馬見塚 拓

最終更新日時: 2019/10/22 00:52:19

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氏名(漢字／フリガナ／アルファベット表記)
馬見塚 拓／マミツカ ヒロシ／Mamitsuka, Hiroshi
所属部署・職名(部局／所属／講座等／職名)
化学研究所／化学研究所附属バイオインフォマティクスセンター／　／教授
協力講座
部局 所属 講座等 職名
薬学研究科 医薬創成情報科学専攻 医薬創成情報科学講座 教授
学内兼務
部局 所属 講座等 職名
学際融合教育研究推進センター 統合複雑系科学国際研究ユニット
連絡先住所
種別 住所(日本語) 住所(英語)
職場
連絡先電話番号
種別 番号
職場
取得学位
学位名(日本語) 学位名(英語) 大学(日本語) 大学(英語) 取得区分
修士（工学） Master of Engineering 東京大学 University of Tokyo
博士（理学） PhD in Information Sciences 東京大学 University of Tokyo
個人ホームページ
URL
http://www.bic.kyoto-u.ac.jp/pathway/mami
ORCID ID
https://orcid.org/0000-0002-6607-5617
researchmap URL
https://researchmap.jp/7000008516
論文
著者 著者(日本語) 著者(英語) タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 書誌情報等 書誌情報等(日本語) 書誌情報等(英語) 出版年月 査読の有無 記述言語 掲載種別 公開
馬見塚 拓 馬見塚 拓 馬見塚 拓 機械学習による薬物分子-ターゲット相互作用予測 機械学習による薬物分子-ターゲット相互作用予測 機械学習による薬物分子-ターゲット相互作用予測 SAR News, 29, 2-8 SAR News, 29, 2-8 SAR News, 29, 2-8 2015/10 日本語 研究論文(学術雑誌) 公開
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瀧川 一学, 馬見塚 拓 瀧川 一学, 馬見塚 拓 瀧川 一学, 馬見塚 拓 化学とグラフアルゴリズム 化学とグラフアルゴリズム 化学とグラフアルゴリズム 化学と教育, 59, 9, 450-453 化学と教育, 59, 9, 450-453 化学と教育, 59, 9, 450-453 2011/09 有 日本語 研究論文(学術雑誌) 公開
馬見塚 拓, 米屋 隆 馬見塚 拓, 米屋 隆 馬見塚 拓, 米屋 隆 PURE:PubMed文献検索支援システム PURE:PubMed文献検索支援システム PURE:PubMed文献検索支援システム 実験医学, 26, 7, 1167-1172 実験医学, 26, 7, 1167-1172 実験医学, 26, 7, 1167-1172 2008/05 日本語 研究論文(学術雑誌) 公開
志賀 元紀, 瀧川 一学, 馬見塚 拓 志賀 元紀, 瀧川 一学, 馬見塚 拓 志賀 元紀, 瀧川 一学, 馬見塚 拓 多様なゲノムデータの統合的クラスタリング解析(理論/実験技術) 多様なゲノムデータの統合的クラスタリング解析(理論/実験技術) 多様なゲノムデータの統合的クラスタリング解析(理論/実験技術) 生物物理, 48, 3, 190-194 生物物理, 48, 3, 190-194 生物物理, 48, 3, 190-194 2008/05 有 日本語 研究論文(学術雑誌) 公開
馬見塚 拓, 安倍 直樹 馬見塚 拓, 安倍 直樹 馬見塚 拓, 安倍 直樹 集団質問学習 - データマイニング・バイオインフォマティクスへの展開 - (招待論文) 集団質問学習 - データマイニング・バイオインフォマティクスへの展開 - (招待論文) 集団質問学習 - データマイニング・バイオインフォマティクスへの展開 - (招待論文) 電子情報通信学会和文論文誌, J85D-II, 5, 717-724 電子情報通信学会和文論文誌, J85D-II, 5, 717-724 電子情報通信学会和文論文誌, J85D-II, 5, 717-724 2002/05 有 日本語 研究論文(学術雑誌) 公開
タイトル言語:
講演・口頭発表等
タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 会議名 会議名(日本語) 会議名(英語) 主催者 主催者(日本語) 主催者(英語) 開催年月日 記述言語 会議種別 公開
Machine Learning for Biological Sciences[招待あり] Machine Learning for Biological Sciences [招待あり] Machine Learning for Biological Sciences [招待あり] セミナー セミナー セミナー 国立国際医療研究センター研究所 国立国際医療研究センター研究所 2018/11/30 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
機械学習による生物科学応用[招待あり] 機械学習による生物科学応用 [招待あり] 機械学習による生物科学応用 [招待あり] 第1245回生物科学セミナー 第1245回生物科学セミナー 第1245回生物科学セミナー 東京大学理学部生物科学科 東京大学理学部生物科学科 2018/11/28 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Database, prediction and beyond[招待あり] Database, prediction and beyond [招待あり] Database, prediction and beyond [招待あり] 反町洋之博士　追悼記念シンポジウム~Three Decades of Calpain~ 反町洋之博士　追悼記念シンポジウム~Three Decades of Calpain~ 反町洋之博士　追悼記念シンポジウム~Three Decades of Calpain~ 2018/07/30 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
機械学習・データマイニング技術／応用の過去・現在 そして未来[招待あり] 機械学習・データマイニング技術／応用の過去・現在 そして未来 [招待あり] 機械学習・データマイニング技術／応用の過去・現在 そして未来 [招待あり] 人工知能学会 第102回人工知能基本問題研究会(SIG-FPAI) 人工知能学会 第102回人工知能基本問題研究会(SIG-FPAI) 人工知能学会 第102回人工知能基本問題研究会(SIG-FPAI) 人工知能学会 人工知能学会 2016/12/12 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Recent Development in Bioinformatics[招待あり] Recent Development in Bioinformatics [招待あり] Recent Development in Bioinformatics [招待あり] セミナー セミナー セミナー 協和発酵キリン株式会社　探索研究所 協和発酵キリン株式会社　探索研究所 2016/07/27 日本語 公開講演、セミナー、チュートリアル、講習、講義 公開
Mining Significant Substructure Pairs from Drug-Target Network[招待あり] Mining Significant Substructure Pairs from Drug-Target Network [招待あり] Mining Significant Substructure Pairs from Drug-Target Network [招待あり] 日本バイオインフォマティクス学会 第17回創薬インフォマティクス研究会 日本バイオインフォマティクス学会 第17回創薬インフォマティクス研究会 日本バイオインフォマティクス学会 第17回創薬インフォマティクス研究会 2013/09/11 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Mining Metabolic Pathways through Gene Expression[招待あり] Mining Metabolic Pathways through Gene Expression [招待あり] Mining Metabolic Pathways through Gene Expression [招待あり] 日本バイオインフォマティクス学会 九州地域部会　セミナー 日本バイオインフォマティクス学会 九州地域部会　セミナー 日本バイオインフォマティクス学会 九州地域部会　セミナー 九州大学生体防御医学研究所セミナー 九州大学生体防御医学研究所セミナー 2013/02/08 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Mining Metabolic Pathways through Gene Expression[招待あり] Mining Metabolic Pathways through Gene Expression [招待あり] Mining Metabolic Pathways through Gene Expression [招待あり] 第1回JHUPOサテライトシンポジウム 第1回JHUPOサテライトシンポジウム 第1回JHUPOサテライトシンポジウム 2013/01/18 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
遺伝子発現データ解析 —スイッチング機構の発見とパスウェイマイニング—[招待あり] 遺伝子発現データ解析 —スイッチング機構の発見とパスウェイマイニング— [招待あり] 遺伝子発現データ解析 —スイッチング機構の発見とパスウェイマイニング— [招待あり] 第15回新潟プロテオミクスフォーラム 第15回新潟プロテオミクスフォーラム 第15回新潟プロテオミクスフォーラム 新潟 新潟 2012/11/20 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Efficiently Detecting Switching Mechanisms in Gene Expression[招待あり] Efficiently Detecting Switching Mechanisms in Gene Expression [招待あり] Efficiently Detecting Switching Mechanisms in Gene Expression [招待あり] セミナー セミナー セミナー 協和発酵キリン株式会社　探索研究所 協和発酵キリン株式会社　探索研究所 2012/02/02 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
薬剤−ターゲットネットワークからの部分構造パタン検出と解析[招待あり] 薬剤−ターゲットネットワークからの部分構造パタン検出と解析 [招待あり] 薬剤−ターゲットネットワークからの部分構造パタン検出と解析 [招待あり] 高知大学大学院医学専攻DCセミナー(大学院公開セミナー) 高知大学大学院医学専攻DCセミナー(大学院公開セミナー) 高知大学大学院医学専攻DCセミナー(大学院公開セミナー) 高知大学医学部 高知大学医学部 2012/01/30 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
生命科学上の非構造化データからのマイニング[招待あり] 生命科学上の非構造化データからのマイニング [招待あり] 生命科学上の非構造化データからのマイニング [招待あり] 第13回新潟プロテオミクスフォーラム 第13回新潟プロテオミクスフォーラム 第13回新潟プロテオミクスフォーラム 2011/10/26 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
代謝ネットワークからのマイニング[招待あり] 代謝ネットワークからのマイニング [招待あり] 代謝ネットワークからのマイニング [招待あり] 教育セミナー、日本プロテオーム学会2011年大会 教育セミナー、日本プロテオーム学会2011年大会 教育セミナー、日本プロテオーム学会2011年大会 2011/07/28 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Mining Significant Substructure Pairs from Drug-Target Network[招待あり] Mining Significant Substructure Pairs from Drug-Target Network [招待あり] Mining Significant Substructure Pairs from Drug-Target Network [招待あり] セミナー セミナー セミナー 協和発酵キリン株式会社　探索研究所 協和発酵キリン株式会社　探索研究所 2011/06/21 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
生命科学上の非構造化データの統合マイニング 生命科学上の非構造化データの統合マイニング 生命科学上の非構造化データの統合マイニング バイオインフォマティクス推進センター事業、第６回研究開発成果報告会 バイオインフォマティクス推進センター事業、第６回研究開発成果報告会 バイオインフォマティクス推進センター事業、第６回研究開発成果報告会 品川 品川 2010/11/10 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
ライフサイエンスデータからのマイニング ライフサイエンスデータからのマイニング ライフサイエンスデータからのマイニング 第17回京都大学化学研究所 公開講演会 第17回京都大学化学研究所 公開講演会 第17回京都大学化学研究所 公開講演会 2010/10/24 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
ネットワークからの遺伝子クラスタリング[招待あり] ネットワークからの遺伝子クラスタリング [招待あり] ネットワークからの遺伝子クラスタリング [招待あり] 公開シンポジウム“統合複雑系科学への招待” 公開シンポジウム“統合複雑系科学への招待” 公開シンポジウム“統合複雑系科学への招待” 2010/08/05 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Mining patterns from trees - Probabilistic model-based approach[招待あり] Mining patterns from trees - Probabilistic model-based approach [招待あり] Mining patterns from trees - Probabilistic model-based approach [招待あり] 日本バイオインフォマティクス学会　第９回北海道地域部会セミナー 日本バイオインフォマティクス学会　第９回北海道地域部会セミナー 日本バイオインフォマティクス学会　第９回北海道地域部会セミナー 北海道大学 北海道大学 2010/02/08 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
発現情報に基づく効率的な代謝経路ランキング手法を適用したリグニン生合成経路解析[招待あり] 発現情報に基づく効率的な代謝経路ランキング手法を適用したリグニン生合成経路解析 [招待あり] 発現情報に基づく効率的な代謝経路ランキング手法を適用したリグニン生合成経路解析 [招待あり] 科研費ワークショップ「生薬とバイオインフォマティクス」 科研費ワークショップ「生薬とバイオインフォマティクス」 科研費ワークショップ「生薬とバイオインフォマティクス」 2009/01/15 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
半構造化データからのマイニング[招待あり] 半構造化データからのマイニング [招待あり] 半構造化データからのマイニング [招待あり] 葉山セミナー 葉山セミナー 葉山セミナー 総合研究大学院大学先導科学研究科 総合研究大学院大学先導科学研究科 2008/10/14 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
ベクトル形式データとネットワークデータを統合したクラスタリング[招待あり] ベクトル形式データとネットワークデータを統合したクラスタリング [招待あり] ベクトル形式データとネットワークデータを統合したクラスタリング [招待あり] 電子情報通信学会「パターン認識・メディア理解研究会」「データ工学研究会」共催、2008年6月研究会 電子情報通信学会「パターン認識・メディア理解研究会」「データ工学研究会」共催、2008年6月研究会 電子情報通信学会「パターン認識・メディア理解研究会」「データ工学研究会」共催、2008年6月研究会 電子情報通信学会 電子情報通信学会 2008/06/19 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Clustering Numerical Vectors with a Modularity Network[招待あり] Clustering Numerical Vectors with a Modularity Network [招待あり] Clustering Numerical Vectors with a Modularity Network [招待あり] セミナー セミナー セミナー 奈良先端科学技術大学院大学 奈良先端科学技術大学院大学 2008/06/17 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Informatics Innovations in Glycogenomics[招待あり] Informatics Innovations in Glycogenomics [招待あり] Informatics Innovations in Glycogenomics [招待あり] 21世紀COEプログラム「ゲノム科学の知的情報基盤・研究拠点形成」最終年度公 開シンポジウム：Symposium on Bioinformatics and Chemical Genomics 21世紀COEプログラム「ゲノム科学の知的情報基盤・研究拠点形成」最終年度公 開シンポジウム：Symposium on Bioinformatics and Chemical Genomics 21世紀COEプログラム「ゲノム科学の知的情報基盤・研究拠点形成」最終年度公 開シンポジウム：Symposium on Bioinformatics and Chemical Genomics 21世紀COEプログラム「ゲノム科学の知的情報基盤・研究拠点形成」 21世紀COEプログラム「ゲノム科学の知的情報基盤・研究拠点形成」 2007/09/20 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
バイオインフォマティクス先端技術の現状と展望[招待あり] バイオインフォマティクス先端技術の現状と展望 [招待あり] バイオインフォマティクス先端技術の現状と展望 [招待あり] セミナー セミナー セミナー 協和発酵工業　バイオフロンティア研究所 協和発酵工業　バイオフロンティア研究所 2006/09/26 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
能動学習を用いた効率的なMHC結合ペプチド予測[招待あり] 能動学習を用いた効率的なMHC結合ペプチド予測 [招待あり] 能動学習を用いた効率的なMHC結合ペプチド予測 [招待あり] 臨床研セミナー 臨床研セミナー 臨床研セミナー 東京都臨床医学総合研究所 東京都臨床医学総合研究所 2006/05/25 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Biological Sequence Analysis with a Probabilistic Model[招待あり] Biological Sequence Analysis with a Probabilistic Model [招待あり] Biological Sequence Analysis with a Probabilistic Model [招待あり] セミナー セミナー セミナー 千葉大学 千葉大学 2006/03/28 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
バイオインフォマティクス人材養成のあるべき姿とは？[招待あり] バイオインフォマティクス人材養成のあるべき姿とは？ [招待あり] バイオインフォマティクス人材養成のあるべき姿とは？ [招待あり] 産業技術総合研究所　生命情報科学人材養成コース　最終シンポジウム「バイオインフォマティクス人材養成5年の歩み　お台場から世界に向けて」 産業技術総合研究所　生命情報科学人材養成コース　最終シンポジウム「バイオインフォマティクス人材養成5年の歩み　お台場から世界に向けて」 産業技術総合研究所　生命情報科学人材養成コース　最終シンポジウム「バイオインフォマティクス人材養成5年の歩み　お台場から世界に向けて」 産業技術総合研究所　生命情報科学センター 産業技術総合研究所　生命情報科学センター 2005/09/22 日本語 シンポジウム・ワークショップパネル(指名) 公開
マルコフ連鎖の有限混合モデルによるマイクロアレイデータからの代謝パスウェイ解析[招待あり] マルコフ連鎖の有限混合モデルによるマイクロアレイデータからの代謝パスウェイ解析 [招待あり] マルコフ連鎖の有限混合モデルによるマイクロアレイデータからの代謝パスウェイ解析 [招待あり] 統計関連学会連合大会企画セッション「アレイデータ解析周辺にみる新しい統計的視点」 統計関連学会連合大会企画セッション「アレイデータ解析周辺にみる新しい統計的視点」 統計関連学会連合大会企画セッション「アレイデータ解析周辺にみる新しい統計的視点」 2005/09/13 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
バイオインフォマティクス先端技術の現状と展望[招待あり] バイオインフォマティクス先端技術の現状と展望 [招待あり] バイオインフォマティクス先端技術の現状と展望 [招待あり] セミナー セミナー セミナー シスメックス株式会社中央研究所・テクノセンター シスメックス株式会社中央研究所・テクノセンター 2005/06/27 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
バイオインフォマティクス先端技術の現状と展望[招待あり] バイオインフォマティクス先端技術の現状と展望 [招待あり] バイオインフォマティクス先端技術の現状と展望 [招待あり] セミナー セミナー セミナー キリンビール株式会社 医薬探索研究所 キリンビール株式会社 医薬探索研究所 2005/06/25 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
糖鎖構造からのデータマイニング[招待あり] 糖鎖構造からのデータマイニング [招待あり] 糖鎖構造からのデータマイニング [招待あり] 公開シンポジウム「ゲノムからケミカルゲノムへ」 公開シンポジウム「ゲノムからケミカルゲノムへ」 公開シンポジウム「ゲノムからケミカルゲノムへ」 京都大学21世紀COEプログラム「ゲノム科学の知的情報基盤・研究拠点形成」 京都大学21世紀COEプログラム「ゲノム科学の知的情報基盤・研究拠点形成」 2005/03/24 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
糖鎖構造からのデータマイニング[招待あり] 糖鎖構造からのデータマイニング [招待あり] 糖鎖構造からのデータマイニング [招待あり] セミナー セミナー セミナー 日本電気（株） 日本電気（株） 2005/03/02 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
代謝パスウェイの発現プロファイルによる解析[招待あり] 代謝パスウェイの発現プロファイルによる解析 [招待あり] 代謝パスウェイの発現プロファイルによる解析 [招待あり] 第27回日本分子生物学会年会ワークショップ 第27回日本分子生物学会年会ワークショップ 第27回日本分子生物学会年会ワークショップ 2004/12/09 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
バイオインフォマティクスへの機械学習応用[招待あり] バイオインフォマティクスへの機械学習応用 [招待あり] バイオインフォマティクスへの機械学習応用 [招待あり] バイオインフォマティクス夏の学校 バイオインフォマティクス夏の学校 バイオインフォマティクス夏の学校 日本バイオインフォマティクス学会 日本バイオインフォマティクス学会 2004/07/21 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
プロテオームインフォマティクスの現状と展望[招待あり] プロテオームインフォマティクスの現状と展望 [招待あり] プロテオームインフォマティクスの現状と展望 [招待あり] 日本SGIソリューションフェア2003 日本SGIソリューションフェア2003 日本SGIソリューションフェア2003 日本SGI 日本SGI 2003/11/05 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
ゲノム・プロテオーム情報のデータマイニング[招待あり] ゲノム・プロテオーム情報のデータマイニング [招待あり] ゲノム・プロテオーム情報のデータマイニング [招待あり] 京都市酒蔵バイオＶＩＬ開所一周年記念事業 「21世紀COEシンポジウム」 京都市酒蔵バイオＶＩＬ開所一周年記念事業 「21世紀COEシンポジウム」 京都市酒蔵バイオＶＩＬ開所一周年記念事業 「21世紀COEシンポジウム」 京都大学21世紀COEプログラム「ゲノム科学の知的情報基盤・研究拠点形成」 京都大学21世紀COEプログラム「ゲノム科学の知的情報基盤・研究拠点形成」 2003/08/11 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Hierarchical Latent Knowledge Analysis on Co-occurrence Data[招待あり] Hierarchical Latent Knowledge Analysis on Co-occurrence Data [招待あり] Hierarchical Latent Knowledge Analysis on Co-occurrence Data [招待あり] 情報処理学会、電子情報通信学会北海道支部共催講演会 情報処理学会、電子情報通信学会北海道支部共催講演会 情報処理学会、電子情報通信学会北海道支部共催講演会 情報処理学会、電子情報通信学会 情報処理学会、電子情報通信学会 2003/06/24 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
潜在変数モデルによるタンパク質相互作用の予測[招待あり] 潜在変数モデルによるタンパク質相互作用の予測 [招待あり] 潜在変数モデルによるタンパク質相互作用の予測 [招待あり] 第３回日本蛋白質科学会年会ワークショップ（プロテインインフォマティクス） 第３回日本蛋白質科学会年会ワークショップ（プロテインインフォマティクス） 第３回日本蛋白質科学会年会ワークショップ（プロテインインフォマティクス） 日本蛋白質科学会 日本蛋白質科学会 2003/06/23 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
階層型潜在変数モデルによるタンパク質間相互作用の予測[招待あり] 階層型潜在変数モデルによるタンパク質間相互作用の予測 [招待あり] 階層型潜在変数モデルによるタンパク質間相互作用の予測 [招待あり] 第１回「高次構造からみるプロテオーム機能発現メカニズム」研究会 第１回「高次構造からみるプロテオーム機能発現メカニズム」研究会 第１回「高次構造からみるプロテオーム機能発現メカニズム」研究会 2003/05/21 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
プロテオーム情報と低分子化合物情報の効率的な解析[招待あり] プロテオーム情報と低分子化合物情報の効率的な解析 [招待あり] プロテオーム情報と低分子化合物情報の効率的な解析 [招待あり] 人工知能学会第23回分子生物情報研究会 人工知能学会第23回分子生物情報研究会 人工知能学会第23回分子生物情報研究会 人工知能学会 人工知能学会 2003/01/20 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Active Ensemble Learning[招待あり] Active Ensemble Learning [招待あり] Active Ensemble Learning [招待あり] セミナー(コロキウム) セミナー(コロキウム) セミナー(コロキウム) 京都大学化学研究所附属バイオインフォマティクスセンター 京都大学化学研究所附属バイオインフォマティクスセンター 2002/03/10 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Active Ensemble Learning[招待あり] Active Ensemble Learning [招待あり] Active Ensemble Learning [招待あり] 第4回情報論的学習理論ワークショップ(IBIS2001) 第4回情報論的学習理論ワークショップ(IBIS2001) 第4回情報論的学習理論ワークショップ(IBIS2001) 2001/07/30 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
HMM及び確率的文法を用いたタンパク質構造・機能予測について[招待あり] HMM及び確率的文法を用いたタンパク質構造・機能予測について [招待あり] HMM及び確率的文法を用いたタンパク質構造・機能予測について [招待あり] 第165回CBI研究講演会 第165回CBI研究講演会 第165回CBI研究講演会 Chem-Bio Informatics Society (CBI学会) Chem-Bio Informatics Society (CBI学会) 1997/12/15 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Predicting Beta-sheets Using Stochastic Tree Grammars[招待あり] Predicting Beta-sheets Using Stochastic Tree Grammars [招待あり] Predicting Beta-sheets Using Stochastic Tree Grammars [招待あり] セミナー(第2回ゲノム情報コロキウム) セミナー(第2回ゲノム情報コロキウム) セミナー(第2回ゲノム情報コロキウム) 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター 東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター 1996/04/22 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
確率的規則に基づくタンパク質αヘリックス領域予測[招待あり] 確率的規則に基づくタンパク質αヘリックス領域予測 [招待あり] 確率的規則に基づくタンパク質αヘリックス領域予測 [招待あり] 第55回日本行動計量学会シンポジウム 第55回日本行動計量学会シンポジウム 第55回日本行動計量学会シンポジウム 日本行動計量学会 日本行動計量学会 1993/02/27 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開
Predicting Alpha-helix Using Stochastic Rule Learning[招待あり] Predicting Alpha-helix Using Stochastic Rule Learning [招待あり] Predicting Alpha-helix Using Stochastic Rule Learning [招待あり] 遺伝子情報処理ワークショップ 遺伝子情報処理ワークショップ 遺伝子情報処理ワークショップ (財)新世代コンピュータ技術開発機構(ICOT) (財)新世代コンピュータ技術開発機構(ICOT) 1992/11/11 日本語 口頭発表(招待・特別) 公開

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タイトル言語:
書籍等出版物
著者 著者(日本語) 著者(英語) タイトル タイトル(日本語) タイトル(英語) 出版社 出版社(日本語) 出版社(英語) 出版年月 記述言語 担当区分 公開
宇高　恵子、馬見塚　拓 宇高　恵子、馬見塚　拓 宇高　恵子、馬見塚　拓 バイオインフォマティクスがわかる バイオインフォマティクスがわかる バイオインフォマティクスがわかる 羊土社 羊土社 羊土社 2003 日本語 分担執筆 公開
安倍　直樹、馬見塚　拓 安倍　直樹、馬見塚　拓 安倍　直樹、馬見塚　拓 発見科学とデータマイニング 発見科学とデータマイニング 発見科学とデータマイニング 共立出版 共立出版 共立出版 2001/06 日本語 分担執筆 公開
タイトル言語:
産業財産権 (特許)
発明者 発明者(日本語) 発明者(英語) 発明の名称 発明の名称(日本語) 発明の名称(英語) 審査の段階 番号 年月 公開
馬見塚 拓 馬見塚 拓 馬見塚 拓 複数文字列アライメント方法およびシステム 複数文字列アライメント方法およびシステム 複数文字列アライメント方法およびシステム 特許登録 特許3237606 2001/10/05 公開
馬見塚 拓 馬見塚 拓 馬見塚 拓 隠れマルコフモデル学習システム及び学習方法 隠れマルコフモデル学習システム及び学習方法 隠れマルコフモデル学習システム及び学習方法 特許登録 特許3094860 2000/08/04 公開
馬見塚 拓 馬見塚 拓 馬見塚 拓 タンパク質立体構造予測方法 タンパク質立体構造予測方法 タンパク質立体構造予測方法 特許登録 特許3012441 1999/12/10 公開
馬見塚 拓 馬見塚 拓 馬見塚 拓 構造分割装置 構造分割装置 構造分割装置 特許登録 特許2980037 1999/09/17 公開
馬見塚 拓 馬見塚 拓 馬見塚 拓 タンパク質立体構造予測方法 タンパク質立体構造予測方法 タンパク質立体構造予測方法 特許登録 特許2940529 1999/06/18 公開
馬見塚 拓、中村 篤祥、鳥羽 弘康 馬見塚 拓、中村 篤祥、鳥羽 弘康 馬見塚 拓、中村 篤祥、鳥羽 弘康 学習装置及び学習方法 学習装置及び学習方法 学習装置及び学習方法 特許登録 特許2870458 1999/01/08 公開
馬見塚 拓 馬見塚 拓 馬見塚 拓 タンパク質立体構造予測方法 タンパク質立体構造予測方法 タンパク質立体構造予測方法 特許登録 特許2739825 1998/01/23 公開
馬見塚 拓、安倍 直樹 馬見塚 拓、安倍 直樹 馬見塚 拓、安倍 直樹 タンパク質立体構造予測方法 タンパク質立体構造予測方法 タンパク質立体構造予測方法 特許登録 特許2658823 1997/06/06 公開
馬見塚 拓、山西 健司 馬見塚 拓、山西 健司 馬見塚 拓、山西 健司 タンパク質立体構造予測方法 タンパク質立体構造予測方法 タンパク質立体構造予測方法 特許登録 特許2551297 1996/08/22 公開
タイトル言語:
学術賞等
賞の名称(日本語) 賞の名称(英語) 授与組織名(日本語) 授与組織名(英語) 年月
Best Performer Broad-DREAM Gene Essentiality Prediction Challenge 2014/11/
IEEE Kansai Section Medal IEEE Kansai Section 2014
Certificate of Appreciation, Service Award IEEE Computer Society 2009
外部資金：競争的資金・科学研究費補助金
種別 代表/分担 テーマ(日本語) テーマ(英語) 期間
特別研究員奨励費 代表 〜
基盤研究（Ｂ） 代表 多様な半構造化データからのデータ構造推定　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　 2012/04/01〜2016/03/31
基盤研究（Ｂ） 代表 多様な半構造化データからのデータ構造推定 （平成26年度分） 2014/04/01〜2015/03/31
基盤研究（Ｂ） 代表 多様な半構造化データからのデータ構造推定 （平成27年度分） 2015/04/01〜2016/03/31
基盤研究(B) 代表 複数行列データからのデータ因子構造推定 （平成28年度分） 2016/04/01〜2017/03/31
基盤研究(B) 代表 複数行列データからのデータ因子構造推定 （平成29年度分） 2017/04/01〜2018/03/31
基盤研究(B) 代表 複数行列データからのデータ因子構造推定 （平成29年度分） 2017/04/01〜2018/03/31
基盤研究(B) 代表 複数行列データからのデータ因子構造推定 （平成30年度分） 2018/04/01〜2019/03/31
基盤研究(B) 代表 複数行列データからのデータ因子構造推定 （平成30年度分） 2018/04/01〜2019/03/31
担当科目
講義名(日本語) 講義名(英語) 開講期 学部/研究科 年度
特別実習(分子設計情報) 通年 薬学部 2011/04〜2012/03
情報科学概論 Introduction to Bioinformatics 前期不定 薬学研究科 2011/04〜2012/03
ケミカル情報スキル（秋入学用） Skill Development for Chemoinformatics 後期前期 薬学研究科 2011/04〜2012/03
ケミカル情報スキル Skill Development for Chemoinformatics 通年不定 薬学研究科 2011/04〜2012/03
医薬創成ITビジネス特論 Advanced Drug Discovery & Development II 前期不定 薬学研究科 2011/04〜2012/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2011/04〜2012/03
ﾊﾞｲｵｲﾝﾌｫﾏﾃｨｸｽ系ｺﾝﾃﾝﾂ制作(秋入学用) Advanced Methods in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2011/04〜2012/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2011/04〜2012/03
バイオインフォマティクス系研究(秋入学用) Research in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2011/04〜2012/03
医薬創成ITビジネス特論 Advanced Drug Discovery & Development II 前期不定 薬学研究科 2012/04〜2013/03
博士後期課程特論 doctoral program 前期集中 薬学研究科 2012/04〜2013/03
博士後期課程特論 doctoral program 後期集中 薬学研究科 2012/04〜2013/03
ケミカル情報スキル Skill Development for Chemoinformatics 通年不定 薬学研究科 2012/04〜2013/03
情報科学概論 Introduction to Bioinformatics 前期不定 薬学研究科 2012/04〜2013/03
特別実習(分子設計情報) Research Training(Computational Genomics) 通年 薬学部 2012/04〜2013/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2012/04〜2013/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2012/04〜2013/03
特別実習(分子設計情報) Research Training(Computational Genomics) 通年 薬学部 2013/04〜2014/03
情報科学概論 Introduction to Bioinformatics 前期不定 薬学研究科 2013/04〜2014/03
ケミカル情報スキル Skill Development for Chemoinformatics 通年不定 薬学研究科 2013/04〜2014/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2013/04〜2014/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2013/04〜2014/03
医薬創成ITビジネス特論 Advanced Drug Discovery & Development II 前期不定 薬学研究科 2013/04〜2014/03
博士後期課程特論 doctoral program 前期集中 薬学研究科 2013/04〜2014/03
博士後期課程特論 doctoral program 後期集中 薬学研究科 2013/04〜2014/03
特別実習(分子設計情報) Research Training(Computational Genomics) 通年 薬学部 2014/04〜2015/03
情報科学概論 Introduction to Bioinformatics 前期不定 薬学研究科 2014/04〜2015/03
ケミカル情報スキル Skill Development for Chemoinformatics 通年不定 薬学研究科 2014/04〜2015/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2014/04〜2015/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2014/04〜2015/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2014/04〜2015/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2014/04〜2015/03
ケミカル情報スキル Skill Development for Chemoinformatics 通年不定 薬学研究科 2015/04〜2016/03
情報科学概論 Introduction to Bioinformatics 前期不定 薬学研究科 2015/04〜2016/03
特別実習(分子設計情報) Research Training(Computational Genomics) 通年 薬学部 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2015/04〜2016/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2015/04〜2016/03
ケミカル情報スキル Skill Development for Chemoinformatics 通年不定 薬学研究科 2016/04〜2017/03
情報科学概論 Introduction to Bioinformatics 前期不定 薬学研究科 2016/04〜2017/03
特別実習(分子設計情報) Research Training(Computational Genomics) 通年 薬学部 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2016/04〜2017/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2016/04〜2017/03
創薬情報科学概論 Introduction to Bioinformatics for Drug Discovery 前期不定 薬学研究科 2017/04〜2018/03
ケミカル情報スキル Skill Development for Chemoinformatics 通年不定 薬学研究科 2017/04〜2018/03
特別実習(分子設計情報) Research Training(Computational Genomics) 通年 薬学部 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2017/04〜2018/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2017/04〜2018/03
創薬情報科学概論 Introduction to Bioinformatics for Drug Discovery 前期不定 薬学研究科 2018/04〜2019/03
ケミカル情報スキル Skill Development for Chemoinformatics 通年不定 薬学研究科 2018/04〜2019/03
特別実習(分子設計情報) Research Training(Computational Genomics) 通年 薬学部 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 後期前期 薬学研究科 2018/04〜2019/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2018/04〜2019/03
創薬情報科学概論 Introduction to Bioinformatics for Drug Discovery 前期不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
ケミカル情報スキル Skill Development for Chemoinformatics 通年不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
特別実習(分子設計情報) Research Training(Computational Genomics) 通年 薬学部 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 前期不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 後期不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系コンテンツ制作 Advanced Methods in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 前期不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 後期不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03
バイオインフォマティクス系研究 Research in Bioinformatics 通年不定 薬学研究科 2019/04〜2020/03

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全学運営（役職等）
役職名 期間
バイオインフォマティクスセンター長 2019/04/01〜2021/03/31
部局運営（役職等）
役職名 期間
化学研究所附属バイオインフォマティクスセンター長 2011/04/01〜2013/03/31
研究用計算機専門委員会委員 2011/07/01〜2013/06/30
化学研究所ゲノムネット推進室運営委員会委員 2013/04/01〜2015/03/31
化学研究所財務委員会委員 2013/04/01〜2014/03/31
化学研究所産学連携委員会委員 2013/04/01〜2014/03/31
化学研究所将来問題・研究活性化委員会委員 2013/04/01〜2014/03/31
化学研究所設備運営委員会委員 2013/04/01〜2014/03/31
化学研究所財務委員会委員 2014/04/01〜2015/03/31
化学研究所将来問題・研究活性化委員会委員 2014/04/01〜2015/03/31
化学研究所設備運営委員会委員 2014/04/01〜2015/03/31
化学研究所ゲノムネット推進室運営委員会委員 2015/04/01〜2017/03/31
化学研究所財務委員会委員 2015/04/01〜2016/03/31
化学研究所産学連携委員会委員 2015/04/01〜2016/03/31
化学研究所自己点検評価委員会委員 2015/04/01〜2016/03/31
化学研究所将来問題・研究活性化委員会委員 2016/04/01〜2017/03/31
化学研究所産学連携委員会委員 2016/04/01〜2017/03/31
化学研究所ゲノムネット推進室運営委員会委員 2017/04/01〜2019/03/31
化学研究所財務委員会委員 2017/04/01〜2018/03/31
化学研究所設備運営委員会委員 2017/04/01〜2018/03/31
化学研究所財務委員会委員 2018/04/01〜2019/03/31
化学研究所将来問題・研究活性化委員会委員 2018/04/01〜2019/03/31
化学研究所広報委員会委員 2018/04/01〜2019/03/31
化学研究所運営委員会委員 2019/04/01〜2020/03/31
化学研究所財務委員会委員 2019/04/01〜2020/03/31
化学研究所広報委員会委員 2019/04/01〜2020/03/31
化学研究所ゲノムネット推進室運営委員会委員 2019/04/01〜2022/03/31

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