacteria and Archaea in the ocean. Microbes Environ., doi:10., 1264/jsme2.ME17203 Microbes Environ., doi:10., 1264/jsme2.ME17203 Microbes Environ., doi:10., 1264/jsme2.ME17203 2018 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
Shimizu Y., Ogata H., Goto S. Shimizu Y., Ogata H., Goto S. Shimizu Y., Ogata H., Goto S. Type III polyketide synthases: functional classification and phylogenomics Type III polyketide synthases: functional classification and phylogenomics Type III polyketide synthases: functional classification and phylogenomics ChemBioChem, 18, 50-65 ChemBioChem, 18, 50-65 ChemBioChem, 18, 50-65 2017 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
緒方 博之 緒方 博之 Hiroyuki Ogata Viral to metazoan marine plankton nucleotide sequences from the Tara Oceans expedition. Viral to metazoan marine plankton nucleotide sequences from the Tara Oceans expedition. Viral to metazoan marine plankton nucleotide sequences from the Tara Oceans expedition. Sci.Date, 4, 170093 Sci.Date, 4, 170093 Sci.Date, 4, 170093 2017 英語 研究論文(学術雑誌) 公開
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緒方博之 緒方博之 Ogata H. フランスのバイオインフォマティクス事情 フランスのバイオインフォマティクス事情 Bioinformatics in France. Japanese Society for Bioinformatics News Letter, 11 Japanese Society for Bioinformatics News Letter, 11 Japanese Society for Bioinformatics News Letter, 11 2005 日本語 公開
Ogata H. Ogata H. Ogata H. Other sequence analysis tools. Other sequence analysis tools. Other sequence analysis tools. Introduction to GenomeNet Databases, 2nd edition Introduction to GenomeNet Databases, 2nd edition Introduction to GenomeNet Databases, 2nd edition 1998 英語 公開
緒方博之、金久實 緒方博之、金久實 Ogata H, Kanehisa M. タンパク質データベース利用による機能解析 タンパク質データベース利用による機能解析 Function analysis using protein databases. 生物物理, 36, 152-154 生物物理, 36, 152-154 Biophysics, 36, 152-154 1996 英語 公開
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海洋巨大ウイルスの多様性と宿主予測[招待あり] 海洋巨大ウイルスの多様性と宿主予測 [招待あり] 海洋巨大ウイルスの多様性と宿主予測 [招待あり] 水圏微生物研究フォーラム 水圏微生物研究フォーラム 水圏微生物研究フォーラム 2016/08/09 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Virus-host database: a manually curated resource for viral host prediction Virus-host database: a manually curated resource for viral host prediction Virus-host database: a manually curated resource for viral host prediction 8th Aquatic Virus Workshop 8th Aquatic Virus Workshop 8th Aquatic Virus Workshop 2016/07/13 英語 口頭発表(一般) 公開
海洋ウイルス:環境ゲノムから見る多様性・相互作用・分布.[招待あり] 海洋ウイルス:環境ゲノムから見る多様性・相互作用・分布. [招待あり] 海洋ウイルス:環境ゲノムから見る多様性・相互作用・分布. [招待あり] 日本海洋学会2016年度春季大会 日本海洋学会2016年度春季大会 日本海洋学会2016年度春季大会 2016/03/17 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
完全長ゲノムに基づく海洋ウイルスの定量的動態解析とその宿主微生物の推定. 完全長ゲノムに基づく海洋ウイルスの定量的動態解析とその宿主微生物の推定. 完全長ゲノムに基づく海洋ウイルスの定量的動態解析とその宿主微生物の推定. 日本海洋学会2016年度春季大会 日本海洋学会2016年度春季大会 日本海洋学会2016年度春季大会 2016/03/12 日本語 ポスター発表 公開
GenomeNet's services for metagenomics studies GenomeNet's services for metagenomics studies GenomeNet's services for metagenomics studies A New Age of Discovery for Aquatic Microeukaryotes A New Age of Discovery for Aquatic Microeukaryotes A New Age of Discovery for Aquatic Microeukaryotes 2016/01/27 英語 ポスター発表 公開
巨大ウイルスは海洋生態系進化の原動力である 巨大ウイルスは海洋生態系進化の原動力である 巨大ウイルスは海洋生態系進化の原動力である 第37回日本分子生物学会年会(2014/11/25-27) 第37回日本分子生物学会年会(2014/11/25-27) 第37回日本分子生物学会年会(2014/11/25-27) Yokohama Yokohama 2015/11/25 日本語 公開
Assessing the diversity of the Megaviridae giant viruses based on RNA polymerase beta genes Assessing the diversity of the Megaviridae giant viruses based on RNA polymerase beta genes Assessing the diversity of the Megaviridae giant viruses based on RNA polymerase beta genes Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2015 Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2015 Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2015 2015/10/30 日本語 ポスター発表 公開
Revealing complete genomes from metagenomes: a case study for viruses in the ocean Revealing complete genomes from metagenomes: a case study for viruses in the ocean Revealing complete genomes from metagenomes: a case study for viruses in the ocean Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2015 Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2015 Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2015 2015/10/29 日本語 口頭発表(一般) 公開
Relating the reaction types and phylogeny of type III polyketide synthases Relating the reaction types and phylogeny of type III polyketide synthases Relating the reaction types and phylogeny of type III polyketide synthases Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2015 Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2015 Informatics in Biology, Medicine and Pharmacology 2015 2015/10/29 英語 口頭発表(一般) 公開
Metagenomic analysis of viral communities in Osaka bay, Japan Metagenomic analysis of viral communities in Osaka bay, Japan Metagenomic analysis of viral communities in Osaka bay, Japan Annual meeting of Japanese Society of Microbial Ecology, 2015 Annual meeting of Japanese Society of Microbial Ecology, 2015 Annual meeting of Japanese Society of Microbial Ecology, 2015 2015/10/18 日本語 ポスター発表 公開
A viral proteomic tree server and its application to a marine metagenomic study A viral proteomic tree server and its application to a marine metagenomic study A viral proteomic tree server and its application to a marine metagenomic study Annual meeting of Japanese Society of Microbial Ecology, 2015 Annual meeting of Japanese Society of Microbial Ecology, 2015 Annual meeting of Japanese Society of Microbial Ecology, 2015 2015/10/18 日本語 ポスター発表 公開
A GenomeNet resource for virus-host interaction network analyses A GenomeNet resource for virus-host interaction network analyses A GenomeNet resource for virus-host interaction network analyses Annual meeting of Japanese Society of Microbial Ecology, 2015 Annual meeting of Japanese Society of Microbial Ecology, 2015 Annual meeting of Japanese Society of Microbial Ecology, 2015 2015/10/18 日本語 ポスター発表 公開
Diversity of marine giant DNA viruses Diversity of marine giant DNA viruses Diversity of marine giant DNA viruses International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology 2015 International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology 2015 International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology 2015 2015/07/20 英語 口頭発表(一般) 公開
海洋巨大ウイルスの多様性と進化.[招待あり] 海洋巨大ウイルスの多様性と進化. [招待あり] 海洋巨大ウイルスの多様性と進化. [招待あり] JT生命誌研究館セミナー JT生命誌研究館セミナー JT生命誌研究館セミナー Tkatsuki Tkatsuki 2015/06/18 日本語 公開
次世代シーケンサーを用いた未知の海洋細菌―ウイルス感染系の推定 次世代シーケンサーを用いた未知の海洋細菌―ウイルス感染系の推定 次世代シーケンサーを用いた未知の海洋細菌―ウイルス感染系の推定 日本水産学会春季大会(2015/3/27-31) 日本水産学会春季大会(2015/3/27-31) 日本水産学会春季大会(2015/3/27-31) Tokyo Tokyo 2015/03/29 日本語 公開
メタオミクスによる海洋ウイルスと微生物群集の継時的観測 メタオミクスによる海洋ウイルスと微生物群集の継時的観測 メタオミクスによる海洋ウイルスと微生物群集の継時的観測 NGS現場の会 NGS現場の会 NGS現場の会 2015/03/29 日本語 口頭発表(一般) 公開
海洋巨大ウイルスの進化と生態[招待あり] 海洋巨大ウイルスの進化と生態 [招待あり] 海洋巨大ウイルスの進化と生態 [招待あり] 京都大学生態研センターセミナー 京都大学生態研センターセミナー 京都大学生態研センターセミナー 2015/02/20 英語 口頭発表(一般) 公開
巨大ウイルスは海洋生態系進化の原動力である 巨大ウイルスは海洋生態系進化の原動力である 巨大ウイルスは海洋生態系進化の原動力である 第37回日本分子生物学会年会 第37回日本分子生物学会年会 第37回日本分子生物学会年会 Yokohama Yokohama 2014/11/25 日本語 公開
ウイルスは生命か?−巨大ウイルスを中心に− ウイルスは生命か?−巨大ウイルスを中心に− ウイルスは生命か?−巨大ウイルスを中心に− 平成26年第二回化学研究所イブニングセミナー 平成26年第二回化学研究所イブニングセミナー 平成26年第二回化学研究所イブニングセミナー ICR,Uji ICR,Uji 2014/11/12 日本語 公開
次世代配列解析による海洋ウイルスと宿主の相互作用の解析 次世代配列解析による海洋ウイルスと宿主の相互作用の解析 次世代配列解析による海洋ウイルスと宿主の相互作用の解析 生命情報科学若手の会 第6回研究会(2014/10/29-30) 生命情報科学若手の会 第6回研究会(2014/10/29-30) 生命情報科学若手の会 第6回研究会(2014/10/29-30) CDB, Kobe CDB, Kobe 2014/10/29 日本語 公開
Why do some viruses encode amino acid biosynthetic genes? Why do some viruses encode amino acid biosynthetic genes? Why do some viruses encode amino acid biosynthetic genes? Informatics in Biology, Medicine and Pharmocology 2014(2014/10/2-4) Informatics in Biology, Medicine and Pharmocology 2014(2014/10/2-4) Informatics in Biology, Medicine and Pharmocology 2014(2014/10/2-4) Sendai Sendai 2014/10/02 英語 公開
Marine viral genomics: from genetic diversity to ecological implications.[招待あり] Marine viral genomics: from genetic diversity to ecological implications. [招待あり] Marine viral genomics: from genetic diversity to ecological implications. [招待あり] Sweden-Kyoto Symposium(2014/9/11-12) Sweden-Kyoto Symposium(2014/9/11-12) Sweden-Kyoto Symposium(2014/9/11-12) Stockholm University/Karolinska Institute, Stockholm Stockholm University/Karolinska Institute, Stockholm 2014/09/02 英語 公開
Exploring Polyketide Synthases from Huge Metagenomic Samples. Exploring Polyketide Synthases from Huge Metagenomic Samples. Exploring Polyketide Synthases from Huge Metagenomic Samples. 14th International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB) 2014/7/20-25 14th International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB) 2014/7/20-25 14th International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB) 2014/7/20-25 Berlin Berlin 2014/07/21 英語 公開
Tools to Interpret Large Genomic and Metagenomic Data using KEGG Databases. Tools to Interpret Large Genomic and Metagenomic Data using KEGG Databases. Tools to Interpret Large Genomic and Metagenomic Data using KEGG Databases. 14th International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB) 2014/7/20-25 14th International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB) 2014/7/20-25 14th International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology (IBSB) 2014/7/20-25 Berlin Berlin 2014/07/20 英語 公開
Recent bioinformatics development in quantitative metagenomics.[招待あり] Recent bioinformatics development in quantitative metagenomics. [招待あり] Recent bioinformatics development in quantitative metagenomics. [招待あり] The 3rd International Seminar on Biodiversity and Evolution (June 6, 2014, Kyoto Kyoiku Bunka Center, Kyoto, Oral presentation) The 3rd International Seminar on Biodiversity and Evolution (June 6, 2014, Kyoto Kyoiku Bunka Center, Kyoto, Oral presentation) The 3rd International Seminar on Biodiversity and Evolution (June 6, 2014, Kyoto Kyoiku Bunka Center, Kyoto, Oral presentation) Kyoto Kyoto 2014/06/06 英語 公開
Giruses in the Ocean: from diversity to their ecological significance (in Japanese).[招待あり] Giruses in the Ocean: from diversity to their ecological significance (in Japanese). [招待あり] Giruses in the Ocean: from diversity to their ecological significance (in Japanese). [招待あり] Annual meeting of the Sciety of Genome Microbiology Japan - Symposium 1(2014/3/7-9) Annual meeting of the Sciety of Genome Microbiology Japan - Symposium 1(2014/3/7-9) Annual meeting of the Sciety of Genome Microbiology Japan - Symposium 1(2014/3/7-9) Tokyo University of Agriculture, Tokyo Tokyo University of Agriculture, Tokyo 2014/03/08 英語 公開
Quantifying large DNA viruses in marine ecosystems. Quantifying large DNA viruses in marine ecosystems. Quantifying large DNA viruses in marine ecosystems. Ocean Science Meeting 2014, Session 075(2014/2/23−28) Ocean Science Meeting 2014, Session 075(2014/2/23−28) Ocean Science Meeting 2014, Session 075(2014/2/23−28) Hawai, USA Hawai, USA 2014/02/25 英語 公開
Giant viruses: a unique entry to the natural diversity of DNA processing genes.[招待あり] Giant viruses: a unique entry to the natural diversity of DNA processing genes. [招待あり] Giant viruses: a unique entry to the natural diversity of DNA processing genes. [招待あり] Second Bioscience and Biotechnology International Symposium: The Nucleic Acid World - Interface between Biology and Chemistry. Second Bioscience and Biotechnology International Symposium: The Nucleic Acid World - Interface between Biology and Chemistry. Second Bioscience and Biotechnology International Symposium: The Nucleic Acid World - Interface between Biology and Chemistry. Suzukakedai Campus, Tokyo Institute of Technology., Yokohama Suzukakedai Campus, Tokyo Institute of Technology., Yokohama 2014/01/29 英語 公開
Quantifying nucleo-cytoplasmic large DNA viruses in marine ecosystems.[招待あり] Quantifying nucleo-cytoplasmic large DNA viruses in marine ecosystems. [招待あり] Quantifying nucleo-cytoplasmic large DNA viruses in marine ecosystems. [招待あり] International Symposium on Giant Virus Biology(2013/11/17-20) International Symposium on Giant Virus Biology(2013/11/17-20) International Symposium on Giant Virus Biology(2013/11/17-20) Ringberg Castle, Tegernsee, Germany Ringberg Castle, Tegernsee, Germany 2013/11/19 英語 公開
Richness of NCLDV genes. Richness of NCLDV genes. Richness of NCLDV genes. Tara-Oceans Biodiversity Workshop, ENS, Paris(2013/7/4−5) Tara-Oceans Biodiversity Workshop, ENS, Paris(2013/7/4−5) Tara-Oceans Biodiversity Workshop, ENS, Paris(2013/7/4−5) Paris, France Paris, France 2013/07/05 英語 公開
Eco-system biology and modeling (WP5 of OCEANOMICS). Eco-system biology and modeling (WP5 of OCEANOMICS). Eco-system biology and modeling (WP5 of OCEANOMICS). OCEANOMICS Kick-off meeting, UPMC, Paris OCEANOMICS Kick-off meeting, UPMC, Paris OCEANOMICS Kick-off meeting, UPMC, Paris Paris, France Paris, France 2013/03/19 英語 公開
The big viruses in marine environments. The big viruses in marine environments. The big viruses in marine environments. Seminar at Nakai laboratory, Tokyo Univ., Tokyo Seminar at Nakai laboratory, Tokyo Univ., Tokyo Seminar at Nakai laboratory, Tokyo Univ., Tokyo Tokyo Tokyo 2013/02/12 英語 公開
A reference database for viruses and its application for the analysis of TARA-OCEANS metagenomic datasets from 3 Mediterranean stations. A reference database for viruses and its application for the analysis of TARA-OCEANS metagenomic datasets from 3 Mediterranean stations. A reference database for viruses and its application for the analysis of TARA-OCEANS metagenomic datasets from 3 Mediterranean stations. MicroB3 workshop: Exploring Ecosystems Biology WP6(2012/12/6−7) MicroB3 workshop: Exploring Ecosystems Biology WP6(2012/12/6−7) MicroB3 workshop: Exploring Ecosystems Biology WP6(2012/12/6−7) Istanbul, Turykey Istanbul, Turykey 2012/12/06 英語 公開
The wonder world of small giants in the sea.[招待あり] The wonder world of small giants in the sea. [招待あり] The wonder world of small giants in the sea. [招待あり] Lecture at Tokyo Institute of Technology, Tokyo Lecture at Tokyo Institute of Technology, Tokyo Lecture at Tokyo Institute of Technology, Tokyo Ookayama, Tokyo Ookayama, Tokyo 2012/06/14 英語 公開
Giant viruses in marine environments. Giant viruses in marine environments. Giant viruses in marine environments. Tara Japan Tour(2012/2/11-19) Tara Japan Tour(2012/2/11-19) Tara Japan Tour(2012/2/11-19) Feb 11-19; JAMSTEC, Yokosuka, Feb-13; Kyoto Univ., Kyoto, Feb-14; National Research Institute of Fisheries and Environment of Inland Sea, Fisheries Research Agency, Hiroshima Feb 11-19; JAMSTEC, Yokosuka, Feb-13; Kyoto Univ., Kyoto, Feb-14; National Research Institute of Fisheries and Environment of Inland Sea, Fisheries Research Agency, Hiroshima 2012/02/17 英語 公開
Diversity of DNA informational proteins originating from viruses. Diversity of DNA informational proteins originating from viruses. Diversity of DNA informational proteins originating from viruses. Aquatic Virus Workshop 6(2011/10/30-11/3) Aquatic Virus Workshop 6(2011/10/30-11/3) Aquatic Virus Workshop 6(2011/10/30-11/3) Texel, The Netherlands Texel, The Netherlands 2011/11/02 英語 公開
The girus gene pool.[招待あり] The girus gene pool. [招待あり] The girus gene pool. [招待あり] ANR/ARP workshop: International conference on the Viruses of the Environement(2011/3/22-23) ANR/ARP workshop: International conference on the Viruses of the Environement(2011/3/22-23) ANR/ARP workshop: International conference on the Viruses of the Environement(2011/3/22-23) Heidelberg, Germany Heidelberg, Germany 2011/03/23 英語 公開
Relationship between algae and their viruses - from the viewpoint of genomics. (pp.14-15) Relationship between algae and their viruses - from the viewpoint of genomics. (pp.14-15) Relationship between algae and their viruses - from the viewpoint of genomics. (pp.14-15) Symposium of National Bio-Resource Project 'Algae' Symposium of National Bio-Resource Project 'Algae' Symposium of National Bio-Resource Project 'Algae' Tokyo Tokyo 2011/01/29 英語 公開
Genomics and metagenomics of marine giruses.[招待あり] Genomics and metagenomics of marine giruses. [招待あり] Genomics and metagenomics of marine giruses. [招待あり] ANR/ARP workshop: Combining high througput genomics, quantitative imaging, in situ oceanographic and satellite data and modeling to better understand plankton ecosystems at the planetary level(2011/1/10-11) ANR/ARP workshop: Combining high througput genomics, quantitative imaging, in situ oceanographic and satellite data and modeling to better understand plankton ecosystems at the planetary level(2011/1/10-11) ANR/ARP workshop: Combining high througput genomics, quantitative imaging, in situ oceanographic and satellite data and modeling to better understand plankton ecosystems at the planetary level(2011/1/10-11) Villefranche, France Villefranche, France 2011/01/11 英語 公開
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Mimivirus and other giants of the virus world.[招待あり] Mimivirus and other giants of the virus world. [招待あり] Mimivirus and other giants of the virus world. [招待あり] Fourth European Congress of Virology(2010/44/7-11) Fourth European Congress of Virology(2010/44/7-11) Fourth European Congress of Virology(2010/44/7-11) Cernobbio, Italy Cernobbio, Italy 2010/04/07 英語 公開
The goal of Tara-Girus.[招待あり] The goal of Tara-Girus. [招待あり] The goal of Tara-Girus. [招待あり] Tara Retreat Meeting(2010/2/1-3) Tara Retreat Meeting(2010/2/1-3) Tara Retreat Meeting(2010/2/1-3) Heidlberg, Germany Heidlberg, Germany 2010/02/01 英語 公開
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Mimivirus, its sisters and cousins: towards revealing the hidden world of giant viruses. Mimivirus, its sisters and cousins: towards revealing the hidden world of giant viruses. Mimivirus, its sisters and cousins: towards revealing the hidden world of giant viruses. Seminar Observatoire Oceanologique de Villefranche-sur-Mer Seminar Observatoire Oceanologique de Villefranche-sur-Mer Seminar Observatoire Oceanologique de Villefranche-sur-Mer Villefranche-sur-Mer, Framce Villefranche-sur-Mer, Framce 2009/12/10 英語 公開
The frontier of the study of dinoflagellate-infecting viruses. The frontier of the study of dinoflagellate-infecting viruses. The frontier of the study of dinoflagellate-infecting viruses. The 25-th conference of the Japanese Society of Microbial Ecology The 25-th conference of the Japanese Society of Microbial Ecology The 25-th conference of the Japanese Society of Microbial Ecology Hiroshima Hiroshima 2009/11/21 英語 公開
How the life cycle impacts transcriptome and genome contents in Emiliania huxleyi. How the life cycle impacts transcriptome and genome contents in Emiliania huxleyi. How the life cycle impacts transcriptome and genome contents in Emiliania huxleyi. Emiliania huxleyi Jamboree(2009/6/17-18) Emiliania huxleyi Jamboree(2009/6/17-18) Emiliania huxleyi Jamboree(2009/6/17-18) Woods Hole Oceanographic Institute Woods Hole Oceanographic Institute 2009/06/18 英語 公開
Horizontal gene transfer between Emiliania huxleyi and viruses (II). Horizontal gene transfer between Emiliania huxleyi and viruses (II). Horizontal gene transfer between Emiliania huxleyi and viruses (II). Emiliania huxleyi Jamboree(2009/6/17-18) Emiliania huxleyi Jamboree(2009/6/17-18) Emiliania huxleyi Jamboree(2009/6/17-18) Woods Hole Oceanographic Institute Woods Hole Oceanographic Institute 2009/06/17 英語 公開
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Host-like genes in giant DNA viruses.[招待あり] Host-like genes in giant DNA viruses. [招待あり] Host-like genes in giant DNA viruses. [招待あり] Lecture at Kyoto University(2008/12/19-22) Lecture at Kyoto University(2008/12/19-22) Lecture at Kyoto University(2008/12/19-22) Kyoto Kyoto 2008/12/22 英語 公開
Aquatic viruses: manipulators of host metabolism and a reservoir of new genes.[招待あり] Aquatic viruses: manipulators of host metabolism and a reservoir of new genes. [招待あり] Aquatic viruses: manipulators of host metabolism and a reservoir of new genes. [招待あり] Lecture at Universite Blaise-Pascal and Universite D'Auvergne Lecture at Universite Blaise-Pascal and Universite D'Auvergne Lecture at Universite Blaise-Pascal and Universite D'Auvergne Aubiere, France Aubiere, France 2008/11/26 英語 公開
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Transcriptomic comparison of 1N and 2N phases of Emiliania huxleyi. Transcriptomic comparison of 1N and 2N phases of Emiliania huxleyi. Transcriptomic comparison of 1N and 2N phases of Emiliania huxleyi. Emiliania huxleyi Jamboree(2008/10/15-17) Emiliania huxleyi Jamboree(2008/10/15-17) Emiliania huxleyi Jamboree(2008/10/15-17) DOE-JGI Walnut Creek California, USA DOE-JGI Walnut Creek California, USA 2008/10/15 英語 公開
Distribution of giant viruses in marine environments. Distribution of giant viruses in marine environments. Distribution of giant viruses in marine environments. The 13th France-Japan Oceanography Symposium(2008/9/8-10) The 13th France-Japan Oceanography Symposium(2008/9/8-10) The 13th France-Japan Oceanography Symposium(2008/9/8-10) Marseille, France Marseille, France 2008/09/10 英語 公開
Transcription of the phycobilisome degradation gene in cyanophage MA-LMM01 infecting Microcystis aeruginosa. Transcription of the phycobilisome degradation gene in cyanophage MA-LMM01 infecting Microcystis aeruginosa. Transcription of the phycobilisome degradation gene in cyanophage MA-LMM01 infecting Microcystis aeruginosa. The 5th Aquatic Virus Workshop(2008/7/6-11) The 5th Aquatic Virus Workshop(2008/7/6-11) The 5th Aquatic Virus Workshop(2008/7/6-11) Vancouver, Canada Vancouver, Canada 2008/07/09 英語 公開
Genetic and biochemical characterization of the lytic enzymes from cyanophage MA-LMM01 infecting Microcystis aeruginosa Genetic and biochemical characterization of the lytic enzymes from cyanophage MA-LMM01 infecting Microcystis aeruginosa Genetic and biochemical characterization of the lytic enzymes from cyanophage MA-LMM01 infecting Microcystis aeruginosa The 5th Aquatic Virus Workshop(2008/7/6-11) The 5th Aquatic Virus Workshop(2008/7/6-11) The 5th Aquatic Virus Workshop(2008/7/6-11) Vancouver, Canada Vancouver, Canada 2008/07/09 英語 公開
Mimivirus and Mimiviridae: towards a new family of microalgae viruses. Mimivirus and Mimiviridae: towards a new family of microalgae viruses. Mimivirus and Mimiviridae: towards a new family of microalgae viruses. The 5th Aquatic Virus Workshop(2008/7/6-11) The 5th Aquatic Virus Workshop(2008/7/6-11) The 5th Aquatic Virus Workshop(2008/7/6-11) Vancouver, Canada Vancouver, Canada 2008/07/08 英語 公開
Giant viruses are old and ubiquitous. Giant viruses are old and ubiquitous. Giant viruses are old and ubiquitous. Seminaire MAGAMA Seminaire MAGAMA Seminaire MAGAMA Marseille, France Marseille, France 2008/02/28 英語 公開
Bioinformatics and evolutionary analysis of NCLDVs. Bioinformatics and evolutionary analysis of NCLDVs. Bioinformatics and evolutionary analysis of NCLDVs. Genomics and Ecology of Aquatic Viruses(20082/11-13) Genomics and Ecology of Aquatic Viruses(20082/11-13) Genomics and Ecology of Aquatic Viruses(20082/11-13) Banyuls-sur-Mer, France Banyuls-sur-Mer, France 2008/02/11 英語 公開
The genome of the freshwater cyanophage Ma-LMM01 infecting toxic Microcystis aeruginosa. The genome of the freshwater cyanophage Ma-LMM01 infecting toxic Microcystis aeruginosa. The genome of the freshwater cyanophage Ma-LMM01 infecting toxic Microcystis aeruginosa. Genomics and Ecology of Aquatic Viruses(20082/11-13) Genomics and Ecology of Aquatic Viruses(20082/11-13) Genomics and Ecology of Aquatic Viruses(20082/11-13) Banyuls-sur-Mer, France Banyuls-sur-Mer, France 2008/02/11 英語 公開
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New insights into the evolutionary behaviour of giant virus genomes.[招待あり] New insights into the evolutionary behaviour of giant virus genomes. [招待あり] New insights into the evolutionary behaviour of giant virus genomes. [招待あり] Bioinformatics Colloquium Bioinformatics Colloquium Bioinformatics Colloquium Munich, Germany Munich, Germany 2007/10/24 英語 公開
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Virus-host genome comparison.[招待あり] Virus-host genome comparison. [招待あり] Virus-host genome comparison. [招待あり] E. huxleyi Genome Jamboree(20073/19-20) E. huxleyi Genome Jamboree(20073/19-20) E. huxleyi Genome Jamboree(20073/19-20) Roscoff, France Roscoff, France 2007/03/19 英語 公開
Analyses comparatives et quantitatives des genomes viraux. Analyses comparatives et quantitatives des genomes viraux. Analyses comparatives et quantitatives des genomes viraux. RAVIE(2007/1/25-26) RAVIE(2007/1/25-26) RAVIE(2007/1/25-26) Aubiere, France Aubiere, France 2007/01/25 英語 公開
Alien genes in viruses: biased biological roles and variable frequencies. Alien genes in viruses: biased biological roles and variable frequencies. Alien genes in viruses: biased biological roles and variable frequencies. 10th Evolutionary Biology Meeting at Marseille(2006/9/20-22) 10th Evolutionary Biology Meeting at Marseille(2006/9/20-22) 10th Evolutionary Biology Meeting at Marseille(2006/9/20-22) Marseille, France Marseille, France 2006/09/20 英語 公開
Genome sequence of Rickettsia bellii suggests the role of amoebae in ancestral gene transfers between intracellular pathogens.[招待あり] Genome sequence of Rickettsia bellii suggests the role of amoebae in ancestral gene transfers between intracellular pathogens. [招待あり] Genome sequence of Rickettsia bellii suggests the role of amoebae in ancestral gene transfers between intracellular pathogens. [招待あり] International symposium on the comparative biology of the alpha-proteobacteria(2006/4/26-29) International symposium on the comparative biology of the alpha-proteobacteria(2006/4/26-29) International symposium on the comparative biology of the alpha-proteobacteria(2006/4/26-29) Blacksburg, Virginia, USA Blacksburg, Virginia, USA 2006/04/27 英語 公開
Le genome de Rickettsia bellii - le role d'amibe dans l'evolution de pathogenes intracellulaires. Le genome de Rickettsia bellii - le role d'amibe dans l'evolution de pathogenes intracellulaires. Le genome de Rickettsia bellii - le role d'amibe dans l'evolution de pathogenes intracellulaires. IFR-48 seminar IFR-48 seminar IFR-48 seminar Marseille, France Marseille, France 2006/04/22 英語 公開
Comparative evolutionary genomics of Rickettsia. Comparative evolutionary genomics of Rickettsia. Comparative evolutionary genomics of Rickettsia. CBRC seminar CBRC seminar CBRC seminar Tokyo Tokyo 2006/03/24 英語 公開
Lessons from Genomics of Rickettsia and Tropheryma.[招待あり] Lessons from Genomics of Rickettsia and Tropheryma. [招待あり] Lessons from Genomics of Rickettsia and Tropheryma. [招待あり] International Symposium From Genomics to Chemical Genomics - 10th Anniversary of KEGG (2005/12/15-16) International Symposium From Genomics to Chemical Genomics - 10th Anniversary of KEGG (2005/12/15-16) International Symposium From Genomics to Chemical Genomics - 10th Anniversary of KEGG (2005/12/15-16) Kyoto Kyoto 2005/12/15 英語 公開
Mimivirus & Evolution du Vivant.[招待あり] Mimivirus & Evolution du Vivant. [招待あり] Mimivirus & Evolution du Vivant. [招待あり] Reunion Evolution Virale(2005/11/7-8) Reunion Evolution Virale(2005/11/7-8) Reunion Evolution Virale(2005/11/7-8) Montpelliker, France Montpelliker, France 2005/11/07 英語 公開
What have we learned from microbial genome projects.[招待あり] What have we learned from microbial genome projects. [招待あり] What have we learned from microbial genome projects. [招待あり] Workshop GENOMED-HEALTH(2005/3/4-5) Workshop GENOMED-HEALTH(2005/3/4-5) Workshop GENOMED-HEALTH(2005/3/4-5) Tunis, Tunisia Tunis, Tunisia 2005/03/04 英語 公開
An approach to generate testable hypotheses in microbiology. An approach to generate testable hypotheses in microbiology. An approach to generate testable hypotheses in microbiology. 5th International Conference on Systems Biology(2004/10/9-13) 5th International Conference on Systems Biology(2004/10/9-13) 5th International Conference on Systems Biology(2004/10/9-13) Heidelberg, Germany Heidelberg, Germany 2004/10/12 英語 公開
Outils bio-informatiques pour la prot_omique - Comparaison TheGPM/Xcalibur Sequest - Gelprint: g_n_ration de gels 2D in-silico. Outils bio-informatiques pour la prot_omique - Comparaison TheGPM/Xcalibur Sequest - Gelprint: g_n_ration de gels 2D in-silico. Outils bio-informatiques pour la prot_omique - Comparaison TheGPM/Xcalibur Sequest - Gelprint: g_n_ration de gels 2D in-silico. Journ_e technique du R_seau National Genopole, "Quelle informatique et bioinformatique pour la prot_omique ?" Journ_e technique du R_seau National Genopole, "Quelle informatique et bioinformatique pour la prot_omique ?" Journ_e technique du R_seau National Genopole, "Quelle informatique et bioinformatique pour la prot_omique ?" Grenoble, France Grenoble, France 2004/06/01 英語 公開
A new database towards rational design of culture conditions of obligate parasites. A new database towards rational design of culture conditions of obligate parasites. A new database towards rational design of culture conditions of obligate parasites. VI_me Cogr_s de la SFM VI_me Cogr_s de la SFM VI_me Cogr_s de la SFM Bordeaux, France Bordeaux, France 2004/05/11 英語 公開
Rickettsia and Tropheryma: Lessons from small bacterial genomes. Rickettsia and Tropheryma: Lessons from small bacterial genomes. Rickettsia and Tropheryma: Lessons from small bacterial genomes. CBRC seminar CBRC seminar CBRC seminar Tokyo Tokyo 2003/12/22 英語 公開
Rickettsia and Tropheryma: Lessons from small parasitic bacterial genomes.[招待あり] Rickettsia and Tropheryma: Lessons from small parasitic bacterial genomes. [招待あり] Rickettsia and Tropheryma: Lessons from small parasitic bacterial genomes. [招待あり] Second JSPS Forum, "Postgenome" Second JSPS Forum, "Postgenome" Second JSPS Forum, "Postgenome" Strasbourg, France Strasbourg, France 2003/11/28 英語 公開
Bioinformatics and structural genomics of intracellular pathogens and E. coli.[招待あり] Bioinformatics and structural genomics of intracellular pathogens and E. coli. [招待あり] Bioinformatics and structural genomics of intracellular pathogens and E. coli. [招待あり] E. coli Workshop: Towards New Biology in 21st Century(2003/10/15-17) E. coli Workshop: Towards New Biology in 21st Century(2003/10/15-17) E. coli Workshop: Towards New Biology in 21st Century(2003/10/15-17) Awaji Awaji 2003/10/15 英語 公開
Genome sequence of Tropheryma whipplei Twist: a small human pathogen of the high G+C Gram-positive bacteria.[招待あり] Genome sequence of Tropheryma whipplei Twist: a small human pathogen of the high G+C Gram-positive bacteria. [招待あり] Genome sequence of Tropheryma whipplei Twist: a small human pathogen of the high G+C Gram-positive bacteria. [招待あり] HAMAP Workshop on Microbial Annotation(2003/6/2-4) HAMAP Workshop on Microbial Annotation(2003/6/2-4) HAMAP Workshop on Microbial Annotation(2003/6/2-4) xxx xxx 2003/06/02 英語 公開
Comparison of whole becterial genomes. Comparison of whole becterial genomes. Comparison of whole becterial genomes. International Congress of Molecular Infectiology 2000(2000/3/29-31) International Congress of Molecular Infectiology 2000(2000/3/29-31) International Congress of Molecular Infectiology 2000(2000/3/29-31) Marseille, France Marseille, France 2003/03/29 英語 公開
Mechanisms of genome evolution in Rickettsia.[招待あり] Mechanisms of genome evolution in Rickettsia. [招待あり] Mechanisms of genome evolution in Rickettsia. [招待あり] International Summer School - From Genome to Life(2002/7/15-27) International Summer School - From Genome to Life(2002/7/15-27) International Summer School - From Genome to Life(2002/7/15-27) Corsica, France Corsica, France 2002/07/15 英語 公開
Protein coding palindromes in Rickettsia: A unique mechanism to create novel protein sequences. Protein coding palindromes in Rickettsia: A unique mechanism to create novel protein sequences. Protein coding palindromes in Rickettsia: A unique mechanism to create novel protein sequences. Molecular Evolution - International conference jointly organized by ISME and SMBE(2002/6/13-16) Molecular Evolution - International conference jointly organized by ISME and SMBE(2002/6/13-16) Molecular Evolution - International conference jointly organized by ISME and SMBE(2002/6/13-16) Sorrento - Naples - Italy Sorrento - Naples - Italy 2002/06/13 英語 公開
Selfish DNA parasitizing protein-coding genes of Rickettsia. Selfish DNA parasitizing protein-coding genes of Rickettsia. Selfish DNA parasitizing protein-coding genes of Rickettsia. Journ_es _volution Biologique(2001/6/27-29) Journ_es _volution Biologique(2001/6/27-29) Journ_es _volution Biologique(2001/6/27-29) Marseille, France Marseille, France 2001/06/27 英語 公開
Rickettsia conorii complete genome sequencing: Preliminary survey. Rickettsia conorii complete genome sequencing: Preliminary survey. Rickettsia conorii complete genome sequencing: Preliminary survey. Genomes 2000(2000/4/11-15) Genomes 2000(2000/4/11-15) Genomes 2000(2000/4/11-15) Paris, France Paris, France 2000/04/11 英語 公開
Unexpected selfish DNA in protein coding regions of Rickettsia.[招待あり] Unexpected selfish DNA in protein coding regions of Rickettsia. [招待あり] Unexpected selfish DNA in protein coding regions of Rickettsia. [招待あり] 4th Annual Conference on Computational Genomics (TIGR) 4th Annual Conference on Computational Genomics (TIGR) 4th Annual Conference on Computational Genomics (TIGR) xxx xxx 2000 英語 公開
Detection of co-regulated genes by comparative analysis of microbial genomes. (pp.304-305) Detection of co-regulated genes by comparative analysis of microbial genomes. (pp.304-305) Detection of co-regulated genes by comparative analysis of microbial genomes. (pp.304-305) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Tokyo Tokyo 1998/12/10 英語 公開
Extracting regulatory signals from the upstream region of co-expressed genes derived from DNA microarray experiments. (pp.306-307) Extracting regulatory signals from the upstream region of co-expressed genes derived from DNA microarray experiments. (pp.306-307) Extracting regulatory signals from the upstream region of co-expressed genes derived from DNA microarray experiments. (pp.306-307) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Tokyo Tokyo 1998/12/10 英語 公開
Automatic detection of gene clusters by P-quasi complete linkage grouping. (pp.300-301) Automatic detection of gene clusters by P-quasi complete linkage grouping. (pp.300-301) Automatic detection of gene clusters by P-quasi complete linkage grouping. (pp.300-301) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Tokyo Tokyo 1998/12/10 英語 公開
Constructing and annotating GENES database in KEGG. (pp.226-227) Constructing and annotating GENES database in KEGG. (pp.226-227) Constructing and annotating GENES database in KEGG. (pp.226-227) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Genome Informatics Workshop 1998(1998/12/10-11) Tokyo Tokyo 1998/12/10 英語 公開
Integrated analysis of metabolic pathways, sequence evolution and genome organization.[招待あり] Integrated analysis of metabolic pathways, sequence evolution and genome organization. [招待あり] Integrated analysis of metabolic pathways, sequence evolution and genome organization. [招待あり] Dagstuhl Seminar - Modeling and Simulation of Gene Regulation and Metabolic Pathway(1998/6/21-26) Dagstuhl Seminar - Modeling and Simulation of Gene Regulation and Metabolic Pathway(1998/6/21-26) Dagstuhl Seminar - Modeling and Simulation of Gene Regulation and Metabolic Pathway(1998/6/21-26) Schloss Dagstuhl, Germany Schloss Dagstuhl, Germany 1998/06/21 英語 公開
Reconstruction and prediction of biochemical pathways from genomic sequences using KEGG. Reconstruction and prediction of biochemical pathways from genomic sequences using KEGG. Reconstruction and prediction of biochemical pathways from genomic sequences using KEGG. Meeting on Genome Mapping, Sequencing & Biology(1998/5/13-17) Meeting on Genome Mapping, Sequencing & Biology(1998/5/13-17) Meeting on Genome Mapping, Sequencing & Biology(1998/5/13-17) Cold Spring Harbor Laboratory, New York, USA Cold Spring Harbor Laboratory, New York, USA 1998/05/13 英語 公開
A graph theoretical approach for comparative analysis of genomic structures and biochemical pathways.[招待あり] A graph theoretical approach for comparative analysis of genomic structures and biochemical pathways. [招待あり] A graph theoretical approach for comparative analysis of genomic structures and biochemical pathways. [招待あり] Glaxo Wellcome Symposium on Bioinformatics '98 Glaxo Wellcome Symposium on Bioinformatics '98 Glaxo Wellcome Symposium on Bioinformatics '98 Tsukuba, Nippon Glaxo Ltd. Tsukuba Research Laboratories Tsukuba, Nippon Glaxo Ltd. Tsukuba Research Laboratories 1998/05/07 英語 公開
Analysis of the metabolic pathways by the similar cluster searching method. Analysis of the metabolic pathways by the similar cluster searching method. Analysis of the metabolic pathways by the similar cluster searching method. Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan(1997/12/16-19) Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan(1997/12/16-19) Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan(1997/12/16-19) Kyoto Kyoto 1997/12/19 英語 公開
The new age of bioinformatics.[招待あり] The new age of bioinformatics. [招待あり] The new age of bioinformatics. [招待あり] A tutuorial at Communications Research Laboratory, Ministry of Posts & Telecommunications A tutuorial at Communications Research Laboratory, Ministry of Posts & Telecommunications A tutuorial at Communications Research Laboratory, Ministry of Posts & Telecommunications Kobe Kobe 1997/06/13 英語 公開
Correlation between the chromosomal location of enzyme genes and the organization of metabolic pathways. Correlation between the chromosomal location of enzyme genes and the organization of metabolic pathways. Correlation between the chromosomal location of enzyme genes and the organization of metabolic pathways. Meeting on Genome Mapping & Sequencing(1997/5/14-18) Meeting on Genome Mapping & Sequencing(1997/5/14-18) Meeting on Genome Mapping & Sequencing(1997/5/14-18) Cold Spring Harbor Laboratory, New York, USA Cold Spring Harbor Laboratory, New York, USA 1997/05/14 英語 公開
Gene function identification system based on the metabolic pathway database. Gene function identification system based on the metabolic pathway database. Gene function identification system based on the metabolic pathway database. Meeting on Genome Mapping & Sequencing(1997/5/14-18) Meeting on Genome Mapping & Sequencing(1997/5/14-18) Meeting on Genome Mapping & Sequencing(1997/5/14-18) Cold Spring Harbor Laboratory, New York, USA Cold Spring Harbor Laboratory, New York, USA 1997/05/14 英語 公開
Genome scale prediction of enzyme genes utilizing the knowledge of metabolic interactions. (pp.252-253) Genome scale prediction of enzyme genes utilizing the knowledge of metabolic interactions. (pp.252-253) Genome scale prediction of enzyme genes utilizing the knowledge of metabolic interactions. (pp.252-253) Genome Informatics Workshop 1996(1996/12/2-3) Genome Informatics Workshop 1996(1996/12/2-3) Genome Informatics Workshop 1996(1996/12/2-3) Tokyo Tokyo 1996/12/02 英語 公開
Metabolism and genome: Computation of metabolic pathways based on genome informatics. Metabolism and genome: Computation of metabolic pathways based on genome informatics. Metabolism and genome: Computation of metabolic pathways based on genome informatics. Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan Tsukuba Tsukuba 1996/11/07 英語 公開
Analyses of metabolic pathways - function and evolution based on classification of enzymes. Analyses of metabolic pathways - function and evolution based on classification of enzymes. Analyses of metabolic pathways - function and evolution based on classification of enzymes. Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan Tsukuba Tsukuba 1996/11/07 英語 公開
Systematic prediction of enzyme genes by the metabolic pathway database. Systematic prediction of enzyme genes by the metabolic pathway database. Systematic prediction of enzyme genes by the metabolic pathway database. Recent Advance in Genome Biology of Micro-organisms(1996/10/28-29) Recent Advance in Genome Biology of Micro-organisms(1996/10/28-29) Recent Advance in Genome Biology of Micro-organisms(1996/10/28-29) Chiba Chiba 1996/10/28 英語 公開
Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan(1996/8/26-28) Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan(1996/8/26-28) Annual Meeting of the Molecular Biology Society of Japan(1996/8/26-28) Sapporo Sapporo 1996/08/28 英語 公開
Size distribution and evolutionary rate of intron revealed by comparison of different mammalian species. Size distribution and evolutionary rate of intron revealed by comparison of different mammalian species. Size distribution and evolutionary rate of intron revealed by comparison of different mammalian species. Progress in biophysics & molecular biology, 65, suppl.1 p.75(1996/8/11-16) Progress in biophysics & molecular biology, 65, suppl.1 p.75(1996/8/11-16) Progress in biophysics & molecular biology, 65, suppl.1 p.75(1996/8/11-16) Amsterdam, Kingdom of the Netherlands Amsterdam, Kingdom of the Netherlands 1996/08/13 英語 公開
Statistical features identified from comparison of homologous introns. (pp.96-97) Statistical features identified from comparison of homologous introns. (pp.96-97) Statistical features identified from comparison of homologous introns. (pp.96-97) Genome Informatics Workshop 1995(1995/12/11-12) Genome Informatics Workshop 1995(1995/12/11-12) Genome Informatics Workshop 1995(1995/12/11-12) Yokohama Yokohama 1995/12/11 英語 公開
Substitution rates in noncoding regions in mammalian genes. Substitution rates in noncoding regions in mammalian genes. Substitution rates in noncoding regions in mammalian genes. Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1995/9/23-25) Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1995/9/23-25) Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1995/9/23-25) Sapporo Sapporo 1995/09/23 英語 公開
A molecular modeling technique for RNA stem-loop structure. A molecular modeling technique for RNA stem-loop structure. A molecular modeling technique for RNA stem-loop structure. Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1994/9/28-30) Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1994/9/28-30) Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1994/9/28-30) Yokohama Yokohama 1994/09/29 英語 公開
Cluster analysis of amino acid indices.[招待あり] Cluster analysis of amino acid indices. [招待あり] Cluster analysis of amino acid indices. [招待あり] Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1994/9/28-30) Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1994/9/28-30) Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1994/9/28-30) Yokohama Yokohama 1994/09/28 英語 公開
A computer modeling method for the three-dimensional structure of RNA. A computer modeling method for the three-dimensional structure of RNA. A computer modeling method for the three-dimensional structure of RNA. Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1993/10/12-14) Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1993/10/12-14) Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan(1993/10/12-14) Nagoya Nagoya 1993/10/13 英語 公開

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タイトル言語:
外部資金:競争的資金・科学研究費補助金
種別 代表/分担 テーマ(日本語) テーマ(英語) 期間
基盤研究(C) 代表 海洋巨大ウイルス・ヴァイロファージ・真核生物の包括的エコシステム解析 (平成26年度分) 2014/04/01〜2015/03/31
基盤研究(C) 代表 海洋巨大ウイルス・ヴァイロファージ・真核生物の包括的エコシステム解析 (平成27年度分) 2015/04/01〜2016/03/31
基盤研究(C) 代表 海洋巨大ウイルス・ヴァイロファージ・真核生物の包括的エコシステム解析 (平成28年度分) 2016/04/01〜2017/03/31
基盤研究(B) 代表 巨大ウイルスが水圏低次生態系で果たす役割の包括的解明 (平成30年度分) 2018/04/01〜2019/03/31
基盤研究(S) 分担 凝集体生命圏:海洋炭素循環の未知制御機構の解明 2019/07/01〜2023/03/31
新学術領域研究 分担 水圏におけるウィルス-宿主間の感染・共存機構の解明 2016/04/01〜2020/03/31
基盤研究(B) 分担 珪藻姉妹群パルマ藻と原子型中心珪藻の比較生物学による珪藻の起源・繁栄機構の解明 2017/04/01〜2019/03/31
担当科目
講義名(日本語) 講義名(英語) 開講期 学部/研究科 年度
バイオインフォマティクス特論A Bioinformatics : Advanced Course A 前期 理学研究科 2014/04〜2015/03
バイオインフォマティクス特論B Bioinformatics : Advanced Course B 後期 理学研究科 2014/04〜2015/03
バイオインフォマティクス Bioinformatics 前期 理学部 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクスゼミナールIA Seminar on Bioinformatics IA 前期 理学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクスゼミナールIB Seminar on Bioinformatics IB 後期 理学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクスゼミナールIC Seminar on Bioinformatics IC 前期 理学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクスゼミナールID Seminar on Bioinformatics ID 後期 理学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIA Seminar on Bioinformatics IIA 前期 理学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIB Seminar on Bioinformatics IIB 後期 理学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIC Seminar on Bioinformatics IIC 前期 理学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクスゼミナールIID Seminar on Bioinformatics IID 後期 理学研究科 2015/04〜2016/03
バイオ情報スキル Skill Development for Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2015/04〜2016/03
特別実習(統合ゲノミクス) Reaearch Training(Integrated Genomics) 通年 薬学部 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス特論A Bioinformatics : Advanced Course A 前期 理学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス特論B Bioinformatics : Advanced Course B 後期 理学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス理論 Bioinformatics I: Target Discovery 後期不定 薬学研究科 2015/04〜2016/03
ゲノム科学 Genome Science 後期 理学部 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス Bioinformatics 前期 理学部 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクスゼミナールIA Seminar on Bioinformatics IA 前期 理学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクスゼミナールIB Seminar on Bioinformatics IB 後期 理学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクスゼミナールIC Seminar on Bioinformatics IC 前期 理学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクスゼミナールID Seminar on Bioinformatics ID 後期 理学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIA Seminar on Bioinformatics IIA 前期 理学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIB Seminar on Bioinformatics IIB 後期 理学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIC Seminar on Bioinformatics IIC 前期 理学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクスゼミナールIID Seminar on Bioinformatics IID 後期 理学研究科 2016/04〜2017/03
バイオ情報スキル Skill Development for Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2016/04〜2017/03
特別実習(統合ゲノミクス) Reaearch Training(Integrated Genomics) 通年 薬学部 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクス特論A Bioinformatics : Advanced Course A 前期 理学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクス特論B Bioinformatics : Advanced Course B 後期 理学研究科 2016/04〜2017/03
ゲノム科学 Genome Science 後期 理学部 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクス Bioinformatics 前期 理学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクス Bioinformatics 前期 理学部 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクスゼミナールIA Seminar on Bioinformatics IA 前期 理学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクスゼミナールIB Seminar on Bioinformatics IB 後期 理学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクスゼミナールIC Seminar on Bioinformatics IC 前期 理学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクスゼミナールID Seminar on Bioinformatics ID 後期 理学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIA Seminar on Bioinformatics IIA 前期 理学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIB Seminar on Bioinformatics IIB 後期 理学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIC Seminar on Bioinformatics IIC 前期 理学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクスゼミナールIID Seminar on Bioinformatics IID 後期 理学研究科 2017/04〜2018/03
バイオ情報スキル Skill Development for Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2017/04〜2018/03
特別実習(統合ゲノミクス) Reaearch Training(Integrated Genomics) 通年 薬学部 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクス特論A Bioinformatics : Advanced Course A 前期 理学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクス特論B Bioinformatics : Advanced Course B 後期 理学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクス理論 Bioinformatics I: Target Discovery 後期不定 薬学研究科 2017/04〜2018/03
ゲノム科学 Genome Science 後期 理学部 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2017/04〜2018/03
統合生物多様性論 Advanced Lectures : Integrative Biological Diversity 前期 理学研究科 2017/04〜2018/03
「薬の世界」入門 Introduction to Pharmaceutical Sciences and Ethics 前期 全学共通科目 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクス Bioinformatics 前期 理学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクス Bioinformatics 前期 理学部 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクスゼミナールIA Seminar on Bioinformatics IA 前期 理学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクスゼミナールIB Seminar on Bioinformatics IB 後期 理学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクスゼミナールIC Seminar on Bioinformatics IC 前期 理学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクスゼミナールID Seminar on Bioinformatics ID 後期 理学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIA Seminar on Bioinformatics IIA 前期 理学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIB Seminar on Bioinformatics IIB 後期 理学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIC Seminar on Bioinformatics IIC 前期 理学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクスゼミナールIID Seminar on Bioinformatics IID 後期 理学研究科 2018/04〜2019/03
バイオ情報スキル Skill Development for Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2018/04〜2019/03
特別実習(統合ゲノミクス) Reaearch Training(Integrated Genomics) 通年 薬学部 2018/04〜2019/03
生物物理学入門 Introduction to Biophysics 前期 全学共通科目 2018/04〜2019/03
ゲノム科学 Genome Science 後期 理学部 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2018/04〜2019/03
「薬の世界」入門 Introduction to Pharmaceutical Sciences and Ethics 前期 全学共通科目 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクス Bioinformatics 前期 理学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス Bioinformatics 前期 理学部 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクスゼミナールIA Seminar on Bioinformatics IA 前期 理学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクスゼミナールIB Seminar on Bioinformatics IB 後期 理学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクスゼミナールIC Seminar on Bioinformatics IC 前期 理学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクスゼミナールID Seminar on Bioinformatics ID 後期 理学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIA Seminar on Bioinformatics IIA 前期 理学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIB Seminar on Bioinformatics IIB 後期 理学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクスゼミナールIIC Seminar on Bioinformatics IIC 前期 理学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクスゼミナールIID Seminar on Bioinformatics IID 後期 理学研究科 2019/04〜2020/03
バイオ情報スキル Skill Development for Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
特別実習(統合ゲノミクス) Reaearch Training(Integrated Genomics) 通年 薬学部 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス特論 Bioinformatics :Advanced Course 後期 理学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス理論 Bioinformatics I: Target Discovery 後期不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
生物物理学入門 Introduction to Biophysics 前期 全学共通科目 2019/04〜2020/03
ゲノム科学 Genome Science 後期 理学部 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 前期不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 後期不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 前期不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 後期不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
「薬の世界」入門 Introduction to Pharmaceutical Sciences and Ethics 前期 全学共通科目 2019/04〜2020/03

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全学運営(役職等)
役職名 期間
バイオインフォマティクスセンター長 2015/04/01〜2017/03/31
国際教育委員会国際学生交流委員会アムジェン・スカラーズ・プログラム小委員会 委員 2017/12/21〜2019/03/31
情報環境機構KUINS利用負担金検討委員会委員 2017/04/01〜2019/03/31
情報環境機構研究用計算機専門委員会委員 2018/04/01〜2020/03/31
情報環境機構基盤システム運用委員会委員 2018/04/01〜2020/03/31
学術情報メディアセンター全国共同利用運営委員会委員 2018/04/01〜2020/03/31
部局運営(役職等)
役職名 期間
化学研究所ゲノムネット推進室運営委員会委員 2014/04/01〜2015/03/31
化学研究所広報委員会委員 2014/04/01〜2015/03/31
化学研究所産学連携委員会委員 2014/04/01〜2015/03/31
化学研究所情報セキュリティ委員会委員 2014/04/01〜2015/03/31
化学研究所ゲノムネット推進室運営委員会委員 2015/04/01〜2017/03/31
化学研究所運営委員会委員 2015/04/01〜2016/03/31
化学研究所広報委員会委員 2015/04/01〜2016/03/31
化学研究所将来問題・研究活性化委員会委員 2015/04/01〜2016/03/31
化学研究所設備運営委員会委員 2015/04/01〜2016/03/31
化学研究所総務・教務委員会委員長 2015/04/01〜2016/03/31
化学研究所運営委員会委員 2016/04/01〜2017/03/31
化学研究所財務委員会委員 2016/04/01〜2017/03/31
化学研究所自己点検評価委員会委員 2016/04/01〜2017/03/31
化学研究所広報委員会委員 2016/04/01〜2017/03/31
化学研究所建物管理委員会委員 2016/04/01〜2017/03/31
2017/04/01〜2019/03/31
化学研究所広報委員会委員 2017/04/01〜2018/03/31
化学研究所産学連携委員会委員 2017/04/01〜2018/03/31
化学研究所将来問題・研究活性化委員会委員 2017/04/01〜2018/03/31
2018/04/01〜2019/03/31
2018/04/01〜2019/03/31
化学研究所産学連携委員会委員 2018/04/01〜2019/03/31
化学研究所設備運営委員会委員 2018/04/01〜2019/03/31
化学研究所ゲノムネット推進室運営委員会委員 2017/04/01〜2019/03/31
京都大学宇治キャンパス公開2019実行委員会 2019/01/01〜2019/12/31
化学研究所講演委員会委員長 2019/04/01〜2020/03/31
化学研究所設備運営委員会委員 2019/04/01〜2020/03/31
化学研究所ゲノムネット推進室運営委員会委員 2019/04/01〜2022/03/31

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