安部 真人

Last Update: 2017/04/26 16:16:16

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Name(Kanji/Kana/Abecedarium Latinum)
安部 真人/アベ マサト/Masato Abe
Primary department(Org1/Org2/Org3/Job title)
農学研究科/応用生命科学専攻生物機能化学講座/助教
Faculty
Org1 Org2 Org3 Job title
農学部
Contact address
Type Address(Japanese) Address(English)
Office 京都大学農学研究科応用生命科学専攻生物機能制御化学研究室 農学部2号館4F408号室
Phone
Type Number
Office 075-753-6405
Affiliated academic organization(s) (Japanese)
Organization name(Japanese) Organization name(English)
日本農芸化学会 Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
日本農薬学会 Pesticide Science Society of Japan
日本質量分析学会 The Mass Spectrometry Society of Japan
有機合成化学協会 The Society of Synthetic Organic Chemistry, Japan
日本生化学会 The Japanese Biochemical Society
Academic degree
Field(Japanese) Field(English) University(Japanese) University(English) Method
修士(農学) 京都大学
博士(農学) 京都大学
Work Experience
Period Organization(Japanese) Organization(English) Job title(Japanese) Job title(English)
-
2007/04/01-2008/03/31 京都大学農学研究科応用生命科学専攻 Applied Life Sciences, Faculty of Agriculture, Kyoto university 21世紀COE研究員 21st COE researcher
2008/04/01-2009/03/31 九州大学先導物質科学研究所 Institure for Materials Chemistry and Engineering, Kyushu university 機関研究員 Research Fellow
2009/04/01-2009/08/31 九州大学先導物質科学研究所 Institute for Materials Chemistry and Engineering, Kyushu university 学術研究員 Research Fellow
Personal Profile
(Japanese)
生理活性物質の化学合成による構造-活性相関研究(生理活性分子の各構造の意味付け)と、それらに基づく分子プローブの開発を行っています。 合成対象は脂質および阻害剤です。 研究では化学合成だけでなく、実際の生理作用についての測定も行うことで、迅速に新たな分子設計を考案できるようにしています。
Research Topics
(Japanese)
カルジオリピン類の合成と生理機能の解明
Overview of your research
(Japanese)
カルジオリピン類はミトコンドリア膜に局在するリン脂質であり、呼吸鎖酵素の活性の制御や、アポトーシス初期段階におけるシトクロムcのミトコンドリア外への漏出に深く関与すると考えられているが、その分子機構の詳細はわかっていない。私たちはカルジオリピンの機能を解明するために、種々の生化学および物理化学実験に供することを目的に、幅広い機能性を有するカルジオリピン類の合成を行っている。
Fields of research (key words)
Key words(Japanese) Key words(English)
カルジオリピン
阻害剤
ミトコンドリア
有機合成
Fields of research (kaken code)
Kaken code
Biological production chemistry/biological organic chemistry
Published Papers > Published Papers
(文系研究者の一般的な論文集への寄稿や単行本の分担執筆などは「著書等」を参照してください)
Authors Title Bibliography Date Peer-Review Language
N. Kojima; M. Abe; Y. Suga; K. Ohtsuki; T. Tanaka; H. Iwasaki; M. Yamashita; H. Miyoshi Critical role of a methyl group on the γ-lactone ring of annonaceous acetogenins in the potent inhibition of mitochondrial complex i Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters,23,5,1217-1219 2013/03/01 Refereed English
Y. Taira; Y. Okegawa; K. Sugimoto; M. Abe; H. Miyoshi; T. Shikanai Antimycin A-like molecules inhibit cyclic electron transport around photosystem I in ruptured chloroplasts FEBS Open Bio,3,406-410 2013 Refereed English
M. Abe; R. Niibayashi; S. Koubori; I. Moriyama; H. Miyoshi Molecular mechanisms for the induction of peroxidase activity of the cytochrome c-cardiolipin complex Biochemistry,50,39,8383-8391 2011/10/04 Refereed English
S. Nakanishi; M. Abe; S. Yamamoto; M. Murai; H. Miyoshi Bis-THF motif of acetogenin binds to the third matrix-side loop of ND1 subunit in mitochondrial NADH-ubiquinone oxidoreductase Biochimica et Biophysica Acta - Bioenergetics,1807,9,1170-1176 2011/09 Refereed English
S. Yamamoto; M. Abe; S. Nakanishi; M. Murai; H. Miyoshi Synthesis and characterization of photoaffinity probe of acetogenin, a strong inhibitor of mitochondrial complex i Tetrahedron Letters,52,24,3090-3093 2011/06/15 Refereed English
Nakanishi, S., Abe, M., Yamamoto, S., Murai, M., and Miyoshi, H. Bis-THF motif of acetogenin binds to the third matrix-side loop of ND1 subunit in mitochondrial NADH-ubiquinone oxidoreductase Biochim. Biophys. Acta in press 2011 Refereed English
M. Abe; S. Kitsuda; S. Ohyama; S. Koubori; M. Murai; H. Miyoshi Concise procedure for the synthesis of cardiolipins having different fatty acid combinations Tetrahedron Letters,51,15,2071-2073 2010/04/14 Refereed English
M. Abe; A. Kubo; S. Yamamoto; Y. Hatoh; M. Murai; Y. Hattori; H. Makabe; T. Nishioka; H. Miyoshi Dynamic function of the spacer region of acetogenins in the inhibition of bovine mitochondrial NADH-ubiquinone oxidoreductase (complex I) Biochemistry,47,23,6260-6266 2008/06/10 Refereed English
Y. Hattori; S.-I. Furuhata; M. Okajima; H. Konno; M. Abe; H. Miyoshi; T. Goto; H. Makabe Synthesis of pyranicin and Its inhibitory action with bovine heary,mitochondrial complex I Organic Letters,10,5,717-720 2008/03/06 Refereed English
S.-i. Furuhata; Y. Hattori; M. Okajima; H. Konno; M. Abe; H. Miyoshi; T. Goto; H. Makabe Synthesis of pyranicin and its deoxygenated analogues and their inhibitory action with bovine heart mitochondrial complex I Tetrahedron,64,33,7695-7703 2008 Refereed English
Y. Hattori; H. Konno; M. Abe; H. Miyoshi; T. Goto; H. Makabe Synthesis, determination of the absolute configuration of tonkinelin, and inhibitory action with bovine heart mitochondrial complex I Bioorganic and Medicinal Chemistry,15,8,3026-3031 2007 Refereed English
T. Yoshida; M. Murai; M. Abe; N. Ichimaru; T. Harada; T. Nishioka; H. Miyoshi Crucial structural factors and mode of action of polyene amides as inhibitors for mitochondrial NADH - Ubiquinone oxidoreductase (complex i) Biochemistry,46,36,10365-10372 2007 Refereed English
N. Ichimaru; M. Abe; M. Murai; M. Senoh; T. Nishioka; H. Miyoshi Function of the alkyl side chains of Δlac-acetogenins in the inhibitory effect on mitochondrial complex I (NADH-ubiquinone oxidoreductase) Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters,16,13,3555-3558 2006 Refereed English
M. Murai; N. Ichimaru; M. Abe; T. Nishioka; H. Miyoshi Synthesis of photolabile Δlac-acetogenin for photoaffinity labeling of mitochondrial complex I Journal of Pesticide Science,31,2,156-158 2006 Refereed English
M. Murai; N. Ichimaru; M. Abe; T. Nishioka; H. Miyoshi Mode of inhibitory action of Δlac-acetogenins, a new class of inhibitors of bovine heart mitochondrial complex I Biochemistry,45,32,9778-9787 2006 Refereed English
Y. Hattori; Y. Kimura; A. Moroda; H. Konno; M. Abe; H. Miyoshi; T. Goto; H. Makabe Synthesis of murisolin, (15R, 16R, 19R, 20S)-murisolin A, and (15R, 16R, 19S, 20S)-16,19-cis-murisolin and their inhibitory action with bovine heart mitochondrial complex I Chemistry - An Asian Journal,1,6,894-904 2006 Refereed English
N. Ichimaru; M. Murai; M. Abe; T. Hamada; Y. Yamada; S. Makino; T. Nishioka; H. Makabe; A. Makino; T. Kobayashi; H. Miyoshi Synthesis and inhibition mechanism of Δlac-acetogenins, a novel type of inhibitor of bovine heart mitochondrial complex I Biochemistry,44,2,816-825 2005 Refereed English
D. Fujita; N. Ichimaru; M. Abe; M. Murai; T. Hamada; T. Nishioka; H. Miyoshi Synthesis of non-THF analogs of acetogenin toward simplified mimics Tetrahedron Letters,46,34,5775-5779 2005 Refereed English
M. Abe; M. Murai; N. Ichimaru; A. Kenmochi; T. Yoshida; A. Kubo; Y. Kimura; A. Moroda; H. Makabe; T. Nishioka; H. Miyoshi Dynamic function of the alkyl spacer of acetogenins in their inhibitory action with mitochondrial complex I (NADH-ubiquinone oxidoreductase) Biochemistry,44,45,14898-14906 2005 Refereed English
H. Makabe; Y. Hattori; Y. Kimura; H. Konno; M. Abe; H. Miyoshi; A. Tanaka; T. Oritani Total synthesis of cis-solamin and its inhibitory action with bovine heart mitochondrial complex I Tetrahedron,60,47,10651-10657 2004/11/15 Refereed English
M. Ritter; H. Palsdottir; M. Abe; W. Mäntele; C. Hunte; H. Miyoshi; P. Hellwig Direct evidence for the interaction of stigmatellin with a protonated acidic group in the bc<sub>1</sub> complex from Saccharomyces cerevisiae as monitored by FTIR difference spectroscopy and <sup>13</sup>C specific labeling Biochemistry,43,26,8439-8446 2004/07/06 Refereed English
T. Hamada; N. Ichimaru; M. Abe; D. Fujita; A. Kenmochi; T. Nishioka; K. Zwicker; U. Brandt; H. Miyoshi Synthesis and Inhibitory Action of Novel Acetogenin Mimics with Bovine Heart Mitochondrial Complex I Biochemistry,43,12,3651-3658 2004/03/30 Refereed English
H. Konno; N. Hiura; H. Makabe; M. Abe; H. Miyoshi Synthesis and mitochondrial complex I inhibition of dihydroxy-cohibin A, non-THF annonaceous acetogenin analogue Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters,14,3,629-632 2004/02/09 Refereed English
M. Abe; A. Kenmochi; N. Ichimaru; T. Hamada; T. Nishioka; H. Miyoshi Essential structural features of acetogenins: Role of hydroxy groups adjacent to the bis-THF rings Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters,14,3,779-782 2004/02/09 Refereed English
H. Makabe; A. Miyawaki; R. Takahashi; Y. Hattori; H. Konno; M. Abe; H. Miyoshi Synthesis of two possible diastereomers of reticulatain-1 Tetrahedron Letters,45,5,973-977 2004/01/26 Refereed English
N. Ichimaru; M. Abe; A. Kenmochi; T. Hamada; T. Nishioka; H. Miyoshi Synthesis of <sup>13</sup>C-labeled ubiquinone-acetogenin hybrid inhibitors of mitochondrial complex I Journal of Pesticide Science,29,2,127-129 2004 Refereed English
H. Yabunaka; M. Abe; A. Kenmochi; T. Hamada; T. Nishioka; H. Miyoshi Synthesis and inhibitory activity of ubiquinone-acetogenin hybrid inhibitor with bovine mitochondrial complex I Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters,13,14,2385-2388 2003/07/21 Refereed English

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Conference Presentation > Conference Presentation
(文系研究者の一般的な学会報告の業績は「講演等」を参照してください)
Authors Title Bibliography Date Peer-Review Language
安部 真人 第16回 ヨーロッパ生体エネルギー会議(EBEC)に参加して(シンポジア) Journal of pesticide science,35,4,591-592 2010/11/20 Japanese
Masato Abe Synthesis of cardiolipin analogues bearing a biophysical probe at any position of the four acyl chains 16th European Bioenergetics Conference (EBEC2010) 2010 Refereed English
Lectures > Public Talks
(文系研究者の一般的な学会報告はこの項に収録されております)
Title Conference name Organization name Date Language
B312 光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究(作用機構,抵抗性 天然物化学,一般講演要旨) 講演要旨集 2012/03/14 Japanese
A301 ミトコンドリア複合体-Iに作用する光反応性フェンピロキシメートの結合部位の同定(I)(作用機構・抵抗性,一般講演要旨) 講演要旨集 2011/02/25 Japanese
強いアレロパシー活性を示すシス桂皮酸の構造活性相関研究 日本薬学会第131年会 2011 Japanese
ミトコンドリア複合体‐Ⅰにおけるアセトゲニン類の結合部位の同定 日本農芸化学会2011年度大会(東日本大震災により中止) 2011 Japanese
光親和性ユビキノンプローブの合成と標的タンパク質の解析 日本農芸化学会2011年度大会(東日本大震災により中止) 2011 Japanese
カルジオリピン類の合成によるシトクロムcとの分子間相互作用の解析 日本農芸化学会2011年度大会(東日本大震災により中止) 2011 Japanese
光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究 日本農薬学会第36回大会(東日本大震災)により中止 2011 Japanese
ミトコンドリア複合体-Iに作用する光反応性フェンピロキシメートの結合部位の同定(I) 日本農薬学会第36回大会(東日本大震災)により中止 2011 Japanese
2A03 光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究(合成プロセス 分子設計,一般講演要旨) 講演要旨集 2010/04/21 Japanese
カルジオリピンの合成に基づくシトクロムc‐カルジオリピン複合体形成の分子機構解明 日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 2010 Japanese
光反応性アセトゲニンの合成と作用機構研究 日本農芸化学会2010年度関西支部大会 2010 Japanese
細胞毒性を有するボンクレキン酸部分構造の構造活性相関 第47回化学関連支部合同九州大会 2010 Japanese
広汎なカルジオリピン類の有機合成と生理活性評価 日本農芸化学会2010年度大会 2010 Japanese
ボンクレキン酸及び誘導体の効率合成とアポトーシス阻害活性 日本化学会第89春季年会 2009 Japanese
ボンクレキン酸の抗アポトーシス作用と細胞毒性 日本ケミカルバイオロジー学会第4回年会 2009 Japanese
ANT阻害剤ボンクレキン酸の誘導体合成と構造活性相関 日本薬学会第129年会 2009 Japanese
アポトーシスを制御する有機小分子 第五回物質合成シンポジウム 2009 Japanese
cis-桂皮酸の構造活性相関研究(1) -オレフィンと芳香環上の置換基の効果- 日本農芸化学会2009年度大会 2009 Japanese
ボンクレキン酸のアポトーシス阻害効果に関する構造活性相関研究 日本農芸化学会2009年度大会 2009 Japanese
A208 ミトコンドリア複合体-I阻害剤アセトゲニン類の作用機構研究 : bis-THF体とmono-THF体の比較から 講演要旨集 2008/03/11 Japanese
アポトーシス阻害剤ボンクレキン酸および誘導体の収束型効率合成 有機合成化学協会 第20回若手のためのセミナー 2008 Japanese
ミトコンドリア複合体-I 阻害剤アセトゲニン類のスペーサー部の機能 日本農芸化学会2008年度大会 2008 Japanese

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External funds, competitive funds and Grants-in-Aid for Scientific Research(kaken)
Type Position Title(Japanese) Title(English) Period
若手研究(B) カルジオリピンの合成に基づくシトクロムc‐カルジオリピン複合体形成の分子機構解明 2010-2011
若手研究(B) Representative シトクロムc‐カルジオリピン複合体の形成と解離に関する分子機構の化学的解明 2012-2013
基盤研究(C) Representative リン脂質カルジオリピンの生合成リモデリング系の分子機構解明 (平成26年度分) 2014/04/01-2015/03/31
基盤研究(C) Representative リン脂質カルジオリピンの生合成リモデリング系の分子機構解明 (平成27年度分) 2015/04/01-2016/03/31
Teaching subject(s)
Name(Japanese) Name(English) Term Department Period
有機化学実験 後期 農学部 2011/04-2012/03
生物機能制御化学専攻実験 農学研究科 2011/04-2012/03
生物機能制御化学専攻演習 農学研究科 2011/04-2012/03
有機化学実験 Laboratory Course in Organic Chemistry 後期 農学部 2012/04-2013/03
有機化学実験 Laboratory Course in Organic Chemistry 後期 農学部 2013/04-2014/03
生物機能制御化学講義 Chemistry of Biological Activity 後期集中 農学研究科 2013/04-2014/03
生物機能制御化学専攻演習 Biofunction Chemistry Seminar 通年 農学研究科 2013/04-2014/03
生物機能制御化学専攻実験 Experimental Course of Biofunction Chemistry 通年 農学研究科 2013/04-2014/03
有機化学実験 Laboratory Course in Organic Chemistry 後期 農学部 2014/04-2015/03
生物機能制御化学講義 Chemistry of Biological Activity 前期集中 農学研究科 2014/04-2015/03
生物機能制御化学専攻演習 Biofunction Chemistry Seminar 通年 農学研究科 2014/04-2015/03
生物機能制御化学専攻実験 Experimental Course of Biofunction Chemistry 通年 農学研究科 2014/04-2015/03
有機化学実験 Laboratory Course in Organic Chemistry 後期 農学部 2015/04-2016/03
生物機能制御化学専攻実験1 Experimental Course of Biofunction Chemistry1 通年 農学研究科 2015/04-2016/03
生物機能制御化学専攻実験 Experimental Course of Biofunction Chemistry 通年 農学研究科 2015/04-2016/03
生物機能制御化学専攻演習1 Biofunction Chemistry Seminar1 通年 農学研究科 2015/04-2016/03
生物機能制御化学専攻演習 Biofunction Chemistry Seminar 通年 農学研究科 2015/04-2016/03
生物機能制御化学講義 Chemistry of Biological Activity 前期集中 農学研究科 2015/04-2016/03
農薬を考える Fundamental Study on Agrochemicals 前期 全学共通科目 2015/04-2016/03
有機化学実験 Laboratory Course in Organic Chemistry 後期 農学部 2016/04-2017/03
生物機能制御化学専攻実験1 Experimental Course of Biofunction Chemistry1 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能制御化学専攻実験2 Experimental Course of Biofunction Chemistry2 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能制御化学専攻実験 Experimental Course of Biofunction Chemistry 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能制御化学専攻演習1 Biofunction Chemistry Seminar1 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能制御化学専攻演習2 Biofunction Chemistry Seminar2 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能制御化学専攻演習 Biofunction Chemistry Seminar 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能制御化学講義 Chemistry of Biological Activity 前期集中 農学研究科 2016/04-2017/03

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