橋本 渉

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Name(Kanji/Kana/Abecedarium Latinum)
橋本 渉/ハシモト ワタル/Wataru Hashimoto
Primary department(Org1/Org2/Org3/Job title)
農学研究科/食品生物科学専攻食品生産工学講座/教授
Faculty
Org1 Org2 Org3 Job title
農学部
Contact address
Type Address(Japanese) Address(English)
Office 〒611-0011 京都府宇治市五ヶ庄 Gokasho, Uji-shi, Kyoto 611-0011 Japan
Phone
Type Number
Office 0774-38-3766
Affiliated academic organization(s) (Japanese)
Organization name(Japanese) Organization name(English)
日本農芸化学会 Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
日本生物工学会 The Society for Biotechnology, Japan
日本応用糖質科学会 The Japanese Society for Applied Glycoscience
日本ビタミン学会 The Vitamin Society of Japan
日本細菌学会 Japanese Society for Bacteriology
日本生化学会 The Japansese Biochemical Society
Affiliated academic organization(s) (overseas)
Organization name Country
American society for microbiology USA
Academic degree
Field(Japanese) Field(English) University(Japanese) University(English) Method
修士(農学) 京都大学
博士(農学) 京都大学
Graduate school
University(Japanese) University(English) Faculty(Japanese) Faculty(English) Major(Japanese) Major(English) Degree
京都大学 大学院農学研究科修士課程食品工学専攻 修了
京都大学 大学院農学研究科博士後期課程食品工学専攻 修了
University
University(Japanese) University(English) Faculty(Japanese) Faculty(English) Major(s)(Japanese) Major(s)(English) Degree
京都大学 農学部食品工学科 卒業
Personal Profile
(Japanese)
1985年私立高槻高等学校卒業、1986年京都大学農学部食品工学科入学、1990年同学科卒業、1990年京都大学農学研究科食品工学専攻修士課程入学、1992年同修士課程修了、1992年京都大学農学研究科食品工学専攻博士後期課程進学、1995年同博士後期課程研究指導認定後退学。1995年より京都大学食糧科学研究所助手、助教授、2001年より京都大学農学研究科助教授、准教授、2015年より教授、現在に至る。研究は、一貫して、応用微生物学研究。将棋二段。
Research Topics
(Japanese)
細菌と各種生物との相互作用に関わる分子機構の細胞構造生物学
Overview of your research
(Japanese)
細菌と各種生物(宿主:動物、植物、微生物)との相互作用について研究を行っています。細菌は、相互作用の仕方により、病原性細菌、腐生細菌(枯死体を栄養源にする)、及び共生細菌に大別できます。細菌による宿主の細胞表層多糖の分解は、両者が相互作用(感染、腐生、共生)する際の初期応答の一つです。宿主細胞表層多糖の認識、分解、輸送、及び代謝に関わる細菌由来タンパク質と酵素に焦点を当て、それらの構造と機能を分子生物学と構造生物学の観点から解析しています。また、細菌と各種生物細胞との共培養により、両者の相互作用に関わる要因を解析しています。
Fields of research (key words)
Key words(Japanese) Key words(English)
応用微生物学
構造生物学
糖質科学
細菌感染症
生物間相互作用
Fields of research (kaken code)
Kaken code
Applied microbiology
Published Papers > Published Papers
(文系研究者の一般的な論文集への寄稿や単行本の分担執筆などは「著書等」を参照してください)
Authors Title Bibliography Date Peer-Review Language
Sayoko Oiki, Bunzo Mikami, Yukie Maruyama, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto A bacterial ABC transporter enables import of mammalian host glycosaminoglycans Scientific Reports,7,1,1069 2017/04 Refereed English
橋本 渉、丸山如江、伊藤貴文、髙瀬隆一、村田幸作 ヘテロ多糖の輸送にかかわる細菌由来超分子の構造基盤 化学と生物,54,12,885-891 2016/12 Refereed Japanese
Masahiro Kobayashi, Hidenori Konishi, Yukie Maruyama, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto Lateral-typed flagellin responsible for formation of a polar flagellum but not of lateral flagella in Sphingomonas sp. strain A1 Microbiology,162,12,2042-2052 2016/12 Refereed English
Yusuke Nakamichi, Sayoko Oiki, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto Conformational change in the active site of Streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase through site-directed mutagenesis at Asp-115 The Protein Journal,35,4,300-309 2016/08 Refereed English
Ryuichi Takase, Yukie Maruyama, Sayoko Oiki, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto Structural determinants in bacterial 2-keto-3-deoxy-D-gluconate dehydrogenase KduD for dual-coenzyme specificity Proteins,84,7,934-947 2016/07 Refereed English
Makoto Hirayama, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata, and Shigeyuki Kawai Comparative characterization of three bacterial exo-type alginate lyases International Journal of Biological Macromolecules,86,519-524 2016/05 Refereed English
Yukie Maruyama, Takafumi Itoh, Ai Kaneko, Yu Nishitani, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Structure of a bacterial ABC transporter involved in the import of the acidic polysaccharide alginate Structure,23,9,1643-1654 2015/09 Refereed English
Y. Maruyama; M. Kobayashi; K. Murata, W. Hashimoto Formation of a single polar flagellum by two distinct flagellar gene sets in Sphingomonas sp. strain A1 Microbiology,161,8,1552-1560 2015/08 Refereed English
W. Hashimoto; A. Ochiai; C.S. Hong; K. Murata; A.M. Chakrabarty Structural studies on Laz, a promiscuous anticancer Neisserial protein Bioengineered,6,3,141-148 2015/05 Refereed English
Y. Maruyama; S. Oiki; R. Takase; B. Mikami; K. Murata; W. Hashimoto Metabolic fate of unsaturated glucuronic/iduronic acids from glycosaminoglycans: molecular identification and structure determination of streptococcal isomerase and dehydrogenase Journal of Biological Chemistry,290,10,6281-6292 2015/03 Refereed English
K. Temtrirath; K. Murata; W. Hashimoto Structural insights into alginate binding by bacterial cell-surface protein Carbohydrate Research,204,39-45 2015/03 Refereed English
F. Yoneyama; M. Yamamoto; W. Hashimoto; K. Murata Production of polyhydroxybutyrate and alginate from glycerol by Azotobacter vinelandii under nitrogen-free conditions Bioengineered,6,4,209-217 2015 Refereed English
R. Takase; B. Mikami; S. Kawai; K. Murata; W. Hashimoto Structure-based conversion of the coenzyme requirement of a short-chain dehydrogenase/reductase involved in bacterial alginate metabolism Journal of Biological Chemistry,289,48,33198-33214 2014/11 Refereed English
C. Hayashi; R. Takase; K. Momma; Y. Maruyama; K. Murata; W. Hashimoto Alginate-dependent gene expression mechanism in Sphingomonas sp. strain A1 Journal of Bacteriology,196,14,2691-2700 2014/07 Refereed English
落合秋人;高瀬隆一;三上文三;橋本渉;村田幸作 アルギン酸代謝酵素の構造と機能 ビタミン,84,11,525-531 2010/11/25 Refereed Japanese
橋本 渉、丸山如江、麻生祐司、村田幸作 細菌器官の分子移植と環境浄化 化学と生物,45,5,320-329 2007/05/01 Refereed Japanese
,62,646-648 2006/07 Refereed English
宮本 裕希子;橋本 渉;村田 幸作 テクノ・トレンド 「スーパー細菌」の創成とバイオレメディエーションへの応用 バイオテクノロジージャーナル,6,4,472-474 2006/07 Japanese
宮本裕希子;麻生祐司;橋本渉;村田幸作 超チャネルの分子移植による環境浄化型「スーパー細菌」の創成 ブレインテクノニュース,115,30-33 2006/05/15 Japanese
麻生祐司;宮本裕希子;橋本渉;村田幸作 スーパー細菌の創成とバイオレメディエーションへの利用 月刊資源環境対策,42,7,103-107 2006/05/15 Japanese
宮本裕希子、橋本 渉、村田幸作 巨大な口を開けるスーパー細菌−超チャネルの移植 バイオニクス, No. 4, 70-71 2006 Japanese
向井貴子、河井重幸、森 茂太郎、橋本 渉、三上文三、村田幸作 原核型グルコキナーゼと真核型ヘキソキナーゼの進化相関 応用微生物学研究, 3(1), 149-157 2005 Japanese
森 茂太郎、河井重幸、橋本 渉、三上文三、村田幸作 NADキナーゼのリン酸受容体特異性と構造との相関 応用微生物学研究, 3(2), 183-189 2005 Japanese
丸 勇史、大西 淳、太田泰弘、伊藤貴文、橋本 渉、三上文三、村田幸作 ブタ腎臓由来N-アシル-D-グルコサミン 2-エピメラーゼの構造、機能及び工業的利用に関する研究 応用微生物学研究, 2 (1), 12-21 2004 Japanese
三宅 統、山崎正幸、河井重幸、橋本 渉、三上文三、村田幸作 細菌アルギン酸リアーゼの分子多様性、進化、およびX線結晶構造に関する研究 応用微生物学研究, 2 (2), 103-111 2004 Japanese
橋本 渉 細菌の形態形成制御と高分子物質の輸送・分解機構に関する構造生物学的研究 日本農藝化學會誌 = Journal of the Agricultural Chemical Society of Japan,77,12,1218-1225 2003/12/01 Japanese
橋本 渉、三上文三、村田幸作 細菌における巨大分子利用の高次バイオシステム バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry,61,4,25-28 2003/04/01 Japanese
橋本 渉;三上 文三;村田 幸作 微生物の「超チャネル」 : 細胞の高分子利用戦略 バイオサイエンスとインダストリー = Bioscience & industry,61,4,9-10 2003/04/01 Japanese
河井重幸、三上文三、橋本 渉、村田幸作 微生物のポリリン酸/ATP-NADキナーゼとATP-NADキナーゼ 応用微生物学研究, 1 (1), 18-25 2003 Japanese
南海浩一、河井重幸、橋本 渉、三上文三、村田幸作 Bacillus sp. GL1におけるキサンタン分解系の酵素学的・遺伝学的解析、及びキサンタンリアーゼのX線結晶構造解析 応用微生物学研究, 1 (1), 26-34 2003 Japanese
三島由美子、門間敬子、河井重幸、橋本 渉、三上文三、村田幸作 Sphingomonas sp. A1 株由来アルギン酸結合タンパク質の構造生物学的研究 応用微生物学研究, 1 (2), 115-122 2003 Japanese
W. Hashimoto Structural and biological studies on the regulation of cell morphology and macromolecule import/depolymerization systems of bacteria Nippon Nogeikagaku Kaishi,77,12,1218-1225 2003 Refereed Japanese
橋本 渉、三上文三、村田幸作 細菌『超チャネル』の構造と高分子輸送機能 生化学,74,7,563-567 2002/07/25 Refereed Japanese
橋本 渉 食研講演会要旨 超チャネルの構造と高分子輸送機能 京都大学食糧科学研究所報告,64,1-3 2001/03 Japanese
橋本 渉、村田幸作 高分子を鵜呑みにする細菌-体腔依存高分子取り込みABCトランスポーターの構造と機能- Bull. Res. Inst. Food Sci. Kyoto University, No.63, 64-65 2000 Japanese
橋本渉;村田幸作 細菌における多糖の取り込みと資化 京都大学食糧科学研究所報告,62,22-23 1999/03/31 Japanese
門間敬子、橋本 渉、村田幸作 遺伝子組換え食品の安全性 日本醸造協会誌,94,2,116-121 1999/02 Japanese
橋本 渉、門間敬子、南海浩一、村田幸作 体腔形成細菌:高分子物質の巧妙な食べ方 人間環境科学,8,169-176 1999 Japanese
橋本 渉、門間敬子、村田幸作 ヘテロ多糖を食べる細菌 化学と生物,36,11,709-715 1998/11/25 Refereed Japanese
橋本渉;小沢祥子;門間敬子;村田幸作 遺伝子組み換え食品の品質と安全性 日本調理科学会誌,31,4,321-326 1998/11 Refereed Japanese
橋本 渉、村田幸作 21世紀の農業の期待と社会的受容(遺伝子組み換え食品の現状と安全性) デイリーフード. 春季号(大豆と技術), 4, 14-19 1997 Japanese
橋本 渉、村田幸作 酵素2-エピメラーゼの生物学的機能 Bull. Res. Inst. Food Sci. Kyoto University, No.60, 126-128 1997 Japanese
村田幸作;橋本渉 細菌の多糖リアーゼ:酵素学的,遺伝学的側面と医薬への応用 日本応用酵素協会誌,31,28-39 1996 Japanese
W. Hashimoto; Y. Maruyama; Y. Nakamichi; B. Mikami; K. Murata Crystal structure of Pedobacter heparinus heparin lyase hep III with the active site in a deep cleft Biochemistry,53,4,777-786 2014 Refereed English
Y. Nakamichi; B. Mikami; K. Murata; W. Hashimoto Crystal structure of a bacterial unsaturated glucuronyl hydrolase with specificity for heparin Journal of Biological Chemistry,289,8,4787-4797 2014 Refereed English
W. Hashimoto; Y. Miyamoto; M. Yamamoto; F. Yoneyama; K. Murata A novel bleb-dependent polysaccharide export system in nitrogen-fixing Azotobacter vinelandii subjected to low nitrogen gas levels International Microbiology,16,1,35-44 2013 Refereed English
B. Mikami; M. Ban; S. Suzuki; H.-J. Yoon; O. Miyake; M. Yamasaki; K. Ogura; Y. Maruyama; W. Hashimoto; K. Murata Induced-fit motion of a lid loop involved in catalysis in alginate lyase A1-III Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography,68,1207-1216 2012/09 Refereed English
Y. Nishitani; Y. Maruyama; T. Itoh; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Recognition of heteropolysaccharide alginate by periplasmic solute-binding proteins of a bacterial ABC transporter Biochemistry,51,17,3622-3633 2012/05/01 Refereed English
Y. Maruyama; T. Itoh; Y. Nishitani; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Crystallization and preliminary X-ray analysis of alginate importer from Sphingomonas sp. A1 Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications,68,317-320 2012/03 Refereed English
F. Yoneyama; M. Yamamoto; W. Hashimoto; K. Murata Azotobacter vinelandii gene clusters for two types of peptidic and catechol siderophores produced in response to molybdenum Journal of Applied Microbiology,111,4,932-938 2011/10 Refereed English
H. Takeda; F. Yoneyama; S. Kawai; W. Hashimoto; K. Murata Bioethanol production from marine biomass alginate by metabolically engineered bacteria Energy and Environmental Science,4,7,2575-2581 2011/07 Refereed English
Y. Maruyama; A. Chuma; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Heterosubunit composition and crystal structures of a novel bacterial M16B metallopeptidase Journal of Molecular Biology,407,1,180-192 2011/03/18 Refereed English
Y. Nakamichi; Y. Maruyama; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Structural determinants in streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase for recognition of glycosaminoglycan sulfate groups Journal of Biological Chemistry,286,8,6262-6271 2011/02/25 Refereed English
Y. Maruyama; A. Ochiai; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Crystal structure of bacterial cell-surface alginate-binding protein with an M75 peptidase motif Biochemical and Biophysical Research Communications,405,3,411-416 2011/02/18 Refereed English
R. Takase; A. Ochiai; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Molecular identification of unsaturated uronate reductase prerequisite for alginate metabolism in Sphingomonas sp. A1 Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics,1804,9,1925-1936 2010/09 Refereed English
A. Ochiai; M. Yamasaki; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Crystal structure of exotype alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens Journal of Biological Chemistry,285,32,24519-24528 2010/08/06 Refereed English
Y. Maruyama; A. Ochiai; T. Itoh; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Mutational studies of the peptidoglycan hydrolase FlgJ of Sphingomonas sp. strain A1 Journal of Basic Microbiology,50,4,311-317 2010/08 Refereed English
W. Hashimoto; S. Kawai; K. Murata Bacterial supersystem for alginate import/metabolism and its environmental and bioenergy applications Bioengineered Bugs,1,2,97-109 2010 Refereed English
S. Kawai; W. Hashimoto; K. Murata Transformation of Saccharomyces cerevisiae and other fungi: methods and possible underlying mechanism. Bioengineered bugs,1,6,395-403 2010 Refereed English
K. Ogura; M. Yamasaki; T. Yamada; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Crystal structure of family 14 polysaccharide lyase with pH-dependent modes of action Journal of Biological Chemistry,284,51,35572-35579 2009/12/18 Refereed English
Y. Maruyama; Y. Nakamichi; T. Itoh; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Substrate specificity of streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolases for sulfated glycosaminoglycan Journal of Biological Chemistry,284,27,18059-18069 2009/07/03 Refereed English
W. Hashimoto; A. Ochiai; J. He; T. Itoh; B. Mikami; K. Murata Crystallization and preliminary crystallographic analysis of the cell-surface alginate-binding protein Algp7 isolated from Sphingomonas sp. A1 Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications,65,515-517 2009/05 Refereed English
A. Ochiai; T. Itoh; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Structural determinants responsible for substrate recognition and mode of action in family 11 polysaccharide lyases Journal of Biological Chemistry,284,15,10181-10189 2009/04/10 Refereed English
W. Hashimoto; A. Ochiai; K. Momma; T. Itoh; B. Mikami; Y. Maruyama; K. Murata Crystal structure of the glycosidase family 73 peptidoglycan hydrolase FlgJ Biochemical and Biophysical Research Communications,381,1,16-21 2009/03/27 Refereed English
J. He; A. Ochiai; Y. Fukuda; W. Hashimoto; K. Murata A putative lipoprotein of Sphingomonas sp. strain A1 binds alginate rather than a lipid moiety FEMS Microbiology Letters,288,2,221-226 2008/11 Refereed English
K. Ogura; M. Yamasaki; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Substrate recognition by family 7 alginate lyase from Sphingomonas sp. A1 Journal of Molecular Biology,380,2,373-385 2008/07/04 Refereed English
T. Itoh; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Crystal Structure of YihS in Complex with d-Mannose: Structural Annotation of Escherichia coli and Salmonella enterica yihS-encoded Proteins to an Aldose-Ketose Isomerase Journal of Molecular Biology,377,5,1443-1459 2008/04/11 Refereed English
Y. Maruyama; M. Momma; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Crystal structure of a novel bacterial cell-surface flagellin binding to a polysaccharide Biochemistry,47,5,1393-1402 2008/02/05 Refereed English
K. Murata; S. Kawai; B. Mikami; W. Hashimoto Superchannel of bacteria: Biological significance and new horizons Bioscience, Biotechnology and Biochemistry,72,2,265-277 2008/02 Refereed English
K.M. Harada; K. Tanaka; Y. Fukuda; W. Hashimoto; K. Murata Paenibacillus sp. strain HC1 xylanases responsible for degradation of rice bran hemicellulose Microbiological Research,163,3,293-298 2008 Refereed English
A. Ochiai; T. Itoh; Y. Maruyama; A. Kawamata; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata A novel structural fold in polysaccharide lyases: Bacillus subtilis family 11 rhamnogalacturonan lyase YesW with an eight-bladed β-propeller Journal of Biological Chemistry,282,51,37134-37145 2007/12/21 Refereed English
W. Hashimoto; T. Itoh; Y. Maruyama; B. Mikami; K. Murata Hydration of vinyl ether groups by unsaturated glycoside hydrolases and their role in bacterial pathogenesis International Microbiology,10,4,233-243 2007/12 Refereed English
Z. Cui; Y. Maruyama; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Crystal Structure of Glycoside Hydrolase Family 78 α-L-Rhamnosidase from Bacillus sp. GL1 Journal of Molecular Biology,374,2,384-398 2007/11/23 Refereed English
A. Ochiai; T. Itoh; A. Kawamata; W. Hashimoto; K. Murata Plant cell wall degradation by saprophytic Bacillus subtilis strains: Gene clusters responsible for rhamnogalacturonan depolymerization Applied and Environmental Microbiology,73,12,3803-3813 2007/06 Refereed English
Chaudhari, Anita; Mahfouz, Magdy; Fialho, Arsenio M.; Yamada, Tohru; Granja, Ana Teresa; Zhu, Yonghua; Hashimoto, Wataru; Schlarb-Ridley, Beatrix; Cho, Wonhwa; Das Gupta, Tapas K.; Chakrabarty, Ananda M. Cupredoxin-cancer interrelationship: Azurin binding with EphB2, interference in EphB2 tyrosine phosphorylation, and inhibition of cancer growth BIOCHEMISTRY,46,7,1799-1810 2007/02/20 Refereed English
Y. Maruyama; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata A structural factor responsible for substrate recognition by Bacillus sp. GL1 xanthan lyase that acts specifically on pyruvated side chains of xanthan Biochemistry,46,3,781-791 2007/01/23 Refereed English
Magdy Mahfouz, Wataru Hashimoto, Tapas K. Das Gupta, and Ananda M. Chakrabarty Bacterial proteins and CpG-rich exrtachromosomal DNA in potential cancer therapy Plasmid, 57 (1), 4-17 2007 Refereed English
T. Itoh; W. Hashimoto; B. Mikami; K. Murata Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase complexed with substrate: Molecular insights into its catalytic reaction mechanism Journal of Biological Chemistry,281,40,29807-29816 2006/10/06 Refereed English
T. Itoh; A. Ochiai; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Structure of unsaturated rhamnogalacturonyl hydrolase complexed with substrate Biochemical and Biophysical Research Communications,347,4,1021-1029 2006/09/08 Refereed English
A. Ochiai; W. Hashimoto; K. Murata A biosystem for alginate metabolism in Agrobacterium tumefaciens strain C58: Molecular identification of Atu3025 as an exotype family PL-15 alginate lyase Research in Microbiology,157,7,642-649 2006/09 Refereed English
Hong, Chang Soo; Yamada, Tohru; Hashimoto, Wataru; Fialho, Arsenio M.; Das Gupta, Tapas K.; Chakrabarty, Ananda M. Disrupting the entry barrier and attacking brain tumors - The role of the Neisseria H.8 epitope and the Laz protein CELL CYCLE,5,15,1633-1641 2006/08/01 Refereed English
T. Itoh; A. Ochiai; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata A Novel Glycoside Hydrolase Family 105: The Structure of Family 105 Unsaturated Rhamnogalacturonyl Hydrolase Complexed with a Disaccharide in Comparison with Family 88 Enzyme Complexed with the Disaccharide Journal of Molecular Biology,360,3,573-585 2006/07/14 Refereed English
K.M. Harada; Y. Aso; W. Hashimoto; B. Mikami; K. Murata Sequence and analysis of the 46.6-kb plasmid pA1 from Sphingomonas sp. A1 that corresponds to the typical IncP-1β plasmid backbone without any accessory gene Plasmid,56,1,11-23 2006/07 Refereed English
T. Itoh; W. Hashimoto; B. Mikami; K. Murata Substrate recognition by unsaturated glucuronyl hydrolase from Bacillus sp. GL1 Biochemical and Biophysical Research Communications,344,1,253-262 2006/05/26 Refereed English
A. Ochiai; M. Yamasaki; T. Itoh; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Crystallization and preliminary X-ray analysis of the rhamnogalacturonan lyase YesW from Bacillus subtilis strain 168, a member of polysaccharide lyase family 11 Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications,62,438-440 2006/05 Refereed English
A. Ochiai; M. Yamasaki; B. Mikami; W. Hashimoto; K. Murata Crystallization and preliminary X-ray analysis of an exotype alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens strain C58, a member of polysaccharide lyase family 15 Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications,62,486-488 2006/05 Refereed English
D. Malle; T. Itoh; W. Hashimoto; K. Murata; S. Utsumi; B. Mikami Overexpression, purification and preliminary X-ray analysis of pullulanase from Bacillus subtilis strain 168 Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications,62,381-384 2006/04 Refereed English
Y. Aso; Y. Miyamoto; K.M. Harada; K. Momma; S. Kawai; W. Hashimoto; B. Mikami; K. Murata Engineered membrane superchannel improves bioremediation potential of dioxin-degrading bacteria Nature Biotechnology,24,2,188-189 2006/02 Refereed English
K.M. Harada; K. Tanaka; Y. Fukuda; W. Hashimoto; K. Murata Degradation of rice bran hemicellulose by Paenibacillus sp. strain HC1: Gene cloning, characterization and function of β-D-glucosidase as an enzyme involved in degradation Archives of Microbiology,184,4,215-224 2005/12 Refereed English
W. Hashimoto; J. He; Y. Wada; H. Nankai; B. Mikami; K. Murata Proteomics-based identification of outer-membrane proteins responsible for import of macromolecules in Sphingomonas sp. A1: Alginate-binding flagellin on the cell surface Biochemistry,44,42,13783-13794 2005/10/25 Refereed English
M. Yamasaki; K. Ogura; W. Hashimoto; B. Mikami; K. Murata A structural basis for depolymerization of alginate by polysaccharide lyase family-7 Journal of Molecular Biology,352,1,11-21 2005/09/09 Refereed English
Y. Maruyama; W. Hashimoto; B. Mikami; K. Murata Crystal structure of Bacillus sp. GL1 xanthan lyase complexed with a substrate: Insights into the enzyme reaction mechanism Journal of Molecular Biology,350,5,974-986 2005/07/29 Refereed English
K. Momma; Y. Mishima; W. Hashimoto; B. Mikami; K. Murata Direct evidence for Sphingomonas sp. A1 periplasmic proteins as macromolecule-binding proteins associated with the ABC transporter: Molecular insights into alginate transport in the periplasm Biochemistry,44,13,5053-5064 2005/04/05 Refereed English
W. Hashimoto; K. Momma; Y. Maruyama; M. Yamasaki; B. Mikami; K. Murata Structure and function of bacterial super-biosystem responsible for import and depolymerization of macromolecules Bioscience, Biotechnology and Biochemistry,69,4,673-692 2005/04 Refereed English
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S. Mori; S. Akao; O. Miyake; H. Nankai; W. Hashimoto; B. Mikami; K. Murata Crystallization and preliminary X-ray analysis of a novel unsaturated glucuronyl hydrolase from Bacillus sp. GL1 Acta Crystallographica - Section D Biological Crystallography,59,946-949 2003/05 Refereed English
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Jun Sato, Shigeyuki Kawai, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata, Keiichi Goto, and Fumio Nanjo Identification of an Antifungal Substance Derived from the Oil-Based Extract of Licorice Biocontrol science,6,2,113-118 2001/09/20 Refereed English
W. Hashimoto; K. Momma; Y. Mishima; B. Mikami; K. Murata Super-channel in Bacteria: Function and Structure of a Macromolecule Import System Mediated by a Pit-dependent ABC Transporter Bioscience, Biotechnology and Biochemistry,65,9,1949-1956 2001/09 Refereed English
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W. Hashimoto; E. Kobayashi; H. Nankai; N. Sato; T. Miya; S. Kawai; K. Murata Unsaturated glucuronyl hydrolase of Bacillus sp. GL1: Novel enzyme prerequisite for metabolism of unsaturated oligosaccharides produced by polysaccharide lyases Archives of Biochemistry and Biophysics,368,2,367-374 1999/08/15 Refereed English
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H. Suzuki; W. Hashimoto; H. Kumagai Glutathione metabolism in Escherichia coli Journal of Molecular Catalysis - B Enzymatic,6,3,175-184 1999/03/11 Refereed English
K. Momma; W. Hashimoto; S. Ozawa; S. Kawai; T. Katsube; F. Takaiwa; M. Kito; S. Utsumi; K. Murata Quality and safety evaluation of genetically engineered rice with soybean glycinin: Analyses of the grain composition and digestibility of glycinin in transgenic rice Bioscience, Biotechnology and Biochemistry,63,2,314-318 1999/02 Refereed English
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N. Shirai; K. Momma; S. Ozawa; W. Hashimoto; M. Kito; S. Utsumi; K. Murata Safety Assessment of Genetically Engineered Food: Detection and Monitoring of Glyphosate-Tolerant Soybeans Bioscience, Biotechnology and Biochemistry,62,7,1461-1464 1998/07 Refereed English
W. Hashimoto; N. Sato; S. Kimura; K. Murata Polysaccharide lyase: Molecular cloning of gellan lyase gene and formation of the lyase from a huge precursor protein in Bacillus sp. GL1 Archives of Biochemistry and Biophysics,354,1,31-39 1998/06/01 Refereed English
W. Hashimoto; K. Murata α-L-Rhamnosidase of Sphingomonas sp. R1 Producing an Unusual Exopolysaccharide of Sphingan Bioscience, Biotechnology and Biochemistry,62,6,1068-1074 1998/06 Refereed English
W. Hashimoto; M. Okamoto; T. Hisano; K. Momma; K. Murata Sphingomonas sp. A1 lyase active on both poly-β-D-mannuronate and heteropolymeric regions in alginate Journal of Fermentation and Bioengineering,86,2,236-238 1998 Refereed English
Wataru Hashimoto, Hikaru Miki, Noriaki Tuchiya, Hirokazu Nankai, and Kousaku Murata Xanthan lyase of Bacillus sp. GL1 that liberates pyruvylated mannose from xanthan side chains Applied and Environmental Microbiology,64/10,3765-3768 1998 Refereed English
W. Hashimoto; T. Inose; K. Masuda; K. Murata Safety assessment of genetically engineered yeast: Elimination of mutagenicity of the yeast Saccharomyces cerevisiae by decreasing the activity of methylglyoxal synthase International Journal of Food Science and Technology,32,6,521-526 1997/12 Refereed English
W. Hashimoto; K. Maesaka; N. Sato; S. Kimura; K. Yamamoto; H. Kumagai; K. Murata Microbial system for polysaccharide depolymerization: Enzymatic route for gellan depolymerization by Bacillus sp. GL1 Archives of Biochemistry and Biophysics,339,1,17-23 1997/03/01 Refereed English
W. Hashimoto; H. Suzuki; K. Yamamoto; H. Kumagai Analysis of low temperature inducible mechanism of γ-glutamyltranspeptidase of Escherichia coli K-12 Bioscience, Biotechnology and Biochemistry,61,1,34-39 1997/01 Refereed English
K. Matsutani; Y. Fukuda; N. Yajima; W. Hashimoto; K. Murata Growth Repression of Yeast and Fungus by Bacterial DNAs: A Possible Physiological Function of DNA Other than as a Carriage of Genetic Information Journal of Fermentation and Bioengineering,84,6,524-527 1997 Refereed English
I. Maru; J. Ohnishi; Y. Ohta; W. Hashimoto; Y. Tsukada; K. Murata; B. Mikami Crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase from porcine kidney Journal of Biochemistry,120,3,481-482 1996/09 Refereed English
H. Sakai; N. Sakabe; K. Sasaki; W. Hashimoto; H. Suzuki; H. Tachi; H. Kumagai; K. Sakabe A preliminary description of the crystal structure of γ-glutamyltranspeptidase from E. coli K-12 Journal of Biochemistry,120,1,26-28 1996/07 Refereed English
W. Hashimoto; T. Inose; H. Nakajima; N. Sato; S. Kimura; K. Murata Purification and characterization of microbial gellan lyase Applied and Environmental Microbiology,62,4,1475-1477 1996/04 Refereed English
T. Hisano; N. Kimura; W. Hashimoto; K. Murata Pit structure on bacterial cell surface Biochemical and Biophysical Research Communications,220,3,979-982 1996/03/27 Refereed English
H. Suzuki; E.-S. Kim; N. Yamamoto; W. Hashimoto; K. Yamamoto; H. Kumagai Mapping, cloning, and DNA sequencing of pepB which encodes peptidase B of Escherichia coli K-12 Journal of Fermentation and Bioengineering,82,4,392-397 1996 Refereed English
SUZUKI, H; HASHIMOTO, W; NOHARA, S; TACHI, H; MONJI, T; YAMAMOTO, K; KUMAGAI, H BOTH LARGE AND SMALL SUBUNITS ARE ESSENTIAL FOR THE ENZYMATIC-ACTIVITY OF GAMMA-GLUTAMYL-TRANSPEPTIDASE OF ESCHERICHIA-COLI K-12 FASEB JOURNAL,9,6,A1429-A1429 1995/04/24 Refereed English
W. Hashimoto; H. Suzuki; K. Yamamoto; H. Kumagai Effect of site-directed mutations on processing and activity of γ-glutamyltranspeptidase, of Escherichia coli K-12<sup>1</sup> Journal of Biochemistry,118,1,75-80 1995 Refereed English
Wataru Hashimoto, Hideyuki Suzuki, Satoko Nohara, Hiromi Tachi, Kenji Yamamoto, and Hidehiko Kumagai Subunit association of -glutamyltranspeptidase of ┣DBEscherichia coli(/)-┫DB Journal of Biochemistry,118/6,1216-1223 1995 Refereed English
H. Kumagai; S. Nohara; H. Suzuki; W. Hashimoto; K. Yamamoto; H. Sakai; K. Sakabe; K. Fukuyama; N. Sakabe Crystallization and preliminary X-ray analysis of γ-glutamyltranspeptidase from Escherichia coli K-12 Journal of Molecular Biology,234,4,1259-1262 1993 Refereed English
H. Suzuki; W. Hashimoto; H. Kumagai Escherichia coli K-12 can utilize an exogenous γ-glutamyl peptide as an amino acid source, for which γ-glutamyltranspeptidase is essential Journal of Bacteriology,175,18,6038-6040 1993 Refereed English
W. Hashimoto; H. Suzuki; S. Nohara; H. Kumagai Escherichia coli γ-glutamyltranspeptidase mutants deficient in processing to subunits Biochemical and Biophysical Research Communications,189,1,173-178 1992 Refereed English
SUZUKI H;KUMAGAI H;HASHIMOTO W;CLAUDIO J O;TOCHIKURA T Molecular cloning and DNA sequence of Escherichia coli K-12 .GAMMA.-glutamyltranspeptidase gene, ggt, and excretion of .GAMMA.-glutamyltranspeptidase. Front New Horiz Amino Acid Res,589-593 1992 Refereed English

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(文系研究者の一般的な学会報告の業績は「講演等」を参照してください)
Authors Title Bibliography Date Peer-Review Language
吉田暢広、菅原良実、南部優子、村田幸作、橋本 渉 「大気窒素」を活用する次世代型発酵:窒素固定細菌による「廃グリセロール」の再資源化 日本農芸化学会2017年度大会 2017/03
橋本 渉、村田幸作 細菌による多糖輸送:アルギン酸取り込み細菌と分泌細菌の特異な細胞表層構造 日本農芸化学会2017年度大会 2017/03
老木紗予子、蒲地玲子、三上文三、村田幸作、橋本 渉 グリコサミノグリカンの輸送に関わる細菌由来基質結合タンパク質のドメインダイナミクス 日本農芸化学会2017年度大会 2017/03
河合桂吾、蒲地玲子、老木紗予子、村田幸作、橋本 渉 腸内細菌における宿主多糖グリコサミノグリカン分解菌の多様性 日本農芸化学会関西支部第498回講演会 2017/02
老木紗予子、三上文三、村田幸作、橋本 渉 病原性連鎖桿菌による動物細胞外マトリックス(グリコサミノグリカン)の分解 第89回日本生化学会2016年度大会 2016/09
杉浦春香、老木紗予子、三上文三、村田幸作、橋本 渉 大豆細胞壁多糖の輸送に関わるBacillus subtilis由来タンパク質YesOの結晶構造 日本農芸化学会2016年度関西支部大会 2016/09
中道優介、河合桂吾、村田幸作、橋本 渉 腸内細菌による宿主多糖グリコサミノグリカンの分解に関するメタゲノム解析 日本農芸化学会2016年度関西支部大会 2016/09
老木紗予子、丸山如江、三上文三、村田幸作、橋本 渉 動物細胞外マトリックス(グリコサミノグリカン)を基質とする病原性細菌ABCトランスポーター 日本農芸化学会2016年度大会 2016/03
小川徳之、木村豪秀、益成利幸、天野芙美、片山有基、永井 豪、市村通朗、丸山如江、伊藤貴文、橋本 渉、村田幸作、相阪和夫 構造情報に基づく部位特異的変異及びランダム変異導入に依るヘモグロビンA1cダイレクトオキシダーゼの造成 日本農芸化学会2016年度大会 2016/03
高瀬隆一、丸山如江、老木紗予子、三上文三、村田幸作、橋本 渉 酸性多糖の代謝に関わる還元酵素の補酵素要求性に関わる構造要因 日本農芸化学会2016年度大会 2016/03
上西加純、金子あい、丸山如江、水野伸宏、馬場清貴、熊坂 崇、三上文三、村田幸作、橋本 渉 細菌ABCトランスポーターのATP加水分解は、closed型の基質結合タンパク質との相互作用によって惹起される 日本農芸化学会関西支部第493回講演会 2016/02
老木紗予子、丸山如江、三上文三、村田幸作、橋本 渉 グリコサミノグリカン輸送に関わる連鎖桿菌由来基質結合タンパク質のX線結晶構造解析 日本農芸化学会2015年度中部・関西支部合同大会 2015/09
中道優介、老木紗予子、三上文三、村田幸作、橋本 渉 連鎖球菌による哺乳類細胞外マトリクス(グリコサミノグリカン)の分解:不飽和グルクロニルヒドロラーゼの反応機構 日本農芸化学会2015年度大会 2015/03
丸山如江、立石 彬、金子あい、 三上文三、橋本 渉、村田幸作 基質結合タンパク質依存的ABCトランスポーターによる多糖認識 日本農芸化学会2015年度大会 2015/03
橋本 渉、村田幸作 窒素固定細菌の膜小胞による多糖輸送 日本農芸化学会2015年度大会 2015/03
小林将大、丸山如江、村田幸作、橋本 渉 Sphingomonas属細菌A1株は高分子多糖アルギン酸に走化性を示す 日本農芸化学会関西支部第488回講演会 2015/01
丸山如江、老木紗予子、三上文三、村田幸作、橋本 渉 宿主細胞外マトリックス(グリコサミノグリカン)の代謝に関わる連鎖球菌の異性化酵素 日本生化学会2014年度大会 2014/10
老木紗予子、中道優介、丸山如江、村田幸作、橋本 渉 宿主細胞外マトリックス(グリコサミノグリカン)に作用する連鎖桿菌遺伝子クラスター 日本生化学会2014年度大会 2014/10
金子あい、丸山如江、三上文三、村田幸作、橋本 渉 立体構造に基づくアルギン酸取り込みABCトランスポーターの機能解析 日本生化学会2014年度大会 2014/10
小林将大、丸山如江、村田幸作、橋本 渉 細菌による側毛型フラジェリンを構成因子とする新規な極単べん毛の形成機構 日本農芸化学会2014年度関西支部大会 2014/09
木下舞花、村田 幸作、橋本 渉 ヒト腸内細菌における褐藻類多糖アルギン酸の資化性 日本農芸化学会2014年度関西支部大会 2014/09
丸山如江、小林将大、村田幸作、橋本 渉 Sphingomonas属細菌A1株の側べん毛関連および 非関連遺伝子群による極単べん毛の形成 日本農芸化学会2014年度大会 2014/03
橋本 渉、丸山如江、高瀬隆一、中道優介、三上文三、村田幸作 連鎖球菌による宿主細胞外マトリクス (グリコサミノグリカン)の代謝機構 日本農芸化学会2014年度大会 2014/03
K. Temtrirath; K. Murata; W. Hashimoto Structural and functional analysis of bacterial cell-surface protein involved in alginate import 日本農芸化学会関西支部第482回講演会 2013/12
林 智恵、丸山如江、橋本 渉、村田幸作 アルギン酸資化性細菌Sphingomonas sp. A1の転写因子AlgOの作用機構 日本農芸化学会2013年度関西・中四国・西日本支部合同大会 2013/09
中道優介、三上文三、村田幸作、橋本 渉 細菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼのヘパリン二糖認識機構 日本農芸化学会2013年度関西・中四国・西日本支部合同大会 2013/09
高瀬隆一、河井重幸、橋本 渉、村田幸作 細菌のアルギン酸代謝に関わる新規なNADH要求性α-ケト酸還元酵素 日本農芸化学会2013年度関西・中四国・西日本支部合同大会 2013/09
金子あい、丸山如江、橋本 渉、村田幸作 酸性多糖アルギン酸の取り込みに関わるABCトランスポーターの機能解析 日本生化学会2013年度大会 2013/09
小林将大、丸山 如江、橋本 渉、村田 幸作 Sphingomonas属細菌A1株の側毛フラジェリンによる極単べん毛の形成 日本生物工学会2013年度大会 2013/09
橋本 渉、丸山如江、三上文三、村田幸作 体腔依存多糖取り込みABCトランスポーターの構造機能相関とその応用 日本農芸化学会2013年度大会 2013/03/27 Japanese
丸山如江、金子あい、三上文三、橋本 渉、村田幸作 細菌由来アルギン酸ABCトランスポーターの立体構造と基質輸送 日本農芸化学会2013年度大会 2013/03/25 Japanese
橋本 渉、丸山如江、中道優介、村田幸作 ヘパリン分解細菌由来ヘパラン硫酸リアーゼHepCの結晶構造と活性部位 日本農芸化学会2013年度大会 2013/03/25 Japanese
丸山如江、三上文三、橋本 渉、村田幸作 ファミリーGH-73ペプチドグリカン分解酵素の活性クレフト構造 日本生化学会2012年度大会 2012/12/16 Japanese
中道優介、丸山如江、橋本 渉、村田幸作 酸性多糖の分解に関わる不飽和グルクロニルヒドロラーゼのクラスター分析 日本生化学会2012年度大会 2012/12/16 Japanese
林 智恵、丸山如江、橋本 渉、村田幸作 「超チャネル」形成細菌Sphingomonas sp. A1のアルギン酸依存的遺伝子発現機構 日本生物工学会2012年度大会 2012/10/16 Japanese
西谷 悠、丸山如江、伊藤貴文、三上文三、橋本 渉、村田幸作 細菌ABCトランスポーターと連携する基質結合タンパク質によるヘテロ多糖アルギン酸の認識機構 日本農芸化学会2012年度関西支部大会 2012/09/29 Japanese
高瀬隆一、三上文三、橋本 渉、村田幸作 酸性多糖の代謝に関わる細菌由来α-ケト酸還元酵素のX線結晶構造解析 日本農芸化学会2012年度大会 2012/03/25 Japanese
橋本 渉、丸山如江、中道優介、三上文三、村田幸作 ヒト関連細菌由来グリコサミノグリカン分解遺伝子クラスターにおけるヘパラン硫酸リアーゼ 日本農芸化学会2012年度大会 2012/03/25 Japanese
中道優介、丸山如江、橋本 渉、村田幸作 グリコサミノグリカン分解に関わる細菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼの基質認識機構 日本農芸化学会2012年度大会 2012/03/25 Japanese
丸山如江、伊藤貴文、西谷 悠、三上文三、橋本 渉、村田幸作 多糖アルギン酸の取り込みに関わる細菌由来ABCトランスポーターのX線結晶構造解析 日本農芸化学会2012年度大会 2012/03/24 Japanese
橋本 渉、丸山如江、三上文三、村田幸作 アルギン酸で誘導発現するSphingomoans属細菌由来鉄輸送オペロンタンパク質の構造と機能 日本農芸化学会 20011年度 関西・中部支部合同大会 2011/10/02 Japanese
西谷 悠、丸山如江、伊藤貴文、三上文三、橋本 渉、村田幸作 多糖アルギン酸を取り込む細菌由来ABCトランスポーターと基質結合タンパク質の相互作用に関する構造機能解析 日本農芸化学会 2011年度 関西・中部支部合同大会 2011/10/02 Japanese
高瀬隆一、三上文三、橋本 渉、村田幸作 ポリウロン酸の代謝に関わる細菌由来α−ケト酸還元酵素の構造機能相関 日本農芸化学会 2011年度 関西・中部支部合同大会 2011/10/02 Japanese
中道優介、丸山如江、三上文三、橋本 渉、村田幸作 連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼのヘパリン二糖認識機構 日本農芸化学会 2011年度 関西・中部支部合同大会 2011/10/02 Japanese
橋本 渉、丸山如江、三上文三、村田幸作 M75メタロペプチダーゼモチーフをもつSphingomonas属細菌由来細胞表層アルギン酸結合タンパク質のX線結晶構造解析 日本生化学会2011年度大会 2011/09/22 Japanese
橋本渉;丸山如江;中道優介;村田幸作 連鎖球菌におけるグリコサミノグリカン分解・輸送・代謝に関わる遺伝子クラスター 日本農芸化学会大会講演要旨集,2011,158 2011/03/05 Japanese
中道優介、丸山如江、三上文三、橋本 渉、村田幸作 連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼのグリコサミノグリカン二糖に対する硫酸基認識 日本農芸化学会2011年度大会 2011/03
竹田浩之、米山史紀、河井重幸、橋本 渉、佐藤信行、村田幸作 体腔形成細菌の分子育種による海洋バイオマスアルギン酸からのエタノール生産 日本農芸化学会2011年度大会 2011/03 Refereed Japanese
落合秋人;高瀬隆一;橋本渉;村田幸作 アルギン酸代謝における細菌由来α‐ケト酸還元酵素の生理機能と活性中心構造 日本農芸化学会大会講演要旨集,2010,162 2010/03/05 Japanese
橋本 渉、丸山如江、落合秋人、三上文三、村田幸作 Sphingomoans属細菌A1株の細胞表層に局在するアルギン酸結合タンパク質の遺伝子発現とX線結晶構造解析 日本農芸化学会2010年度関西支部大会 2010 Japanese
丸山如江、落合秋人、三上文三、橋本 渉、村田幸作 Sphingomonas属細菌A1株由来ペプチドグリカン分解酵素の立体構造に基づく触媒機構解析析 日本農芸化学会2010年度関西支部大会 2010 Japanese
中道優介,丸山如江,三上文三,橋本 渉,村田幸作 硫酸化グリコサミノグリカンに作用する連鎖球菌由来不飽和グルクロニルヒドロラーゼの基質認識機構 日本農芸化学会2010年度関西支部大会 2010 Japanese
橋本 渉、落合秋人、何 金山、村田幸作 細菌由来推定リポタンパク質の脂質結合性評価とその予備的X線結晶構造解析 日本農芸化学会2010年度大会 2010 Japanese
伊藤貴文、三上文三、橋本 渉、村田幸作 アルギン酸輸送ABCトランスポーターの機能解析と予備的X線結晶構造解析 日本農芸化学会2010年度大会 2010 Japanese
丸山如江、橋本 渉、村田幸作 細菌由来メタロペプチダーゼファミリーM16酵素のX線結晶構造 日本農芸化学会2010年度大会 2010 Japanese
米山史紀、山本真由美、橋本渉、村田幸作 窒素固定細菌Azotobacter vinelandiiのシデロフォア生合成遺伝子クラスター 日本農芸化学会2010年度大会 2010 Japanese
竹田浩之;落合秋人;橋本渉;村田幸作 細菌によるアルギン酸からのバイオ燃料生産:エタノール生産菌の分子育種 日本農芸化学会大会講演要旨集,2009,98 2009/03/05 Japanese
伊藤貴文、西谷 悠、三上文三、橋本 渉、村田幸作 細菌におけるATP加水分解エネルギーによる高分子多糖の取り込み リン化合物討論会 2009 Japanese
落合秋人、三上文三、橋本 渉、村田幸作 Structural determinants responsible for mode of action in polysaccharide lyases for biofuel production 日本生化学会2009年度大会 2009 Japanese
高瀬隆一、落合秋人、三上文三、橋本 渉、村田幸作 Coenzyme-binding mode in α-keto acid reductase responsible for alginate metabolism 日本生化学会2009年度大会 2009 Japanese
中道優介、丸山如江、三上文三、橋本 渉、村田幸作 A novel streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase specific for sulfated glycosaminoglycans 日本生化学会2009年度大会 2009 Japanese
伊藤貴文、三上文三、橋本 渉、村田幸作 Expression and function analysis of Sphingomonas alginate ABC transporter 日本生化学会2009年度大会 2009 Japanese
橋本 渉、伊藤貴文、三上文三、村田幸作 多糖の輸送・分解に関わる細菌由来超分子の構造と機能 日本生化学会2009年度大会 2009 Japanese
小倉康平、山崎正幸、橋爪貴也、山田 隆、三上文三、橋本 渉、村田 幸作 アルギン酸リアーゼvAL-1(S)は反応pHにより異なる作用様式(エンド/エキソ型)を示す 日本生物工学会2009年度大会 2009 Japanese
落合秋人、高瀬隆一、三上文三、橋本 渉、村田幸作 アルギン酸代謝に関わる NADPH 依存α- ケト酸還元酵素の構造機能相関 日本ビタミン学会第61回大会 2009 Japanese
落合秋人、三上文三、橋本 渉、村田幸作 褐藻アルギン酸の糖化に関わる細菌由来エキソ型リアーゼの構造・機能相関 日本農芸化学会2009年度大会 2009 Japanese
橋本 渉、落合秋人、門間敬子、丸山如江、伊藤貴文、三上文三、村田幸作 ファミリーGH73ペプチドグリカン分解酵素のX線結晶構造 日本農芸化学会2009年度大会 2009 Japanese
小倉康平、山崎正幸、橋爪貴也、山田 隆、三上文三、橋本 渉、村田幸作 ファミリーPL-14多糖リアーゼvAL-1(S)の構造・機能相関 日本農芸化学会2009年度大会 2009 Japanese
高瀬隆一;落合秋人;橋本渉;村田幸作 細菌によるアルギン酸からのエタノール生産:アルギン酸糖化産物(α‐ケト酸)還元酵素の分子同定 日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集,454th,10 2008 Japanese
小倉康平, 山崎正幸, 橋爪貴也, 山田 隆, 三上文三, 橋本 渉, 村田幸作 クロレラウイルスCVK-1由来ファミリー14多糖リアーゼのX線結晶構造 日本農芸化学会2008年度関西支部大会 2008 Japanese
落合秋人,高瀬隆一,橋本 渉,村田幸作 アルギン酸単糖(α-ケト酸)を無毒化するレダクターゼの分子同定 日本生物工学会2008年度大会 2008 Japanese
伊藤貴文, 三上文三, 橋本 渉, 村田幸作 サルモネラ菌由来マンノースイソメラーゼYihSの機能と立体構造 日本農芸化学会関西支部第454回講演会 2008 Japanese
落合秋人、三上文三、橋本 渉、村田幸作 細菌によるアルギン酸からのエタノール生産:アルギン酸糖化酵素エキソ型リアーゼのX線結晶構造, 日本農芸化学会関西支部第454回講演会 2008 Japanese
Akihito Ochiai, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Structural determinants responsible for substrate recognition and mode of action in polysaccharide lyases Korea-Japan Joint Meeting on Biotechnology 2008 English

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Lectures > Invited Lectures
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Title Conference name Organization name Date Language
細菌細胞膜のダイナミクスと有用物質生産 [招待あり] 平成28年度3研究会合同講演会(発酵と代謝研究会、アルコール・バイオマス研究会、新資源生物変換研究会) 2017/03/27 Japanese
細菌由来多糖分解酵素の構造と機能 [招待あり] 第11回関西グライコサイエンスフォーラム 関西グライコサイエンスフォーラム 2010 Japanese
細菌における多糖の輸送と分解—構造・機能・移植— [招待あり] 日本応用糖質科学会第28回近畿支部会 日本応用糖質科学会 2008 Japanese
Publications > Books
Authors Title Publisher Date Language
Sayoko Oiki, Reiko Kamochi, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto Conformational change of bacterial solute-binding protein involved in import of glycosaminoglycans SPring-8 User Experiment Report, 2016B2574 2016
Sayoko Oiki, Kasumi Uenishi, Yukie Maruyama, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto Crystal structure of Streptobacillus solute-binding protein involved in import of glycosaminoglycans SPring-8 User Experiment Report, 2015B2058 2015 English
Ai Kaneko, Yukie Maruyama, Sayoko Oiki, Yusuke Nakamichi, Ryuichi Takase, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto X-ray crystallographic analysis of bacterial alginate ABC transporter through Humid Air and Glue-coating method SPring-8 User Experiment Report, 2014A1148 2014 English
Ai Kaneko, Yukie Maruyama, Sayoko Oiki, Kasumi Uenishi, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto Crystal structure of bacterial alginate ABC transporter in complex with periplasmic binding protein with longer oligoalginate SPring-8 User Experiment Report, 2014B1137 2014 English
Yusuke Nakamichi, Ai Kaneko, Kanate Temtrirath, Ryuichi Takase, Yukie Maruyama, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto Structural determinants in bacterial unsaturated glucuronyl hydrolase for degradation of heparin disaccharides SPring-8 User Experiment Report, 2013B1260 2013 English
Yukie Maruyama, Yusuke Nakamichi, Ai Kaneko, Ryuichi Takase, Bunzo Mikami, Kousaku Murata, and Wataru Hashimoto Crystal structure of heparan sulfate lyase HepC from Pedobacter heparinus SPring-8 User Experiment Report, 2013A1106 2013 English
Magdy Mahfouz, Wataru Hashimoto, Tapas K. Das Gupta, and Ananda M. Chakrabarty Bacterial proteins in potential cancer therapy I. K. International Publishing House Pvt Ltd 2009 English
橋本 渉、村田幸作 スーパー細菌の創成とダイオキシン分解の高効率化技術 『土壌・地下水汚染の浄化・修復技術』、ブッカーズ、株式会社エヌ・ティー・エス(NTS), pp137-147 2008 Japanese
橋本 渉、村田幸作 4章 微生物の細胞構造 遺伝子から見た応用微生物学. 熊谷英彦、加藤暢夫、村田幸作、阪井康能編, 朝倉出版, pp55-68 2008 Japanese
村田幸作、橋本 渉 「小胞状構造体」の形成に関わる細菌細胞膜のダイナミクス 特定領域研究研究成果報告書 (2000年度〜2004年度科学研究費補助金) 細胞システム解明に向けたゲノム生物学の新展開(略称:ゲノム生物学), p432-433 2006 Japanese
村田幸作、橋本 渉 細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明 文部科学省 科学研究費 特定領域研究[ゲノム]4領域 2003年度報告書:275 2005 Japanese
村田幸作、橋本 渉、河井重幸 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発 厚生労働科学研究費補助金、難政治性疾患克服研究事業、「特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究」、平成16年度総括・分担研究報告書:53-57 2005 Japanese
村田幸作、橋本 渉、河井重幸 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発 厚生労働科学研究費補助金 難治性疾患克服研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成 15年度 総括・分担研究報告書, 55-59 2004 Japanese
村田幸作、橋本 渉、河井重幸 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発 厚生労働科学研究費補助金 特定疾患対策研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成14年度 総括・分担研究報告書, 36-41 2003 Japanese
村田幸作、橋本 渉 細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明 文部科学省科学研究費特定領域研究「ゲノム」4領域2003年度合同班会議, B120 2003 Japanese
橋本 渉、村田幸作 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発 厚生科学研究費補助金 特定疾患対策研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成13年度 総括・分担研究報告書, 95-103 2002 Japanese
橋本 渉 細菌『超チャネル』の高次構造と巨大分子輸送機能 平成13年度新世代研究所研究助成成果報告書、pp75-80 2002 Japanese
村田幸作、橋本 渉 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発 厚生科学研究費補助金 特定疾患対策研究事業 特定疾患の微生物学的原因究明に関する研究 平成12年度 総括・分担研究報告書, 53-55 2001 Japanese
村田幸作、橋本 渉、門間敬子 細菌細胞表層における体腔の高次空間構造と高分子輸送機構 文部省科学研究費補助金 特定領域研究(A)(1). バイオターゲティングのための生体分子デザイン 平成12年度 研究報告書, 304-309 2001 Japanese
村田幸作、橋本 渉 慢性肺疾患における細菌の関与とその治療法の開発 厚生省調査研究班基盤研究部門(特定疾患に関する微生物研究班)平成11年度 研究報告書, 49-50 2000 Japanese
村田幸作、門間敬子、橋本 渉 細菌細胞表層における体腔形成機構と体腔の高分子輸送機構 文部省科学研究費補助金 特定領域研究(A)(1). バイオターゲティングのための生体分子デザイン 平成11年度 研究報告書, 324-329 2000 Japanese
門間敬子、橋本 渉、村田幸作 細菌細胞表層への体腔提示と体腔へのターゲッティング 文部省科学研究費補助金 特定領域研究(A)(1). バイオターゲティングのための生体分子デザイン 平成10年度 研究報告書, 284-289 1999 Japanese
村田幸作、橋本 渉 細菌アルギン酸リアーゼのバイオフィルム感染症治療への応用-高次構造と抗原性部位の除去- 厚生省特定疾患調査研究班(特定疾患に関する微生物研究班)平成10年度 研究報告書, 49-52 1999 Japanese
橋本 渉、門間敬子、村田幸作 健康と環境への安全性 「遺伝子組換え植物の光と影」(山田康之、佐野 浩編集) 学会出版センター, pp91-103 1999 Japanese
村田幸作、橋本 渉 細菌多糖リアーゼのバイオフィルム感染症治療への応用:化学修飾アルギン酸リアーゼの酵素学的・免疫学的特性 厚生省特定疾患調査研究班(特定疾患に関する微生物研究班)平成9年度 研究報告書, 42-48 1998 Japanese
村田幸作、橋本 渉 細菌多糖リアーゼのバイオフィルム感染症治療への応用 厚生省特定疾患調査研究班(特定疾患に関する微生物研究班)平成8年度 研究報告書, 51-55 1997 Japanese
Hidehiko Kumagai, Hideyuki Suzuki, Wataru Hashimoto, and Satoko Nohara Structure-function relationship and regulation of biosynthesis of γ-glutamyltranspeptidase of Escherichia coli K-12 長瀬科学技術振興財団研究報告集, 4, 97-107 1992 Japanese
Yukie Maruyama, Yusuke Nakamichi, Ryuichi Takase, Kanate Temtrirath, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystal structure of peptidoglycan hydrolase FlgJ mutant from Sphingomonas sp. strain A1 SPring-8 User Experiment Report, 2012A1317 2012 English
Wataru Hashimoto, Yukie Maruyama, Kanate Temtrirath, Yusuke Nakamichi, Ryuichi Takase, Bunzo Mikami, and Kousaku Murata Crystal structure of Sphingomonas sp. strain A1 alginate-binding protein Algp7 in complex with metal ion SPring-8 User Experiment Report, 2012B1265 2012 English
Wataru Hashimoto, Yukie Maruyama, Ryuichi Takase, Yusuke Nakamichi, Bunzo Mikami, and Kousaku Murata Crystal structure of streptococcal α-keto acid reductase involved in metabolism of glycosaminoglycans SPring-8 User Experiment Report, 2011B2055 2011 English
Yu Nishitani, Yukie Maruyama, Yusuke Nakamichi, Ryuichi Takase, Kazuto Ohashi, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of ATP-binding cassette transporter from Sphingomonas sp. strain A1 SPring-8 User Experiment Report, 2011A1186 2011 English
Yu Nishitani, Yukie Maruyama, Takafumi Itoh, Yusuke Nakamichi, Ryuichi Takase, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Binding mode to heteropolysaccharide alginate by Sphingomonas sp. A1 periplasmic protein associated with ABC transporter SPring-8 User Experiment Report, 2011B1108 2011 English
Yusuke Nakamichi, Yukie Maruyama, Ryuichi Takase, Yu Nishitani, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata The flexible catalytic residues prerequisite for activity expression in bacterial glycosaminoglycan-degrading enzyme SPring-8 User Experiment Report, 2010B1149 2010 English
Yusuke Nakamichi, Yukie Maruyama, Ryuichi Takase, Yu Nishitani, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Loop movement over the active cleft in streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase SPring-8 User Experiment Report, 2010A1279 2010 English
Ryuichi Takase, Akihito Ochiai, Takafumi Itoh, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystal structure of NADP-bound α-keto acid reductase prerequisite for alginate metabolism in Sphingomonas sp. A1 SPring-8 User Experiment Report, 2009B1177 2009 English
Wataru Hashimoto, Yukie Maruyama, Takafumi Itoh, Bunzo Mikami, and Kousaku Murata Bacterial system for alginate uptake and degradation In "Alginates: Biology & Applications" Microbiology Monographs 13: (Ed. Bernd Rehm), Springer, pp73-94 2009 English
Yusuke Nakamichi, Yukie Maruyama, Takafumi Itoh, Akihito Ochiai, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystal structure of streptococcal unsaturated glucuronyl hydrolase in complex with sulfated substrate SPring-8 User Experiment Report, 2009B1201 2009 English
Ryuichi Takase, Akihito Ochiai, Yusuke Nakamichi, Takafumi Itoh, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata X-ray crystal structure of Sphingomonas sp. A1 α-keto acid reductase for alginate metabolism SPring-8 User Experiment Report, 2009A1179 2009 English
Yukie Maruyama, Asako Chuma, Akihito Ochiai, Kohei Ogura, Yusuke Nakamichi, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata X-ray structural analysis of the metallopeptidase family M16 enzyme SPring-8 User Experiment Report, 2009A1329 2009 English
Yukie Maruyama, Asako Chuma, Takafumi Itoh, Akihito Ochiai, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystal structure of the metallopeptidase family M16 enzyme from Sphingomonas sp. strain A1 SPring-8 User Experiment Report, 2009B1192 2009 English
Takafumi Itoh, Akihito Ochiai, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Structural insights into the reaction mechanism of coenzyme-independent mannose isomerase SPring-8 User Experiment Report, 2008A1119 2008 English
Wataru Hashimoto, Akihito Ochiai, Takafumi Itoh, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Yukie Maruyama, and Kousaku Murata X-ray crystal structure of Sphingomonas sp. A1 peptidoglycan hydrolase categorized to family GH-73 SPring-8 User Experiment Report, 2008B1112 2008 English
Akihito Ochiai, Takafumi Itoh, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of peptidoglycan hydrolase from Sphingomonas sp. strain A1 SPring-8 User Experiment Report, 2008A1322 2008 English
Takafumi Itoh, Kohei Ogura, Yusuke Nakamichi, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystal structure of alginate-binding protein (AlgQ1) in complex with unsaturated mannuronic acid trisaccharide SPring-8 User Experiment Report, 2008B1191 2008 English
Wataru Hashimoto, Takafumi Itoh, Yukie Maruyama, Bunzo Mikami, and Kousaku Murata Unsaturated glycoside hydrolases trigger hydration of vinyl ether groups but not of glycoside bond Abstract papers of The 5th open workshop “Chemistry of Biological processes created by water and biomolecules”, p201, January 24-25, 2008. Nara prefectural new public hall, Nara, Japan. Supported by the Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Ar 2008 English
Yukie Maruyama, Misato Momma, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Alginate recognition by cell surface flagellin homologous proteins of Sphingomonas sp. A1 SPring-8 User Experiment Report, 2007A1330 2007 English
Takafumi Itoh, Yukie Maruyama, Akihito Ochiai, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Structural identification of bacterial yihS-encoded proteins to an aldose-ketose isomerase SPring-8 User Experiment Report, 2007B1176 2007 English
Takafumi Itoh, Yukie Maruyama, Akihito Ochiai, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Structural analysis of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase superfamily SPring-8 User Experiment Report, 2007A1154 2007 English
Yukie Maruyama, Takafumi Itoh, Akihito Ochiai, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystal structure of unsaturated glucuronyl hydrolase from Streptococcus agalactiae SPring-8 User Experiment Report, 2007A1407 2007 English
Yukie Maruyama, Misato Momma, Takafumi Itoh, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata X-ray crystallographic study on Sphingomonas sp. A1 cell surface protein associating with alginate-binding flagellin homologue SPring-8 User Experiment Report, 2007B1624 2007 English
Akihito Ochiai, Takafumi Itoh, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystal structure of exotype rhamnogalacturonan lyase YesX from Bacillus subtilis strain 168: structural factors responsible for mode of action SPring-8 User Experiment Report, 2007B1268 2007 English
Takafumi Itoh, Yukie Maruyama, Kohei Ogura, Malle Dominggus, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Structural analysis for the substrate specificity of a novel glycosidase, unsaturated galacturonyl hydrolase, responsible for the degradation plant cell walls SPring-8 User Experiment Report, 2006B1067 2006 English
Takafumi Itoh, Kimihiko Mizutani, Yukie Maruyama, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystal structure of unsaturated galacturonyl hydrolase in complex with unsaturated galacturonic acid SPring-8 User Experiment Report, 2006A1103 2006 English
Yukie Maruyama, Misato Momma, Akihito Ochiai, Takafumi Itoh, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Structural analysis of flagellin homologous protein on cell surface of Sphingomonas sp. A1 SPring-8 User Experiment Report, 2006B1126 2006 English
Yukie Maruyama, Misato Momma, Kohei Ogura, Malle Dominggus, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Analysis of alginate recognition system on cell surface of Sphingomonas sp. A1 SPring-8 User Experiment Report, 2006A1150 2006 English
Akihito Ochiai, Takafumi Itoh, Yukie Maruyama, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystal structure of rhamnogalacturonan lyase from Bacillus subtilis strain 168 SPring-8 User Experiment Report, 2006B1214 2006 English
Takafumi Itoh, Akihito Ochiai, Bunzo Mikami, Aiko Tanabe, Kimihiko Mizutani, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Crystal structure of unsaturated rhamnogalacturonan hydrolase complexed with substrate SPring-8 User Experiment Report, 2006A1405 2006 English
Akihito Ochiai, Masayuki Yamasaki, Wataru Hashimoto, Bunzo Mikami, and Kousaku Murata Preliminary X-ray study of an alginate lyase Atu3025 from Agrobacterium tumefaciens C58, a member of polysaccharide lyase family 15 SPring-8 User Experiment Report, 15(2005A), pp298 2005 English
Yukie Maruyama, Masayuki Yamasaki, Takafumi Itoh, Akihito Ochiai, Kohei Ogura, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Polysaccharide lyase: Crystal structure of Bacillus sp. GL1 xanthan lyase complexed with substrate SPring-8 User Experiment Report, 14(2004B), pp173 2005 English
Yukie Maruyama, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Polysaccharide lyase: Crystal structure of Bacillus sp. GL1 xanthan lyase complexed with pyruvate mannose SPring-8 User Experiment Report, 14(2004B), pp295 2005 English
Akihito Ochiai, Masayuki Yamasaki, Takafumi Itoh, Yukie Maruyama, Aiko Tanabe, Bunzo Mikami, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata X-ray analysis of exotype alginate lyase from Agrobacterium tumefaciens C58 SPring-8 User Experiment Report, 2005B0351 2005 English
Masayuki Yamasaki, Satoko Moriwaki, Kimihiko Mizutani, Takafumi Itoh, Akira Hirata, You-Na Kang, Mizuho Ban, Wataru Hashimoto, Bunzo Mikami, and Kousaku Murata Insight into the catalytic mechanism of family PL-7 alginate lyase PA1167 from Pseudomonas aeruginosa SPring-8 user experiment report, 13(2004A), p199 2004 English
Masayuki Yamasaki, Satoko Moriwaki, Wataru Hashimoto, Kousaku Murata, Kimihiko Mizutani, and Bunzo Mikami Crystal structure of family PL-7 alginate lyase PA1167 from Pseudomonas aeruginosa SPring-8 user experiment report, 12(2003B), p211 2004 English
Keiko Momma, Wataru Hashimoto, Shigeru Utsumi, and Kousaku Murata Safety assessment of genetically modified rice and potatoes with soybean glycinin In "Testing for genetic manipulation in plants", Molecular Methods of Plant Analysis, vol. 22, pp139-152 (Eds. J. F. Jackson, H. F. Linskens, and R. B. Inman), Springer-Verlag, Berlin Heidelberg 2002 English
Wataru Hashimoto, Yumiko Mishima, Osamu Miyake, Hirokazu Nankai, Keiko Momma, and Kousaku Murata Biodegradation of alginate, xanthan, and gellan In "Biopolymers" volume 9: Polysaccharides I (Ed. A. Steinb�chel), Wiley-VCH, pp175-199 2002 English
Shigeyuki Kawai, Shigetarou Mori, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Identification and characterization of a novel enzyme: inorganic polyphosphate/ATP-NAD kinase of Micrococcus flavus Abstract for Fifth International Symposium on Environmental Biotechnology, p63-66, Kyoto, July 9-13 2000 English
Wataru Hashimoto, Keiko Momma, Hye-Jin Yoon, Yumiko Mishima, Osamu Miyake, Shigeyuki Kawai, Bunzo Mikami, and Kousaku Murata Special apparatus for assimilation, transport, and depolymerization of alginate in Sphingomonas sp. A1 Abstract for Fifth International Symposium on Environmental Biotechnology, p916-919, Kyoto, July 9-13 2000 English
Shigeyuki Kawai, Takako Mukai, Shigetarou Mori, Sachiko Suzuki, Wataru Hashimoto, and Kousaku Murata Polyphosphate kinase, polyphosphate-glucokinase, and polyphosphate-NAD kinase in microorganisms and their applications Res. Adv. Biosci. Bioeng., 1, 19-31 2000 English
Wataru Hashimoto, Sachiko Ozawa, Nobuaki Shirai, Keiko Momma, Shigeyuki Kawai, Shigeru Utsumi, and Kousaku Murata Genetically modified foods: potential problems for safety assessment and monitoring In Recent Res. Devel. in Agricultural & Food Chem., Research Signpost, 3, 277-293 1999 English
Wataru Hashimoto, Hikaru Miki, Masako Okamoto, Tomohiro Hisano, Keiko Momma, and Kousaku Murata Bacterial exo(hetero)polysaccharide lyases: enzymatic and genetic aspects of lyases, and their applications In Recent Res. Devel. in Fermentation & Bioeng., 1, 77-108, Research Signpost 1998 English
Hideyuki Suzuki, Wataru Hashimoto, Satoko Nohara, Hiromi Tachi, Tetsuya Monji, Kenji Yamamoto, and Hidehiko Kumagai Both large and small subunits are essential for the enzymatic activity of γ-glutamyltranspeptidase of Escherichia coli K-12 The FASEB Journal ASBMB/Annual meeting, 9 (6), May 1995 English
Hidehiko Kumagai, Hideyuki Suzuki, and Wataru Hashimoto γ-Glutamyltranspeptidase is essential for Escherichia coli K-12 to utilize as exogenous γ-glutamyl peptide as an amino acid source Annual reports of IC Biotech, 16, 556-559 1993 English
Hideyuki Suzuki, Hidehiko Kumagai, Wataru Hashimoto, Jaime O. Claudio, and Tatsurokuro Tochikura Molecular cloning and DNA sequence of Escherichia coli K-12 γ-glutamyltranspeptidase gene, ggt, and excretion of γ-glutamyl-transpeptidase Frontiers and new horizons in amino acid research, pp.589-593., Ed. by K. Takai, Elsevier Science Publishers B. V. 1992 English
Wataru Hashimoto, Hideyuki Suzuki, Satoko Nohara, and Hidehiko Kumagai γ-Glutamyltranspeptidase mutants of E. coli deficient in processing to subunits Annual reports of IC Biotech, 15, 460-464 1992 English

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Patents
Right holders Title Stage Patent number Date
小川徳之、楳原芙美、木村豪秀、村田幸作、橋本 渉 糖化ヘキサペプチドオキシダーゼとその利用 特許公開 特開WO2015/005258 2015/01/15
小川徳之、楳原芙美、木村豪秀、村田幸作、橋本 渉 糖化ヘモグロビンの測定方法 特許公開 特開WO2015/005257 2015/01/15
村田幸作、橋本 渉、河井重幸、織田浩司、庵原啓司、三上文三、竹田浩之、米山史紀、落合秋人 海洋バイオマスからのエタノール生産 特許公開 特開WO2011/024858 2011/03/03
村田幸作、橋本 渉、河井重幸、葉山善幸、福田泰樹 酵母の形質転換方法 特許公開 特開特許公開2003-250542 2003/09/09
松谷恵子、福田泰樹、矢嶋瑞夫、橋本 渉、村田幸作 真核微生物用抗菌剤およびそれを用いる真核微生物の増殖抑制方法 特許公開 特開特許公開平11-79922 1999/03/23
佐藤信行、中島 浩、森山 茂、橋本 渉、村田幸作 新規なゲラン分解酵素とオリゴ糖 特許公開 特開特許公開平9-234065 1997/09/09
Awards
Title(Japanese) Title(English) Organization name(Japanese) Organization name(English) Date
日本農芸化学奨励賞(日本農芸化学会)Award for Young Scientist, Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry 日本農芸化学会 2003
日本農芸化学会2011年度大会 トピックス賞(竹田先生、米山先生、河井先生、佐藤先生、村田先生との共同受賞) 日本農芸化学会 2011
日本農芸化学会2015年度大会 トピックス賞(丸山先生、村田先生らとの共同受賞) 日本農芸化学会 2015/04/07
Newspaper articles
Title Media name Column name Date
大きな分子を取り込む細菌の輸送機構解明 日刊工業新聞 21面 2015/07/31
国立大学法人京都大学、細菌の大規模改変を可能にする新技術の確立 日経バイオテク 2015/08/03
京大、巨大分子輸送装置の構造解明、バイオ燃料生産への応用も 大学ジャーナル 2015/08/11
病原菌の糖類吸収メカニズムの解明 京都新聞 社会欄25面 2017/04/22
京大と摂南大、細菌によるコンドロイチン分解・吸収機構の実体を解明 日本経済新聞 電子版 2017/04/24
国立大学法人京都大学、細菌によるコンドロイチン分解・吸収機構の実体解明-感染症に対する予防や治療薬の開発に期待- 日経バイオテク 2017/04/25
External funds, competitive funds and Grants-in-Aid for Scientific Research(kaken)
Type Position Title(Japanese) Title(English) Period
挑戦的萌芽研究 Assignment 好アルカリ性細菌の原形質分離をプロトン駆動力形成基盤とした革新的ATP合成機構 2016/04/01-2018/03/31
基盤研究(C) Assignment 高分子取込みABC輸送体の分子機構の解析と改変による多様な物質輸送系の構築 2016/04/01-2019/03/31
基盤研究(B) Representative 動物の細胞外マトリクスを標的とする病原性細菌の定着・感染機構に関する構造生命科学 2015/04/01-2018/03/31
基盤研究(B) Assignment 巨大分子輸送ABCトランスポーターの完全立体構造の決定と機能解析 2014/04/01-2017/03/31
挑戦的萌芽研究 Representative 体腔形成細菌の新規な金属輸送機構の解明とその放射性物質・レアメタル回収への応用 2014/04/01-2016/03/31
基盤研究(C) Representative 連鎖球菌における宿主細胞外マトリックス(グリコサミノグリカン)の代謝機構 2011/04/28-2014/03/31
基盤研究(B) Assignment 基質結合タンパク質と巨大分子特異的ABCインポーターとの複合体の構造と機能 2011/04/01-2014/03/31
基盤研究(C) Representative 連鎖球菌におけるヘパリン分解・輸送系の構造・機能相関とその感染症への関与 2008/04/-2011/03/31
基盤研究(B) Assignment 細菌鞭毛フラジェリンの構造機能相関と細胞表層局在化機構 2008/04/-2010/03/31
基盤研究(C) Representative グリコサミノグリカン分解による連鎖球菌の宿主細胞侵入・感染機構の分子・構造生物学 2006/04/-2008/03/31
萌芽研究 Assignment 体腔器官の分子移植による細菌の構造と機能の大規模改変とその応用 2006/04/-2008/03/31
特定領域研究 Assignment タンパク質の「揺らぎ」と機能発現における水分子の役割 2006/04/-2008/03/31
基盤研究(B) Assignment 鞭毛タンパク質フラジェリンの機能解析による細菌細胞表層構造の構築原理と鞭毛進化 2005/04/-2008/03/31
特定領域研究 Assignment 「小胞状構造体」の形成に関わる細菌細胞膜のダイナミクス 2004/04/-2005/03/31
特定領域研究 Assignment 細菌の細胞膜流動による「小胞状構造体」の形成に関わる遺伝子ネットワークの解明 2003/04/-2004/03/31
若手研究(B) Representative 高分子物質の結合と分解に関わるタンパク質・酵素の機能を規定する動的高次構造の解析 2003/04/-2006/03/31
基盤研究(B) Assignment 酵素リアーゼの共通機能を規定する非共通アミノ酸配列の生物学的意義 2002/04/-2005/03/31
特定領域研究(C) Representative 難治性細菌感染症における細菌の増殖、潜伏及び感染持続機構の解析と新規治療法の確立 2001/04/-2002/03/31
奨励研究(A) Representative 緑膿菌エコーシステムにおけるバイオフィルムの酵素・遺伝学的特性解析とその応用 2001/04/-2003/03/31
萌芽的研究 Assignment DNA分子の戦略的生存システムの解析とその応用 2000/04/-2002/03/31
基盤研究(B) Assignment 多触媒中心酵素の生合成と構造・機能相関に基づく遺伝情報多重性の解析 1999/04/-2002/03/31
特定領域研究(A) Assignment 細菌細胞表層における体腔形成機構と体腔の高分子輸送機構 1999/04/-2000/03/31
奨励研究(A) Representative X線結晶構造解析による多糖リアーゼの構造・機能相関と構造的一般則 1999/04/-2001/03/31
基盤研究(B) Assignment 緑膿菌バイオフィルム感染症治療に対する細菌アルギン酸リアーゼの機能と安全性 1998/04/-2001/03/31
特定領域研究(A) Assignment 細菌細胞表層への体腔提示と体腔への高分子ターゲッティング機構 1998/04/-1999/03/31
奨励研究(A) Representative 細菌多糖リアーゼの多面的機能・構造相関解析と医薬・食品領域への応用 1997/04/-1999/03/31
奨励研究(A) Representative 多糖の合成と分解に関わるスヒンゴモナス属細菌表層の穴構造と新規高分子取り込み機構 1996/04/-1997/03/31
挑戦的萌芽研究 Representative 体腔形成細菌の新規な金属輸送機構の解明とその放射性物質・レアメタル回収への応用 (平成26年度分) 2014/04/01-2015/03/31
基盤研究(B) Representative 動物の細胞外マトリクスを標的とする病原性細菌の定着・感染機構に関する構造生命科学 (平成27年度分) 2015/04/01-2016/03/31
挑戦的萌芽研究 Representative 体腔形成細菌の新規な金属輸送機構の解明とその放射性物質・レアメタル回収への応用 (平成27年度分) 2015/04/01-2016/03/31
基盤研究(B) Representative 動物の細胞外マトリクスを標的とする病原性細菌の定着・感染機構に関する構造生命科学 (平成28年度分) 2016/04/01-2017/03/31
基盤研究(B) Representative 動物の細胞外マトリクスを標的とする病原性細菌の定着・感染機構に関する構造生命科学 (平成28年度分) 2016/04/01-2017/03/31

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Non-external, competitive funds or grants other than grants-in-aid for Scientific research (kaken)
System Main person Title(Japanese) Title(English) Period
公益財団法人 不二たん白質研究振興財団 橋本 渉 納豆菌による大豆成分の認識 2017/04/01-2018/03/31
公益財団法人ダノン健康栄養財団 ダノン学術研究助成金 橋本 渉 宿主細胞外マトリックスを介したプロバイオティクスとヒト腸管との相互作用 2015/01/01-2015/12/31
公益財団法人野田産業科学研究所研究助成 橋本 渉 酸性多糖の代謝に関わる還元酵素の立体構造に基づく補酵素特異性変換とそのバイオ燃料生産への応用 2015/04/01-2016/03/31
公益財団法人水谷糖質科学振興財団研究助成 橋本 渉 断片化グリコサミノグリカンの分解に関わる新規酵素の構造機能相関とその医薬への応用 2014/04/01-2015/03/31
日本石鹸洗剤工業会 グリセリン新規用途開発研究助成金 橋本 渉 窒素固定細菌によるグリセリンからのバイオポリマー発酵生産 2014/04/01-2015/03/31
(財)昭和報公会研究助成金 橋本 渉 細菌細胞壁ペプチドグリカンの分解に関する研究 2008/04/01-2009/03/31
文部科学省 キーテクノロジー研究開発の推進「ターゲットタンパク研究プログラム」 橋本 渉 多糖の輸送・分解に関わる細菌由来超分子の構造生物学とその食品・環境分野への応用 2007/07/01-2012/03/31
ノボザイムズ研究奨励金 橋本 渉 Establishment of common structural rules for polysaccharide lyases and their application to medical areas 2002/04/01-2003/03/31
(財)新世代研究所研究奨励金 橋本 渉 細菌『超チャネル』の高次構造と巨大分子輸送機能 2001/04/01-2002/03/31
(財)稲盛財団研究助成金 橋本 渉 シアル酸合成・血圧制御に関わるN-アシル-D-グルコサミン2-エピメラーゼ/レニン結合タンパク質の細胞生理学的解析 Cell physiology of N-acyl-D-glucosamine 2-epimerase responsible for synthesis of sialic acid and regulation of blood pressure 2001/04/01-2002/03/31
(財)日本バイオインダストリー協会研究奨励金 橋本 渉 細菌体腔依存型高分子物質特異的ABCトランスポーターの構造と機能 2000/04/01-2001/03/31
京都大学学術奨励金 橋本 渉 細菌細胞表層のダイナミクスと高分子物質の新規取り込み機構 1997/04/01-1998/03/31

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Teaching subject(s)
Name(Japanese) Name(English) Term Department Period
微生物学実験及び実験法 後期 農学部 2011/04-2012/03
専門外国書講読II 後期 農学部 2011/04-2012/03
生物機能変換学 後期 農学部 2011/04-2012/03
生物機能変換学専攻演習 農学研究科 2011/04-2012/03
専門外国書講読II Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II 後期 農学部 2012/04-2013/03
応用微生物学実験及び実験法 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2012/04-2013/03
生物機能変換学 Molecular Biotechnology 後期 農学部 2012/04-2013/03
食品微生物学 Food Microbiology 前期 農学部 2013/04-2014/03
生物機能変換学 Molecular Biotechnology 後期 農学部 2013/04-2014/03
専門外国書講読II Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II 後期 農学部 2013/04-2014/03
応用微生物学実験及び実験法 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2013/04-2014/03
生物機能変換学専攻演習 Molecular Biotechnology Seminar 通年 農学研究科 2013/04-2014/03
生物機能変換学専攻実験 Experimental Course in Molecular Biotechnology 通年 農学研究科 2013/04-2014/03
情報基礎演習[農学部] Practice of Basic Informatics(Faculty of Agriculture) 後期 全学共通科目 2013/04-2014/03
食品微生物学 Food Microbiology 前期 農学部 2014/04-2015/03
生物機能変換学 Molecular Biotechnology 後期 農学部 2014/04-2015/03
専門外国書講読II Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II 後期 農学部 2014/04-2015/03
応用微生物学実験及び実験法 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2014/04-2015/03
生物機能変換学特論 Molecular Biotechnology (Advanced Course) 後期集中 農学研究科 2014/04-2015/03
生物機能変換学専攻演習 Molecular Biotechnology Seminar 通年 農学研究科 2014/04-2015/03
生物機能変換学専攻実験 Experimental Course in Molecular Biotechnology 通年 農学研究科 2014/04-2015/03
専門外国書講読II Introduction to Foreign Literature in Food Science and Biotechnology II 後期 農学部 2015/04-2016/03
応用微生物学実験及び実験法 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2015/04-2016/03
情報基礎演習[農学部] Practice of Basic Informatics(Faculty of Agriculture) 後期 全学共通科目 2015/04-2016/03
生物機能変換学 Molecular Biotechnology 後期 農学部 2015/04-2016/03
生物機能変換学専攻実験1 Experimental Course in Molecular Biotechnology1 通年 農学研究科 2015/04-2016/03
生物機能変換学専攻実験 Experimental Course in Molecular Biotechnology 通年 農学研究科 2015/04-2016/03
生物機能変換学専攻演習1 Molecular Biotechnology Seminar1 通年 農学研究科 2015/04-2016/03
生物機能変換学専攻演習 Molecular Biotechnology Seminar 通年 農学研究科 2015/04-2016/03
食品微生物学 Food Microbiology 前期 農学部 2015/04-2016/03
基礎微生物学 Basic Microbiology 前期 農学部 2016/04-2017/03
基礎微生物学 Basic Microbiology 後期 農学部 2016/04-2017/03
微生物生産学 Microbiological Technology 後期 農学部 2016/04-2017/03
微生物遺伝学 Microbial Genetics 後期 農学部 2016/04-2017/03
応用微生物学実験及び実験法 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2016/04-2017/03
生物機能変換学専攻実験1 Experimental Course in Molecular Biotechnology1 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能変換学専攻実験2 Experimental Course in Molecular Biotechnology2 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能変換学専攻実験 Experimental Course in Molecular Biotechnology 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能変換学専攻演習1 Molecular Biotechnology Seminar1 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能変換学専攻演習2 Molecular Biotechnology Seminar2 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能変換学専攻演習 Molecular Biotechnology Seminar 通年 農学研究科 2016/04-2017/03
生物機能変換学特論 Molecular Biotechnology (Advanced Course) 後期集中 農学研究科 2016/04-2017/03
基礎微生物学 Basic Microbiology 後期 農学部 2017/04-2018/03
微生物生産学 Microbiological Technology 後期 農学部 2017/04-2018/03
微生物遺伝学 Microbial Genetics 前期 農学部 2017/04-2018/03
応用微生物学実験及び実験法 Laboratory Course in Applied Microbiology 後期 農学部 2017/04-2018/03
応用微生物学特論 Advanced Course of Applied Microbiology 前期集中 農学研究科 2017/04-2018/03
生物機能変換学専攻実験1 Experimental Course in Molecular Biotechnology1 通年 農学研究科 2017/04-2018/03
生物機能変換学専攻実験2 Experimental Course in Molecular Biotechnology2 通年 農学研究科 2017/04-2018/03
生物機能変換学専攻演習1 Molecular Biotechnology Seminar1 通年 農学研究科 2017/04-2018/03
生物機能変換学専攻演習2 Molecular Biotechnology Seminar2 通年 農学研究科 2017/04-2018/03

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School management (title, position)
Title Period
宇治キャンパス公開2013実行委員会 委員 2013/01/01-2013/12/31
宇治地区宇治事業所省エネルギー推進委員会 委員 2012/04/01-2014/03/31
宇治地区宇治事業所省エネルギー推進委員会 委員 2014/04/01-2016/03/31
宇治地区事業所省エネルギー推進委員会 委員 2010/04/01-2012/03/31
Faculty management (title, position)
Title Period
京都大学宇治キャンパス公開2013実行委員会 2013/01/01-2013/12/31
宇治事業所省エネルギー推進委員会 2012/04/01-2014/03/31
宇治事業所省エネルギー推進委員会 2014/04/01-2016/03/31
図書委員会 委員 2013/04/01-2015/03/31
国際交流委員会 委員 2015/04/01-2017/03/31
学部教務委員会 委員 2016/04/01-2018/03/31
制度・組織等検討委員会 委員 2017/04/01-2019/03/31
Academic organization (other)
Organization name(Japanese) Organization name(English) Misc(Japanese) Misc(English) Period
酵母研究会 運営委員 2006-2015
第18回酵母合同シンポジウム 第18回酵母合同シンポジウム実行委員 2008-2008
第20回酵母合同シンポジウム 第20回酵母合同シンポジウム実行委員 2012-2012